MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_013161	TTC	2	6	121068	121073	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058032
2502	NC_013161	TAA	2	6	121121	121126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058032
2503	NC_013161	AGG	2	6	121138	121143	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058032
2504	NC_013161	T	6	6	121160	121165	0 %	100 %	0 %	0 %	257058032
2505	NC_013161	TGT	2	6	121198	121203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058032
2506	NC_013161	TC	3	6	121208	121213	0 %	50 %	0 %	50 %	257058032
2507	NC_013161	AT	3	6	121219	121224	50 %	50 %	0 %	0 %	257058032
2508	NC_013161	TGC	3	9	121260	121268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058032
2509	NC_013161	ATG	2	6	121365	121370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058032
2510	NC_013161	TGC	2	6	121385	121390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058032
2511	NC_013161	AAT	2	6	121420	121425	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058032
2512	NC_013161	CCCAT	2	10	121454	121463	20 %	20 %	0 %	60 %	257058032
2513	NC_013161	ATC	2	6	121470	121475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058032
2514	NC_013161	ATTG	2	8	121549	121556	25 %	50 %	25 %	0 %	257058032
2515	NC_013161	GTTTT	2	10	121558	121567	0 %	80 %	20 %	0 %	257058032
2516	NC_013161	TG	3	6	121588	121593	0 %	50 %	50 %	0 %	257058032
2517	NC_013161	TCC	2	6	121608	121613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2518	NC_013161	AGT	2	6	121627	121632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2519	NC_013161	AGG	2	6	121650	121655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2520	NC_013161	TGAG	2	8	121658	121665	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2521	NC_013161	CCTT	2	8	121701	121708	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2522	NC_013161	AGG	2	6	121718	121723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2523	NC_013161	T	7	7	121786	121792	0 %	100 %	0 %	0 %	257058033
2524	NC_013161	GT	3	6	121795	121800	0 %	50 %	50 %	0 %	257058033
2525	NC_013161	TCA	2	6	121840	121845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058033
2526	NC_013161	TTG	2	6	121861	121866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_013161	TCA	2	6	122007	122012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2528	NC_013161	TAC	2	6	122049	122054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2529	NC_013161	TTTC	2	8	122086	122093	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2530	NC_013161	AGA	2	6	122112	122117	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2531	NC_013161	ATT	2	6	122173	122178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2532	NC_013161	ACACTA	2	12	122316	122327	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257058034
2533	NC_013161	GTT	2	6	122385	122390	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058034
2534	NC_013161	TTAA	2	8	122397	122404	50 %	50 %	0 %	0 %	257058034
2535	NC_013161	T	6	6	122439	122444	0 %	100 %	0 %	0 %	257058034
2536	NC_013161	A	6	6	122458	122463	100 %	0 %	0 %	0 %	257058034
2537	NC_013161	ATA	2	6	122489	122494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058034
2538	NC_013161	GTT	2	6	122514	122519	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058035
2539	NC_013161	CTT	2	6	122523	122528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058035
2540	NC_013161	ATCC	2	8	122562	122569	25 %	25 %	0 %	50 %	257058035
2541	NC_013161	AGCAAC	2	12	122584	122595	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	257058035
2542	NC_013161	ATA	2	6	122628	122633	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058035
2543	NC_013161	TTC	2	6	122707	122712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058035
2544	NC_013161	CTA	2	6	122730	122735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058035
2545	NC_013161	AAT	2	6	122745	122750	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058035
2546	NC_013161	CTC	2	6	122814	122819	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2547	NC_013161	TAC	2	6	122828	122833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_013161	TTATC	2	10	122836	122845	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
2549	NC_013161	GATTCT	2	12	122889	122900	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2550	NC_013161	T	6	6	123075	123080	0 %	100 %	0 %	0 %	257058036
2551	NC_013161	TAG	2	6	123200	123205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058036
2552	NC_013161	GTTGA	2	10	123209	123218	20 %	40 %	40 %	0 %	257058036
2553	NC_013161	TAA	2	6	123232	123237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058036
2554	NC_013161	GTT	2	6	123262	123267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058036
2555	NC_013161	CTT	2	6	123290	123295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058036
2556	NC_013161	TAA	2	6	123308	123313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058036
2557	NC_013161	ACG	3	9	123327	123335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058036
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2559	NC_013161	TTA	2	6	123373	123378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058036
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2561	NC_013161	ATAAA	2	10	123427	123436	80 %	20 %	0 %	0 %	257058036
2562	NC_013161	A	6	6	123443	123448	100 %	0 %	0 %	0 %	257058036
2563	NC_013161	AAC	2	6	123516	123521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058036
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2573	NC_013161	TCT	2	6	123880	123885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058036
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2581	NC_013161	TCC	2	6	124209	124214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058036
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2587	NC_013161	TTTA	2	8	124447	124454	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
2588	NC_013161	CTA	2	6	124458	124463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2590	NC_013161	ATC	2	6	124554	124559	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058037
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2594	NC_013161	T	6	6	124663	124668	0 %	100 %	0 %	0 %	257058037
2595	NC_013161	AAG	2	6	124674	124679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058037
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2598	NC_013161	ACG	2	6	124751	124756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058037
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2607	NC_013161	A	6	6	125336	125341	100 %	0 %	0 %	0 %	257058038
2608	NC_013161	TTG	2	6	125359	125364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058038
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2610	NC_013161	T	6	6	125423	125428	0 %	100 %	0 %	0 %	257058038
2611	NC_013161	ATT	2	6	125509	125514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058038
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2622	NC_013161	ATT	2	6	126050	126055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2624	NC_013161	TAG	2	6	126174	126179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2991	NC_013161	AAC	2	6	145117	145122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058053
2992	NC_013161	TCA	2	6	145125	145130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058053
2993	NC_013161	AT	3	6	145246	145251	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2994	NC_013161	TAA	2	6	145333	145338	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2995	NC_013161	ACA	2	6	145369	145374	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058055
2996	NC_013161	GCG	2	6	145435	145440	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058055
2997	NC_013161	AATTT	2	10	145450	145459	40 %	60 %	0 %	0 %	257058055
2998	NC_013161	TTGAGG	2	12	145523	145534	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257058055
2999	NC_013161	CAA	2	6	145565	145570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058055
3000	NC_013161	TAA	2	6	145623	145628	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058055

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