MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_013161	AATATT	2	12	241886	241897	50 %	50 %	0 %	0 %	257058172
5002	NC_013161	TGC	2	6	241932	241937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058172
5003	NC_013161	ATC	2	6	242040	242045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058172
5004	NC_013161	AAC	2	6	242100	242105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058172
5005	NC_013161	AG	3	6	242141	242146	50 %	0 %	50 %	0 %	257058172
5006	NC_013161	GCA	2	6	242211	242216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058172
5007	NC_013161	T	6	6	242249	242254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_013161	ATT	2	6	242302	242307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_013161	AAC	2	6	242401	242406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5010	NC_013161	TAT	2	6	242415	242420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_013161	CCA	2	6	242437	242442	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5012	NC_013161	ACC	2	6	242446	242451	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5013	NC_013161	A	6	6	242661	242666	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5014	NC_013161	TC	3	6	242692	242697	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5015	NC_013161	ATC	2	6	242756	242761	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058173
5016	NC_013161	TTG	2	6	242764	242769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058173
5017	NC_013161	TCA	2	6	242846	242851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058173
5018	NC_013161	AGA	2	6	242894	242899	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058173
5019	NC_013161	CAA	2	6	242931	242936	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058173
5020	NC_013161	GCG	2	6	242949	242954	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058173
5021	NC_013161	GCG	2	6	243003	243008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058173
5022	NC_013161	CGG	2	6	243079	243084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058173
5023	NC_013161	A	6	6	243198	243203	100 %	0 %	0 %	0 %	257058173
5024	NC_013161	CAA	2	6	243348	243353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058173
5025	NC_013161	T	7	7	243359	243365	0 %	100 %	0 %	0 %	257058173
5026	NC_013161	ATC	2	6	243436	243441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058173
5027	NC_013161	GTC	2	6	243487	243492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058173
5028	NC_013161	ATG	2	6	243495	243500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058173
5029	NC_013161	CTGT	2	8	243729	243736	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5030	NC_013161	AAG	2	6	243750	243755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5031	NC_013161	GTCAT	2	10	243815	243824	20 %	40 %	20 %	20 %	257058174
5032	NC_013161	TTA	2	6	243844	243849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058174
5033	NC_013161	AGT	2	6	243946	243951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058174
5034	NC_013161	TTC	2	6	243962	243967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058174
5035	NC_013161	TCC	2	6	244026	244031	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058174
5036	NC_013161	T	6	6	244044	244049	0 %	100 %	0 %	0 %	257058174
5037	NC_013161	ATC	2	6	244109	244114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058174
5038	NC_013161	ACT	2	6	244119	244124	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058174
5039	NC_013161	ATT	2	6	244150	244155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058174
5040	NC_013161	AGA	2	6	244212	244217	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058174
5041	NC_013161	TTG	2	6	244246	244251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058174
5042	NC_013161	CGA	2	6	244360	244365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058174
5043	NC_013161	CT	4	8	244366	244373	0 %	50 %	0 %	50 %	257058174
5044	NC_013161	ATT	2	6	244447	244452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058174
5045	NC_013161	CA	3	6	244503	244508	50 %	0 %	0 %	50 %	257058174
5046	NC_013161	TTA	2	6	244571	244576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058174
5047	NC_013161	CTTT	2	8	244617	244624	0 %	75 %	0 %	25 %	257058174
5048	NC_013161	CCT	2	6	244659	244664	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058174
5049	NC_013161	TATT	2	8	244692	244699	25 %	75 %	0 %	0 %	257058174
5050	NC_013161	TAA	2	6	244872	244877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_013161	AAC	2	6	244923	244928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_013161	AAT	3	9	245144	245152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_013161	TGT	2	6	245160	245165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_013161	ATA	2	6	245166	245171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_013161	TA	3	6	245173	245178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_013161	AGT	2	6	245260	245265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058175
5057	NC_013161	GCT	2	6	245395	245400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058175
5058	NC_013161	GAT	2	6	245428	245433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058175
5059	NC_013161	CAT	2	6	245458	245463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058175
5060	NC_013161	TTC	2	6	245474	245479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058175
5061	NC_013161	TGA	2	6	245556	245561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058175
5062	NC_013161	AGC	2	6	245586	245591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058175
5063	NC_013161	GGA	2	6	245776	245781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058175
5064	NC_013161	ATCTT	2	10	245873	245882	20 %	60 %	0 %	20 %	257058175
5065	NC_013161	ATTGA	2	10	245947	245956	40 %	40 %	20 %	0 %	257058175
5066	NC_013161	AC	3	6	246066	246071	50 %	0 %	0 %	50 %	257058175
5067	NC_013161	GAT	2	6	246097	246102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058175
5068	NC_013161	A	6	6	246134	246139	100 %	0 %	0 %	0 %	257058175
5069	NC_013161	ATC	2	6	246148	246153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058175
5070	NC_013161	GCA	3	9	246271	246279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058175
5071	NC_013161	TAC	2	6	246287	246292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058175
5072	NC_013161	GCT	2	6	246334	246339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058175
5073	NC_013161	GA	3	6	246350	246355	50 %	0 %	50 %	0 %	257058175
5074	NC_013161	GAA	2	6	246379	246384	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058175
5075	NC_013161	GAA	2	6	246391	246396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058175
5076	NC_013161	ACC	2	6	246438	246443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058175
5077	NC_013161	AAC	2	6	246458	246463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058175
5078	NC_013161	ATCA	2	8	246495	246502	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5079	NC_013161	ACA	2	6	246511	246516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5080	NC_013161	ATA	2	6	246520	246525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_013161	ATT	2	6	246554	246559	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5082	NC_013161	TTC	2	6	246567	246572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_013161	CATT	2	8	246573	246580	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5084	NC_013161	ATT	2	6	246584	246589	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5085	NC_013161	AGA	2	6	246608	246613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5086	NC_013161	TTG	2	6	246636	246641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5087	NC_013161	A	6	6	246666	246671	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5088	NC_013161	CAC	2	6	246719	246724	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5089	NC_013161	AAT	2	6	246726	246731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5090	NC_013161	AT	3	6	246739	246744	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5091	NC_013161	TTA	2	6	246793	246798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5092	NC_013161	ATT	2	6	246837	246842	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5093	NC_013161	AG	3	6	246849	246854	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5094	NC_013161	TAA	2	6	246887	246892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5095	NC_013161	AGC	3	9	247005	247013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058176
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5098	NC_013161	TGC	2	6	247173	247178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058176
5099	NC_013161	CTT	2	6	247202	247207	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058176
5100	NC_013161	ACC	2	6	247237	247242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058176
5101	NC_013161	CAG	2	6	247352	247357	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058176
5102	NC_013161	CTG	2	6	247426	247431	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058176
5103	NC_013161	TGA	2	6	247501	247506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058176
5104	NC_013161	TCC	2	6	247509	247514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058176
5105	NC_013161	TTGA	2	8	247524	247531	25 %	50 %	25 %	0 %	257058176
5106	NC_013161	TCA	2	6	247549	247554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058176
5107	NC_013161	GCT	2	6	247576	247581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058176
5108	NC_013161	CAT	2	6	247604	247609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058176
5109	NC_013161	TGC	2	6	247662	247667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058176
5110	NC_013161	GAC	2	6	247679	247684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058176
5111	NC_013161	CTT	3	9	247706	247714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058176
5112	NC_013161	CAA	2	6	247733	247738	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058176
5113	NC_013161	TGA	2	6	247746	247751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058176
5114	NC_013161	CCT	2	6	247758	247763	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058176
5115	NC_013161	ATA	2	6	247828	247833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058176
5116	NC_013161	TAA	2	6	247846	247851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5117	NC_013161	CAA	2	6	247870	247875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5118	NC_013161	AAC	2	6	247876	247881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5119	NC_013161	AAT	2	6	247933	247938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5120	NC_013161	GCT	2	6	247953	247958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5121	NC_013161	TCA	2	6	247999	248004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5122	NC_013161	TGA	2	6	248128	248133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058177
5123	NC_013161	GCA	2	6	248149	248154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058177
5124	NC_013161	T	6	6	248206	248211	0 %	100 %	0 %	0 %	257058177
5125	NC_013161	TCC	2	6	248329	248334	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	257058177
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5138	NC_013161	ATA	2	6	248714	248719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5231	NC_013161	CTAGT	2	10	253783	253792	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
5232	NC_013161	TAT	2	6	253813	253818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5233	NC_013161	AGT	2	6	253819	253824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_013161	TTG	2	6	253847	253852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_013161	TCCT	2	8	253931	253938	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5236	NC_013161	TA	3	6	253972	253977	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5237	NC_013161	CAA	2	6	253992	253997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5238	NC_013161	TAT	2	6	254050	254055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_013161	AAAT	2	8	254056	254063	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5240	NC_013161	ATTA	2	8	254070	254077	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5241	NC_013161	AGG	2	6	254122	254127	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5242	NC_013161	TCT	2	6	254138	254143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5243	NC_013161	A	8	8	254151	254158	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5244	NC_013161	TTAAG	2	10	254173	254182	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
5245	NC_013161	AT	3	6	254256	254261	50 %	50 %	0 %	0 %	257058183
5246	NC_013161	AACAA	2	10	254354	254363	80 %	0 %	0 %	20 %	257058183
5247	NC_013161	CTA	2	6	254445	254450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_013161	GT	3	6	254454	254459	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_013161	TAAG	2	8	254477	254484	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5250	NC_013161	CA	3	6	254485	254490	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5251	NC_013161	ATTA	2	8	254493	254500	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5252	NC_013161	GTAGG	2	10	254511	254520	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
5253	NC_013161	AAT	2	6	254531	254536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5254	NC_013161	AATT	2	8	254583	254590	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5255	NC_013161	TTA	2	6	254603	254608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5256	NC_013161	ACTG	2	8	254616	254623	25 %	25 %	25 %	25 %	257058184
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5280	NC_013161	TTA	2	6	255564	255569	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5375	NC_013161	ATC	2	6	259797	259802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058188
5376	NC_013161	TTG	2	6	259808	259813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058188
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5381	NC_013161	GGAG	2	8	260068	260075	25 %	0 %	75 %	0 %	257058188
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5385	NC_013161	GA	3	6	260186	260191	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5386	NC_013161	CTC	2	6	260263	260268	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5387	NC_013161	ATAG	2	8	260284	260291	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5388	NC_013161	ATT	2	6	260328	260333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5389	NC_013161	ATTC	2	8	260429	260436	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5390	NC_013161	TATCCC	2	12	260457	260468	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
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5432	NC_013161	CAGT	2	8	262522	262529	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5475	NC_013161	CCCGT	2	10	264503	264512	0 %	20 %	20 %	60 %	257058192
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5492	NC_013161	T	6	6	265652	265657	0 %	100 %	0 %	0 %	257058192
5493	NC_013161	CAAGGA	2	12	265664	265675	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	257058192
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5495	NC_013161	ACT	2	6	265888	265893	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058192
5496	NC_013161	ATG	3	9	265932	265940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058192
5497	NC_013161	ATA	2	6	265941	265946	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058192
5498	NC_013161	TGGCAA	2	12	265994	266005	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257058192
5499	NC_013161	CTGA	2	8	266048	266055	25 %	25 %	25 %	25 %	257058192
5500	NC_013161	G	6	6	266065	266070	0 %	0 %	100 %	0 %	257058192

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