MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 1009

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012985	TGCAT	2	10	1406	1415	20 %	40 %	20 %	20 %	254780124
2	NC_012985	AGATG	2	10	1781	1790	40 %	20 %	40 %	0 %	254780124
3	NC_012985	TATCA	2	10	2485	2494	40 %	40 %	0 %	20 %	254780125
4	NC_012985	TCGTT	2	10	3027	3036	0 %	60 %	20 %	20 %	254780125
5	NC_012985	GTCCT	2	10	6210	6219	0 %	40 %	20 %	40 %	254780129
6	NC_012985	GATCA	2	10	8841	8850	40 %	20 %	20 %	20 %	254780134
7	NC_012985	ATTTT	2	10	9695	9704	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012985	AGAAA	2	10	12266	12275	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012985	TCTTT	2	10	12823	12832	0 %	80 %	0 %	20 %	254780137
10	NC_012985	AAAGA	2	10	13322	13331	80 %	0 %	20 %	0 %	254780137
11	NC_012985	AAAAT	2	10	13771	13780	80 %	20 %	0 %	0 %	254780137
12	NC_012985	GAAAA	2	10	13840	13849	80 %	0 %	20 %	0 %	254780137
13	NC_012985	AAAAT	2	10	15643	15652	80 %	20 %	0 %	0 %	254780138
14	NC_012985	TCATT	2	10	16232	16241	20 %	60 %	0 %	20 %	254780138
15	NC_012985	AAAAC	2	10	16837	16846	80 %	0 %	0 %	20 %	254780139
16	NC_012985	CTAAT	2	10	17022	17031	40 %	40 %	0 %	20 %	254780139
17	NC_012985	CAATA	2	10	18366	18375	60 %	20 %	0 %	20 %	254780140
18	NC_012985	AACAT	2	10	18379	18388	60 %	20 %	0 %	20 %	254780140
19	NC_012985	TATTT	2	10	22495	22504	20 %	80 %	0 %	0 %	254780142
20	NC_012985	AAATC	2	10	25307	25316	60 %	20 %	0 %	20 %	254780143
21	NC_012985	AGGCG	2	10	26343	26352	20 %	0 %	60 %	20 %	254780143
22	NC_012985	AAAGA	2	10	27144	27153	80 %	0 %	20 %	0 %	254780143
23	NC_012985	TCATT	2	10	28502	28511	20 %	60 %	0 %	20 %	254780144
24	NC_012985	GACGA	2	10	29232	29241	40 %	0 %	40 %	20 %	254780145
25	NC_012985	TGGGA	2	10	30539	30548	20 %	20 %	60 %	0 %	254780147
26	NC_012985	AAAAT	2	10	31368	31377	80 %	20 %	0 %	0 %	254780149
27	NC_012985	AAACA	2	10	36454	36463	80 %	0 %	0 %	20 %	254780153
28	NC_012985	ATATA	2	10	42159	42168	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012985	TCAAT	2	10	42414	42423	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_012985	TAATA	2	10	42798	42807	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_012985	CCTTG	2	10	44196	44205	0 %	40 %	20 %	40 %	254780161
32	NC_012985	ATCCC	2	10	47907	47916	20 %	20 %	0 %	60 %	254780164
33	NC_012985	TAACA	2	10	48026	48035	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
34	NC_012985	TTCAT	2	10	52625	52634	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
35	NC_012985	CTTTA	2	10	53312	53321	20 %	60 %	0 %	20 %	254780171
36	NC_012985	CTCTT	2	10	53664	53673	0 %	60 %	0 %	40 %	254780171
37	NC_012985	AACAG	2	10	54066	54075	60 %	0 %	20 %	20 %	254780172
38	NC_012985	AATTT	2	10	56623	56632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012985	TTGAA	2	10	61977	61986	40 %	40 %	20 %	0 %	254780181
40	NC_012985	TAGAA	2	10	62394	62403	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_012985	ATCTC	2	10	63425	63434	20 %	40 %	0 %	40 %	254780182
42	NC_012985	TCCTG	2	10	67103	67112	0 %	40 %	20 %	40 %	254780184
43	NC_012985	CGATC	2	10	71492	71501	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
44	NC_012985	TTGAA	2	10	72476	72485	40 %	40 %	20 %	0 %	254780186
45	NC_012985	AAGAA	2	10	73046	73055	80 %	0 %	20 %	0 %	254780187
46	NC_012985	ATTTT	2	10	77759	77768	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_012985	AAAAG	2	10	80187	80196	80 %	0 %	20 %	0 %	254780191
48	NC_012985	ACTCA	2	10	80533	80542	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
49	NC_012985	ATTTT	2	10	80878	80887	20 %	80 %	0 %	0 %	255764460
50	NC_012985	CATCT	2	10	82077	82086	20 %	40 %	0 %	40 %	254780193
51	NC_012985	GCACC	2	10	82160	82169	20 %	0 %	20 %	60 %	254780193
52	NC_012985	TAGAA	2	10	83214	83223	60 %	20 %	20 %	0 %	254780193
53	NC_012985	CATAT	2	10	83683	83692	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
54	NC_012985	GTGTT	2	10	83693	83702	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012985	CTAGT	2	10	84278	84287	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
56	NC_012985	AATCT	2	10	85357	85366	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
57	NC_012985	TATAA	2	10	85379	85388	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012985	ATTTA	2	10	85651	85660	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012985	CAAGA	2	10	87840	87849	60 %	0 %	20 %	20 %	254780197
60	NC_012985	GGATA	2	10	90010	90019	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012985	ACTTC	2	10	91707	91716	20 %	40 %	0 %	40 %	254780201
62	NC_012985	CAAGG	2	10	91774	91783	40 %	0 %	40 %	20 %	254780201
63	NC_012985	AAATC	2	10	92796	92805	60 %	20 %	0 %	20 %	254780202
64	NC_012985	AATCA	2	10	93077	93086	60 %	20 %	0 %	20 %	254780202
65	NC_012985	ATATC	2	10	94847	94856	40 %	40 %	0 %	20 %	254780204
66	NC_012985	TCCAA	2	10	95480	95489	40 %	20 %	0 %	40 %	254780205
67	NC_012985	ATAAA	2	10	95551	95560	80 %	20 %	0 %	0 %	254780205
68	NC_012985	CCTTA	2	10	96273	96282	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
69	NC_012985	ACAAA	2	10	96849	96858	80 %	0 %	0 %	20 %	254780206
70	NC_012985	AATCT	2	10	98782	98791	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
71	NC_012985	GAGAA	2	10	106321	106330	60 %	0 %	40 %	0 %	254780218
72	NC_012985	ATAGT	2	10	106602	106611	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012985	TAAAA	2	10	106628	106637	80 %	20 %	0 %	0 %	254780219
74	NC_012985	TTCAA	2	10	106702	106711	40 %	40 %	0 %	20 %	254780219
75	NC_012985	ATAAA	2	10	106789	106798	80 %	20 %	0 %	0 %	254780219
76	NC_012985	ATAAA	2	10	106909	106918	80 %	20 %	0 %	0 %	254780219
77	NC_012985	AAATC	2	10	107258	107267	60 %	20 %	0 %	20 %	254780220
78	NC_012985	AAAAC	2	10	107541	107550	80 %	0 %	0 %	20 %	254780221
79	NC_012985	CAATG	2	10	108296	108305	40 %	20 %	20 %	20 %	254780222
80	NC_012985	TACAT	2	10	108452	108461	40 %	40 %	0 %	20 %	254780222
81	NC_012985	AAAAC	2	10	109197	109206	80 %	0 %	0 %	20 %	254780222
82	NC_012985	CTACG	2	10	109644	109653	20 %	20 %	20 %	40 %	254780222
83	NC_012985	TCATT	2	10	113234	113243	20 %	60 %	0 %	20 %	254780225
84	NC_012985	TGCTT	2	10	113871	113880	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
85	NC_012985	CCATC	2	10	118194	118203	20 %	20 %	0 %	60 %	254780229
86	NC_012985	CAATA	2	10	120186	120195	60 %	20 %	0 %	20 %	254780229
87	NC_012985	CTTTT	2	10	120648	120657	0 %	80 %	0 %	20 %	254780229
88	NC_012985	CTTTT	2	10	122544	122553	0 %	80 %	0 %	20 %	254780229
89	NC_012985	CAATA	2	10	122718	122727	60 %	20 %	0 %	20 %	254780229
90	NC_012985	GCAAT	2	10	123989	123998	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
91	NC_012985	TCCTC	2	10	125079	125088	0 %	40 %	0 %	60 %	254780231
92	NC_012985	CTTTT	2	10	125872	125881	0 %	80 %	0 %	20 %	254780233
93	NC_012985	TCACA	2	10	130877	130886	40 %	20 %	0 %	40 %	254780238
94	NC_012985	CTTTA	2	10	134292	134301	20 %	60 %	0 %	20 %	254780242
95	NC_012985	CCACT	2	10	135852	135861	20 %	20 %	0 %	60 %	254780246
96	NC_012985	AACAG	2	10	136142	136151	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
97	NC_012985	GCATC	2	10	136745	136754	20 %	20 %	20 %	40 %	254780248
98	NC_012985	AACAC	2	10	138209	138218	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
99	NC_012985	AAATA	2	10	138831	138840	80 %	20 %	0 %	0 %	254780254
100	NC_012985	CCTTT	2	10	138881	138890	0 %	60 %	0 %	40 %	254780254
101	NC_012985	ACGCA	2	10	147645	147654	40 %	0 %	20 %	40 %	254780266
102	NC_012985	TTTGA	2	10	148491	148500	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_012985	GCATA	2	10	149518	149527	40 %	20 %	20 %	20 %	254780268
104	NC_012985	ACCAT	2	10	150258	150267	40 %	20 %	0 %	40 %	254780268
105	NC_012985	AACAT	2	10	152078	152087	60 %	20 %	0 %	20 %	254780270
106	NC_012985	AGATC	2	10	152186	152195	40 %	20 %	20 %	20 %	254780270
107	NC_012985	ACAAA	2	10	152417	152426	80 %	0 %	0 %	20 %	254780270
108	NC_012985	TTGAT	2	10	156269	156278	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012985	AGGAG	2	10	157422	157431	40 %	0 %	60 %	0 %	254780273
110	NC_012985	ACTTC	2	10	160322	160331	20 %	40 %	0 %	40 %	254780275
111	NC_012985	ACCGC	2	10	160594	160603	20 %	0 %	20 %	60 %	254780276
112	NC_012985	TTCCA	2	10	163163	163172	20 %	40 %	0 %	40 %	254780277
113	NC_012985	TATTT	2	10	163852	163861	20 %	80 %	0 %	0 %	254780277
114	NC_012985	AATTG	2	10	164215	164224	40 %	40 %	20 %	0 %	254780277
115	NC_012985	AAAAT	2	10	164920	164929	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012985	ATCCA	2	10	165593	165602	40 %	20 %	0 %	40 %	254780279
117	NC_012985	CTGTA	2	10	167382	167391	20 %	40 %	20 %	20 %	254780280
118	NC_012985	ACTAT	2	10	167672	167681	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012985	AAAAT	2	10	167923	167932	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_012985	ATCTA	2	10	168528	168537	40 %	40 %	0 %	20 %	254780281
121	NC_012985	AAAAT	2	10	169122	169131	80 %	20 %	0 %	0 %	254780282
122	NC_012985	CTGTT	2	10	169808	169817	0 %	60 %	20 %	20 %	254780282
123	NC_012985	TTCGA	2	10	171400	171409	20 %	40 %	20 %	20 %	254780284
124	NC_012985	CCAAG	2	10	172432	172441	40 %	0 %	20 %	40 %	254780284
125	NC_012985	TCATT	2	10	173327	173336	20 %	60 %	0 %	20 %	254780285
126	NC_012985	TAATA	2	10	174581	174590	60 %	40 %	0 %	0 %	254780285
127	NC_012985	TTTTC	2	10	175001	175010	0 %	80 %	0 %	20 %	254780285
128	NC_012985	AAATA	2	10	175174	175183	80 %	20 %	0 %	0 %	254780286
129	NC_012985	TCATC	2	10	175434	175443	20 %	40 %	0 %	40 %	254780286
130	NC_012985	TATAA	2	10	177260	177269	60 %	40 %	0 %	0 %	254780288
131	NC_012985	CCTTT	2	10	179326	179335	0 %	60 %	0 %	40 %	254780289
132	NC_012985	ATGTT	2	10	180529	180538	20 %	60 %	20 %	0 %	254780290
133	NC_012985	ATCCT	2	10	180664	180673	20 %	40 %	0 %	40 %	254780290
134	NC_012985	AAAAC	2	10	181646	181655	80 %	0 %	0 %	20 %	254780291
135	NC_012985	TATAA	2	10	182918	182927	60 %	40 %	0 %	0 %	254780291
136	NC_012985	CATTA	2	10	182972	182981	40 %	40 %	0 %	20 %	254780291
137	NC_012985	TCCAT	2	10	184601	184610	20 %	40 %	0 %	40 %	254780294
138	NC_012985	TTGAA	2	10	186141	186150	40 %	40 %	20 %	0 %	254780295
139	NC_012985	TATCA	2	10	187226	187235	40 %	40 %	0 %	20 %	254780297
140	NC_012985	GTCTT	2	10	188330	188339	0 %	60 %	20 %	20 %	254780298
141	NC_012985	AAAAT	2	10	188725	188734	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_012985	CAATC	2	10	189853	189862	40 %	20 %	0 %	40 %	254780299
143	NC_012985	TAAGG	2	10	190609	190618	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012985	GCTAT	2	10	192956	192965	20 %	40 %	20 %	20 %	254780302
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146	NC_012985	CTCTA	2	10	195692	195701	20 %	40 %	0 %	40 %	254780306
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148	NC_012985	GATAC	2	10	200182	200191	40 %	20 %	20 %	20 %	254780308
149	NC_012985	CTTAT	2	10	201336	201345	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
150	NC_012985	TAAAA	2	10	201372	201381	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_012985	TATTT	2	10	203260	203269	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_012985	ACCTG	2	10	203478	203487	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
153	NC_012985	AAACT	2	10	206555	206564	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
154	NC_012985	ACATT	2	10	210523	210532	40 %	40 %	0 %	20 %	254780317
155	NC_012985	CTATT	2	10	211451	211460	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
156	NC_012985	CTTTA	2	10	211687	211696	20 %	60 %	0 %	20 %	254780320
157	NC_012985	GATGG	2	10	215510	215519	20 %	20 %	60 %	0 %	254780322
158	NC_012985	GAGAA	2	10	215680	215689	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
159	NC_012985	TAAGG	2	10	216877	216886	40 %	20 %	40 %	0 %	254780323
160	NC_012985	ATCAA	2	10	217542	217551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
161	NC_012985	CCAAA	2	10	218974	218983	60 %	0 %	0 %	40 %	254780326
162	NC_012985	CAAGC	2	10	219578	219587	40 %	0 %	20 %	40 %	254780326
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166	NC_012985	CATTA	2	10	226151	226160	40 %	40 %	0 %	20 %	254780331
167	NC_012985	TTCCT	2	10	226366	226375	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
168	NC_012985	ACGAT	2	10	226961	226970	40 %	20 %	20 %	20 %	254780332
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170	NC_012985	TGGGT	2	10	228128	228137	0 %	40 %	60 %	0 %	254780333
171	NC_012985	TTGGA	2	10	229240	229249	20 %	40 %	40 %	0 %	254780334
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174	NC_012985	TAATG	2	10	233174	233183	40 %	40 %	20 %	0 %	254780337
175	NC_012985	ACTAC	2	10	236315	236324	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
176	NC_012985	ACCTC	2	10	237146	237155	20 %	20 %	0 %	60 %	254780340
177	NC_012985	ACCAT	2	10	237278	237287	40 %	20 %	0 %	40 %	254780340
178	NC_012985	TGGAA	2	10	237741	237750	40 %	20 %	40 %	0 %	254780341
179	NC_012985	TAATT	2	10	238940	238949	40 %	60 %	0 %	0 %	254780342
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182	NC_012985	AAAAT	2	10	239513	239522	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
183	NC_012985	CAAAA	2	10	240798	240807	80 %	0 %	0 %	20 %	254780344
184	NC_012985	TTCAT	2	10	240971	240980	20 %	60 %	0 %	20 %	254780344
185	NC_012985	GTACC	2	10	243308	243317	20 %	20 %	20 %	40 %	254780348
186	NC_012985	AAAAT	2	10	246834	246843	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_012985	CGATG	2	10	248727	248736	20 %	20 %	40 %	20 %	255764463
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192	NC_012985	CATCT	2	10	255472	255481	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
193	NC_012985	AGGTA	2	10	255512	255521	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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195	NC_012985	TCATA	2	10	258518	258527	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
196	NC_012985	TACTT	2	10	259696	259705	20 %	60 %	0 %	20 %	255764465
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198	NC_012985	ATCAT	2	10	263728	263737	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
199	NC_012985	TCTTT	2	10	263819	263828	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
200	NC_012985	ATACC	2	10	265993	266002	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
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219	NC_012985	GCAAT	2	10	287593	287602	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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238	NC_012985	TTTAA	2	10	311227	311236	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
239	NC_012985	TTATC	2	10	311955	311964	20 %	60 %	0 %	20 %	254780410
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244	NC_012985	GATGC	2	10	321359	321368	20 %	20 %	40 %	20 %	254780417
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251	NC_012985	TTCCT	2	10	334399	334408	0 %	60 %	0 %	40 %	254780427
252	NC_012985	ATCAT	2	10	334934	334943	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
253	NC_012985	TTGTA	2	10	335874	335883	20 %	60 %	20 %	0 %	255764472
254	NC_012985	GAAAT	2	10	337514	337523	60 %	20 %	20 %	0 %	254780430
255	NC_012985	TTTTC	2	10	338665	338674	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
256	NC_012985	TGGAG	2	10	340479	340488	20 %	20 %	60 %	0 %	255764473
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258	NC_012985	GTTTT	2	10	345729	345738	0 %	80 %	20 %	0 %	254780438
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261	NC_012985	TGGAG	2	10	347147	347156	20 %	20 %	60 %	0 %	254780439
262	NC_012985	GGGCA	2	10	348057	348066	20 %	0 %	60 %	20 %	254780439
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264	NC_012985	TATTT	2	10	352234	352243	20 %	80 %	0 %	0 %	254780442
265	NC_012985	GAAAT	2	10	352392	352401	60 %	20 %	20 %	0 %	254780442
266	NC_012985	ATACA	2	10	353881	353890	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_012985	GGATC	2	10	356722	356731	20 %	20 %	40 %	20 %	254780445
268	NC_012985	TCAAT	2	10	360179	360188	40 %	40 %	0 %	20 %	254780448
269	NC_012985	ATATA	2	10	360527	360536	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
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406	NC_012985	TTAAT	5	25	535168	535192	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
407	NC_012985	TTTAT	3	15	536298	536312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
408	NC_012985	TTTAT	2	10	536893	536902	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_012985	ATTTT	2	10	565270	565279	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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445	NC_012985	ATTTT	2	10	574795	574804	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_012985	ATTGT	2	10	584194	584203	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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