MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 185337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013132	GCA	2	6	171001	171006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419189
3502	NC_013132	AAT	2	6	171008	171013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419189
3503	NC_013132	ACGC	2	8	171170	171177	25 %	0 %	25 %	50 %	256419190
3504	NC_013132	TTG	2	6	171218	171223	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419190
3505	NC_013132	TAT	2	6	171264	171269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419190
3506	NC_013132	AGAAA	2	10	171287	171296	80 %	0 %	20 %	0 %	256419190
3507	NC_013132	CAG	2	6	171329	171334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419190
3508	NC_013132	CCAG	2	8	171407	171414	25 %	0 %	25 %	50 %	256419190
3509	NC_013132	GCA	2	6	171415	171420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419190
3510	NC_013132	TAA	3	9	171429	171437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419190
3511	NC_013132	CCAG	2	8	171491	171498	25 %	0 %	25 %	50 %	256419190
3512	NC_013132	CAA	2	6	171531	171536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419190
3513	NC_013132	CGC	2	6	171570	171575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419190
3514	NC_013132	CGC	2	6	171654	171659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419190
3515	NC_013132	CAG	2	6	171687	171692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419190
3516	NC_013132	GCCA	3	12	171748	171759	25 %	0 %	25 %	50 %	256419190
3517	NC_013132	ACC	2	6	171781	171786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419190
3518	NC_013132	TGA	2	6	171954	171959	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419190
3519	NC_013132	GAA	2	6	172015	172020	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419190
3520	NC_013132	ATA	2	6	172067	172072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419190
3521	NC_013132	AAG	2	6	172073	172078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419190
3522	NC_013132	GACA	2	8	172108	172115	50 %	0 %	25 %	25 %	256419190
3523	NC_013132	CCA	2	6	172151	172156	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419190
3524	NC_013132	TAAA	2	8	172200	172207	75 %	25 %	0 %	0 %	256419190
3525	NC_013132	CAA	2	6	172284	172289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_013132	TTCAT	2	10	172297	172306	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
3527	NC_013132	CCATTT	2	12	172317	172328	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3528	NC_013132	AT	3	6	172362	172367	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_013132	TAA	2	6	172404	172409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_013132	CAT	2	6	172430	172435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3531	NC_013132	TAT	2	6	172436	172441	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013132	CCT	3	9	172442	172450	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3533	NC_013132	TCC	2	6	172473	172478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419191
3534	NC_013132	CTT	2	6	172483	172488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419191
3535	NC_013132	CGG	2	6	172517	172522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419191
3536	NC_013132	ATA	2	6	172590	172595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419191
3537	NC_013132	GCC	2	6	172623	172628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419191
3538	NC_013132	CTT	2	6	172718	172723	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419191
3539	NC_013132	TCA	2	6	172732	172737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419191
3540	NC_013132	CTG	3	9	172743	172751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419191
3541	NC_013132	TAC	2	6	172762	172767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419191
3542	NC_013132	A	6	6	172848	172853	100 %	0 %	0 %	0 %	256419191
3543	NC_013132	CAG	2	6	172866	172871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419191
3544	NC_013132	ATC	2	6	172932	172937	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419191
3545	NC_013132	CCT	2	6	172976	172981	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419191
3546	NC_013132	CTT	2	6	172982	172987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419191
3547	NC_013132	TCT	2	6	172997	173002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419191
3548	NC_013132	CTG	2	6	173016	173021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419191
3549	NC_013132	ATC	2	6	173028	173033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419191
3550	NC_013132	ACC	2	6	173051	173056	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419191
3551	NC_013132	GCC	2	6	173157	173162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419191
3552	NC_013132	TCC	2	6	173185	173190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419191
3553	NC_013132	TGC	2	6	173191	173196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419191
3554	NC_013132	TGG	2	6	173250	173255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419191
3555	NC_013132	CCT	2	6	173362	173367	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419191
3556	NC_013132	ATG	2	6	173452	173457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013132	ATT	2	6	173497	173502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419192
3558	NC_013132	TC	3	6	173519	173524	0 %	50 %	0 %	50 %	256419192
3559	NC_013132	GGC	2	6	173525	173530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419192
3560	NC_013132	CCG	2	6	173578	173583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419192
3561	NC_013132	TGA	2	6	173596	173601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419192
3562	NC_013132	CACT	2	8	173721	173728	25 %	25 %	0 %	50 %	256419192
3563	NC_013132	GAT	2	6	173756	173761	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419192
3564	NC_013132	AGC	2	6	173872	173877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419192
3565	NC_013132	ATC	2	6	173930	173935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419192
3566	NC_013132	CT	3	6	173944	173949	0 %	50 %	0 %	50 %	256419192
3567	NC_013132	CGG	2	6	174019	174024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419192
3568	NC_013132	TG	3	6	174104	174109	0 %	50 %	50 %	0 %	256419192
3569	NC_013132	ACC	2	6	174113	174118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419192
3570	NC_013132	CAA	2	6	174125	174130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419192
3571	NC_013132	AC	3	6	174179	174184	50 %	0 %	0 %	50 %	256419192
3572	NC_013132	A	6	6	174188	174193	100 %	0 %	0 %	0 %	256419192
3573	NC_013132	CCT	2	6	174211	174216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419192
3574	NC_013132	TTAAT	2	10	174288	174297	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
3575	NC_013132	CTAT	2	8	174385	174392	25 %	50 %	0 %	25 %	256419193
3576	NC_013132	A	6	6	174394	174399	100 %	0 %	0 %	0 %	256419193
3577	NC_013132	ACA	2	6	174471	174476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419193
3578	NC_013132	A	7	7	174545	174551	100 %	0 %	0 %	0 %	256419193
3579	NC_013132	AAC	2	6	174658	174663	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419193
3580	NC_013132	CCA	2	6	174707	174712	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419193
3581	NC_013132	TC	3	6	174791	174796	0 %	50 %	0 %	50 %	256419193
3582	NC_013132	CAC	2	6	174903	174908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419193
3583	NC_013132	CTG	2	6	174938	174943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419193
3584	NC_013132	TGC	2	6	175017	175022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419193
3585	NC_013132	CAG	2	6	175062	175067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419193
3586	NC_013132	ACT	2	6	175127	175132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419193
3587	NC_013132	AGC	2	6	175197	175202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419193
3588	NC_013132	A	6	6	175213	175218	100 %	0 %	0 %	0 %	256419193
3589	NC_013132	GCC	2	6	175228	175233	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419193
3590	NC_013132	TAA	2	6	175341	175346	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419193
3591	NC_013132	AGAAA	2	10	175384	175393	80 %	0 %	20 %	0 %	256419193
3592	NC_013132	AAC	2	6	175396	175401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419193
3593	NC_013132	CTG	2	6	175402	175407	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419193
3594	NC_013132	CAG	2	6	175414	175419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419193
3595	NC_013132	TATAAA	2	12	175424	175435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419193
3596	NC_013132	ACCTAT	2	12	175464	175475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419194
3597	NC_013132	GTC	2	6	175497	175502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419194
3598	NC_013132	CTCA	2	8	175508	175515	25 %	25 %	0 %	50 %	256419194
3599	NC_013132	TCTT	2	8	175602	175609	0 %	75 %	0 %	25 %	256419194
3600	NC_013132	CTT	2	6	175676	175681	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419194
3601	NC_013132	ACC	2	6	175700	175705	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419194
3602	NC_013132	ACC	2	6	175814	175819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419194
3603	NC_013132	ATA	2	6	175853	175858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419194
3604	NC_013132	CGG	2	6	175866	175871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419194
3605	NC_013132	TGT	2	6	175905	175910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419194
3606	NC_013132	TCA	2	6	175992	175997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419194
3607	NC_013132	CAA	2	6	176015	176020	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419194
3608	NC_013132	TTA	2	6	176094	176099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419194
3609	NC_013132	AAC	2	6	176141	176146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419194
3610	NC_013132	CCG	2	6	176248	176253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3611	NC_013132	CTG	2	6	176361	176366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419195
3612	NC_013132	GCC	2	6	176385	176390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419195
3613	NC_013132	AGC	2	6	176480	176485	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419195
3614	NC_013132	TGC	2	6	176489	176494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419195
3615	NC_013132	TCA	2	6	176536	176541	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419195
3616	NC_013132	AGA	2	6	176573	176578	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419195
3617	NC_013132	AAC	2	6	176579	176584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419195
3618	NC_013132	AGA	2	6	176585	176590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419195
3619	NC_013132	AAAC	2	8	176611	176618	75 %	0 %	0 %	25 %	256419195
3620	NC_013132	TTC	2	6	176619	176624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419195
3621	NC_013132	TTA	2	6	176628	176633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419195
3622	NC_013132	AC	4	8	176882	176889	50 %	0 %	0 %	50 %	256419195
3623	NC_013132	ATT	2	6	176972	176977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419195
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3876	NC_013132	CAAA	2	8	188639	188646	75 %	0 %	0 %	25 %	256419205
3877	NC_013132	TCTGGC	2	12	188707	188718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419205
3878	NC_013132	TGA	2	6	188719	188724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419205
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3884	NC_013132	TAC	2	6	189113	189118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419206
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3889	NC_013132	CTGC	2	8	189475	189482	0 %	25 %	25 %	50 %	256419206
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3907	NC_013132	A	6	6	190259	190264	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3958	NC_013132	TA	3	6	193197	193202	50 %	50 %	0 %	0 %	256419207
3959	NC_013132	GCT	3	9	193244	193252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419207
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3962	NC_013132	ATC	2	6	193514	193519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3963	NC_013132	AT	3	6	193569	193574	50 %	50 %	0 %	0 %	256419208
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3969	NC_013132	AAAG	2	8	194434	194441	75 %	0 %	25 %	0 %	256419209
3970	NC_013132	CTGGG	2	10	194639	194648	0 %	20 %	60 %	20 %	256419209
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3978	NC_013132	ATC	2	6	195028	195033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419210
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3985	NC_013132	TG	3	6	195427	195432	0 %	50 %	50 %	0 %	256419210
3986	NC_013132	CTC	2	6	195438	195443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419210
3987	NC_013132	AAG	2	6	195471	195476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3988	NC_013132	ATA	2	6	195528	195533	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3989	NC_013132	CATC	2	8	195538	195545	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
3990	NC_013132	AATA	2	8	195581	195588	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3991	NC_013132	GCCAT	2	10	195638	195647	20 %	20 %	20 %	40 %	256419211
3992	NC_013132	CAA	2	6	195718	195723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419211
3993	NC_013132	GA	3	6	195726	195731	50 %	0 %	50 %	0 %	256419211
3994	NC_013132	GTA	2	6	195813	195818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419211
3995	NC_013132	ACA	2	6	195820	195825	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419211
3996	NC_013132	CCT	2	6	195889	195894	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256419211
3997	NC_013132	CCA	2	6	195907	195912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419211
3998	NC_013132	TAT	2	6	195953	195958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419211
3999	NC_013132	CAG	2	6	195959	195964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419211
4000	NC_013132	TTC	2	6	195982	195987	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419211

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