MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 3587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012960	CAA	2	6	60111	60116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795615
1502	NC_012960	AAG	2	6	60133	60138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795615
1503	NC_012960	AC	3	6	60163	60168	50 %	0 %	0 %	50 %	253795615
1504	NC_012960	GT	3	6	60220	60225	0 %	50 %	50 %	0 %	253795615
1505	NC_012960	TGGC	2	8	60259	60266	0 %	25 %	50 %	25 %	253795615
1506	NC_012960	GC	3	6	60318	60323	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1507	NC_012960	GCT	2	6	60362	60367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795616
1508	NC_012960	GT	3	6	60380	60385	0 %	50 %	50 %	0 %	253795616
1509	NC_012960	GGT	2	6	60386	60391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795616
1510	NC_012960	GC	3	6	60435	60440	0 %	0 %	50 %	50 %	253795616
1511	NC_012960	GT	3	6	60455	60460	0 %	50 %	50 %	0 %	253795616
1512	NC_012960	CTGG	2	8	60530	60537	0 %	25 %	50 %	25 %	253795616
1513	NC_012960	CG	3	6	60538	60543	0 %	0 %	50 %	50 %	253795616
1514	NC_012960	TAA	2	6	60595	60600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	253795616
1515	NC_012960	GC	3	6	60623	60628	0 %	0 %	50 %	50 %	253795616
1516	NC_012960	GT	3	6	60637	60642	0 %	50 %	50 %	0 %	253795616
1517	NC_012960	GAG	2	6	60730	60735	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253795616
1518	NC_012960	CG	3	6	60825	60830	0 %	0 %	50 %	50 %	253795616
1519	NC_012960	TG	3	6	60831	60836	0 %	50 %	50 %	0 %	253795616
1520	NC_012960	GC	3	6	60891	60896	0 %	0 %	50 %	50 %	253795617
1521	NC_012960	GAT	2	6	60945	60950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795617
1522	NC_012960	ACAA	2	8	60953	60960	75 %	0 %	0 %	25 %	253795617
1523	NC_012960	GCG	2	6	60961	60966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795617
1524	NC_012960	TGG	2	6	61042	61047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795617
1525	NC_012960	GC	3	6	61049	61054	0 %	0 %	50 %	50 %	253795617
1526	NC_012960	CG	3	6	61062	61067	0 %	0 %	50 %	50 %	253795617
1527	NC_012960	GT	3	6	61070	61075	0 %	50 %	50 %	0 %	253795617
1528	NC_012960	GCT	2	6	61114	61119	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795617
1529	NC_012960	GC	3	6	61164	61169	0 %	0 %	50 %	50 %	253795617
1530	NC_012960	CGC	2	6	61183	61188	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795617
1531	NC_012960	GC	3	6	61288	61293	0 %	0 %	50 %	50 %	253795617
1532	NC_012960	GCTC	2	8	61331	61338	0 %	25 %	25 %	50 %	253795617
1533	NC_012960	GCT	2	6	61339	61344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795617
1534	NC_012960	AGCG	2	8	61371	61378	25 %	0 %	50 %	25 %	253795617
1535	NC_012960	TTTAGC	2	12	61381	61392	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	253795617
1536	NC_012960	AGC	2	6	61414	61419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795617
1537	NC_012960	AAGCC	2	10	61421	61430	40 %	0 %	20 %	40 %	253795617
1538	NC_012960	AGC	2	6	61508	61513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795618
1539	NC_012960	GCC	2	6	61522	61527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795618
1540	NC_012960	GCAG	2	8	61537	61544	25 %	0 %	50 %	25 %	253795618
1541	NC_012960	AAC	2	6	61546	61551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795618
1542	NC_012960	GGC	2	6	61582	61587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795618
1543	NC_012960	GCGT	2	8	61593	61600	0 %	25 %	50 %	25 %	253795618
1544	NC_012960	GTG	2	6	61631	61636	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795618
1545	NC_012960	GC	3	6	61678	61683	0 %	0 %	50 %	50 %	253795618
1546	NC_012960	GCT	2	6	61689	61694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795618
1547	NC_012960	GCG	2	6	61781	61786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795618
1548	NC_012960	CGG	2	6	61854	61859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795618
1549	NC_012960	CGC	2	6	61872	61877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795618
1550	NC_012960	AGCT	2	8	61904	61911	25 %	25 %	25 %	25 %	253795618
1551	NC_012960	GTG	2	6	61918	61923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795618
1552	NC_012960	ACGC	2	8	61999	62006	25 %	0 %	25 %	50 %	253795618
1553	NC_012960	CGG	2	6	62100	62105	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795618
1554	NC_012960	GAAG	2	8	62168	62175	50 %	0 %	50 %	0 %	253795618
1555	NC_012960	GCGAC	2	10	62181	62190	20 %	0 %	40 %	40 %	253795618
1556	NC_012960	TG	3	6	62245	62250	0 %	50 %	50 %	0 %	253795619
1557	NC_012960	GCC	2	6	62254	62259	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795619
1558	NC_012960	GC	3	6	62298	62303	0 %	0 %	50 %	50 %	253795619
1559	NC_012960	GCT	2	6	62306	62311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795619
1560	NC_012960	CGG	2	6	62321	62326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795619
1561	NC_012960	TGG	2	6	62412	62417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795619
1562	NC_012960	GCAC	2	8	62457	62464	25 %	0 %	25 %	50 %	253795619
1563	NC_012960	GC	3	6	62468	62473	0 %	0 %	50 %	50 %	253795619
1564	NC_012960	GCTA	2	8	62484	62491	25 %	25 %	25 %	25 %	253795619
1565	NC_012960	GCTG	2	8	62495	62502	0 %	25 %	50 %	25 %	253795620
1566	NC_012960	A	6	6	62519	62524	100 %	0 %	0 %	0 %	253795620
1567	NC_012960	GC	3	6	62528	62533	0 %	0 %	50 %	50 %	253795620
1568	NC_012960	GC	3	6	62538	62543	0 %	0 %	50 %	50 %	253795620
1569	NC_012960	GC	3	6	62566	62571	0 %	0 %	50 %	50 %	253795620
1570	NC_012960	T	7	7	62572	62578	0 %	100 %	0 %	0 %	253795620
1571	NC_012960	GCT	2	6	62612	62617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795620
1572	NC_012960	TTG	2	6	62686	62691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795620
1573	NC_012960	GCT	2	6	62751	62756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795620
1574	NC_012960	GCG	2	6	62762	62767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795620
1575	NC_012960	GCT	2	6	62786	62791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795620
1576	NC_012960	CAA	2	6	62812	62817	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	253795621
1577	NC_012960	AACC	2	8	62818	62825	50 %	0 %	0 %	50 %	253795621
1578	NC_012960	GGA	2	6	62860	62865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253795621
1579	NC_012960	AAG	2	6	62982	62987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795621
1580	NC_012960	GTG	2	6	62999	63004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795621
1581	NC_012960	CGA	2	6	63016	63021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795621
1582	NC_012960	CTT	2	6	63031	63036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253795621
1583	NC_012960	GAC	2	6	63125	63130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795621
1584	NC_012960	CCCA	2	8	63138	63145	25 %	0 %	0 %	75 %	253795621
1585	NC_012960	GAT	2	6	63170	63175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795621
1586	NC_012960	AGCT	2	8	63256	63263	25 %	25 %	25 %	25 %	253795621
1587	NC_012960	GGT	2	6	63281	63286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795621
1588	NC_012960	AAAC	2	8	63375	63382	75 %	0 %	0 %	25 %	253795621
1589	NC_012960	GGTGTG	2	12	63403	63414	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795621
1590	NC_012960	CAGCC	2	10	63429	63438	20 %	0 %	20 %	60 %	253795621
1591	NC_012960	AAG	2	6	63450	63455	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795621
1592	NC_012960	AGGCTG	2	12	63468	63479	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	253795621
1593	NC_012960	GC	3	6	63538	63543	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1594	NC_012960	AAG	2	6	63648	63653	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795622
1595	NC_012960	GGGCAA	2	12	63671	63682	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	253795622
1596	NC_012960	TGC	2	6	63727	63732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795622
1597	NC_012960	GCT	2	6	63780	63785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795622
1598	NC_012960	GTG	2	6	63854	63859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795623
1599	NC_012960	TGC	2	6	63864	63869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795623
1600	NC_012960	TGG	2	6	63891	63896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795623
1601	NC_012960	GCTG	2	8	64000	64007	0 %	25 %	50 %	25 %	253795623
1602	NC_012960	GC	3	6	64011	64016	0 %	0 %	50 %	50 %	253795623
1603	NC_012960	GC	3	6	64039	64044	0 %	0 %	50 %	50 %	253795623
1604	NC_012960	AGCGC	2	10	64142	64151	20 %	0 %	40 %	40 %	253795624
1605	NC_012960	GTT	2	6	64222	64227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795624
1606	NC_012960	GTG	2	6	64234	64239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795624
1607	NC_012960	ACG	2	6	64255	64260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795624
1608	NC_012960	GCT	2	6	64266	64271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795624
1609	NC_012960	GTG	3	9	64300	64308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795624
1610	NC_012960	CTA	2	6	64334	64339	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795624
1611	NC_012960	GTT	2	6	64351	64356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795624
1612	NC_012960	CG	3	6	64428	64433	0 %	0 %	50 %	50 %	253795625
1613	NC_012960	GC	3	6	64451	64456	0 %	0 %	50 %	50 %	253795625
1614	NC_012960	GGT	2	6	64471	64476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795625
1615	NC_012960	GCT	2	6	64484	64489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795625
1616	NC_012960	GC	4	8	64493	64500	0 %	0 %	50 %	50 %	253795625
1617	NC_012960	GTC	2	6	64502	64507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795625
1618	NC_012960	GC	5	10	64518	64527	0 %	0 %	50 %	50 %	253795625
1619	NC_012960	GCG	2	6	64549	64554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795625
1620	NC_012960	GCG	2	6	64556	64561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795625
1621	NC_012960	GTG	2	6	64578	64583	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795625
1622	NC_012960	CTG	2	6	64626	64631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795626
1623	NC_012960	CAG	2	6	64703	64708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795626
1624	NC_012960	GC	3	6	64709	64714	0 %	0 %	50 %	50 %	253795626
1625	NC_012960	CGA	2	6	64798	64803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795626
1626	NC_012960	GCT	2	6	64889	64894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795626
1627	NC_012960	GC	3	6	64940	64945	0 %	0 %	50 %	50 %	253795626
1628	NC_012960	ACT	2	6	64984	64989	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795626
1629	NC_012960	CGT	2	6	65060	65065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795626
1630	NC_012960	GC	3	6	65067	65072	0 %	0 %	50 %	50 %	253795626
1631	NC_012960	GCT	2	6	65093	65098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795626
1632	NC_012960	GC	3	6	65141	65146	0 %	0 %	50 %	50 %	253795627
1633	NC_012960	GAGC	2	8	65166	65173	25 %	0 %	50 %	25 %	253795627
1634	NC_012960	CG	4	8	65210	65217	0 %	0 %	50 %	50 %	253795627
1635	NC_012960	GCA	2	6	65241	65246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795627
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1637	NC_012960	CTA	2	6	65343	65348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795627
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1642	NC_012960	TGG	2	6	65605	65610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795628
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1644	NC_012960	TGCT	2	8	65736	65743	0 %	50 %	25 %	25 %	253795628
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1650	NC_012960	GC	4	8	65952	65959	0 %	0 %	50 %	50 %	253795629
1651	NC_012960	TGGC	2	8	66017	66024	0 %	25 %	50 %	25 %	253795629
1652	NC_012960	TTAAGC	2	12	66147	66158	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	253795629
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1656	NC_012960	CTCA	2	8	66379	66386	25 %	25 %	0 %	50 %	253795630
1657	NC_012960	GC	3	6	66411	66416	0 %	0 %	50 %	50 %	253795630
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1659	NC_012960	GCT	2	6	66438	66443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795630
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1663	NC_012960	GC	4	8	66509	66516	0 %	0 %	50 %	50 %	253795630
1664	NC_012960	CGT	2	6	66548	66553	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795631
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1681	NC_012960	GC	3	6	67308	67313	0 %	0 %	50 %	50 %	253795632
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1740	NC_012960	AGC	2	6	69789	69794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795637
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1748	NC_012960	GCC	2	6	70007	70012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795638
1749	NC_012960	GTC	2	6	70025	70030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795638
1750	NC_012960	CTG	2	6	70039	70044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795638
1751	NC_012960	CTTCG	2	10	70093	70102	0 %	40 %	20 %	40 %	253795638
1752	NC_012960	CAC	2	6	70190	70195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795638
1753	NC_012960	GCG	2	6	70211	70216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795638
1754	NC_012960	AGC	2	6	70272	70277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795638
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