MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chitinophaga pinensis DSM 2588 chromosome

Total Repeats: 185337

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_013132	TA	3	6	266310	266315	50 %	50 %	0 %	0 %	256419267
5502	NC_013132	CTT	2	6	266329	266334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419267
5503	NC_013132	CAG	2	6	266345	266350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419267
5504	NC_013132	TGG	2	6	266407	266412	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419267
5505	NC_013132	AT	3	6	266451	266456	50 %	50 %	0 %	0 %	256419267
5506	NC_013132	TC	3	6	266497	266502	0 %	50 %	0 %	50 %	256419267
5507	NC_013132	TGC	2	6	266558	266563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419267
5508	NC_013132	CAG	2	6	266641	266646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419267
5509	NC_013132	TGT	2	6	266737	266742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419267
5510	NC_013132	ATGA	2	8	266775	266782	50 %	25 %	25 %	0 %	256419267
5511	NC_013132	ATC	2	6	266872	266877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419267
5512	NC_013132	T	6	6	267002	267007	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5513	NC_013132	ACA	2	6	267028	267033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5514	NC_013132	CAT	2	6	267043	267048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5515	NC_013132	ATC	2	6	267053	267058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5516	NC_013132	A	6	6	267068	267073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5517	NC_013132	TAT	2	6	267080	267085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5518	NC_013132	TTCCG	2	10	267172	267181	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5519	NC_013132	ATC	2	6	267248	267253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5520	NC_013132	AGT	2	6	267272	267277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5521	NC_013132	AC	3	6	267308	267313	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5522	NC_013132	TTCCG	2	10	267398	267407	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
5523	NC_013132	ATC	2	6	267475	267480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5524	NC_013132	AGT	2	6	267499	267504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5525	NC_013132	A	7	7	267508	267514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5526	NC_013132	CA	3	6	267564	267569	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5527	NC_013132	TTG	2	6	267587	267592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5528	NC_013132	TGTT	2	8	267622	267629	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5529	NC_013132	T	7	7	267653	267659	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5530	NC_013132	A	6	6	267679	267684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5531	NC_013132	ATT	2	6	267694	267699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5532	NC_013132	CAT	2	6	267834	267839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419268
5533	NC_013132	TCT	2	6	267968	267973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419268
5534	NC_013132	ATC	2	6	268033	268038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419268
5535	NC_013132	TTCCT	2	10	268096	268105	0 %	60 %	0 %	40 %	256419268
5536	NC_013132	TCT	2	6	268130	268135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419268
5537	NC_013132	TTTCG	2	10	268166	268175	0 %	60 %	20 %	20 %	256419268
5538	NC_013132	AGG	2	6	268213	268218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419268
5539	NC_013132	TACG	2	8	268236	268243	25 %	25 %	25 %	25 %	256419268
5540	NC_013132	ATC	2	6	268258	268263	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419268
5541	NC_013132	TCA	2	6	268277	268282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419268
5542	NC_013132	CTG	2	6	268284	268289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419268
5543	NC_013132	GGT	2	6	268312	268317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419268
5544	NC_013132	GAT	2	6	268440	268445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419268
5545	NC_013132	TG	3	6	268472	268477	0 %	50 %	50 %	0 %	256419268
5546	NC_013132	TTC	2	6	268543	268548	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419268
5547	NC_013132	TTC	2	6	268612	268617	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419269
5548	NC_013132	AAT	2	6	268620	268625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419269
5549	NC_013132	ATC	2	6	268659	268664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419269
5550	NC_013132	TCT	2	6	268681	268686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419269
5551	NC_013132	ATG	2	6	268731	268736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419269
5552	NC_013132	TTCCG	2	10	268755	268764	0 %	40 %	20 %	40 %	256419269
5553	NC_013132	CCG	2	6	268837	268842	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419269
5554	NC_013132	CTG	2	6	268863	268868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419269
5555	NC_013132	CTG	2	6	268984	268989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419269
5556	NC_013132	TCT	2	6	268997	269002	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419269
5557	NC_013132	CAT	2	6	269016	269021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419269
5558	NC_013132	GT	3	6	269075	269080	0 %	50 %	50 %	0 %	256419269
5559	NC_013132	T	6	6	269080	269085	0 %	100 %	0 %	0 %	256419269
5560	NC_013132	TAT	2	6	269174	269179	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419269
5561	NC_013132	ATG	2	6	269257	269262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5562	NC_013132	TA	3	6	269320	269325	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5563	NC_013132	GAA	2	6	269350	269355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5564	NC_013132	TTA	2	6	269387	269392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5565	NC_013132	ATC	2	6	269440	269445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419270
5566	NC_013132	CAG	2	6	269577	269582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419270
5567	NC_013132	CTA	2	6	269594	269599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419270
5568	NC_013132	CGA	2	6	269656	269661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419270
5569	NC_013132	CTTT	2	8	269792	269799	0 %	75 %	0 %	25 %	256419270
5570	NC_013132	CGTTT	2	10	269815	269824	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
5571	NC_013132	AGT	2	6	269851	269856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5572	NC_013132	AAC	2	6	269961	269966	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419271
5573	NC_013132	CAG	2	6	269993	269998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419271
5574	NC_013132	GTA	2	6	270027	270032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419271
5575	NC_013132	CCA	2	6	270126	270131	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419271
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5577	NC_013132	TAA	2	6	270437	270442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419272
5578	NC_013132	TA	3	6	270533	270538	50 %	50 %	0 %	0 %	256419272
5579	NC_013132	ACGGA	2	10	270582	270591	40 %	0 %	40 %	20 %	256419272
5580	NC_013132	GCC	2	6	270639	270644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256419272
5581	NC_013132	CAT	2	6	270662	270667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419272
5582	NC_013132	CGTC	2	8	270884	270891	0 %	25 %	25 %	50 %	256419272
5583	NC_013132	TTG	2	6	270894	270899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419272
5584	NC_013132	CAG	2	6	271019	271024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419272
5585	NC_013132	CCA	2	6	271054	271059	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256419272
5586	NC_013132	T	6	6	271114	271119	0 %	100 %	0 %	0 %	256419272
5587	NC_013132	ATG	2	6	271144	271149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419272
5588	NC_013132	CTT	2	6	271193	271198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419272
5589	NC_013132	ATT	2	6	271299	271304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5590	NC_013132	AGC	2	6	271318	271323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419273
5591	NC_013132	ACT	2	6	271352	271357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419273
5592	NC_013132	TGA	2	6	271397	271402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419273
5593	NC_013132	TTGGCG	2	12	271424	271435	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	256419273
5594	NC_013132	GAT	2	6	271456	271461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419273
5595	NC_013132	T	6	6	271642	271647	0 %	100 %	0 %	0 %	256419273
5596	NC_013132	GGT	2	6	271723	271728	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256419273
5597	NC_013132	GAA	2	6	271759	271764	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419273
5598	NC_013132	GCAA	2	8	271832	271839	50 %	0 %	25 %	25 %	256419273
5599	NC_013132	GTT	2	6	271848	271853	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	256419273
5600	NC_013132	TTG	2	6	271869	271874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5601	NC_013132	CAGC	2	8	271907	271914	25 %	0 %	25 %	50 %	256419274
5602	NC_013132	AGGT	2	8	272016	272023	25 %	25 %	50 %	0 %	256419274
5603	NC_013132	ATA	2	6	272118	272123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419274
5604	NC_013132	GCAG	2	8	272150	272157	25 %	0 %	50 %	25 %	256419274
5605	NC_013132	T	6	6	272255	272260	0 %	100 %	0 %	0 %	256419274
5606	NC_013132	CCGG	2	8	272291	272298	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5607	NC_013132	AT	3	6	272338	272343	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5608	NC_013132	TTC	2	6	272428	272433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5609	NC_013132	AT	3	6	272514	272519	50 %	50 %	0 %	0 %	256419275
5610	NC_013132	CAGA	2	8	272540	272547	50 %	0 %	25 %	25 %	256419275
5611	NC_013132	GGCG	2	8	272563	272570	0 %	0 %	75 %	25 %	256419275
5612	NC_013132	TTC	2	6	272576	272581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419275
5613	NC_013132	GAG	2	6	272663	272668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256419275
5614	NC_013132	TAT	2	6	272672	272677	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419275
5615	NC_013132	ATG	2	6	272693	272698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419275
5616	NC_013132	ATG	2	6	272706	272711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419275
5617	NC_013132	GCA	2	6	272725	272730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419275
5618	NC_013132	CTG	2	6	272910	272915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419275
5619	NC_013132	TAA	3	9	273094	273102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	256419275
5620	NC_013132	CTTA	2	8	273132	273139	25 %	50 %	0 %	25 %	256419275
5621	NC_013132	TTA	2	6	273168	273173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	256419275
5622	NC_013132	GCT	3	9	273185	273193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419275
5623	NC_013132	GGC	2	6	273313	273318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256419275
5624	NC_013132	ACA	2	6	273361	273366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419275
5625	NC_013132	TCT	2	6	273374	273379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419275
5626	NC_013132	TGA	2	6	273408	273413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256419275
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5629	NC_013132	GAA	2	6	273508	273513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256419275
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5642	NC_013132	CTT	2	6	273827	273832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5644	NC_013132	AT	3	6	273931	273936	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5645	NC_013132	TAAA	2	8	273940	273947	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5646	NC_013132	GGA	2	6	273969	273974	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5648	NC_013132	A	6	6	274026	274031	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5649	NC_013132	AT	3	6	274135	274140	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5650	NC_013132	ATTAT	2	10	274148	274157	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
5651	NC_013132	TGA	2	6	274161	274166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5653	NC_013132	TTC	2	6	274251	274256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5655	NC_013132	TGC	2	6	274301	274306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5657	NC_013132	TGTT	2	8	274358	274365	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
5658	NC_013132	TGAT	2	8	274386	274393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5659	NC_013132	TCT	2	6	274399	274404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5669	NC_013132	TTTG	2	8	274729	274736	0 %	75 %	25 %	0 %	256419276
5670	NC_013132	A	6	6	274747	274752	100 %	0 %	0 %	0 %	256419276
5671	NC_013132	T	6	6	274785	274790	0 %	100 %	0 %	0 %	256419276
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5750	NC_013132	GCT	2	6	278723	278728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419280
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5753	NC_013132	CT	3	6	278975	278980	0 %	50 %	0 %	50 %	256419280
5754	NC_013132	AAC	2	6	279048	279053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	256419280
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5760	NC_013132	CTG	2	6	279264	279269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256419280
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5762	NC_013132	GGCA	2	8	279304	279311	25 %	0 %	50 %	25 %	256419280
5763	NC_013132	AT	3	6	279440	279445	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5764	NC_013132	AAT	2	6	279463	279468	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5765	NC_013132	TCA	2	6	279559	279564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5766	NC_013132	AT	3	6	279624	279629	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5767	NC_013132	TAAA	2	8	279689	279696	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5768	NC_013132	GCA	2	6	279824	279829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256419281
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5772	NC_013132	CAT	2	6	280022	280027	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256419281
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5858	NC_013132	TGGTA	2	10	285044	285053	20 %	40 %	40 %	0 %	256419284
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5869	NC_013132	CTT	2	6	286056	286061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256419284
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