MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 127735

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013132	TCG	2	6	25	30	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_013132	AAC	2	6	101	106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_013132	GAA	2	6	291	296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419058
4	NC_013132	AAG	2	6	438	443	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419058
5	NC_013132	GGT	2	6	627	632	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419058
6	NC_013132	TCA	2	6	763	768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419058
7	NC_013132	GAA	2	6	788	793	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419058
8	NC_013132	ATC	2	6	798	803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419058
9	NC_013132	GAT	2	6	849	854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419058
10	NC_013132	ACC	2	6	910	915	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419058
11	NC_013132	ACC	2	6	956	961	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419058
12	NC_013132	AGT	2	6	1106	1111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419058
13	NC_013132	TCT	2	6	1185	1190	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419058
14	NC_013132	TCA	2	6	1254	1259	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419058
15	NC_013132	GCT	2	6	1325	1330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419058
16	NC_013132	GCT	2	6	1623	1628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_013132	CAG	2	6	1656	1661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013132	AAC	2	6	1667	1672	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013132	TAA	2	6	1673	1678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013132	AAG	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419059
21	NC_013132	GAA	2	6	1773	1778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419059
22	NC_013132	TGA	2	6	1958	1963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419059
23	NC_013132	GTC	2	6	2001	2006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419059
24	NC_013132	CTT	2	6	2020	2025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419059
25	NC_013132	AAC	2	6	2056	2061	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419059
26	NC_013132	GTT	2	6	2063	2068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419059
27	NC_013132	TCT	2	6	2107	2112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419059
28	NC_013132	AGA	2	6	2126	2131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419059
29	NC_013132	AAC	2	6	2219	2224	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419059
30	NC_013132	CAA	2	6	2402	2407	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_013132	TCC	2	6	2624	2629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_013132	TCC	2	6	2671	2676	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_013132	ATT	4	12	2728	2739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419060
34	NC_013132	GAA	2	6	2774	2779	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419060
35	NC_013132	CTG	2	6	2786	2791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
36	NC_013132	AGA	2	6	2818	2823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419060
37	NC_013132	CTG	2	6	2841	2846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
38	NC_013132	GCC	2	6	2942	2947	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419060
39	NC_013132	CTG	2	6	3018	3023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
40	NC_013132	TAC	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419060
41	NC_013132	TGA	2	6	3142	3147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419060
42	NC_013132	CTT	2	6	3181	3186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419060
43	NC_013132	CGT	2	6	3190	3195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419060
44	NC_013132	AGA	2	6	3220	3225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419060
45	NC_013132	CAC	2	6	3241	3246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419060
46	NC_013132	CCT	2	6	3258	3263	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419060
47	NC_013132	CCT	2	6	3427	3432	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419060
48	NC_013132	TTA	2	6	3482	3487	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419060
49	NC_013132	AGA	2	6	3734	3739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_013132	CTT	2	6	3765	3770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_013132	TCC	2	6	3842	3847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_013132	TCC	2	6	4034	4039	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419061
53	NC_013132	AAC	2	6	4082	4087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
54	NC_013132	TCC	2	6	4187	4192	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419061
55	NC_013132	GAA	2	6	4225	4230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419061
56	NC_013132	ATA	2	6	4235	4240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419061
57	NC_013132	GCA	2	6	4285	4290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419061
58	NC_013132	CAG	2	6	4291	4296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419061
59	NC_013132	GTT	2	6	4492	4497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419061
60	NC_013132	GTA	3	9	4558	4566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
61	NC_013132	AAC	2	6	4699	4704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
62	NC_013132	GGT	2	6	4705	4710	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
63	NC_013132	GGT	2	6	4750	4755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
64	NC_013132	GGT	2	6	4888	4893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
65	NC_013132	TCA	2	6	4901	4906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
66	NC_013132	CTA	2	6	4907	4912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
67	NC_013132	TGC	2	6	4929	4934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
68	NC_013132	TGC	3	9	5034	5042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
69	NC_013132	CTA	2	6	5072	5077	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
70	NC_013132	GGT	2	6	5167	5172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
71	NC_013132	CGT	2	6	5209	5214	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
72	NC_013132	TCC	2	6	5225	5230	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419061
73	NC_013132	ACC	2	6	5347	5352	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419061
74	NC_013132	CTG	2	6	5701	5706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
75	NC_013132	GAT	2	6	5788	5793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
76	NC_013132	TGA	2	6	5829	5834	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
77	NC_013132	CGT	2	6	5974	5979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
78	NC_013132	ACT	3	9	6020	6028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
79	NC_013132	GGT	2	6	6037	6042	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419061
80	NC_013132	TTC	2	6	6295	6300	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419061
81	NC_013132	ACT	2	6	6326	6331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
82	NC_013132	TCA	2	6	6332	6337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
83	NC_013132	CTG	2	6	6523	6528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
84	NC_013132	AGT	2	6	6552	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419061
85	NC_013132	TCT	3	9	6559	6567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419061
86	NC_013132	TCG	2	6	6743	6748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
87	NC_013132	CAA	3	9	6771	6779	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
88	NC_013132	CTT	2	6	6809	6814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419061
89	NC_013132	TGC	2	6	6837	6842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
90	NC_013132	CAA	2	6	6888	6893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419061
91	NC_013132	ATC	2	6	7012	7017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419061
92	NC_013132	GCT	2	6	7122	7127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419061
93	NC_013132	CTG	2	6	7373	7378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
94	NC_013132	TGG	2	6	7523	7528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419062
95	NC_013132	GAT	2	6	7544	7549	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419062
96	NC_013132	GGT	2	6	7613	7618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419062
97	NC_013132	TAC	2	6	7763	7768	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419062
98	NC_013132	TGC	2	6	7917	7922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
99	NC_013132	CTG	2	6	7941	7946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
100	NC_013132	GCT	2	6	7973	7978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
101	NC_013132	CTG	2	6	8072	8077	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
102	NC_013132	AAC	2	6	8108	8113	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419062
103	NC_013132	GCA	2	6	8172	8177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419062
104	NC_013132	GAA	2	6	8270	8275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419062
105	NC_013132	AGA	2	6	8285	8290	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419062
106	NC_013132	TTC	2	6	8350	8355	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419062
107	NC_013132	CTA	2	6	8448	8453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419062
108	NC_013132	CTG	2	6	8471	8476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
109	NC_013132	CGT	2	6	8618	8623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419062
110	NC_013132	GCC	2	6	8687	8692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419062
111	NC_013132	AAG	2	6	8782	8787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419062
112	NC_013132	AGT	2	6	8809	8814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419062
113	NC_013132	GGC	2	6	8825	8830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419062
114	NC_013132	CTA	2	6	9057	9062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419063
115	NC_013132	GAA	2	6	9231	9236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
116	NC_013132	TGA	2	6	9346	9351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419063
117	NC_013132	ACC	2	6	9363	9368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419063
118	NC_013132	AGT	2	6	9437	9442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419063
119	NC_013132	AGA	2	6	9620	9625	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
120	NC_013132	CTC	2	6	9823	9828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419063
121	NC_013132	AAT	2	6	9855	9860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419063
122	NC_013132	GAA	2	6	9974	9979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
123	NC_013132	GCA	2	6	10029	10034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419063
124	NC_013132	ATC	2	6	10125	10130	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419063
125	NC_013132	AAG	2	6	10217	10222	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419063
126	NC_013132	GGT	2	6	10281	10286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419063
127	NC_013132	CTT	2	6	10511	10516	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419063
128	NC_013132	TAT	2	6	10517	10522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419063
129	NC_013132	ATG	2	6	10587	10592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419063
130	NC_013132	TGC	2	6	10613	10618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419063
131	NC_013132	GGT	2	6	10680	10685	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419063
132	NC_013132	ATT	2	6	10839	10844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419063
133	NC_013132	CTG	2	6	10848	10853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419063
134	NC_013132	TTA	2	6	10866	10871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_013132	ATA	2	6	10890	10895	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_013132	AGC	2	6	10900	10905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_013132	TAA	2	6	10917	10922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_013132	TTC	2	6	11000	11005	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419064
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142	NC_013132	CGT	2	6	11339	11344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419064
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164	NC_013132	AAT	2	6	12839	12844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_013132	ATA	2	6	12855	12860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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229	NC_013132	AAG	2	6	16824	16829	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
230	NC_013132	ATC	2	6	16942	16947	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
231	NC_013132	ACA	2	6	16952	16957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
232	NC_013132	TGG	2	6	17181	17186	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419071
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253	NC_013132	GGA	2	6	18394	18399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419072
254	NC_013132	AGG	2	6	18400	18405	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419072
255	NC_013132	AAT	2	6	18458	18463	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419072
256	NC_013132	CAG	2	6	18467	18472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419072
257	NC_013132	GCT	2	6	18493	18498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419072
258	NC_013132	CAA	2	6	18535	18540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419072
259	NC_013132	AGA	2	6	18547	18552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419072
260	NC_013132	TTA	2	6	18601	18606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419072
261	NC_013132	TGA	2	6	18646	18651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419072
262	NC_013132	TAC	2	6	18900	18905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419072
263	NC_013132	GCT	2	6	18953	18958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419072
264	NC_013132	TAG	2	6	18970	18975	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419072
265	NC_013132	ATT	2	6	18997	19002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419072
266	NC_013132	TCC	2	6	19029	19034	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419072
267	NC_013132	GCC	2	6	19076	19081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419072
268	NC_013132	TAC	2	6	19085	19090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419072
269	NC_013132	GAT	2	6	19193	19198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419072
270	NC_013132	AGA	2	6	19207	19212	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419072
271	NC_013132	GCT	2	6	19295	19300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419072
272	NC_013132	GTA	2	6	19334	19339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419072
273	NC_013132	GGA	2	6	19369	19374	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419072
274	NC_013132	TTA	2	6	19388	19393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419072
275	NC_013132	CTG	2	6	19415	19420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419072
276	NC_013132	GTA	2	6	19493	19498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419072
277	NC_013132	GAA	2	6	19594	19599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419072
278	NC_013132	AAG	2	6	19783	19788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419073
279	NC_013132	GCA	2	6	19808	19813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419073
280	NC_013132	TGA	2	6	19858	19863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419073
281	NC_013132	CAA	2	6	19898	19903	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419073
282	NC_013132	AAC	2	6	19914	19919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419073
283	NC_013132	TGA	2	6	19940	19945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419073
284	NC_013132	GAC	2	6	19977	19982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419073
285	NC_013132	TAA	2	6	20084	20089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419073
286	NC_013132	CGT	2	6	20234	20239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419073
287	NC_013132	CAA	2	6	20414	20419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419073
288	NC_013132	ATC	2	6	20550	20555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_013132	TAA	2	6	20563	20568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_013132	CTT	2	6	20597	20602	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419074
291	NC_013132	CCA	2	6	20669	20674	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419074
292	NC_013132	TCA	2	6	20704	20709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419074
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294	NC_013132	GAA	2	6	20850	20855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419074
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296	NC_013132	ATA	2	6	21048	21053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419074
297	NC_013132	TTC	2	6	21075	21080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419074
298	NC_013132	AAT	2	6	21097	21102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419074
299	NC_013132	AGG	2	6	21114	21119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419074
300	NC_013132	GCA	2	6	21152	21157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419074
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302	NC_013132	ATG	2	6	21256	21261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419074
303	NC_013132	GCA	2	6	21287	21292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419074
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310	NC_013132	TAG	2	6	21640	21645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419074
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317	NC_013132	AAT	2	6	22285	22290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
318	NC_013132	TTG	2	6	22482	22487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419075
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322	NC_013132	TGC	3	9	23011	23019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419075
323	NC_013132	CTG	2	6	23040	23045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419075
324	NC_013132	CAT	2	6	23147	23152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419075
325	NC_013132	CTT	2	6	23174	23179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419075
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328	NC_013132	GTA	2	6	23408	23413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
329	NC_013132	TTA	2	6	23769	23774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419077
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332	NC_013132	CCA	2	6	23883	23888	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419077
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347	NC_013132	TAT	2	6	25372	25377	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419078
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484	NC_013132	AGA	2	6	34451	34456	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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500	NC_013132	TTG	2	6	35679	35684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419088

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