MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 47511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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4002	NC_012751	AATC	2	8	176410	176417	50 %	25 %	0 %	25 %	238897416
4003	NC_012751	ATG	2	6	176616	176621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897416
4004	NC_012751	GCA	2	6	176633	176638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897416
4005	NC_012751	GAA	2	6	176645	176650	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897416
4006	NC_012751	ATC	2	6	176797	176802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897416
4007	NC_012751	GA	4	8	176828	176835	50 %	0 %	50 %	0 %	238897416
4008	NC_012751	CT	3	6	176859	176864	0 %	50 %	0 %	50 %	238897416
4009	NC_012751	GCA	2	6	176911	176916	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897416
4010	NC_012751	ACG	2	6	176980	176985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897416
4011	NC_012751	TGC	2	6	177034	177039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897416
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4013	NC_012751	TGG	2	6	177079	177084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897416
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4017	NC_012751	TGG	2	6	177151	177156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897416
4018	NC_012751	GTAC	2	8	177158	177165	25 %	25 %	25 %	25 %	238897416
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4020	NC_012751	TGG	2	6	177298	177303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897416
4021	NC_012751	TGACCG	2	12	177312	177323	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	238897416
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4023	NC_012751	GAAT	2	8	177447	177454	50 %	25 %	25 %	0 %	238897416
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4025	NC_012751	GCTT	2	8	177497	177504	0 %	50 %	25 %	25 %	238897416
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4034	NC_012751	CGG	2	6	178130	178135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238897417
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4043	NC_012751	GGC	2	6	178551	178556	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_012751	T	8	8	178600	178607	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012751	T	6	6	178633	178638	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012751	TTA	2	6	178662	178667	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4055	NC_012751	AAGAA	2	10	179126	179135	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012751	A	6	6	179141	179146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_012751	A	6	6	179179	179184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_012751	A	6	6	179188	179193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4061	NC_012751	A	7	7	179276	179282	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012751	AATTTA	2	12	179297	179308	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_012751	TAT	2	6	179323	179328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4069	NC_012751	T	8	8	179466	179473	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_012751	ATGA	2	8	181271	181278	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4110	NC_012751	GTC	2	6	181314	181319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_012751	A	6	6	181357	181362	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012751	T	6	6	181367	181372	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012751	TCA	2	6	181411	181416	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4120	NC_012751	T	6	6	181663	181668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4125	NC_012751	T	6	6	181848	181853	0 %	100 %	0 %	0 %	238897422
4126	NC_012751	TTCA	2	8	181872	181879	25 %	50 %	0 %	25 %	238897422
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4129	NC_012751	TCC	2	6	182035	182040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	238897422
4130	NC_012751	TCCA	2	8	182105	182112	25 %	25 %	0 %	50 %	238897422
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4133	NC_012751	T	6	6	182153	182158	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4134	NC_012751	ATC	2	6	182195	182200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4159	NC_012751	A	6	6	183210	183215	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4162	NC_012751	T	7	7	183281	183287	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4163	NC_012751	A	6	6	183288	183293	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4170	NC_012751	A	7	7	183539	183545	100 %	0 %	0 %	0 %	238897424
4171	NC_012751	TAT	2	6	183574	183579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4233	NC_012751	A	6	6	185242	185247	100 %	0 %	0 %	0 %	238897425
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4236	NC_012751	TA	3	6	185345	185350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4237	NC_012751	AC	3	6	185359	185364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
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4240	NC_012751	ATC	2	6	185460	185465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4241	NC_012751	TGAC	2	8	185592	185599	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4242	NC_012751	ATAA	2	8	185673	185680	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
4243	NC_012751	TCG	2	6	185706	185711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4244	NC_012751	AAGC	2	8	185726	185733	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
4245	NC_012751	TCT	2	6	185751	185756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4246	NC_012751	T	6	6	185758	185763	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4247	NC_012751	ATC	2	6	185886	185891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4248	NC_012751	AACC	2	8	185960	185967	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4249	NC_012751	CAT	2	6	186079	186084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4250	NC_012751	TGA	2	6	186085	186090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4251	NC_012751	A	6	6	186145	186150	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4252	NC_012751	TCT	2	6	186162	186167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4253	NC_012751	A	6	6	186226	186231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4254	NC_012751	A	7	7	186243	186249	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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4256	NC_012751	T	6	6	186268	186273	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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