MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 47511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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1502	NC_012751	AAAC	2	8	67207	67214	75 %	0 %	0 %	25 %	238897311
1503	NC_012751	GTAAA	2	10	67271	67280	60 %	20 %	20 %	0 %	238897311
1504	NC_012751	A	7	7	67278	67284	100 %	0 %	0 %	0 %	238897311
1505	NC_012751	TC	3	6	67367	67372	0 %	50 %	0 %	50 %	238897311
1506	NC_012751	ATT	2	6	67403	67408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897311
1507	NC_012751	CA	3	6	67430	67435	50 %	0 %	0 %	50 %	238897311
1508	NC_012751	A	7	7	67458	67464	100 %	0 %	0 %	0 %	238897311
1509	NC_012751	A	6	6	67496	67501	100 %	0 %	0 %	0 %	238897311
1510	NC_012751	GAAA	2	8	67511	67518	75 %	0 %	25 %	0 %	238897311
1511	NC_012751	AAT	2	6	67532	67537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897311
1512	NC_012751	AT	3	6	67557	67562	50 %	50 %	0 %	0 %	238897311
1513	NC_012751	ATC	2	6	67594	67599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897312
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1516	NC_012751	A	6	6	67720	67725	100 %	0 %	0 %	0 %	238897313
1517	NC_012751	AAT	2	6	67740	67745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897313
1518	NC_012751	TAC	2	6	67749	67754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897313
1519	NC_012751	TCA	2	6	67805	67810	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897313
1520	NC_012751	CAT	2	6	67812	67817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897313
1521	NC_012751	ATAAA	2	10	67844	67853	80 %	20 %	0 %	0 %	238897313
1522	NC_012751	ACA	2	6	67858	67863	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897313
1523	NC_012751	TGA	2	6	67882	67887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897313
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1527	NC_012751	CAT	2	6	68118	68123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897314
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1529	NC_012751	CTA	2	6	68171	68176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897314
1530	NC_012751	A	6	6	68194	68199	100 %	0 %	0 %	0 %	238897314
1531	NC_012751	GGCC	2	8	68213	68220	0 %	0 %	50 %	50 %	238897314
1532	NC_012751	CAA	2	6	68277	68282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897314
1533	NC_012751	CCAA	2	8	68294	68301	50 %	0 %	0 %	50 %	238897314
1534	NC_012751	T	8	8	68313	68320	0 %	100 %	0 %	0 %	238897314
1535	NC_012751	TAC	2	6	68360	68365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897314
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1538	NC_012751	TGAC	2	8	68581	68588	25 %	25 %	25 %	25 %	238897314
1539	NC_012751	TTA	2	6	68590	68595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897314
1540	NC_012751	ATG	2	6	68647	68652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897315
1541	NC_012751	TAA	2	6	68690	68695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897315
1542	NC_012751	GCCA	2	8	68759	68766	25 %	0 %	25 %	50 %	238897315
1543	NC_012751	AAT	2	6	68815	68820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897315
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1545	NC_012751	CAC	2	6	68935	68940	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238897315
1546	NC_012751	AGGAG	2	10	68962	68971	40 %	0 %	60 %	0 %	238897315
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1550	NC_012751	GAC	2	6	69153	69158	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897315
1551	NC_012751	CGA	2	6	69201	69206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897315
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1554	NC_012751	AAT	2	6	69325	69330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897315
1555	NC_012751	AAT	2	6	69535	69540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897315
1556	NC_012751	GAA	2	6	69556	69561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	238897315
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1559	NC_012751	A	6	6	69623	69628	100 %	0 %	0 %	0 %	238897315
1560	NC_012751	A	6	6	69705	69710	100 %	0 %	0 %	0 %	238897315
1561	NC_012751	GCA	2	6	69723	69728	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897315
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1567	NC_012751	TTAA	2	8	70130	70137	50 %	50 %	0 %	0 %	238897315
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1593	NC_012751	T	6	6	71299	71304	0 %	100 %	0 %	0 %	238897316
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1597	NC_012751	ATG	2	6	71462	71467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897316
1598	NC_012751	ACA	2	6	71484	71489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897316
1599	NC_012751	TAT	2	6	71515	71520	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1601	NC_012751	TCA	2	6	71586	71591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1602	NC_012751	AAT	2	6	71600	71605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1603	NC_012751	GTTTC	2	10	71644	71653	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
1604	NC_012751	TAA	2	6	71671	71676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897317
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1606	NC_012751	TGC	2	6	71771	71776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897317
1607	NC_012751	TAT	2	6	71783	71788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897317
1608	NC_012751	TAC	2	6	71885	71890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897317
1609	NC_012751	CAA	2	6	71910	71915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	238897317
1610	NC_012751	AGC	2	6	71976	71981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897317
1611	NC_012751	ATG	2	6	72024	72029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897317
1612	NC_012751	ATA	2	6	72058	72063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897317
1613	NC_012751	T	7	7	72078	72084	0 %	100 %	0 %	0 %	238897317
1614	NC_012751	TGA	2	6	72106	72111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897317
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1622	NC_012751	TGGT	2	8	72252	72259	0 %	50 %	50 %	0 %	238897317
1623	NC_012751	ACAG	2	8	72278	72285	50 %	0 %	25 %	25 %	238897317
1624	NC_012751	CTTTT	2	10	72381	72390	0 %	80 %	0 %	20 %	238897317
1625	NC_012751	T	6	6	72422	72427	0 %	100 %	0 %	0 %	238897317
1626	NC_012751	A	6	6	72452	72457	100 %	0 %	0 %	0 %	238897317
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