MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013161	ATT	2	6	23204	23209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057942
502	NC_013161	CAAACC	2	12	23263	23274	50 %	0 %	0 %	50 %	257057942
503	NC_013161	ACC	2	6	23279	23284	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057942
504	NC_013161	TTA	2	6	23334	23339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057942
505	NC_013161	TCT	2	6	23379	23384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057942
506	NC_013161	TCA	2	6	23433	23438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057942
507	NC_013161	CTT	2	6	23491	23496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057942
508	NC_013161	G	7	7	23514	23520	0 %	0 %	100 %	0 %	257057942
509	NC_013161	AATT	2	8	23525	23532	50 %	50 %	0 %	0 %	257057942
510	NC_013161	ATC	2	6	23577	23582	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057942
511	NC_013161	AAAT	2	8	23597	23604	75 %	25 %	0 %	0 %	257057942
512	NC_013161	T	6	6	23688	23693	0 %	100 %	0 %	0 %	257057942
513	NC_013161	CTT	3	9	23740	23748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057942
514	NC_013161	AAC	2	6	23787	23792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057942
515	NC_013161	TTA	2	6	23817	23822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057942
516	NC_013161	CGA	2	6	23872	23877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057942
517	NC_013161	TAT	2	6	23917	23922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057942
518	NC_013161	TTTG	2	8	23943	23950	0 %	75 %	25 %	0 %	257057942
519	NC_013161	AATG	2	8	23965	23972	50 %	25 %	25 %	0 %	257057942
520	NC_013161	TCA	2	6	23985	23990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057942
521	NC_013161	AGGA	2	8	24011	24018	50 %	0 %	50 %	0 %	257057942
522	NC_013161	GCT	3	9	24051	24059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057942
523	NC_013161	GTC	2	6	24231	24236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057942
524	NC_013161	C	6	6	24253	24258	0 %	0 %	0 %	100 %	257057942
525	NC_013161	AGG	2	6	24276	24281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057942
526	NC_013161	GCA	2	6	24285	24290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057942
527	NC_013161	GAT	2	6	24350	24355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057942
528	NC_013161	AC	3	6	24368	24373	50 %	0 %	0 %	50 %	257057942
529	NC_013161	CGA	2	6	24379	24384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057942
530	NC_013161	TCTT	2	8	24395	24402	0 %	75 %	0 %	25 %	257057942
531	NC_013161	TTG	2	6	24492	24497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057942
532	NC_013161	ACG	2	6	24578	24583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057942
533	NC_013161	CCA	2	6	24625	24630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257057942
534	NC_013161	CTT	2	6	24646	24651	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057942
535	NC_013161	GTG	2	6	24703	24708	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057942
536	NC_013161	AGC	2	6	24737	24742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057942
537	NC_013161	CTT	2	6	24898	24903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057942
538	NC_013161	TTA	2	6	24912	24917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057942
539	NC_013161	CCT	2	6	24981	24986	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057942
540	NC_013161	TTGT	2	8	25015	25022	0 %	75 %	25 %	0 %	257057942
541	NC_013161	TTCC	2	8	25069	25076	0 %	50 %	0 %	50 %	257057942
542	NC_013161	AGG	2	6	25092	25097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257057942
543	NC_013161	GCG	2	6	25127	25132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257057942
544	NC_013161	TTC	2	6	25221	25226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013161	TCT	2	6	25317	25322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013161	TAGT	2	8	25358	25365	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
547	NC_013161	CAAT	2	8	25390	25397	50 %	25 %	0 %	25 %	257057943
548	NC_013161	ATC	2	6	25448	25453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057943
549	NC_013161	GAA	2	6	25502	25507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057943
550	NC_013161	AAG	2	6	25512	25517	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057943
551	NC_013161	AACG	2	8	25540	25547	50 %	0 %	25 %	25 %	257057943
552	NC_013161	T	6	6	25636	25641	0 %	100 %	0 %	0 %	257057943
553	NC_013161	CTAT	2	8	25650	25657	25 %	50 %	0 %	25 %	257057943
554	NC_013161	A	6	6	25749	25754	100 %	0 %	0 %	0 %	257057943
555	NC_013161	A	6	6	25774	25779	100 %	0 %	0 %	0 %	257057943
556	NC_013161	TCG	2	6	25795	25800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057943
557	NC_013161	GAT	2	6	25823	25828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057943
558	NC_013161	TGA	2	6	26011	26016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057943
559	NC_013161	TGC	2	6	26088	26093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057943
560	NC_013161	ATTTAG	2	12	26119	26130	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	257057943
561	NC_013161	T	6	6	26138	26143	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013161	ATC	2	6	26160	26165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057944
563	NC_013161	TCT	2	6	26166	26171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057944
564	NC_013161	GAC	3	9	26212	26220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057944
565	NC_013161	GTTT	2	8	26283	26290	0 %	75 %	25 %	0 %	257057944
566	NC_013161	GAAA	2	8	26305	26312	75 %	0 %	25 %	0 %	257057944
567	NC_013161	ATT	2	6	26315	26320	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057944
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570	NC_013161	ATA	2	6	26399	26404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057944
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573	NC_013161	T	6	6	26488	26493	0 %	100 %	0 %	0 %	257057944
574	NC_013161	CTT	2	6	26515	26520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057944
575	NC_013161	TCT	2	6	26526	26531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057944
576	NC_013161	ACG	2	6	26564	26569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057944
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578	NC_013161	CATT	2	8	26635	26642	25 %	50 %	0 %	25 %	257057944
579	NC_013161	ATT	2	6	26798	26803	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057944
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592	NC_013161	T	8	8	27326	27333	0 %	100 %	0 %	0 %	257057944
593	NC_013161	TTG	2	6	27341	27346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057944
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596	NC_013161	ATT	2	6	27522	27527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013161	TAA	2	6	27550	27555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
598	NC_013161	TCAT	2	8	27612	27619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
599	NC_013161	T	7	7	27635	27641	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
600	NC_013161	A	7	7	27675	27681	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013161	AAT	2	6	27763	27768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013161	A	6	6	27812	27817	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
603	NC_013161	TCA	2	6	27968	27973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057945
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605	NC_013161	GTG	2	6	28030	28035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257057945
606	NC_013161	GTC	2	6	28084	28089	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057945
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608	NC_013161	CATTA	2	10	28182	28191	40 %	40 %	0 %	20 %	257057945
609	NC_013161	AAAATG	2	12	28192	28203	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	257057945
610	NC_013161	CAA	2	6	28270	28275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057945
611	NC_013161	TCT	2	6	28292	28297	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057945
612	NC_013161	ATT	2	6	28432	28437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057945
613	NC_013161	AGA	2	6	28535	28540	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057945
614	NC_013161	CGT	2	6	28597	28602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057945
615	NC_013161	AGC	2	6	28613	28618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057945
616	NC_013161	CTGTGA	2	12	28739	28750	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	257057945
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620	NC_013161	GTT	2	6	28971	28976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057945
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622	NC_013161	A	6	6	29038	29043	100 %	0 %	0 %	0 %	257057945
623	NC_013161	ATT	2	6	29126	29131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057945
624	NC_013161	GAT	2	6	29145	29150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257057945
625	NC_013161	TCTTA	2	10	29252	29261	20 %	60 %	0 %	20 %	257057945
626	NC_013161	GTT	2	6	29333	29338	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057945
627	NC_013161	GCA	2	6	29370	29375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057945
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629	NC_013161	TATTT	2	10	29493	29502	20 %	80 %	0 %	0 %	257057945
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760	NC_013161	TTC	2	6	36025	36030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057953
761	NC_013161	TAA	2	6	36057	36062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057953
762	NC_013161	TCC	2	6	36112	36117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257057953
763	NC_013161	TTG	2	6	36160	36165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057953
764	NC_013161	GGTT	2	8	36168	36175	0 %	50 %	50 %	0 %	257057953
765	NC_013161	ATTG	2	8	36273	36280	25 %	50 %	25 %	0 %	257057953
766	NC_013161	AAT	2	6	36288	36293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057953
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769	NC_013161	A	7	7	36458	36464	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
770	NC_013161	ATT	3	9	36494	36502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
771	NC_013161	T	6	6	36517	36522	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
772	NC_013161	TAC	2	6	36529	36534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
773	NC_013161	ACC	2	6	36557	36562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
774	NC_013161	GTT	2	6	36611	36616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257057954
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780	NC_013161	TAA	2	6	36951	36956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257057954
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792	NC_013161	ACA	2	6	37267	37272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257057954
793	NC_013161	GATA	2	8	37280	37287	50 %	25 %	25 %	0 %	257057954
794	NC_013161	AATA	2	8	37306	37313	75 %	25 %	0 %	0 %	257057954
795	NC_013161	CGT	2	6	37417	37422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257057954
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797	NC_013161	A	7	7	37620	37626	100 %	0 %	0 %	0 %	257057954
798	NC_013161	TAA	2	6	37666	37671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
799	NC_013161	TCAA	2	8	37690	37697	50 %	25 %	0 %	25 %	257057955
800	NC_013161	AGAT	2	8	37738	37745	50 %	25 %	25 %	0 %	257057955
801	NC_013161	GCA	2	6	37765	37770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257057955
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803	NC_013161	CTT	2	6	37850	37855	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257057955
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824	NC_013161	ATC	2	6	38773	38778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257057955
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829	NC_013161	GGAAA	2	10	38949	38958	60 %	0 %	40 %	0 %	257057956
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851	NC_013161	ATA	2	6	39671	39676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
852	NC_013161	ATG	2	6	39697	39702	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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881	NC_013161	AT	3	6	40678	40683	50 %	50 %	0 %	0 %	257057957
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885	NC_013161	CAAA	2	8	40988	40995	75 %	0 %	0 %	25 %	257057957
886	NC_013161	AGA	2	6	41036	41041	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257057957
887	NC_013161	AGACA	2	10	41061	41070	60 %	0 %	20 %	20 %	257057957
888	NC_013161	ATT	2	6	41091	41096	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257057957
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