MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hodgkinia cicadicola Dsem chromosome

Total Repeats: 3587

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012960	TGCT	2	8	38763	38770	0 %	50 %	25 %	25 %	253795592
1002	NC_012960	CCA	2	6	38814	38819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795592
1003	NC_012960	GC	4	8	38941	38948	0 %	0 %	50 %	50 %	253795592
1004	NC_012960	GT	4	8	38970	38977	0 %	50 %	50 %	0 %	253795592
1005	NC_012960	CAC	2	6	39008	39013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	253795592
1006	NC_012960	CCG	2	6	39096	39101	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795592
1007	NC_012960	GGC	2	6	39167	39172	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795592
1008	NC_012960	TAC	2	6	39200	39205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795592
1009	NC_012960	CGCT	2	8	39216	39223	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1010	NC_012960	GCT	2	6	39233	39238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1011	NC_012960	GC	3	6	39278	39283	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_012960	GC	4	8	39365	39372	0 %	0 %	50 %	50 %	253795593
1013	NC_012960	GCT	2	6	39376	39381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795593
1014	NC_012960	ATG	2	6	39539	39544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795593
1015	NC_012960	T	6	6	39548	39553	0 %	100 %	0 %	0 %	253795593
1016	NC_012960	GCT	2	6	39691	39696	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795593
1017	NC_012960	ATG	2	6	39743	39748	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795593
1018	NC_012960	CGC	2	6	39752	39757	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795593
1019	NC_012960	TGC	2	6	39794	39799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795593
1020	NC_012960	GCT	3	9	39844	39852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795593
1021	NC_012960	GTT	2	6	39882	39887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795594
1022	NC_012960	ACT	2	6	39973	39978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795594
1023	NC_012960	GT	3	6	40110	40115	0 %	50 %	50 %	0 %	253795594
1024	NC_012960	GCTGGC	2	12	40157	40168	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	253795594
1025	NC_012960	TGC	2	6	40233	40238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1026	NC_012960	TTGT	2	8	40250	40257	0 %	75 %	25 %	0 %	253795595
1027	NC_012960	GCC	2	6	40281	40286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795595
1028	NC_012960	GCG	2	6	40290	40295	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795595
1029	NC_012960	ACG	2	6	40578	40583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1030	NC_012960	GTG	2	6	40739	40744	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795595
1031	NC_012960	GAC	2	6	40745	40750	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1032	NC_012960	GCT	2	6	40793	40798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1033	NC_012960	GCT	2	6	40816	40821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1034	NC_012960	GC	3	6	40822	40827	0 %	0 %	50 %	50 %	253795595
1035	NC_012960	GCC	2	6	40854	40859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795595
1036	NC_012960	GC	3	6	40885	40890	0 %	0 %	50 %	50 %	253795595
1037	NC_012960	TAG	2	6	40986	40991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	253795595
1038	NC_012960	CCCACC	2	12	41045	41056	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	253795595
1039	NC_012960	TG	4	8	41061	41068	0 %	50 %	50 %	0 %	253795595
1040	NC_012960	AAG	2	6	41075	41080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795595
1041	NC_012960	CAG	2	6	41092	41097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1042	NC_012960	GC	3	6	41145	41150	0 %	0 %	50 %	50 %	253795595
1043	NC_012960	GC	3	6	41179	41184	0 %	0 %	50 %	50 %	253795595
1044	NC_012960	GGC	2	6	41197	41202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	253795595
1045	NC_012960	TGT	2	6	41203	41208	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	253795595
1046	NC_012960	GCT	2	6	41224	41229	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1047	NC_012960	GTG	2	6	41291	41296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795595
1048	NC_012960	GA	3	6	41440	41445	50 %	0 %	50 %	0 %	253795595
1049	NC_012960	ACG	2	6	41460	41465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795595
1050	NC_012960	CTT	2	6	41474	41479	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253795595
1051	NC_012960	GA	3	6	41482	41487	50 %	0 %	50 %	0 %	253795595
1052	NC_012960	GGT	2	6	41491	41496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	253795595
1053	NC_012960	CG	3	6	41542	41547	0 %	0 %	50 %	50 %	253795595
1054	NC_012960	TAGCT	2	10	41549	41558	20 %	40 %	20 %	20 %	253795595
1055	NC_012960	CAG	2	6	41564	41569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012960	CGT	2	6	41577	41582	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_012960	TTC	2	6	41589	41594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1058	NC_012960	GTTTC	2	10	41626	41635	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1059	NC_012960	C	7	7	41660	41666	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1060	NC_012960	T	8	8	41688	41695	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_012960	GCGCC	4	20	41732	41751	0 %	0 %	40 %	60 %	253795596
1062	NC_012960	T	7	7	41809	41815	0 %	100 %	0 %	0 %	253795596
1063	NC_012960	T	7	7	41827	41833	0 %	100 %	0 %	0 %	253795596
1064	NC_012960	C	7	7	41879	41885	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1065	NC_012960	T	7	7	41894	41900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_012960	T	6	6	41931	41936	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_012960	GC	3	6	41969	41974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1068	NC_012960	TGC	2	6	41991	41996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_012960	GC	3	6	41995	42000	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1070	NC_012960	TCC	2	6	42017	42022	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_012960	TTC	2	6	42038	42043	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_012960	GCT	2	6	42046	42051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_012960	GC	5	10	42053	42062	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1074	NC_012960	CT	3	6	42078	42083	0 %	50 %	0 %	50 %	253795597
1075	NC_012960	ACG	2	6	42107	42112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795597
1076	NC_012960	TGC	2	6	42121	42126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795597
1077	NC_012960	T	7	7	42144	42150	0 %	100 %	0 %	0 %	253795597
1078	NC_012960	A	7	7	42154	42160	100 %	0 %	0 %	0 %	253795597
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1080	NC_012960	T	7	7	42229	42235	0 %	100 %	0 %	0 %	253795597
1081	NC_012960	CTT	2	6	42242	42247	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253795597
1082	NC_012960	GT	4	8	42248	42255	0 %	50 %	50 %	0 %	253795597
1083	NC_012960	GT	3	6	42259	42264	0 %	50 %	50 %	0 %	253795597
1084	NC_012960	GT	3	6	42269	42274	0 %	50 %	50 %	0 %	253795597
1085	NC_012960	GA	4	8	42276	42283	50 %	0 %	50 %	0 %	253795597
1086	NC_012960	GT	3	6	42284	42289	0 %	50 %	50 %	0 %	253795597
1087	NC_012960	GGGTG	2	10	42290	42299	0 %	20 %	80 %	0 %	253795597
1088	NC_012960	GT	4	8	42303	42310	0 %	50 %	50 %	0 %	253795597
1089	NC_012960	GT	3	6	42321	42326	0 %	50 %	50 %	0 %	253795597
1090	NC_012960	G	7	7	42327	42333	0 %	0 %	100 %	0 %	253795597
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1093	NC_012960	GA	3	6	42361	42366	50 %	0 %	50 %	0 %	253795597
1094	NC_012960	GA	3	6	42370	42375	50 %	0 %	50 %	0 %	253795597
1095	NC_012960	GT	3	6	42406	42411	0 %	50 %	50 %	0 %	253795597
1096	NC_012960	TCTA	2	8	42413	42420	25 %	50 %	0 %	25 %	253795597
1097	NC_012960	CAG	2	6	42457	42462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795598
1098	NC_012960	CGC	2	6	42482	42487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795598
1099	NC_012960	TGC	2	6	42566	42571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795598
1100	NC_012960	TC	3	6	42580	42585	0 %	50 %	0 %	50 %	253795598
1101	NC_012960	AGA	2	6	42630	42635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	253795599
1102	NC_012960	A	6	6	42635	42640	100 %	0 %	0 %	0 %	253795599
1103	NC_012960	CGAAGC	2	12	42652	42663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795599
1104	NC_012960	T	7	7	42738	42744	0 %	100 %	0 %	0 %	253795599
1105	NC_012960	A	6	6	42816	42821	100 %	0 %	0 %	0 %	253795600
1106	NC_012960	GCT	2	6	42854	42859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795600
1107	NC_012960	AGCG	2	8	42867	42874	25 %	0 %	50 %	25 %	253795600
1108	NC_012960	GC	3	6	42891	42896	0 %	0 %	50 %	50 %	253795600
1109	NC_012960	A	8	8	42908	42915	100 %	0 %	0 %	0 %	253795600
1110	NC_012960	GCTC	2	8	42924	42931	0 %	25 %	25 %	50 %	253795600
1111	NC_012960	T	6	6	43019	43024	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012960	CTT	2	6	43025	43030	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_012960	CTC	8	24	43031	43054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1114	NC_012960	TTC	9	27	43059	43085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_012960	CTC	2	6	43086	43091	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1116	NC_012960	C	7	7	43091	43097	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1117	NC_012960	G	6	6	43123	43128	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_012960	GCTG	2	8	43164	43171	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1119	NC_012960	AGCTT	2	10	43177	43186	20 %	40 %	20 %	20 %	253795601
1120	NC_012960	GT	3	6	43200	43205	0 %	50 %	50 %	0 %	253795601
1121	NC_012960	CTT	2	6	43329	43334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	253795601
1122	NC_012960	GCC	2	6	43382	43387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795602
1123	NC_012960	GAC	2	6	43424	43429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795602
1124	NC_012960	GC	4	8	43455	43462	0 %	0 %	50 %	50 %	253795602
1125	NC_012960	CGC	2	6	43464	43469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	253795602
1126	NC_012960	GC	3	6	43496	43501	0 %	0 %	50 %	50 %	253795602
1127	NC_012960	TCA	2	6	43545	43550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	253795602
1128	NC_012960	GCT	3	9	43595	43603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795602
1129	NC_012960	GCTG	2	8	43618	43625	0 %	25 %	50 %	25 %	253795602
1130	NC_012960	GCT	2	6	43689	43694	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	253795602
1131	NC_012960	TG	3	6	43712	43717	0 %	50 %	50 %	0 %	253795603
1132	NC_012960	CGA	2	6	43728	43733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	253795603
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1136	NC_012960	GC	3	6	43794	43799	0 %	0 %	50 %	50 %	253795603
1137	NC_012960	GC	3	6	43810	43815	0 %	0 %	50 %	50 %	253795603
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1143	NC_012960	TTTGGG	2	12	44013	44024	0 %	50 %	50 %	0 %	253795604
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1387	NC_012960	CG	3	6	54685	54690	0 %	0 %	50 %	50 %	253795610
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1498	NC_012960	GAG	2	6	59985	59990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	253795615
1499	NC_012960	GC	4	8	60000	60007	0 %	0 %	50 %	50 %	253795615
1500	NC_012960	CCAA	2	8	60085	60092	50 %	0 %	0 %	50 %	253795615

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