MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
96001	NC_013161	ATTG	2	8	4665772	4665779	25 %	50 %	25 %	0 %	257062234
96002	NC_013161	TCT	2	6	4665786	4665791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062234
96003	NC_013161	TCTT	2	8	4665827	4665834	0 %	75 %	0 %	25 %	257062234
96004	NC_013161	GGTT	2	8	4665839	4665846	0 %	50 %	50 %	0 %	257062234
96005	NC_013161	TTA	2	6	4665861	4665866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062234
96006	NC_013161	GGAA	2	8	4666068	4666075	50 %	0 %	50 %	0 %	257062234
96007	NC_013161	AGT	2	6	4666089	4666094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062234
96008	NC_013161	CCTG	2	8	4666103	4666110	0 %	25 %	25 %	50 %	257062234
96009	NC_013161	T	6	6	4666176	4666181	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96010	NC_013161	TG	3	6	4666193	4666198	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96011	NC_013161	GAA	2	6	4666252	4666257	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96012	NC_013161	ATG	2	6	4666304	4666309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96013	NC_013161	TCT	2	6	4666369	4666374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96014	NC_013161	TTG	2	6	4666390	4666395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96015	NC_013161	CAA	2	6	4666472	4666477	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96016	NC_013161	TG	3	6	4666533	4666538	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96017	NC_013161	ATG	2	6	4666597	4666602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96018	NC_013161	T	6	6	4666606	4666611	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96019	NC_013161	AAT	2	6	4666645	4666650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062235
96020	NC_013161	AAT	2	6	4666658	4666663	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062235
96021	NC_013161	T	6	6	4666789	4666794	0 %	100 %	0 %	0 %	257062235
96022	NC_013161	CTT	2	6	4666800	4666805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257062235
96023	NC_013161	TAA	2	6	4666832	4666837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062235
96024	NC_013161	T	6	6	4666857	4666862	0 %	100 %	0 %	0 %	257062235
96025	NC_013161	AGGAC	2	10	4666892	4666901	40 %	0 %	40 %	20 %	257062235
96026	NC_013161	AAT	2	6	4666964	4666969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062235
96027	NC_013161	GTC	2	6	4666980	4666985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062235
96028	NC_013161	GAG	2	6	4666992	4666997	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257062235
96029	NC_013161	GA	3	6	4667015	4667020	50 %	0 %	50 %	0 %	257062235
96030	NC_013161	GAC	2	6	4667163	4667168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062235
96031	NC_013161	CAACC	2	10	4667178	4667187	40 %	0 %	0 %	60 %	257062235
96032	NC_013161	ACCATA	2	12	4667203	4667214	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257062235
96033	NC_013161	ACC	2	6	4667237	4667242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257062235
96034	NC_013161	AAC	2	6	4667290	4667295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062235
96035	NC_013161	CTTA	2	8	4667448	4667455	25 %	50 %	0 %	25 %	257062236
96036	NC_013161	TTG	2	6	4667461	4667466	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062236
96037	NC_013161	CAA	2	6	4667626	4667631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062236
96038	NC_013161	ATC	2	6	4667653	4667658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062236
96039	NC_013161	AAG	2	6	4667663	4667668	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062236
96040	NC_013161	TCC	2	6	4667688	4667693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257062236
96041	NC_013161	TGA	2	6	4667706	4667711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062236
96042	NC_013161	GGT	2	6	4667715	4667720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257062236
96043	NC_013161	TGA	2	6	4667772	4667777	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257062236
96044	NC_013161	CGC	2	6	4667779	4667784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257062236
96045	NC_013161	GCT	2	6	4667791	4667796	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062236
96046	NC_013161	TGC	2	6	4667799	4667804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257062236
96047	NC_013161	GAAC	2	8	4667895	4667902	50 %	0 %	25 %	25 %	257062236
96048	NC_013161	AAG	2	6	4667954	4667959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062236
96049	NC_013161	CAT	2	6	4667964	4667969	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257062236
96050	NC_013161	TAA	2	6	4667988	4667993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257062236
96051	NC_013161	ATTG	2	8	4668075	4668082	25 %	50 %	25 %	0 %	257062236
96052	NC_013161	TCCC	2	8	4668287	4668294	0 %	25 %	0 %	75 %	257062237
96053	NC_013161	GGATG	2	10	4668387	4668396	20 %	20 %	60 %	0 %	257062237
96054	NC_013161	GA	3	6	4668421	4668426	50 %	0 %	50 %	0 %	257062237
96055	NC_013161	GCA	2	6	4668435	4668440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257062237
96056	NC_013161	TCAA	2	8	4668483	4668490	50 %	25 %	0 %	25 %	257062237
96057	NC_013161	TTG	2	6	4668533	4668538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062237
96058	NC_013161	TAA	2	6	4668618	4668623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96059	NC_013161	AG	3	6	4668707	4668712	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96060	NC_013161	GTT	2	6	4668732	4668737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257062238
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96063	NC_013161	TTA	2	6	4668822	4668827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257062238
96064	NC_013161	TTAT	2	8	4668854	4668861	25 %	75 %	0 %	0 %	257062238
96065	NC_013161	ACA	2	6	4668874	4668879	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257062238
96066	NC_013161	A	7	7	4668892	4668898	100 %	0 %	0 %	0 %	257062238
96067	NC_013161	A	6	6	4668944	4668949	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96068	NC_013161	AGC	2	6	4668998	4669003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
96069	NC_013161	CAT	2	6	4669004	4669009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96070	NC_013161	TAA	2	6	4669060	4669065	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96071	NC_013161	GAA	2	6	4669096	4669101	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96072	NC_013161	GAT	2	6	4669128	4669133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96073	NC_013161	AAG	2	6	4669162	4669167	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96074	NC_013161	AGA	2	6	4669208	4669213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257062239
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96084	NC_013161	CGG	2	6	4669798	4669803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.