MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 28856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012985	ATC	2	6	22195	22200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
502	NC_012985	AGA	2	6	22219	22224	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780142
503	NC_012985	ATC	2	6	22255	22260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
504	NC_012985	CCA	2	6	22308	22313	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780142
505	NC_012985	TTC	2	6	22325	22330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780142
506	NC_012985	ATC	2	6	22334	22339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
507	NC_012985	TGA	2	6	22370	22375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780142
508	NC_012985	TATTT	2	10	22495	22504	20 %	80 %	0 %	0 %	254780142
509	NC_012985	AGA	2	6	22646	22651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780142
510	NC_012985	ACA	2	6	22662	22667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780142
511	NC_012985	AC	3	6	22671	22676	50 %	0 %	0 %	50 %	254780142
512	NC_012985	ACA	2	6	22856	22861	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780142
513	NC_012985	ACT	2	6	22871	22876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
514	NC_012985	CTTT	2	8	22904	22911	0 %	75 %	0 %	25 %	254780142
515	NC_012985	CAA	2	6	22914	22919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780142
516	NC_012985	CTT	2	6	22921	22926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780142
517	NC_012985	T	8	8	22954	22961	0 %	100 %	0 %	0 %	254780142
518	NC_012985	CAA	2	6	23049	23054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780142
519	NC_012985	AAT	2	6	23070	23075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780142
520	NC_012985	AGA	2	6	23090	23095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780142
521	NC_012985	AAT	3	9	23242	23250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780142
522	NC_012985	TCA	2	6	23277	23282	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
523	NC_012985	ATT	2	6	23287	23292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780142
524	NC_012985	CGG	2	6	23306	23311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254780142
525	NC_012985	GGA	2	6	23378	23383	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780142
526	NC_012985	ATC	2	6	23405	23410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
527	NC_012985	ATT	2	6	23419	23424	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780142
528	NC_012985	CAA	2	6	23445	23450	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780142
529	NC_012985	TAT	2	6	23464	23469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780142
530	NC_012985	T	6	6	23471	23476	0 %	100 %	0 %	0 %	254780142
531	NC_012985	AGA	3	9	23488	23496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780142
532	NC_012985	TAA	2	6	23551	23556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780142
533	NC_012985	AT	3	6	23560	23565	50 %	50 %	0 %	0 %	254780142
534	NC_012985	CAT	2	6	23578	23583	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
535	NC_012985	CTT	2	6	23631	23636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780142
536	NC_012985	ACG	2	6	23681	23686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780142
537	NC_012985	AC	3	6	23706	23711	50 %	0 %	0 %	50 %	254780142
538	NC_012985	AAT	2	6	23869	23874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780142
539	NC_012985	AAAC	2	8	23950	23957	75 %	0 %	0 %	25 %	254780142
540	NC_012985	T	6	6	24002	24007	0 %	100 %	0 %	0 %	254780142
541	NC_012985	CTGA	2	8	24059	24066	25 %	25 %	25 %	25 %	254780142
542	NC_012985	ATC	2	6	24079	24084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780142
543	NC_012985	A	6	6	24097	24102	100 %	0 %	0 %	0 %	254780142
544	NC_012985	TTG	2	6	24115	24120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780142
545	NC_012985	TC	3	6	24130	24135	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
546	NC_012985	A	6	6	24159	24164	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_012985	A	6	6	24166	24171	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
548	NC_012985	TTCT	2	8	24172	24179	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
549	NC_012985	TTA	2	6	24183	24188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780143
550	NC_012985	TTA	2	6	24202	24207	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780143
551	NC_012985	TTC	2	6	24219	24224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
552	NC_012985	CGTG	2	8	24243	24250	0 %	25 %	50 %	25 %	254780143
553	NC_012985	CAA	2	6	24347	24352	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
554	NC_012985	CAT	2	6	24383	24388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
555	NC_012985	GCA	2	6	24424	24429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
556	NC_012985	ACC	2	6	24474	24479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780143
557	NC_012985	TGT	2	6	24505	24510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780143
558	NC_012985	AG	3	6	24517	24522	50 %	0 %	50 %	0 %	254780143
559	NC_012985	CAT	2	6	24632	24637	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
560	NC_012985	CTT	2	6	24695	24700	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
561	NC_012985	ATC	3	9	24774	24782	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
562	NC_012985	TCT	2	6	24794	24799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
563	NC_012985	TAA	2	6	24878	24883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
564	NC_012985	TCT	2	6	24893	24898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
565	NC_012985	TTA	2	6	25057	25062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780143
566	NC_012985	CTGA	2	8	25088	25095	25 %	25 %	25 %	25 %	254780143
567	NC_012985	CAA	2	6	25112	25117	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
568	NC_012985	AGG	2	6	25143	25148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780143
569	NC_012985	ATC	2	6	25152	25157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
570	NC_012985	C	6	6	25157	25162	0 %	0 %	0 %	100 %	254780143
571	NC_012985	TCT	2	6	25169	25174	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
572	NC_012985	CCA	2	6	25281	25286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780143
573	NC_012985	AAATC	2	10	25307	25316	60 %	20 %	0 %	20 %	254780143
574	NC_012985	CGTT	2	8	25483	25490	0 %	50 %	25 %	25 %	254780143
575	NC_012985	CACG	2	8	25571	25578	25 %	0 %	25 %	50 %	254780143
576	NC_012985	TTC	2	6	25617	25622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
577	NC_012985	CTA	2	6	25661	25666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
578	NC_012985	GAT	2	6	25701	25706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780143
579	NC_012985	TCT	2	6	25768	25773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
580	NC_012985	TTC	2	6	25809	25814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
581	NC_012985	CGA	2	6	25907	25912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
582	NC_012985	TCA	2	6	25987	25992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
583	NC_012985	TCA	2	6	26051	26056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
584	NC_012985	CGAA	2	8	26106	26113	50 %	0 %	25 %	25 %	254780143
585	NC_012985	CAA	2	6	26162	26167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
586	NC_012985	AGC	2	6	26169	26174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
587	NC_012985	TAA	2	6	26235	26240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
588	NC_012985	GA	3	6	26313	26318	50 %	0 %	50 %	0 %	254780143
589	NC_012985	AGGCG	2	10	26343	26352	20 %	0 %	60 %	20 %	254780143
590	NC_012985	T	6	6	26366	26371	0 %	100 %	0 %	0 %	254780143
591	NC_012985	TCT	2	6	26389	26394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
592	NC_012985	TCA	2	6	26440	26445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
593	NC_012985	TCT	2	6	26479	26484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
594	NC_012985	ACA	2	6	26503	26508	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
595	NC_012985	ACG	2	6	26582	26587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
596	NC_012985	AACT	2	8	26594	26601	50 %	25 %	0 %	25 %	254780143
597	NC_012985	CAG	2	6	26630	26635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
598	NC_012985	CTCGCT	2	12	26689	26700	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	254780143
599	NC_012985	CCT	2	6	26704	26709	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780143
600	NC_012985	ACG	2	6	26727	26732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
601	NC_012985	TG	4	8	26733	26740	0 %	50 %	50 %	0 %	254780143
602	NC_012985	AG	3	6	26752	26757	50 %	0 %	50 %	0 %	254780143
603	NC_012985	TTC	2	6	26766	26771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
604	NC_012985	CAG	2	6	26810	26815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
605	NC_012985	ACA	2	6	26818	26823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780143
606	NC_012985	TAA	2	6	26834	26839	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
607	NC_012985	TGA	2	6	26871	26876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780143
608	NC_012985	TTC	2	6	26929	26934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
609	NC_012985	GAAC	2	8	26950	26957	50 %	0 %	25 %	25 %	254780143
610	NC_012985	CGA	2	6	26959	26964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780143
611	NC_012985	TCA	2	6	26983	26988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
612	NC_012985	ATA	2	6	27028	27033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
613	NC_012985	AAT	2	6	27036	27041	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
614	NC_012985	TCT	2	6	27043	27048	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
615	NC_012985	CAT	2	6	27065	27070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
616	NC_012985	AAAGA	2	10	27144	27153	80 %	0 %	20 %	0 %	254780143
617	NC_012985	ATT	3	9	27282	27290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780143
618	NC_012985	TCA	2	6	27358	27363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780143
619	NC_012985	AT	4	8	27382	27389	50 %	50 %	0 %	0 %	254780143
620	NC_012985	TCT	2	6	27415	27420	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780143
621	NC_012985	TACA	2	8	27423	27430	50 %	25 %	0 %	25 %	254780143
622	NC_012985	TTTC	2	8	27476	27483	0 %	75 %	0 %	25 %	254780143
623	NC_012985	TAA	2	6	27492	27497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780143
624	NC_012985	TTTC	2	8	27510	27517	0 %	75 %	0 %	25 %	254780143
625	NC_012985	GAA	2	6	27559	27564	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780143
626	NC_012985	ACCA	2	8	27576	27583	50 %	0 %	0 %	50 %	254780143
627	NC_012985	A	6	6	27694	27699	100 %	0 %	0 %	0 %	254780143
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629	NC_012985	ATGA	2	8	27738	27745	50 %	25 %	25 %	0 %	254780143
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