MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6001	NC_013161	ACTT	2	8	288905	288912	25 %	50 %	0 %	25 %	257058209
6002	NC_013161	ATT	2	6	288925	288930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058209
6003	NC_013161	TGC	2	6	288958	288963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058209
6004	NC_013161	ACC	2	6	288996	289001	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058209
6005	NC_013161	AATC	2	8	289041	289048	50 %	25 %	0 %	25 %	257058209
6006	NC_013161	GAT	2	6	289103	289108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058209
6007	NC_013161	AGG	2	6	289126	289131	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058209
6008	NC_013161	ATA	3	9	289206	289214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058209
6009	NC_013161	GGA	2	6	289217	289222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058209
6010	NC_013161	TCA	2	6	289261	289266	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058209
6011	NC_013161	GAA	2	6	289271	289276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058209
6012	NC_013161	CAA	2	6	289340	289345	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058209
6013	NC_013161	ATT	2	6	289349	289354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058209
6014	NC_013161	CTT	2	6	289362	289367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058209
6015	NC_013161	TAA	2	6	289402	289407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058209
6016	NC_013161	TCC	2	6	289420	289425	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058209
6017	NC_013161	AATC	2	8	289427	289434	50 %	25 %	0 %	25 %	257058209
6018	NC_013161	TAA	2	6	289537	289542	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058209
6019	NC_013161	AAAATA	2	12	289563	289574	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	257058209
6020	NC_013161	TCTT	2	8	289581	289588	0 %	75 %	0 %	25 %	257058209
6021	NC_013161	TAA	3	9	289615	289623	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058209
6022	NC_013161	TTC	2	6	289626	289631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058209
6023	NC_013161	ATT	2	6	289641	289646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058209
6024	NC_013161	CT	3	6	289694	289699	0 %	50 %	0 %	50 %	257058210
6025	NC_013161	GAA	2	6	289701	289706	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058210
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6027	NC_013161	AGC	2	6	289823	289828	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058210
6028	NC_013161	AGTT	2	8	289858	289865	25 %	50 %	25 %	0 %	257058210
6029	NC_013161	ATT	2	6	289980	289985	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058210
6030	NC_013161	TTA	2	6	290085	290090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058210
6031	NC_013161	GAA	2	6	290103	290108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058210
6032	NC_013161	C	6	6	290112	290117	0 %	0 %	0 %	100 %	257058210
6033	NC_013161	GATT	2	8	290240	290247	25 %	50 %	25 %	0 %	257058210
6034	NC_013161	ACC	2	6	290286	290291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058210
6035	NC_013161	CCA	2	6	290403	290408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058211
6036	NC_013161	AGG	2	6	290414	290419	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058211
6037	NC_013161	GAA	2	6	290428	290433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058211
6038	NC_013161	CATAA	2	10	290466	290475	60 %	20 %	0 %	20 %	257058211
6039	NC_013161	CGA	2	6	290507	290512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058211
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6041	NC_013161	A	6	6	290593	290598	100 %	0 %	0 %	0 %	257058211
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6043	NC_013161	GTTC	2	8	290643	290650	0 %	50 %	25 %	25 %	257058211
6044	NC_013161	TC	3	6	290649	290654	0 %	50 %	0 %	50 %	257058211
6045	NC_013161	A	6	6	290699	290704	100 %	0 %	0 %	0 %	257058211
6046	NC_013161	TTA	2	6	290713	290718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058211
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6052	NC_013161	CAT	2	6	291048	291053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058211
6053	NC_013161	GATTA	2	10	291070	291079	40 %	40 %	20 %	0 %	257058211
6054	NC_013161	T	8	8	291103	291110	0 %	100 %	0 %	0 %	257058211
6055	NC_013161	AAG	2	6	291115	291120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058211
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6058	NC_013161	TGT	2	6	291347	291352	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058211
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6060	NC_013161	AAC	2	6	291466	291471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058211
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6063	NC_013161	GAA	2	6	291516	291521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058211
6064	NC_013161	GGGT	2	8	291583	291590	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
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6067	NC_013161	TCAAT	2	10	291825	291834	40 %	40 %	0 %	20 %	257058212
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6075	NC_013161	A	6	6	292053	292058	100 %	0 %	0 %	0 %	257058212
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6082	NC_013161	AG	3	6	292311	292316	50 %	0 %	50 %	0 %	257058212
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6094	NC_013161	TAA	2	6	292783	292788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6095	NC_013161	CAA	2	6	292815	292820	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6096	NC_013161	TGT	2	6	292855	292860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6097	NC_013161	TG	3	6	292886	292891	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6098	NC_013161	TTA	2	6	292927	292932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6099	NC_013161	ATTC	2	8	293160	293167	25 %	50 %	0 %	25 %	257058213
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6113	NC_013161	TCAAG	2	10	294170	294179	40 %	20 %	20 %	20 %	257058214
6114	NC_013161	CAAA	2	8	294194	294201	75 %	0 %	0 %	25 %	257058214
6115	NC_013161	GCA	2	6	294264	294269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058214
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6117	NC_013161	TGA	2	6	294283	294288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6118	NC_013161	GCT	2	6	294385	294390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058215
6119	NC_013161	TCCAAG	2	12	294486	294497	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	257058215
6120	NC_013161	GGC	2	6	294603	294608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058215
6121	NC_013161	T	6	6	294625	294630	0 %	100 %	0 %	0 %	257058215
6122	NC_013161	CGCC	2	8	294640	294647	0 %	0 %	25 %	75 %	257058215
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6124	NC_013161	CAGGT	2	10	294690	294699	20 %	20 %	40 %	20 %	257058215
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6249	NC_013161	CTT	2	6	300337	300342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058218
6250	NC_013161	TCA	2	6	300343	300348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058218
6251	NC_013161	AAC	2	6	300353	300358	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058218
6252	NC_013161	GGAT	2	8	300375	300382	25 %	25 %	50 %	0 %	257058218
6253	NC_013161	TTTC	2	8	300384	300391	0 %	75 %	0 %	25 %	257058218
6254	NC_013161	TTC	2	6	300395	300400	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058218
6255	NC_013161	TGA	2	6	300413	300418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058218
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6261	NC_013161	TCT	3	9	300669	300677	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058218
6262	NC_013161	T	6	6	300707	300712	0 %	100 %	0 %	0 %	257058218
6263	NC_013161	TAC	2	6	300769	300774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058218
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6267	NC_013161	ATA	2	6	300931	300936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058218
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6269	NC_013161	TC	3	6	301037	301042	0 %	50 %	0 %	50 %	257058218
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6271	NC_013161	TCTT	2	8	301071	301078	0 %	75 %	0 %	25 %	257058218
6272	NC_013161	ACTCAA	2	12	301108	301119	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	257058218
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6274	NC_013161	ATTG	2	8	301201	301208	25 %	50 %	25 %	0 %	257058218
6275	NC_013161	CAAA	2	8	301231	301238	75 %	0 %	0 %	25 %	257058218
6276	NC_013161	ATT	3	9	301259	301267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058218
6277	NC_013161	ATC	2	6	301421	301426	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058218
6278	NC_013161	TGT	3	9	301540	301548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6279	NC_013161	TTG	2	6	301571	301576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6280	NC_013161	CT	4	8	301624	301631	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6281	NC_013161	TC	3	6	301634	301639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6282	NC_013161	CA	3	6	301662	301667	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6283	NC_013161	A	8	8	301734	301741	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6284	NC_013161	AC	4	8	301798	301805	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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6287	NC_013161	GCC	2	6	301946	301951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058219
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6294	NC_013161	GGGTTA	2	12	302213	302224	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	257058219
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6314	NC_013161	TCAA	2	8	303352	303359	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
6315	NC_013161	CTGC	2	8	303389	303396	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6316	NC_013161	TGC	2	6	303403	303408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058220
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6341	NC_013161	TGT	2	6	304476	304481	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6351	NC_013161	TTTGT	2	10	304985	304994	0 %	80 %	20 %	0 %	257058222
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6354	NC_013161	TAA	2	6	305066	305071	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6355	NC_013161	AGTTT	2	10	305105	305114	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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6359	NC_013161	ATA	2	6	305310	305315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6360	NC_013161	TGG	2	6	305333	305338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6361	NC_013161	TTA	2	6	305374	305379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6362	NC_013161	T	6	6	305398	305403	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6363	NC_013161	CTG	2	6	305459	305464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6365	NC_013161	ATT	2	6	305580	305585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6366	NC_013161	AAT	2	6	305619	305624	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6367	NC_013161	GATT	2	8	305703	305710	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
6368	NC_013161	TAA	2	6	305726	305731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6369	NC_013161	A	6	6	305760	305765	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6370	NC_013161	GAC	2	6	305831	305836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6371	NC_013161	T	6	6	305900	305905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6372	NC_013161	TTCT	2	8	305931	305938	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
6373	NC_013161	CCA	2	6	306027	306032	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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