MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 8802 chromosome

Total Repeats: 96084

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_013161	ATTT	2	8	216453	216460	25 %	75 %	0 %	0 %	257058136
4502	NC_013161	T	6	6	216470	216475	0 %	100 %	0 %	0 %	257058136
4503	NC_013161	ATCA	2	8	216545	216552	50 %	25 %	0 %	25 %	257058136
4504	NC_013161	GAT	2	6	216653	216658	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058136
4505	NC_013161	AATT	2	8	216719	216726	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4506	NC_013161	TTA	2	6	216730	216735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_013161	TTC	2	6	216829	216834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058137
4508	NC_013161	CA	3	6	216908	216913	50 %	0 %	0 %	50 %	257058137
4509	NC_013161	AAT	2	6	217061	217066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058137
4510	NC_013161	GTT	2	6	217231	217236	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058138
4511	NC_013161	TGG	2	6	217242	217247	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058138
4512	NC_013161	CAA	2	6	217336	217341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058138
4513	NC_013161	TC	3	6	217343	217348	0 %	50 %	0 %	50 %	257058138
4514	NC_013161	C	6	6	217391	217396	0 %	0 %	0 %	100 %	257058138
4515	NC_013161	CGA	2	6	217413	217418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058138
4516	NC_013161	AAT	2	6	217472	217477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058138
4517	NC_013161	G	6	6	217501	217506	0 %	0 %	100 %	0 %	257058138
4518	NC_013161	T	6	6	217521	217526	0 %	100 %	0 %	0 %	257058138
4519	NC_013161	GTA	2	6	217645	217650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_013161	T	7	7	217682	217688	0 %	100 %	0 %	0 %	257058139
4521	NC_013161	GAA	2	6	217733	217738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058139
4522	NC_013161	TTGA	2	8	217747	217754	25 %	50 %	25 %	0 %	257058139
4523	NC_013161	AGG	2	6	217789	217794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058139
4524	NC_013161	AACC	2	8	217812	217819	50 %	0 %	0 %	50 %	257058139
4525	NC_013161	GTT	2	6	217869	217874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	257058139
4526	NC_013161	CAA	2	6	217945	217950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058139
4527	NC_013161	TCG	2	6	218053	218058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058139
4528	NC_013161	CGC	2	6	218077	218082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058139
4529	NC_013161	TGC	2	6	218117	218122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058139
4530	NC_013161	TAA	2	6	218150	218155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058139
4531	NC_013161	TAGGT	2	10	218179	218188	20 %	40 %	40 %	0 %	257058139
4532	NC_013161	GCT	2	6	218190	218195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058139
4533	NC_013161	TC	3	6	218421	218426	0 %	50 %	0 %	50 %	257058139
4534	NC_013161	GTACG	2	10	218463	218472	20 %	20 %	40 %	20 %	257058139
4535	NC_013161	TTGCCA	2	12	218482	218493	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	257058139
4536	NC_013161	AAT	2	6	218612	218617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058140
4537	NC_013161	GCT	2	6	218766	218771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058140
4538	NC_013161	TGG	2	6	218839	218844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058140
4539	NC_013161	CTG	2	6	218908	218913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058140
4540	NC_013161	TAA	2	6	218921	218926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058140
4541	NC_013161	TGA	2	6	218940	218945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058140
4542	NC_013161	T	6	6	218953	218958	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4543	NC_013161	GGGTA	2	10	219058	219067	20 %	20 %	60 %	0 %	257058141
4544	NC_013161	CTT	2	6	219099	219104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058141
4545	NC_013161	TCT	2	6	219143	219148	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058141
4546	NC_013161	TAA	2	6	219160	219165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058141
4547	NC_013161	TTC	2	6	219229	219234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058141
4548	NC_013161	TCG	2	6	219260	219265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058141
4549	NC_013161	GTG	2	6	219281	219286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058141
4550	NC_013161	CCA	2	6	219327	219332	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058141
4551	NC_013161	CAG	2	6	219339	219344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058141
4552	NC_013161	CGA	2	6	219441	219446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058141
4553	NC_013161	CCACTT	2	12	219621	219632	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	257058141
4554	NC_013161	GGC	2	6	219687	219692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058141
4555	NC_013161	TTTC	2	8	219729	219736	0 %	75 %	0 %	25 %	257058141
4556	NC_013161	CT	3	6	219763	219768	0 %	50 %	0 %	50 %	257058141
4557	NC_013161	CGG	2	6	219825	219830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	257058141
4558	NC_013161	CGT	2	6	219857	219862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058141
4559	NC_013161	GGT	2	6	219877	219882	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	257058141
4560	NC_013161	TGA	2	6	220150	220155	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_013161	CGT	2	6	220173	220178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058142
4562	NC_013161	GAC	2	6	220186	220191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058142
4563	NC_013161	GCA	2	6	220365	220370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058142
4564	NC_013161	T	6	6	220382	220387	0 %	100 %	0 %	0 %	257058142
4565	NC_013161	TAT	2	6	220465	220470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058142
4566	NC_013161	T	7	7	220520	220526	0 %	100 %	0 %	0 %	257058142
4567	NC_013161	T	7	7	220534	220540	0 %	100 %	0 %	0 %	257058142
4568	NC_013161	TAA	2	6	220597	220602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4569	NC_013161	ATT	2	6	220606	220611	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058143
4570	NC_013161	T	6	6	220625	220630	0 %	100 %	0 %	0 %	257058143
4571	NC_013161	TCG	2	6	220649	220654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058143
4572	NC_013161	TGACGA	2	12	220710	220721	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	257058143
4573	NC_013161	CTT	2	6	220834	220839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058143
4574	NC_013161	GA	3	6	220908	220913	50 %	0 %	50 %	0 %	257058143
4575	NC_013161	GTT	2	6	220991	220996	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_013161	GTT	2	6	221025	221030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_013161	GAA	2	6	221044	221049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4578	NC_013161	GCT	2	6	221058	221063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_013161	ATG	3	9	221064	221072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_013161	ATCACC	2	12	221114	221125	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	257058144
4581	NC_013161	TCG	2	6	221134	221139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058144
4582	NC_013161	CA	3	6	221157	221162	50 %	0 %	0 %	50 %	257058144
4583	NC_013161	T	7	7	221163	221169	0 %	100 %	0 %	0 %	257058144
4584	NC_013161	TTA	3	9	221219	221227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_013161	T	8	8	221266	221273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4586	NC_013161	CTT	2	6	221311	221316	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058145
4587	NC_013161	TTC	2	6	221337	221342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058145
4588	NC_013161	ACG	2	6	221410	221415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058145
4589	NC_013161	TTCC	2	8	221502	221509	0 %	50 %	0 %	50 %	257058145
4590	NC_013161	ATCT	2	8	221570	221577	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4591	NC_013161	TCT	2	6	221581	221586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4592	NC_013161	TTC	2	6	221635	221640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_013161	CTC	2	6	221670	221675	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4594	NC_013161	TAACA	2	10	221686	221695	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
4595	NC_013161	GAC	2	6	221745	221750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058146
4596	NC_013161	TAA	2	6	221800	221805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058146
4597	NC_013161	TCA	2	6	221911	221916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058146
4598	NC_013161	A	6	6	221977	221982	100 %	0 %	0 %	0 %	257058146
4599	NC_013161	GACC	2	8	222040	222047	25 %	0 %	25 %	50 %	257058146
4600	NC_013161	TCA	2	6	222079	222084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058146
4601	NC_013161	TC	3	6	222164	222169	0 %	50 %	0 %	50 %	257058146
4602	NC_013161	A	7	7	222247	222253	100 %	0 %	0 %	0 %	257058146
4603	NC_013161	A	6	6	222311	222316	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_013161	TCA	2	6	222321	222326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4605	NC_013161	TTTG	2	8	222406	222413	0 %	75 %	25 %	0 %	257058147
4606	NC_013161	CTA	2	6	222433	222438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058147
4607	NC_013161	AGA	2	6	222444	222449	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058147
4608	NC_013161	ACA	2	6	222519	222524	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	257058147
4609	NC_013161	A	7	7	222528	222534	100 %	0 %	0 %	0 %	257058147
4610	NC_013161	AAG	2	6	222543	222548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058147
4611	NC_013161	T	6	6	222586	222591	0 %	100 %	0 %	0 %	257058147
4612	NC_013161	A	6	6	222686	222691	100 %	0 %	0 %	0 %	257058147
4613	NC_013161	A	6	6	222791	222796	100 %	0 %	0 %	0 %	257058147
4614	NC_013161	GA	3	6	222803	222808	50 %	0 %	50 %	0 %	257058147
4615	NC_013161	AAT	2	6	222839	222844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058147
4616	NC_013161	GAC	2	6	222919	222924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4617	NC_013161	AAT	2	6	222932	222937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058147
4618	NC_013161	AAG	2	6	222990	222995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	257058147
4619	NC_013161	AGG	2	6	223002	223007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	257058147
4620	NC_013161	ACC	2	6	223011	223016	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	257058147
4621	NC_013161	GAC	2	6	223030	223035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
4622	NC_013161	TGA	2	6	223141	223146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	257058147
4623	NC_013161	CCG	2	6	223177	223182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	257058147
4624	NC_013161	ACG	2	6	223203	223208	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	257058147
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4626	NC_013161	TAA	2	6	223241	223246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	257058147
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4633	NC_013161	CTG	3	9	223491	223499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058147
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4638	NC_013161	ATT	2	6	223716	223721	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	257058148
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4743	NC_013161	TCT	2	6	229232	229237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	257058159
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4997	NC_013161	C	6	6	241737	241742	0 %	0 %	0 %	100 %	257058172
4998	NC_013161	ACT	2	6	241808	241813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	257058172
4999	NC_013161	TCG	2	6	241822	241827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	257058172
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