MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) plasmid pHD5AT

Total Repeats: 1350

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012752	TGGCTT	2	12	20928	20939	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	238899359
502	NC_012752	GCCA	2	8	20946	20953	25 %	0 %	25 %	50 %	238899359
503	NC_012752	TGC	2	6	20961	20966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899359
504	NC_012752	GCA	2	6	20976	20981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899359
505	NC_012752	GAT	2	6	20998	21003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899359
506	NC_012752	CAT	2	6	21123	21128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899359
507	NC_012752	CAG	2	6	21218	21223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899359
508	NC_012752	AGAC	2	8	21237	21244	50 %	0 %	25 %	25 %	238899359
509	NC_012752	C	8	8	21423	21430	0 %	0 %	0 %	100 %	238899359
510	NC_012752	GTC	2	6	21458	21463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899359
511	NC_012752	GTCG	2	8	21481	21488	0 %	25 %	50 %	25 %	238899359
512	NC_012752	A	6	6	21522	21527	100 %	0 %	0 %	0 %	238899359
513	NC_012752	CAA	2	6	21532	21537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238899359
514	NC_012752	ACG	2	6	21590	21595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899359
515	NC_012752	GA	3	6	21630	21635	50 %	0 %	50 %	0 %	238899359
516	NC_012752	GA	3	6	21691	21696	50 %	0 %	50 %	0 %	238899359
517	NC_012752	T	6	6	21716	21721	0 %	100 %	0 %	0 %	238899360
518	NC_012752	AGA	2	6	21746	21751	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899360
519	NC_012752	GC	3	6	21772	21777	0 %	0 %	50 %	50 %	238899360
520	NC_012752	CAT	2	6	21796	21801	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899360
521	NC_012752	TGT	2	6	21850	21855	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899360
522	NC_012752	G	6	6	21905	21910	0 %	0 %	100 %	0 %	238899360
523	NC_012752	ATC	2	6	21911	21916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899360
524	NC_012752	AATG	2	8	21921	21928	50 %	25 %	25 %	0 %	238899360
525	NC_012752	T	7	7	21992	21998	0 %	100 %	0 %	0 %	238899360
526	NC_012752	GCG	2	6	22158	22163	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899360
527	NC_012752	GTC	2	6	22185	22190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899360
528	NC_012752	GTC	2	6	22286	22291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899360
529	NC_012752	TGT	2	6	22292	22297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899360
530	NC_012752	ATA	2	6	22309	22314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899360
531	NC_012752	A	6	6	22344	22349	100 %	0 %	0 %	0 %	238899360
532	NC_012752	T	6	6	22387	22392	0 %	100 %	0 %	0 %	238899360
533	NC_012752	GCC	2	6	22393	22398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238899360
534	NC_012752	TGT	2	6	22431	22436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899360
535	NC_012752	TCACTG	2	12	22452	22463	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	238899360
536	NC_012752	A	7	7	22520	22526	100 %	0 %	0 %	0 %	238899360
537	NC_012752	TTCC	2	8	22532	22539	0 %	50 %	0 %	50 %	238899360
538	NC_012752	CAT	2	6	22576	22581	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899360
539	NC_012752	GTC	2	6	22590	22595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899360
540	NC_012752	GT	3	6	22613	22618	0 %	50 %	50 %	0 %	238899360
541	NC_012752	C	6	6	22645	22650	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
542	NC_012752	GA	3	6	22653	22658	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
543	NC_012752	T	6	6	22662	22667	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_012752	TGAG	2	8	22682	22689	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
545	NC_012752	T	6	6	22718	22723	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
546	NC_012752	ATC	2	6	22730	22735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899361
547	NC_012752	CTT	2	6	22828	22833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899361
548	NC_012752	GA	3	6	22986	22991	50 %	0 %	50 %	0 %	238899361
549	NC_012752	T	7	7	23012	23018	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
550	NC_012752	T	6	6	23025	23030	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
551	NC_012752	T	6	6	23051	23056	0 %	100 %	0 %	0 %	238899361
552	NC_012752	A	8	8	23178	23185	100 %	0 %	0 %	0 %	238899361
553	NC_012752	AG	3	6	23234	23239	50 %	0 %	50 %	0 %	238899361
554	NC_012752	GTT	2	6	23260	23265	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899361
555	NC_012752	TTC	2	6	23336	23341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899361
556	NC_012752	AGA	2	6	23523	23528	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899361
557	NC_012752	CCG	2	6	23560	23565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238899361
558	NC_012752	CAGC	2	8	23578	23585	25 %	0 %	25 %	50 %	238899361
559	NC_012752	CGCGG	2	10	23643	23652	0 %	0 %	60 %	40 %	238899361
560	NC_012752	CCT	2	6	23725	23730	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899361
561	NC_012752	A	6	6	23743	23748	100 %	0 %	0 %	0 %	238899361
562	NC_012752	ATG	2	6	23823	23828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899361
563	NC_012752	AG	3	6	23848	23853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012752	TCA	2	6	23883	23888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_012752	GAT	2	6	23919	23924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899362
566	NC_012752	GA	3	6	23929	23934	50 %	0 %	50 %	0 %	238899362
567	NC_012752	A	8	8	23957	23964	100 %	0 %	0 %	0 %	238899362
568	NC_012752	GCAA	2	8	24096	24103	50 %	0 %	25 %	25 %	238899362
569	NC_012752	TGA	2	6	24122	24127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899362
570	NC_012752	GGCAA	2	10	24129	24138	40 %	0 %	40 %	20 %	238899362
571	NC_012752	AAT	2	6	24203	24208	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899362
572	NC_012752	TAT	2	6	24297	24302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899363
573	NC_012752	GCC	2	6	24316	24321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	238899363
574	NC_012752	GA	3	6	24423	24428	50 %	0 %	50 %	0 %	238899363
575	NC_012752	A	6	6	24440	24445	100 %	0 %	0 %	0 %	238899363
576	NC_012752	TTC	2	6	24500	24505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899363
577	NC_012752	TTA	2	6	24520	24525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899363
578	NC_012752	CCA	2	6	24540	24545	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238899363
579	NC_012752	TGA	2	6	24556	24561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899363
580	NC_012752	CAG	2	6	24582	24587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899364
581	NC_012752	GA	3	6	24615	24620	50 %	0 %	50 %	0 %	238899364
582	NC_012752	CA	4	8	24686	24693	50 %	0 %	0 %	50 %	238899364
583	NC_012752	GTT	3	9	24716	24724	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899364
584	NC_012752	GTTGA	2	10	24750	24759	20 %	40 %	40 %	0 %	238899364
585	NC_012752	TTG	2	6	24777	24782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899364
586	NC_012752	T	6	6	24839	24844	0 %	100 %	0 %	0 %	238899364
587	NC_012752	ACA	2	6	24862	24867	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238899364
588	NC_012752	TCG	2	6	24951	24956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899364
589	NC_012752	GGC	2	6	24988	24993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899364
590	NC_012752	TTG	2	6	24996	25001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238899364
591	NC_012752	GCT	2	6	25041	25046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899364
592	NC_012752	ATATA	2	10	25061	25070	60 %	40 %	0 %	0 %	238899364
593	NC_012752	TC	3	6	25077	25082	0 %	50 %	0 %	50 %	238899364
594	NC_012752	AT	3	6	25093	25098	50 %	50 %	0 %	0 %	238899364
595	NC_012752	GAA	2	6	25136	25141	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238899364
596	NC_012752	AT	3	6	25156	25161	50 %	50 %	0 %	0 %	238899364
597	NC_012752	AGAA	2	8	25172	25179	75 %	0 %	25 %	0 %	238899364
598	NC_012752	T	6	6	25202	25207	0 %	100 %	0 %	0 %	238899364
599	NC_012752	CCT	2	6	25223	25228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899364
600	NC_012752	ATTA	2	8	25240	25247	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_012752	ATTT	2	8	25285	25292	25 %	75 %	0 %	0 %	238899365
602	NC_012752	TCT	2	6	25300	25305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238899365
603	NC_012752	CAC	2	6	25361	25366	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238899365
604	NC_012752	CCT	2	6	25435	25440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899365
605	NC_012752	GTG	2	6	25501	25506	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238899365
606	NC_012752	ATC	2	6	25522	25527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899365
607	NC_012752	CCA	2	6	25622	25627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238899365
608	NC_012752	CCT	2	6	25735	25740	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899365
609	NC_012752	AGC	2	6	25749	25754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899365
610	NC_012752	GGC	2	6	25806	25811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238899365
611	NC_012752	TAAA	2	8	25822	25829	75 %	25 %	0 %	0 %	238899365
612	NC_012752	A	6	6	25888	25893	100 %	0 %	0 %	0 %	238899365
613	NC_012752	AAGC	2	8	25917	25924	50 %	0 %	25 %	25 %	238899365
614	NC_012752	TGCC	2	8	25967	25974	0 %	25 %	25 %	50 %	238899365
615	NC_012752	AAT	2	6	25999	26004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899365
616	NC_012752	T	6	6	26107	26112	0 %	100 %	0 %	0 %	238899365
617	NC_012752	TAA	2	6	26178	26183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238899365
618	NC_012752	TAC	2	6	26225	26230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238899365
619	NC_012752	TG	3	6	26233	26238	0 %	50 %	50 %	0 %	238899365
620	NC_012752	GAC	2	6	26364	26369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238899365
621	NC_012752	TAT	2	6	26381	26386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238899365
622	NC_012752	GCCA	2	8	26422	26429	25 %	0 %	25 %	50 %	238899365
623	NC_012752	CTGAG	2	10	26440	26449	20 %	20 %	40 %	20 %	238899365
624	NC_012752	T	6	6	26583	26588	0 %	100 %	0 %	0 %	238899365
625	NC_012752	TGC	2	6	26596	26601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238899365
626	NC_012752	GATT	2	8	26650	26657	25 %	50 %	25 %	0 %	238899365
627	NC_012752	T	6	6	26719	26724	0 %	100 %	0 %	0 %	238899365
628	NC_012752	GC	3	6	26756	26761	0 %	0 %	50 %	50 %	238899365
629	NC_012752	TGA	2	6	26771	26776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238899365
630	NC_012752	CATA	2	8	26870	26877	50 %	25 %	0 %	25 %	238899365
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632	NC_012752	CCT	2	6	26953	26958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238899365
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