MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

< Previous12345678910111213...192193Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_013161	TTG	2	6	95948	95953	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058008
2003	NC_013161	TG	3	6	95962	95967	0 %	50 %	50 %	0 %	257058008
2004	NC_013161	AGG	2	6	96045	96050	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058008
2005	NC_013161	A	6	6	96075	96080	100 %	0 %	0 %	0 %	257058008
2006	NC_013161	TTGA	2	8	96154	96161	25 %	50 %	25 %	0 %	257058008
2007	NC_013161	CTT	2	6	96203	96208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058008
2008	NC_013161	TC	3	6	96233	96238	0 %	50 %	0 %	50 %	257058008
2009	NC_013161	CCAACG	2	12	96325	96336	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	257058008
2010	NC_013161	GCC	2	6	96346	96351	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058008
2011	NC_013161	CAT	2	6	96359	96364	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058008
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2013	NC_013161	TTATT	2	10	96426	96435	20 %	80 %	0 %	0 %	257058008
2014	NC_013161	ATTTT	2	10	96486	96495	20 %	80 %	0 %	0 %	257058008
2015	NC_013161	GAA	2	6	96507	96512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058009
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2021	NC_013161	ATT	2	6	96731	96736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058009
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2035	NC_013161	TAT	2	6	97415	97420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2036	NC_013161	A	6	6	97422	97427	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2111	NC_013161	CA	4	8	101097	101104	50 %	0 %	0 %	50 %	257058013
2112	NC_013161	T	6	6	101182	101187	0 %	100 %	0 %	0 %	257058013
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2120	NC_013161	AT	3	6	101546	101551	50 %	50 %	0 %	0 %	257058013
2121	NC_013161	A	6	6	101614	101619	100 %	0 %	0 %	0 %	257058013
2122	NC_013161	AAT	2	6	101683	101688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058013
2123	NC_013161	CTA	2	6	101745	101750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058013
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2125	NC_013161	CTT	2	6	101817	101822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058013
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2127	NC_013161	CGC	2	6	101878	101883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058013
2128	NC_013161	ACA	2	6	101887	101892	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058013
2129	NC_013161	TGA	2	6	102017	102022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058014
2130	NC_013161	T	6	6	102044	102049	0 %	100 %	0 %	0 %	257058014
2131	NC_013161	AAC	2	6	102127	102132	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058014
2132	NC_013161	TTG	2	6	102194	102199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058014
2133	NC_013161	GCT	2	6	102204	102209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058014
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2135	NC_013161	AAAT	2	8	102290	102297	75 %	25 %	0 %	0 %	257058014
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2140	NC_013161	T	8	8	102696	102703	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2141	NC_013161	ACA	2	6	102708	102713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2142	NC_013161	A	6	6	102758	102763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2143	NC_013161	TTG	2	6	102893	102898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058015
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2149	NC_013161	TTG	2	6	102977	102982	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058015
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2234	NC_013161	AGA	2	6	106332	106337	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2246	NC_013161	TCCT	2	8	107182	107189	0 %	50 %	0 %	50 %	257058019
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2248	NC_013161	GCA	2	6	107321	107326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058019
2249	NC_013161	ACC	2	6	107641	107646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058019
2250	NC_013161	CTG	2	6	107835	107840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058019
2251	NC_013161	TAC	2	6	107952	107957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058019
2252	NC_013161	AGA	2	6	108007	108012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058019
2253	NC_013161	AT	3	6	108032	108037	50 %	50 %	0 %	0 %	257058019
2254	NC_013161	TAA	2	6	108072	108077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058019
2255	NC_013161	ATA	2	6	108103	108108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058019
2256	NC_013161	ATC	2	6	108170	108175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058019
2257	NC_013161	ATTG	2	8	108224	108231	25 %	50 %	25 %	0 %	257058019
2258	NC_013161	GTC	2	6	108233	108238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058019
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2264	NC_013161	TAG	2	6	108825	108830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058020
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2267	NC_013161	GATG	2	8	108901	108908	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2268	NC_013161	TAAC	2	8	108977	108984	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
2269	NC_013161	ATTT	2	8	109013	109020	25 %	75 %	0 %	0 %	257058021
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2290	NC_013161	CAAAC	2	10	110075	110084	60 %	0 %	0 %	40 %	257058022
2291	NC_013161	CAA	2	6	110206	110211	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2292	NC_013161	TGGG	2	8	110219	110226	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
2293	NC_013161	ATT	2	6	110366	110371	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058023
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2361	NC_013161	GA	3	6	113299	113304	50 %	0 %	50 %	0 %	257058025
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2364	NC_013161	TTA	2	6	113629	113634	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2365	NC_013161	TTTCT	2	10	113653	113662	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
2366	NC_013161	A	8	8	113690	113697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2367	NC_013161	T	6	6	113714	113719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2368	NC_013161	TTCA	2	8	113776	113783	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2369	NC_013161	TAT	2	6	113833	113838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2370	NC_013161	AAG	2	6	113868	113873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058026
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2372	NC_013161	ATT	2	6	113995	114000	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058026
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2374	NC_013161	AAC	2	6	114045	114050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058026
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