MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 6043

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013132	GCAGG	2	10	595	604	20 %	0 %	60 %	20 %	256419058
2	NC_013132	AGAAA	2	10	1197	1206	80 %	0 %	20 %	0 %	256419058
3	NC_013132	GCGCA	2	10	1919	1928	20 %	0 %	40 %	40 %	256419059
4	NC_013132	ATCAG	2	10	2188	2197	40 %	20 %	20 %	20 %	256419059
5	NC_013132	GCATG	2	10	3024	3033	20 %	20 %	40 %	20 %	256419060
6	NC_013132	GTTCC	2	10	5574	5583	0 %	40 %	20 %	40 %	256419061
7	NC_013132	TTCCA	2	10	7693	7702	20 %	40 %	0 %	40 %	256419062
8	NC_013132	CTGAA	2	10	8601	8610	40 %	20 %	20 %	20 %	256419062
9	NC_013132	CTGAA	2	10	10372	10381	40 %	20 %	20 %	20 %	256419063
10	NC_013132	TCAAA	2	10	11218	11227	60 %	20 %	0 %	20 %	256419064
11	NC_013132	AATCA	2	10	11832	11841	60 %	20 %	0 %	20 %	256419065
12	NC_013132	ATACA	2	10	14099	14108	60 %	20 %	0 %	20 %	256419067
13	NC_013132	CTTCC	2	10	18772	18781	0 %	40 %	0 %	60 %	256419072
14	NC_013132	GGACA	2	10	19037	19046	40 %	0 %	40 %	20 %	256419072
15	NC_013132	AGACG	2	10	19904	19913	40 %	0 %	40 %	20 %	256419073
16	NC_013132	CTTTG	2	10	20577	20586	0 %	60 %	20 %	20 %	256419074
17	NC_013132	ACCAG	2	10	22087	22096	40 %	0 %	20 %	40 %	256419074
18	NC_013132	TGTAC	2	10	23517	23526	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
19	NC_013132	AAAAG	2	10	23704	23713	80 %	0 %	20 %	0 %	256419076
20	NC_013132	CTTCC	2	10	27858	27867	0 %	40 %	0 %	60 %	256419079
21	NC_013132	TCTCC	2	10	29779	29788	0 %	40 %	0 %	60 %	256419082
22	NC_013132	CTCAG	2	10	31371	31380	20 %	20 %	20 %	40 %	256419082
23	NC_013132	ATAAA	2	10	31777	31786	80 %	20 %	0 %	0 %	256419082
24	NC_013132	AAATT	2	10	32397	32406	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013132	GATCA	2	10	34118	34127	40 %	20 %	20 %	20 %	256419086
26	NC_013132	CAGCG	2	10	34261	34270	20 %	0 %	40 %	40 %	256419086
27	NC_013132	ATAGG	2	10	37765	37774	40 %	20 %	40 %	0 %	256419088
28	NC_013132	CTTTT	2	10	38144	38153	0 %	80 %	0 %	20 %	256419088
29	NC_013132	AAATC	2	10	40110	40119	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_013132	AACAA	2	10	41028	41037	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
31	NC_013132	TTAAC	2	10	41480	41489	40 %	40 %	0 %	20 %	256419090
32	NC_013132	GCTAT	2	10	43627	43636	20 %	40 %	20 %	20 %	256419092
33	NC_013132	GACCA	2	10	43773	43782	40 %	0 %	20 %	40 %	256419092
34	NC_013132	TCACA	2	10	45196	45205	40 %	20 %	0 %	40 %	256419093
35	NC_013132	CATTG	2	10	45794	45803	20 %	40 %	20 %	20 %	256419094
36	NC_013132	AAGTT	2	10	46976	46985	40 %	40 %	20 %	0 %	256419095
37	NC_013132	CCATT	2	10	47723	47732	20 %	40 %	0 %	40 %	256419095
38	NC_013132	ATACA	2	10	48070	48079	60 %	20 %	0 %	20 %	256419095
39	NC_013132	TAAAA	2	10	48708	48717	80 %	20 %	0 %	0 %	256419095
40	NC_013132	CAAAT	2	10	48919	48928	60 %	20 %	0 %	20 %	256419095
41	NC_013132	GATAA	2	10	49031	49040	60 %	20 %	20 %	0 %	256419095
42	NC_013132	AAAAT	2	10	49256	49265	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_013132	ATAAC	2	10	50963	50972	60 %	20 %	0 %	20 %	256419097
44	NC_013132	AAATC	2	10	52564	52573	60 %	20 %	0 %	20 %	256419097
45	NC_013132	CAACT	2	10	55592	55601	40 %	20 %	0 %	40 %	256419099
46	NC_013132	CGGAA	2	10	55744	55753	40 %	0 %	40 %	20 %	256419099
47	NC_013132	AGGAT	2	10	58755	58764	40 %	20 %	40 %	0 %	256419103
48	NC_013132	ACTAT	2	10	58955	58964	40 %	40 %	0 %	20 %	256419103
49	NC_013132	CCATC	2	10	59537	59546	20 %	20 %	0 %	60 %	256419103
50	NC_013132	TCGCC	2	10	59776	59785	0 %	20 %	20 %	60 %	256419103
51	NC_013132	TCATT	2	10	61558	61567	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
52	NC_013132	ACAAT	2	10	61639	61648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
53	NC_013132	ACTTA	2	10	61796	61805	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_013132	AGTAT	2	10	64231	64240	40 %	40 %	20 %	0 %	256419107
55	NC_013132	GTGTT	2	10	65614	65623	0 %	60 %	40 %	0 %	256419108
56	NC_013132	GGGAC	2	10	65911	65920	20 %	0 %	60 %	20 %	256419108
57	NC_013132	GGATA	2	10	67273	67282	40 %	20 %	40 %	0 %	256419110
58	NC_013132	GGTAC	2	10	68063	68072	20 %	20 %	40 %	20 %	256419110
59	NC_013132	TTCTC	2	10	74569	74578	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
60	NC_013132	AAAGG	2	10	75547	75556	60 %	0 %	40 %	0 %	256419115
61	NC_013132	CCAGG	2	10	77795	77804	20 %	0 %	40 %	40 %	256419116
62	NC_013132	TTCCC	2	10	77962	77971	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
63	NC_013132	TTAGC	2	10	77978	77987	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
64	NC_013132	CGTAT	2	10	78667	78676	20 %	40 %	20 %	20 %	256419117
65	NC_013132	CATCC	2	10	83978	83987	20 %	20 %	0 %	60 %	256419121
66	NC_013132	TACAC	2	10	85125	85134	40 %	20 %	0 %	40 %	256419122
67	NC_013132	CACCG	2	10	86326	86335	20 %	0 %	20 %	60 %	256419124
68	NC_013132	CCGTA	2	10	86526	86535	20 %	20 %	20 %	40 %	256419124
69	NC_013132	CCCGT	2	10	92352	92361	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
70	NC_013132	ATCAT	2	10	93174	93183	40 %	40 %	0 %	20 %	256419133
71	NC_013132	CGTAG	2	10	93188	93197	20 %	20 %	40 %	20 %	256419133
72	NC_013132	GAAGA	2	10	97789	97798	60 %	0 %	40 %	0 %	256419136
73	NC_013132	TTCTT	2	10	102788	102797	0 %	80 %	0 %	20 %	256419139
74	NC_013132	TGATC	2	10	102867	102876	20 %	40 %	20 %	20 %	256419139
75	NC_013132	TACAT	2	10	103622	103631	40 %	40 %	0 %	20 %	256419140
76	NC_013132	GGCAA	2	10	104928	104937	40 %	0 %	40 %	20 %	256419141
77	NC_013132	TCATT	2	10	107104	107113	20 %	60 %	0 %	20 %	256419143
78	NC_013132	CGCTT	2	10	107136	107145	0 %	40 %	20 %	40 %	256419143
79	NC_013132	CAATC	2	10	110438	110447	40 %	20 %	0 %	40 %	256419146
80	NC_013132	AAGAG	2	10	112176	112185	60 %	0 %	40 %	0 %	256419147
81	NC_013132	GATCA	2	10	112843	112852	40 %	20 %	20 %	20 %	256419147
82	NC_013132	ATTTT	2	10	114171	114180	20 %	80 %	0 %	0 %	256419148
83	NC_013132	GTTCA	2	10	116853	116862	20 %	40 %	20 %	20 %	256419149
84	NC_013132	GACGG	2	10	117126	117135	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
85	NC_013132	TTCAC	2	10	120062	120071	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
86	NC_013132	AAAAT	2	10	120471	120480	80 %	20 %	0 %	0 %	256419154
87	NC_013132	ATTGA	2	10	120881	120890	40 %	40 %	20 %	0 %	256419154
88	NC_013132	CTTAT	2	10	121978	121987	20 %	60 %	0 %	20 %	256419154
89	NC_013132	AGTAC	2	10	125245	125254	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_013132	ATTTG	2	10	126126	126135	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
91	NC_013132	TTTTC	2	10	127957	127966	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
92	NC_013132	GCTAC	2	10	128028	128037	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
93	NC_013132	GCTAC	2	10	128185	128194	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
94	NC_013132	CTTTG	2	10	128217	128226	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
95	NC_013132	ACAGA	2	10	129571	129580	60 %	0 %	20 %	20 %	256419157
96	NC_013132	CAGGG	2	10	130591	130600	20 %	0 %	60 %	20 %	256419157
97	NC_013132	AGCGG	2	10	136591	136600	20 %	0 %	60 %	20 %	256419162
98	NC_013132	TTTCC	2	10	136946	136955	0 %	60 %	0 %	40 %	256419162
99	NC_013132	TAAAA	2	10	137973	137982	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_013132	CAGTA	2	10	139514	139523	40 %	20 %	20 %	20 %	256419166
101	NC_013132	TATGT	2	10	140615	140624	20 %	60 %	20 %	0 %	256419166
102	NC_013132	CAAAT	2	10	141216	141225	60 %	20 %	0 %	20 %	256419167
103	NC_013132	CCCTT	2	10	141708	141717	0 %	40 %	0 %	60 %	256419167
104	NC_013132	ATCGT	2	10	142116	142125	20 %	40 %	20 %	20 %	256419167
105	NC_013132	GTAAG	2	10	145136	145145	40 %	20 %	40 %	0 %	256419169
106	NC_013132	TTTTC	2	10	149634	149643	0 %	80 %	0 %	20 %	256419172
107	NC_013132	ATCTT	2	10	151884	151893	20 %	60 %	0 %	20 %	256419173
108	NC_013132	CTGGT	2	10	153099	153108	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
109	NC_013132	CATGA	2	10	153400	153409	40 %	20 %	20 %	20 %	256419175
110	NC_013132	GAAAA	2	10	157487	157496	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
111	NC_013132	ATCCT	2	10	157656	157665	20 %	40 %	0 %	40 %	256419182
112	NC_013132	ATTTC	2	10	158668	158677	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
113	NC_013132	CTTCT	2	10	160075	160084	0 %	60 %	0 %	40 %	256419184
114	NC_013132	ATCAC	2	10	160336	160345	40 %	20 %	0 %	40 %	256419184
115	NC_013132	TATGT	2	10	160746	160755	20 %	60 %	20 %	0 %	256419184
116	NC_013132	ATCTT	2	10	161116	161125	20 %	60 %	0 %	20 %	256419184
117	NC_013132	ACGTT	2	10	164408	164417	20 %	40 %	20 %	20 %	256419185
118	NC_013132	ATTAA	2	10	166341	166350	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_013132	AAAAT	2	10	166725	166734	80 %	20 %	0 %	0 %	256419187
120	NC_013132	AATCT	2	10	167454	167463	40 %	40 %	0 %	20 %	256419187
121	NC_013132	AGAAA	2	10	171287	171296	80 %	0 %	20 %	0 %	256419190
122	NC_013132	TTCAT	2	10	172297	172306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
123	NC_013132	TTAAT	2	10	174288	174297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_013132	AGAAA	2	10	175384	175393	80 %	0 %	20 %	0 %	256419193
125	NC_013132	AGCAT	2	10	180151	180160	40 %	20 %	20 %	20 %	256419198
126	NC_013132	TATCC	2	10	180661	180670	20 %	40 %	0 %	40 %	256419198
127	NC_013132	ATAGA	2	10	181457	181466	60 %	20 %	20 %	0 %	256419199
128	NC_013132	TCCCA	2	10	182307	182316	20 %	20 %	0 %	60 %	256419200
129	NC_013132	AAACA	2	10	183463	183472	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
130	NC_013132	ATTAT	2	10	183538	183547	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_013132	ATATT	2	10	184628	184637	40 %	60 %	0 %	0 %	256419203
132	NC_013132	AGATC	2	10	184781	184790	40 %	20 %	20 %	20 %	256419203
133	NC_013132	TAGCA	2	10	184921	184930	40 %	20 %	20 %	20 %	256419203
134	NC_013132	TCATT	2	10	186783	186792	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
135	NC_013132	TTTTG	2	10	187107	187116	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013132	AAATG	2	10	187280	187289	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
137	NC_013132	CTTCT	2	10	188364	188373	0 %	60 %	0 %	40 %	256419205
138	NC_013132	TATCA	2	10	188580	188589	40 %	40 %	0 %	20 %	256419205
139	NC_013132	CAGTA	2	10	191373	191382	40 %	20 %	20 %	20 %	256419207
140	NC_013132	AACTG	2	10	193160	193169	40 %	20 %	20 %	20 %	256419207
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144	NC_013132	GCCAT	2	10	195638	195647	20 %	20 %	20 %	40 %	256419211
145	NC_013132	TACGG	2	10	195997	196006	20 %	20 %	40 %	20 %	256419211
146	NC_013132	TTAAT	2	10	197122	197131	40 %	60 %	0 %	0 %	256419211
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151	NC_013132	CTGGG	2	10	209193	209202	0 %	20 %	60 %	20 %	256419216
152	NC_013132	TATTC	2	10	209506	209515	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_013132	TTCAT	2	10	210901	210910	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_013132	AGTTG	2	10	211269	211278	20 %	40 %	40 %	0 %	256419220
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159	NC_013132	GCTTA	2	10	217864	217873	20 %	40 %	20 %	20 %	256419222
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195	NC_013132	TTCCG	2	10	267398	267407	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
196	NC_013132	TTCCT	2	10	268096	268105	0 %	60 %	0 %	40 %	256419268
197	NC_013132	TTTCG	2	10	268166	268175	0 %	60 %	20 %	20 %	256419268
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236	NC_013132	AATAA	2	10	328742	328751	80 %	20 %	0 %	0 %	256419324
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239	NC_013132	TTGTA	2	10	331129	331138	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
240	NC_013132	GTAAT	2	10	331620	331629	40 %	40 %	20 %	0 %	256419329
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249	NC_013132	TTTAC	2	10	340682	340691	20 %	60 %	0 %	20 %	256419343
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252	NC_013132	CTTTA	2	10	347679	347688	20 %	60 %	0 %	20 %	256419348
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262	NC_013132	CCGAA	2	10	379425	379434	40 %	0 %	20 %	40 %	256419372
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264	NC_013132	CAGGA	2	10	382110	382119	40 %	0 %	40 %	20 %	256419374
265	NC_013132	CAGAA	2	10	382568	382577	60 %	0 %	20 %	20 %	256419374
266	NC_013132	AGGAG	2	10	382625	382634	40 %	0 %	60 %	0 %	256419374
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388	NC_013132	GGTTT	2	10	590163	590172	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_013132	ATCAG	2	10	600477	600486	40 %	20 %	20 %	20 %	256419548
396	NC_013132	GACAA	2	10	601228	601237	60 %	0 %	20 %	20 %	256419549
397	NC_013132	TACAT	2	10	602602	602611	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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