MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Liberibacter asiaticus str. psy62 chromosome

Total Repeats: 28856

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012985	AGA	2	6	215453	215458	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780322
5002	NC_012985	TAT	2	6	215498	215503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780322
5003	NC_012985	GATGG	2	10	215510	215519	20 %	20 %	60 %	0 %	254780322
5004	NC_012985	CTA	2	6	215524	215529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780322
5005	NC_012985	AATA	2	8	215551	215558	75 %	25 %	0 %	0 %	254780322
5006	NC_012985	A	8	8	215576	215583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012985	AAT	2	6	215646	215651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_012985	A	6	6	215658	215663	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5009	NC_012985	ATA	2	6	215669	215674	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012985	GAGAA	2	10	215680	215689	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012985	ACG	2	6	215712	215717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5012	NC_012985	GAA	2	6	215732	215737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5013	NC_012985	TAA	2	6	215824	215829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780323
5014	NC_012985	AT	3	6	215864	215869	50 %	50 %	0 %	0 %	254780323
5015	NC_012985	GAA	2	6	215891	215896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780323
5016	NC_012985	CCT	2	6	215994	215999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780323
5017	NC_012985	TCA	2	6	216036	216041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780323
5018	NC_012985	CTTA	2	8	216098	216105	25 %	50 %	0 %	25 %	254780323
5019	NC_012985	CGCTAA	2	12	216134	216145	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	254780323
5020	NC_012985	ACC	2	6	216265	216270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780323
5021	NC_012985	TAC	2	6	216289	216294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780323
5022	NC_012985	TTTC	2	8	216394	216401	0 %	75 %	0 %	25 %	254780323
5023	NC_012985	TAATTT	2	12	216509	216520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780323
5024	NC_012985	T	6	6	216518	216523	0 %	100 %	0 %	0 %	254780323
5025	NC_012985	CTG	2	6	216551	216556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780323
5026	NC_012985	CATC	2	8	216581	216588	25 %	25 %	0 %	50 %	254780323
5027	NC_012985	AAT	2	6	216637	216642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780323
5028	NC_012985	ACC	2	6	216686	216691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780323
5029	NC_012985	TCC	2	6	216750	216755	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780323
5030	NC_012985	AAC	2	6	216834	216839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780323
5031	NC_012985	TAAA	3	12	216860	216871	75 %	25 %	0 %	0 %	254780323
5032	NC_012985	TAAGG	2	10	216877	216886	40 %	20 %	40 %	0 %	254780323
5033	NC_012985	AAAG	2	8	216971	216978	75 %	0 %	25 %	0 %	254780323
5034	NC_012985	A	7	7	216983	216989	100 %	0 %	0 %	0 %	254780323
5035	NC_012985	ACT	2	6	216993	216998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780323
5036	NC_012985	A	6	6	217003	217008	100 %	0 %	0 %	0 %	254780323
5037	NC_012985	AT	3	6	217041	217046	50 %	50 %	0 %	0 %	254780323
5038	NC_012985	AC	3	6	217077	217082	50 %	0 %	0 %	50 %	254780323
5039	NC_012985	AAC	2	6	217124	217129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780323
5040	NC_012985	ATA	2	6	217168	217173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	254780323
5041	NC_012985	CAT	2	6	217181	217186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780323
5042	NC_012985	TTC	2	6	217206	217211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780323
5043	NC_012985	A	6	6	217234	217239	100 %	0 %	0 %	0 %	254780323
5044	NC_012985	CAA	2	6	217253	217258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780323
5045	NC_012985	TC	3	6	217295	217300	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5046	NC_012985	CAA	2	6	217327	217332	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5047	NC_012985	CT	3	6	217336	217341	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5048	NC_012985	A	7	7	217387	217393	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5049	NC_012985	TTAC	2	8	217407	217414	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5050	NC_012985	T	6	6	217466	217471	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5051	NC_012985	ATT	2	6	217480	217485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5052	NC_012985	A	6	6	217509	217514	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5053	NC_012985	ATC	2	6	217529	217534	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5054	NC_012985	ATCAA	2	10	217542	217551	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5055	NC_012985	ATGA	2	8	217580	217587	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5056	NC_012985	ATTAAT	2	12	217591	217602	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5057	NC_012985	AC	3	6	217661	217666	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5058	NC_012985	ATAC	2	8	217702	217709	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5059	NC_012985	CTT	2	6	217714	217719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_012985	TAG	2	6	217794	217799	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_012985	T	6	6	217821	217826	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5062	NC_012985	ATT	2	6	217834	217839	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5063	NC_012985	TCT	2	6	217929	217934	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780324
5064	NC_012985	CAA	2	6	217973	217978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780324
5065	NC_012985	TAC	2	6	218013	218018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780324
5066	NC_012985	TC	3	6	218044	218049	0 %	50 %	0 %	50 %	254780324
5067	NC_012985	AGT	2	6	218160	218165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5068	NC_012985	TTC	2	6	218204	218209	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5069	NC_012985	A	6	6	218254	218259	100 %	0 %	0 %	0 %	254780325
5070	NC_012985	ATC	2	6	218304	218309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780325
5071	NC_012985	TGC	2	6	218329	218334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780325
5072	NC_012985	GACA	2	8	218369	218376	50 %	0 %	25 %	25 %	254780325
5073	NC_012985	A	7	7	218376	218382	100 %	0 %	0 %	0 %	254780325
5074	NC_012985	CAA	2	6	218453	218458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780325
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5077	NC_012985	GAC	2	6	218567	218572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780325
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5079	NC_012985	TCC	2	6	218589	218594	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780325
5080	NC_012985	CTA	3	9	218615	218623	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780325
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5082	NC_012985	TCA	2	6	218668	218673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_012985	ATT	2	6	218754	218759	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5084	NC_012985	AT	3	6	218815	218820	50 %	50 %	0 %	0 %	254780326
5085	NC_012985	CA	3	6	218889	218894	50 %	0 %	0 %	50 %	254780326
5086	NC_012985	TCT	2	6	218897	218902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780326
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5089	NC_012985	CCAAA	2	10	218974	218983	60 %	0 %	0 %	40 %	254780326
5090	NC_012985	CCA	2	6	219045	219050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	254780326
5091	NC_012985	GATA	2	8	219099	219106	50 %	25 %	25 %	0 %	254780326
5092	NC_012985	CTT	2	6	219114	219119	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780326
5093	NC_012985	AAG	2	6	219159	219164	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	254780326
5094	NC_012985	AG	3	6	219224	219229	50 %	0 %	50 %	0 %	254780326
5095	NC_012985	ACA	2	6	219308	219313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780326
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5097	NC_012985	AGT	2	6	219441	219446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780326
5098	NC_012985	ATC	2	6	219463	219468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780326
5099	NC_012985	TCA	2	6	219557	219562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780326
5100	NC_012985	CAAGC	2	10	219578	219587	40 %	0 %	20 %	40 %	254780326
5101	NC_012985	AC	3	6	219620	219625	50 %	0 %	0 %	50 %	254780326
5102	NC_012985	CAAA	2	8	219629	219636	75 %	0 %	0 %	25 %	254780326
5103	NC_012985	TCC	2	6	219688	219693	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	254780326
5104	NC_012985	A	7	7	219907	219913	100 %	0 %	0 %	0 %	254780326
5105	NC_012985	CAT	2	6	219914	219919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780326
5106	NC_012985	GCG	2	6	219946	219951	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	254780326
5107	NC_012985	CAACA	2	10	220032	220041	60 %	0 %	0 %	40 %	254780326
5108	NC_012985	A	6	6	220062	220067	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_012985	A	6	6	220087	220092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_012985	T	6	6	220192	220197	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_012985	TAA	2	6	220293	220298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_012985	ATA	2	6	220306	220311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012985	TTC	2	6	220319	220324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5114	NC_012985	GCAA	2	8	220369	220376	50 %	0 %	25 %	25 %	254780327
5115	NC_012985	ACG	2	6	220398	220403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780327
5116	NC_012985	TAT	2	6	220414	220419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	254780327
5117	NC_012985	GAT	2	6	220471	220476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780327
5118	NC_012985	CAA	2	6	220515	220520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780327
5119	NC_012985	GTA	2	6	220561	220566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780327
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5121	NC_012985	AGG	2	6	220620	220625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780327
5122	NC_012985	AGC	2	6	220683	220688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	254780327
5123	NC_012985	TTC	2	6	220691	220696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780327
5124	NC_012985	GTC	2	6	220735	220740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780327
5125	NC_012985	TCGC	2	8	220757	220764	0 %	25 %	25 %	50 %	254780327
5126	NC_012985	TC	3	6	220833	220838	0 %	50 %	0 %	50 %	254780327
5127	NC_012985	TGA	2	6	220839	220844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780327
5128	NC_012985	CGC	2	6	220849	220854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	254780327
5129	NC_012985	GCT	2	6	220855	220860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	254780327
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5131	NC_012985	AAC	2	6	220888	220893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	254780327
5132	NC_012985	TGA	2	6	220977	220982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780327
5133	NC_012985	GCAC	2	8	221008	221015	25 %	0 %	25 %	50 %	254780327
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5140	NC_012985	TCA	2	6	221315	221320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780327
5141	NC_012985	ATG	2	6	221341	221346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780327
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5143	NC_012985	CT	4	8	221426	221433	0 %	50 %	0 %	50 %	254780327
5144	NC_012985	ACT	2	6	221450	221455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	254780327
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5152	NC_012985	CTAG	2	8	221707	221714	25 %	25 %	25 %	25 %	254780327
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5154	NC_012985	GGA	2	6	221863	221868	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780327
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5158	NC_012985	AGG	2	6	221988	221993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	254780327
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5161	NC_012985	GAT	2	6	222109	222114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	254780327
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5185	NC_012985	CTTA	2	8	223137	223144	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
5186	NC_012985	GTT	2	6	223196	223201	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	254780328
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5231	NC_012985	AT	3	6	225433	225438	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5232	NC_012985	TTTC	2	8	225476	225483	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
5233	NC_012985	T	7	7	225500	225506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5234	NC_012985	AAT	2	6	225514	225519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5235	NC_012985	GT	3	6	225541	225546	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5236	NC_012985	CTT	2	6	225622	225627	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5237	NC_012985	TCT	2	6	225653	225658	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5238	NC_012985	AG	3	6	225660	225665	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
5239	NC_012985	A	7	7	225726	225732	100 %	0 %	0 %	0 %	254780331
5240	NC_012985	TTC	3	9	225745	225753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	254780331
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