MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_013161	AAG	2	6	541951	541956	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058437
11002	NC_013161	GAA	2	6	542007	542012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058437
11003	NC_013161	A	6	6	542017	542022	100 %	0 %	0 %	0 %	257058437
11004	NC_013161	A	6	6	542067	542072	100 %	0 %	0 %	0 %	257058437
11005	NC_013161	AGA	2	6	542111	542116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058437
11006	NC_013161	TAT	2	6	542140	542145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058437
11007	NC_013161	TTA	2	6	542184	542189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058437
11008	NC_013161	AGAA	2	8	542204	542211	75 %	0 %	25 %	0 %	257058437
11009	NC_013161	TAAT	2	8	542214	542221	50 %	50 %	0 %	0 %	257058437
11010	NC_013161	TAA	2	6	542231	542236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_013161	TTG	2	6	542296	542301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058438
11012	NC_013161	ATA	2	6	542302	542307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058438
11013	NC_013161	TGT	2	6	542367	542372	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058438
11014	NC_013161	CAC	2	6	542405	542410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058438
11015	NC_013161	CGA	2	6	542457	542462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058438
11016	NC_013161	T	7	7	542514	542520	0 %	100 %	0 %	0 %	257058438
11017	NC_013161	ATA	2	6	542537	542542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058438
11018	NC_013161	CGG	2	6	542569	542574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058438
11019	NC_013161	T	7	7	542679	542685	0 %	100 %	0 %	0 %	257058438
11020	NC_013161	GGT	2	6	542741	542746	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058438
11021	NC_013161	TAA	2	6	542770	542775	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058438
11022	NC_013161	TGT	2	6	542811	542816	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058438
11023	NC_013161	GGC	2	6	542823	542828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058438
11024	NC_013161	AGG	2	6	542898	542903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058438
11025	NC_013161	TGA	2	6	542907	542912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058438
11026	NC_013161	T	6	6	543037	543042	0 %	100 %	0 %	0 %	257058438
11027	NC_013161	AAT	2	6	543044	543049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058438
11028	NC_013161	A	6	6	543242	543247	100 %	0 %	0 %	0 %	257058438
11029	NC_013161	GCT	2	6	543330	543335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058438
11030	NC_013161	TCC	2	6	543371	543376	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058438
11031	NC_013161	C	6	6	543390	543395	0 %	0 %	0 %	100 %	257058438
11032	NC_013161	ACG	2	6	543417	543422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058438
11033	NC_013161	TAT	2	6	543544	543549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11034	NC_013161	TTA	2	6	543621	543626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11035	NC_013161	A	6	6	543633	543638	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11036	NC_013161	T	7	7	543682	543688	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11037	NC_013161	T	8	8	543694	543701	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11038	NC_013161	CAT	2	6	543702	543707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11039	NC_013161	CAAGT	2	10	543713	543722	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11040	NC_013161	CCCGA	2	10	543881	543890	20 %	0 %	20 %	60 %	257058439
11041	NC_013161	ATA	2	6	543936	543941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058439
11042	NC_013161	CTA	2	6	544100	544105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058439
11043	NC_013161	ATC	2	6	544110	544115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058439
11044	NC_013161	TAA	2	6	544128	544133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058439
11045	NC_013161	GGA	3	9	544150	544158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058439
11046	NC_013161	AGT	2	6	544167	544172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058439
11047	NC_013161	TTTG	2	8	544328	544335	0 %	75 %	25 %	0 %	257058439
11048	NC_013161	CTT	2	6	544358	544363	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058439
11049	NC_013161	AAC	2	6	544374	544379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058439
11050	NC_013161	TAT	2	6	544382	544387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058439
11051	NC_013161	CGT	2	6	544426	544431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058439
11052	NC_013161	TCT	2	6	544432	544437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058439
11053	NC_013161	TGT	2	6	544477	544482	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058439
11054	NC_013161	GTT	2	6	544484	544489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058439
11055	NC_013161	TCT	2	6	544536	544541	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058439
11056	NC_013161	TTGTTT	2	12	544554	544565	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	257058439
11057	NC_013161	CTT	2	6	544592	544597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058439
11058	NC_013161	TAA	2	6	544599	544604	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058439
11059	NC_013161	T	6	6	544615	544620	0 %	100 %	0 %	0 %	257058439
11060	NC_013161	CTT	2	6	544628	544633	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058439
11061	NC_013161	GTT	2	6	544679	544684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058439
11062	NC_013161	ATC	2	6	544707	544712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058439
11063	NC_013161	GTT	2	6	544772	544777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058439
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11065	NC_013161	GCT	2	6	544825	544830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058439
11066	NC_013161	AGC	2	6	544941	544946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058439
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11068	NC_013161	TCA	2	6	545012	545017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058439
11069	NC_013161	TTG	2	6	545040	545045	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058439
11070	NC_013161	TAG	2	6	545087	545092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058439
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11072	NC_013161	GAG	2	6	545177	545182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058439
11073	NC_013161	TGG	2	6	545246	545251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058439
11074	NC_013161	GTT	2	6	545278	545283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058439
11075	NC_013161	T	6	6	545488	545493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11076	NC_013161	TAG	2	6	545553	545558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058440
11077	NC_013161	TTC	2	6	545582	545587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058440
11078	NC_013161	CATC	2	8	545617	545624	25 %	25 %	0 %	50 %	257058440
11079	NC_013161	TAA	2	6	545668	545673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058440
11080	NC_013161	TAA	2	6	545702	545707	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058440
11081	NC_013161	TGT	2	6	545721	545726	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058440
11082	NC_013161	TGG	2	6	545749	545754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058440
11083	NC_013161	ATA	2	6	545883	545888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058440
11084	NC_013161	GCT	2	6	545901	545906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058440
11085	NC_013161	CGC	2	6	545912	545917	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058440
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11088	NC_013161	AATT	2	8	546104	546111	50 %	50 %	0 %	0 %	257058440
11089	NC_013161	CAA	2	6	546145	546150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058440
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11091	NC_013161	TGT	2	6	546210	546215	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058440
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11093	NC_013161	GGTGA	2	10	546387	546396	20 %	20 %	60 %	0 %	257058440
11094	NC_013161	AAT	2	6	546407	546412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058440
11095	NC_013161	CTAAG	2	10	546433	546442	40 %	20 %	20 %	20 %	257058440
11096	NC_013161	CCCA	2	8	546468	546475	25 %	0 %	0 %	75 %	257058440
11097	NC_013161	TTG	2	6	546498	546503	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058440
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11099	NC_013161	TTGCCA	2	12	546584	546595	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257058440
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11101	NC_013161	TTCG	2	8	546679	546686	0 %	50 %	25 %	25 %	257058440
11102	NC_013161	TGG	2	6	546712	546717	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058440
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11104	NC_013161	ACC	2	6	546801	546806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058440
11105	NC_013161	GGT	2	6	546952	546957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058440
11106	NC_013161	TGG	2	6	546994	546999	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058440
11107	NC_013161	CAA	2	6	547003	547008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058440
11108	NC_013161	GGT	2	6	547025	547030	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058440
11109	NC_013161	GAT	2	6	547118	547123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058440
11110	NC_013161	ATC	2	6	547131	547136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058440
11111	NC_013161	GA	3	6	547214	547219	50 %	0 %	50 %	0 %	257058440
11112	NC_013161	T	6	6	547260	547265	0 %	100 %	0 %	0 %	257058440
11113	NC_013161	GTA	2	6	547273	547278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058440
11114	NC_013161	CCGT	2	8	547528	547535	0 %	25 %	25 %	50 %	257058440
11115	NC_013161	CGG	2	6	547572	547577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058440
11116	NC_013161	CCTTT	2	10	547663	547672	0 %	60 %	0 %	40 %	257058440
11117	NC_013161	CGG	2	6	547747	547752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058440
11118	NC_013161	TCA	2	6	547759	547764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058440
11119	NC_013161	AGG	2	6	547893	547898	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058440
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11121	NC_013161	TCC	2	6	547952	547957	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058440
11122	NC_013161	CACT	2	8	547960	547967	25 %	25 %	0 %	50 %	257058440
11123	NC_013161	GGA	2	6	548053	548058	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058440
11124	NC_013161	TTG	2	6	548099	548104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058440
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11134	NC_013161	ACTG	2	8	548475	548482	25 %	25 %	25 %	25 %	257058440
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11156	NC_013161	CTC	2	6	549769	549774	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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11164	NC_013161	CTTC	2	8	550122	550129	0 %	50 %	0 %	50 %	257058443
11165	NC_013161	TATTCC	2	12	550139	550150	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	257058443
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11226	NC_013161	TGTT	2	8	552865	552872	0 %	75 %	25 %	0 %	257058448
11227	NC_013161	GAA	2	6	552874	552879	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058448
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11229	NC_013161	AATC	2	8	553005	553012	50 %	25 %	0 %	25 %	257058448
11230	NC_013161	G	6	6	553042	553047	0 %	0 %	100 %	0 %	257058448
11231	NC_013161	ATC	2	6	553060	553065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058448
11232	NC_013161	G	7	7	553149	553155	0 %	0 %	100 %	0 %	257058448
11233	NC_013161	GTA	2	6	553185	553190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058448
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11235	NC_013161	TTA	2	6	553375	553380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058448
11236	NC_013161	AATT	2	8	553438	553445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11237	NC_013161	ATT	2	6	553449	553454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11238	NC_013161	A	6	6	553489	553494	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11239	NC_013161	AAT	2	6	553501	553506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11240	NC_013161	ATA	2	6	553507	553512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11241	NC_013161	ATC	2	6	553609	553614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058449
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11487	NC_013161	TAT	2	6	566865	566870	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058461
11488	NC_013161	TAAAT	2	10	566909	566918	60 %	40 %	0 %	0 %	257058461
11489	NC_013161	TCA	4	12	567011	567022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058461
11490	NC_013161	CTGA	2	8	567040	567047	25 %	25 %	25 %	25 %	257058461
11491	NC_013161	ATC	2	6	567103	567108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058461
11492	NC_013161	AAT	2	6	567109	567114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058461
11493	NC_013161	CAG	2	6	567168	567173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058461
11494	NC_013161	TA	3	6	567222	567227	50 %	50 %	0 %	0 %	257058461
11495	NC_013161	TGAG	2	8	567249	567256	25 %	25 %	50 %	0 %	257058461
11496	NC_013161	TAA	2	6	567294	567299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058461
11497	NC_013161	TGA	2	6	567332	567337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058461
11498	NC_013161	TAA	2	6	567346	567351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058461
11499	NC_013161	AG	3	6	567361	567366	50 %	0 %	50 %	0 %	257058461
11500	NC_013161	GCT	2	6	567473	567478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058461

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