MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013161	CAA	2	6	46406	46411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057962
1002	NC_013161	AAG	2	6	46454	46459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057962
1003	NC_013161	CTT	2	6	46482	46487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057962
1004	NC_013161	ATCAA	2	10	46534	46543	60 %	20 %	0 %	20 %	257057962
1005	NC_013161	A	6	6	46553	46558	100 %	0 %	0 %	0 %	257057962
1006	NC_013161	CTT	2	6	46597	46602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057962
1007	NC_013161	TATT	2	8	46658	46665	25 %	75 %	0 %	0 %	257057962
1008	NC_013161	AAT	2	6	46700	46705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057962
1009	NC_013161	ATTT	2	8	46809	46816	25 %	75 %	0 %	0 %	257057962
1010	NC_013161	A	6	6	46836	46841	100 %	0 %	0 %	0 %	257057962
1011	NC_013161	TGC	2	6	46855	46860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057962
1012	NC_013161	CTT	2	6	46881	46886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057962
1013	NC_013161	AGG	2	6	46957	46962	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057962
1014	NC_013161	GTT	2	6	46999	47004	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057962
1015	NC_013161	CAG	2	6	47063	47068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057962
1016	NC_013161	CAA	2	6	47084	47089	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057962
1017	NC_013161	CAT	2	6	47169	47174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057962
1018	NC_013161	AAT	2	6	47262	47267	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057963
1019	NC_013161	GAA	2	6	47275	47280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057963
1020	NC_013161	GGC	2	6	47289	47294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057963
1021	NC_013161	T	6	6	47319	47324	0 %	100 %	0 %	0 %	257057963
1022	NC_013161	TCA	2	6	47340	47345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057963
1023	NC_013161	GAT	2	6	47599	47604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057963
1024	NC_013161	GATTT	2	10	47684	47693	20 %	60 %	20 %	0 %	257057963
1025	NC_013161	TGA	2	6	47717	47722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057963
1026	NC_013161	TCA	2	6	47766	47771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057963
1027	NC_013161	CTC	2	6	47864	47869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057963
1028	NC_013161	TCA	2	6	47907	47912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057963
1029	NC_013161	AATTT	2	10	47926	47935	40 %	60 %	0 %	0 %	257057963
1030	NC_013161	ATC	2	6	47951	47956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057963
1031	NC_013161	A	8	8	47997	48004	100 %	0 %	0 %	0 %	257057963
1032	NC_013161	TAATT	2	10	48075	48084	40 %	60 %	0 %	0 %	257057963
1033	NC_013161	AGCA	2	8	48088	48095	50 %	0 %	25 %	25 %	257057963
1034	NC_013161	GAA	2	6	48182	48187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057964
1035	NC_013161	GCA	2	6	48220	48225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057964
1036	NC_013161	ATT	2	6	48245	48250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057964
1037	NC_013161	GCA	3	9	48371	48379	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057964
1038	NC_013161	TGA	2	6	48457	48462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057964
1039	NC_013161	AAC	2	6	48489	48494	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057964
1040	NC_013161	CAA	2	6	48524	48529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057964
1041	NC_013161	TTA	2	6	48534	48539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057964
1042	NC_013161	ATC	2	6	48552	48557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057964
1043	NC_013161	CAT	2	6	48562	48567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057964
1044	NC_013161	TAA	2	6	48589	48594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057964
1045	NC_013161	TGC	2	6	48601	48606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057964
1046	NC_013161	ATG	2	6	48639	48644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057964
1047	NC_013161	ATT	2	6	48731	48736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057964
1048	NC_013161	ATG	2	6	48744	48749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057964
1049	NC_013161	CGC	2	6	48779	48784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257057964
1050	NC_013161	TTTA	2	8	48847	48854	25 %	75 %	0 %	0 %	257057964
1051	NC_013161	ATT	2	6	48873	48878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057964
1052	NC_013161	ATG	2	6	48891	48896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057964
1053	NC_013161	TAT	2	6	48900	48905	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057964
1054	NC_013161	CAA	2	6	48974	48979	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057964
1055	NC_013161	ACTCA	2	10	48992	49001	40 %	20 %	0 %	40 %	257057964
1056	NC_013161	TAT	2	6	49013	49018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057964
1057	NC_013161	CGAC	2	8	49067	49074	25 %	0 %	25 %	50 %	257057964
1058	NC_013161	CAA	2	6	49095	49100	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057964
1059	NC_013161	ACC	2	6	49112	49117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057964
1060	NC_013161	TCA	2	6	49118	49123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057964
1061	NC_013161	AAT	2	6	49274	49279	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1062	NC_013161	TTA	2	6	49363	49368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057965
1063	NC_013161	CTA	2	6	49376	49381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057965
1064	NC_013161	TTA	2	6	49382	49387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057965
1065	NC_013161	TGAGG	2	10	49412	49421	20 %	20 %	60 %	0 %	257057965
1066	NC_013161	TCA	2	6	49442	49447	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057965
1067	NC_013161	TCTA	2	8	49470	49477	25 %	50 %	0 %	25 %	257057965
1068	NC_013161	AAC	2	6	49540	49545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057965
1069	NC_013161	AAT	2	6	49664	49669	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057965
1070	NC_013161	AT	3	6	49699	49704	50 %	50 %	0 %	0 %	257057965
1071	NC_013161	T	7	7	49709	49715	0 %	100 %	0 %	0 %	257057965
1072	NC_013161	ATG	2	6	49729	49734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057965
1073	NC_013161	TA	3	6	49752	49757	50 %	50 %	0 %	0 %	257057965
1074	NC_013161	TAGA	2	8	49831	49838	50 %	25 %	25 %	0 %	257057965
1075	NC_013161	TTG	2	6	49966	49971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057965
1076	NC_013161	GA	3	6	49979	49984	50 %	0 %	50 %	0 %	257057965
1077	NC_013161	A	8	8	50035	50042	100 %	0 %	0 %	0 %	257057965
1078	NC_013161	AATA	2	8	50049	50056	75 %	25 %	0 %	0 %	257057965
1079	NC_013161	CAA	2	6	50058	50063	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057965
1080	NC_013161	AATCT	2	10	50190	50199	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_013161	AT	3	6	50250	50255	50 %	50 %	0 %	0 %	257057966
1082	NC_013161	GTTTCT	2	12	50266	50277	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	257057966
1083	NC_013161	TCC	2	6	50304	50309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057966
1084	NC_013161	TTAGAT	2	12	50329	50340	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257057966
1085	NC_013161	TTA	2	6	50504	50509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057966
1086	NC_013161	TAG	2	6	50675	50680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057966
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1088	NC_013161	ATG	2	6	50711	50716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057966
1089	NC_013161	TTA	2	6	50737	50742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057966
1090	NC_013161	GGT	2	6	50751	50756	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057966
1091	NC_013161	TAT	2	6	50757	50762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057966
1092	NC_013161	TAAAG	2	10	50881	50890	60 %	20 %	20 %	0 %	257057966
1093	NC_013161	CAG	2	6	50958	50963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057967
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1095	NC_013161	A	6	6	51012	51017	100 %	0 %	0 %	0 %	257057967
1096	NC_013161	TATC	2	8	51044	51051	25 %	50 %	0 %	25 %	257057967
1097	NC_013161	CAACA	2	10	51103	51112	60 %	0 %	0 %	40 %	257057967
1098	NC_013161	GAA	2	6	51243	51248	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057967
1099	NC_013161	TTA	2	6	51343	51348	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057967
1100	NC_013161	CCAT	2	8	51364	51371	25 %	25 %	0 %	50 %	257057967
1101	NC_013161	A	7	7	51391	51397	100 %	0 %	0 %	0 %	257057967
1102	NC_013161	TTGT	2	8	51514	51521	0 %	75 %	25 %	0 %	257057967
1103	NC_013161	CAT	2	6	51552	51557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057967
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1105	NC_013161	TTTA	2	8	51672	51679	25 %	75 %	0 %	0 %	257057967
1106	NC_013161	CTG	2	6	51682	51687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057967
1107	NC_013161	TTG	2	6	51784	51789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057967
1108	NC_013161	ATTT	2	8	51867	51874	25 %	75 %	0 %	0 %	257057967
1109	NC_013161	GAT	2	6	51900	51905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057967
1110	NC_013161	ATC	2	6	51991	51996	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057967
1111	NC_013161	A	6	6	52126	52131	100 %	0 %	0 %	0 %	257057967
1112	NC_013161	AT	3	6	52133	52138	50 %	50 %	0 %	0 %	257057967
1113	NC_013161	ACG	2	6	52181	52186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057968
1114	NC_013161	ATT	2	6	52240	52245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057968
1115	NC_013161	TAG	2	6	52280	52285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057968
1116	NC_013161	AACTA	2	10	52298	52307	60 %	20 %	0 %	20 %	257057968
1117	NC_013161	TGG	2	6	52336	52341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057968
1118	NC_013161	TTA	2	6	52440	52445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057968
1119	NC_013161	TATGA	2	10	52504	52513	40 %	40 %	20 %	0 %	257057968
1120	NC_013161	TAG	2	6	52545	52550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057968
1121	NC_013161	A	6	6	52621	52626	100 %	0 %	0 %	0 %	257057968
1122	NC_013161	ATTCC	2	10	52643	52652	20 %	40 %	0 %	40 %	257057968
1123	NC_013161	AGC	2	6	52680	52685	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057968
1124	NC_013161	GTG	2	6	52720	52725	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057968
1125	NC_013161	TTA	2	6	52737	52742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057968
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1127	NC_013161	ATCTG	2	10	52821	52830	20 %	40 %	20 %	20 %	257057968
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1255	NC_013161	ATT	2	6	58949	58954	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057974
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