MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Catenulispora acidiphila DSM 44928 chromosome

Total Repeats: 291454

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013131	CCG	2	6	18704	18709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389248
502	NC_013131	CCG	2	6	18713	18718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389248
503	NC_013131	CGG	2	6	18760	18765	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389248
504	NC_013131	GGC	2	6	18790	18795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389248
505	NC_013131	GGCGAA	2	12	18797	18808	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	256389248
506	NC_013131	CGG	2	6	18826	18831	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389248
507	NC_013131	GCT	2	6	18915	18920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389248
508	NC_013131	CGA	2	6	18972	18977	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013131	GAA	2	6	19011	19016	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
510	NC_013131	ATC	3	9	19080	19088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_013131	TCG	2	6	19215	19220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389249
512	NC_013131	GCGCC	2	10	19247	19256	0 %	0 %	40 %	60 %	256389249
513	NC_013131	ACG	2	6	19302	19307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389249
514	NC_013131	TGGC	2	8	19325	19332	0 %	25 %	50 %	25 %	256389249
515	NC_013131	TCG	2	6	19392	19397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389249
516	NC_013131	GGCA	2	8	19413	19420	25 %	0 %	50 %	25 %	256389249
517	NC_013131	CG	3	6	19427	19432	0 %	0 %	50 %	50 %	256389249
518	NC_013131	GCCGG	2	10	19442	19451	0 %	0 %	60 %	40 %	256389249
519	NC_013131	GCG	2	6	19478	19483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389249
520	NC_013131	CGA	2	6	19507	19512	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389249
521	NC_013131	CCG	3	9	19569	19577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389249
522	NC_013131	GCT	2	6	19627	19632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389249
523	NC_013131	GCTG	2	8	19671	19678	0 %	25 %	50 %	25 %	256389249
524	NC_013131	GCC	2	6	19679	19684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389249
525	NC_013131	ACG	2	6	19689	19694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389249
526	NC_013131	CGG	2	6	19738	19743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389249
527	NC_013131	CGC	2	6	19773	19778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389249
528	NC_013131	CCG	2	6	19860	19865	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
529	NC_013131	GCC	2	6	19890	19895	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389250
530	NC_013131	ATG	2	6	19926	19931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389250
531	NC_013131	TCA	2	6	19978	19983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389250
532	NC_013131	CGG	2	6	20000	20005	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389250
533	NC_013131	CGC	4	12	20068	20079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389250
534	NC_013131	TGC	2	6	20088	20093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389250
535	NC_013131	CCG	2	6	20149	20154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389250
536	NC_013131	CGA	2	6	20158	20163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389250
537	NC_013131	TCT	2	6	20182	20187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389250
538	NC_013131	CGT	2	6	20215	20220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389250
539	NC_013131	GCT	2	6	20230	20235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389250
540	NC_013131	GA	4	8	20369	20376	50 %	0 %	50 %	0 %	256389250
541	NC_013131	CGG	2	6	20377	20382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389250
542	NC_013131	GCG	2	6	20433	20438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389250
543	NC_013131	GGA	2	6	20447	20452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389250
544	NC_013131	TAT	2	6	20538	20543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_013131	TC	3	6	20546	20551	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_013131	GCC	2	6	20584	20589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
547	NC_013131	GC	4	8	20706	20713	0 %	0 %	50 %	50 %	256389251
548	NC_013131	GGC	2	6	20719	20724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389251
549	NC_013131	TGGC	2	8	20726	20733	0 %	25 %	50 %	25 %	256389251
550	NC_013131	GCC	2	6	20736	20741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389251
551	NC_013131	GAA	2	6	20843	20848	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389251
552	NC_013131	CGG	2	6	20866	20871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389251
553	NC_013131	GC	3	6	20889	20894	0 %	0 %	50 %	50 %	256389251
554	NC_013131	GCC	2	6	20923	20928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389251
555	NC_013131	CGC	2	6	20949	20954	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389251
556	NC_013131	CGGG	2	8	20955	20962	0 %	0 %	75 %	25 %	256389251
557	NC_013131	CCGC	2	8	20988	20995	0 %	0 %	25 %	75 %	256389251
558	NC_013131	TCGG	2	8	21116	21123	0 %	25 %	50 %	25 %	256389251
559	NC_013131	CGT	2	6	21132	21137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389251
560	NC_013131	CAC	2	6	21178	21183	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389251
561	NC_013131	GCC	2	6	21190	21195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389251
562	NC_013131	GC	3	6	21198	21203	0 %	0 %	50 %	50 %	256389251
563	NC_013131	ACC	2	6	21254	21259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	256389251
564	NC_013131	GAG	2	6	21380	21385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
565	NC_013131	CG	3	6	21504	21509	0 %	0 %	50 %	50 %	256389252
566	NC_013131	CTC	2	6	21566	21571	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389252
567	NC_013131	CCG	2	6	21575	21580	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389252
568	NC_013131	CAG	2	6	21623	21628	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389252
569	NC_013131	GTC	2	6	21662	21667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389252
570	NC_013131	CGG	2	6	21955	21960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389252
571	NC_013131	GCA	2	6	21964	21969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389252
572	NC_013131	GAT	2	6	21977	21982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389252
573	NC_013131	CCG	2	6	22003	22008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389252
574	NC_013131	CAG	2	6	22040	22045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389252
575	NC_013131	CGG	3	9	22084	22092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389252
576	NC_013131	CTC	2	6	22124	22129	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389252
577	NC_013131	CCG	2	6	22210	22215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389252
578	NC_013131	GGC	3	9	22229	22237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389252
579	NC_013131	CGC	2	6	22246	22251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389252
580	NC_013131	GC	4	8	22258	22265	0 %	0 %	50 %	50 %	256389252
581	NC_013131	GCC	2	6	22289	22294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389252
582	NC_013131	CGCAC	2	10	22317	22326	20 %	0 %	20 %	60 %	256389252
583	NC_013131	CGG	2	6	22390	22395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_013131	CGA	2	6	22425	22430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013131	GCG	2	6	22458	22463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_013131	CGG	2	6	22466	22471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_013131	CCG	2	6	22475	22480	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
588	NC_013131	CGGC	2	8	22517	22524	0 %	0 %	50 %	50 %	256389253
589	NC_013131	GCCG	2	8	22596	22603	0 %	0 %	50 %	50 %	256389253
590	NC_013131	GCG	2	6	22630	22635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389253
591	NC_013131	TCG	2	6	22639	22644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389253
592	NC_013131	GA	3	6	22649	22654	50 %	0 %	50 %	0 %	256389253
593	NC_013131	GCA	2	6	22655	22660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389253
594	NC_013131	CCACGG	2	12	22679	22690	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	256389253
595	NC_013131	CGT	3	9	22694	22702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389253
596	NC_013131	GC	3	6	22968	22973	0 %	0 %	50 %	50 %	256389253
597	NC_013131	CGG	2	6	22991	22996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389253
598	NC_013131	GCA	2	6	23000	23005	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389253
599	NC_013131	ATC	2	6	23014	23019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389253
600	NC_013131	GTG	2	6	23044	23049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389253
601	NC_013131	GCGCTC	2	12	23052	23063	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	256389253
602	NC_013131	CAG	2	6	23076	23081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389253
603	NC_013131	CGG	3	9	23101	23109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389253
604	NC_013131	CGG	2	6	23111	23116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389253
605	NC_013131	CGT	2	6	23117	23122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389253
606	NC_013131	CGGTG	2	10	23153	23162	0 %	20 %	60 %	20 %	256389253
607	NC_013131	TCG	2	6	23164	23169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389253
608	NC_013131	CAT	2	6	23220	23225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389253
609	NC_013131	GCGG	2	8	23268	23275	0 %	0 %	75 %	25 %	256389253
610	NC_013131	CCGA	2	8	23325	23332	25 %	0 %	25 %	50 %	256389253
611	NC_013131	TTC	2	6	23334	23339	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389253
612	NC_013131	CAT	2	6	23447	23452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_013131	CCG	2	6	23484	23489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
614	NC_013131	GTC	2	6	23499	23504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013131	CGG	2	6	23518	23523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
616	NC_013131	CTG	2	6	23583	23588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389254
617	NC_013131	GTG	2	6	23601	23606	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389254
618	NC_013131	GGC	3	9	23693	23701	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389254
619	NC_013131	GTG	2	6	23706	23711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389254
620	NC_013131	CGGC	2	8	23731	23738	0 %	0 %	50 %	50 %	256389254
621	NC_013131	GCT	2	6	23741	23746	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389254
622	NC_013131	TCG	2	6	23779	23784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389254
623	NC_013131	CGG	2	6	23798	23803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389254
624	NC_013131	TGC	2	6	23815	23820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389254
625	NC_013131	GAA	2	6	23856	23861	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	256389254
626	NC_013131	CGA	2	6	23876	23881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389254
627	NC_013131	CGG	2	6	24035	24040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389254
628	NC_013131	TCG	2	6	24049	24054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389254
629	NC_013131	TGC	2	6	24076	24081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389254
630	NC_013131	GGC	2	6	24104	24109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	256389254
631	NC_013131	GCT	2	6	24214	24219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389255
632	NC_013131	GC	3	6	24424	24429	0 %	0 %	50 %	50 %	256389255
633	NC_013131	CG	4	8	24456	24463	0 %	0 %	50 %	50 %	256389255
634	NC_013131	GAT	2	6	24484	24489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389255
635	NC_013131	TCG	2	6	24524	24529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389255
636	NC_013131	CGT	2	6	24543	24548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389255
637	NC_013131	GGCC	2	8	24588	24595	0 %	0 %	50 %	50 %	256389255
638	NC_013131	CCT	2	6	24606	24611	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389255
639	NC_013131	TCA	2	6	24657	24662	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389255
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641	NC_013131	GTG	2	6	24737	24742	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	256389255
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643	NC_013131	CTT	2	6	24769	24774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	256389255
644	NC_013131	GAG	2	6	24784	24789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	256389255
645	NC_013131	GTC	2	6	24790	24795	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389255
646	NC_013131	GAC	2	6	24831	24836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_013131	GAC	3	9	24906	24914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389256
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649	NC_013131	GTCCTG	2	12	24976	24987	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	256389256
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702	NC_013131	CGG	2	6	26592	26597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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752	NC_013131	GAC	2	6	28516	28521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389259
753	NC_013131	GGACC	2	10	28546	28555	20 %	0 %	40 %	40 %	256389259
754	NC_013131	CAT	2	6	28558	28563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	256389259
755	NC_013131	GAC	2	6	28601	28606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389259
756	NC_013131	GTA	2	6	28607	28612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389259
757	NC_013131	GC	4	8	28706	28713	0 %	0 %	50 %	50 %	256389259
758	NC_013131	CGA	2	6	28801	28806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389259
759	NC_013131	CGC	2	6	28816	28821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389259
760	NC_013131	TCGA	2	8	28857	28864	25 %	25 %	25 %	25 %	256389260
761	NC_013131	CGAAGC	2	12	28873	28884	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	256389260
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763	NC_013131	CGC	2	6	28945	28950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389260
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771	NC_013131	CG	3	6	29214	29219	0 %	0 %	50 %	50 %	256389260
772	NC_013131	TCC	2	6	29226	29231	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	256389260
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777	NC_013131	AGT	2	6	29456	29461	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	256389261
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785	NC_013131	CGC	2	6	29639	29644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	256389261
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873	NC_013131	ATC	2	6	32437	32442	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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881	NC_013131	G	6	6	32795	32800	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
882	NC_013131	GTG	2	6	32851	32856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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