MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Candidatus Hamiltonella defensa 5AT (Acyrthosiphon pisum) chromosome

Total Repeats: 47511

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012751	TGA	2	6	217376	217381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5002	NC_012751	A	7	7	217425	217431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5003	NC_012751	T	7	7	217502	217508	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5004	NC_012751	T	6	6	217520	217525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5005	NC_012751	T	6	6	217613	217618	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5006	NC_012751	AGT	2	6	217642	217647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5007	NC_012751	ATT	2	6	217667	217672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5008	NC_012751	TCA	2	6	217745	217750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5009	NC_012751	AT	3	6	217756	217761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5010	NC_012751	ATGA	2	8	217765	217772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
5011	NC_012751	AAT	2	6	217827	217832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897450
5012	NC_012751	TTAA	2	8	217837	217844	50 %	50 %	0 %	0 %	238897450
5013	NC_012751	ATT	2	6	217922	217927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	238897450
5014	NC_012751	T	9	9	217926	217934	0 %	100 %	0 %	0 %	238897450
5015	NC_012751	TGG	2	6	217996	218001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897450
5016	NC_012751	TTTA	2	8	218029	218036	25 %	75 %	0 %	0 %	238897450
5017	NC_012751	TA	3	6	218054	218059	50 %	50 %	0 %	0 %	238897450
5018	NC_012751	ATGG	2	8	218073	218080	25 %	25 %	50 %	0 %	238897450
5019	NC_012751	CTT	2	6	218227	218232	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897450
5020	NC_012751	T	7	7	218276	218282	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5021	NC_012751	TGC	2	6	218324	218329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5022	NC_012751	AGT	2	6	218370	218375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5023	NC_012751	TTAT	2	8	218398	218405	25 %	75 %	0 %	0 %	238897451
5024	NC_012751	CTT	2	6	218541	218546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897451
5025	NC_012751	CTT	2	6	218553	218558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897451
5026	NC_012751	ACG	2	6	218570	218575	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897451
5027	NC_012751	GATC	2	8	218576	218583	25 %	25 %	25 %	25 %	238897451
5028	NC_012751	AGG	2	6	218674	218679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238897451
5029	NC_012751	T	6	6	218692	218697	0 %	100 %	0 %	0 %	238897451
5030	NC_012751	TGG	2	6	218838	218843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897451
5031	NC_012751	TTTC	2	8	218913	218920	0 %	75 %	0 %	25 %	238897451
5032	NC_012751	TCT	2	6	218936	218941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897451
5033	NC_012751	CAT	2	6	219076	219081	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897451
5034	NC_012751	T	7	7	219185	219191	0 %	100 %	0 %	0 %	238897451
5035	NC_012751	TTC	2	6	219229	219234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897451
5036	NC_012751	TTTTG	2	10	219268	219277	0 %	80 %	20 %	0 %	238897451
5037	NC_012751	T	6	6	219309	219314	0 %	100 %	0 %	0 %	238897451
5038	NC_012751	C	7	7	219397	219403	0 %	0 %	0 %	100 %	238897451
5039	NC_012751	TGT	2	6	219446	219451	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897451
5040	NC_012751	T	8	8	219478	219485	0 %	100 %	0 %	0 %	238897451
5041	NC_012751	TCA	2	6	219650	219655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897451
5042	NC_012751	GC	3	6	219691	219696	0 %	0 %	50 %	50 %	238897451
5043	NC_012751	A	6	6	219714	219719	100 %	0 %	0 %	0 %	238897451
5044	NC_012751	TAA	2	6	219805	219810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897451
5045	NC_012751	ATC	2	6	219835	219840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897451
5046	NC_012751	T	7	7	219911	219917	0 %	100 %	0 %	0 %	238897451
5047	NC_012751	TCGT	2	8	220038	220045	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
5048	NC_012751	GCG	3	9	220191	220199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238897452
5049	NC_012751	TGG	2	6	220247	220252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	238897452
5050	NC_012751	T	6	6	220274	220279	0 %	100 %	0 %	0 %	238897452
5051	NC_012751	T	7	7	220353	220359	0 %	100 %	0 %	0 %	238897452
5052	NC_012751	A	6	6	220474	220479	100 %	0 %	0 %	0 %	238897452
5053	NC_012751	T	6	6	220499	220504	0 %	100 %	0 %	0 %	238897452
5054	NC_012751	TCG	2	6	220538	220543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897452
5055	NC_012751	CTT	2	6	220600	220605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897452
5056	NC_012751	GCGTT	2	10	220677	220686	0 %	40 %	40 %	20 %	238897452
5057	NC_012751	TGGA	2	8	220713	220720	25 %	25 %	50 %	0 %	238897452
5058	NC_012751	TTCC	2	8	220726	220733	0 %	50 %	0 %	50 %	238897452
5059	NC_012751	GTT	2	6	220753	220758	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897452
5060	NC_012751	TCG	2	6	220770	220775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897452
5061	NC_012751	CA	3	6	220795	220800	50 %	0 %	0 %	50 %	238897452
5062	NC_012751	CG	3	6	220842	220847	0 %	0 %	50 %	50 %	238897452
5063	NC_012751	TAA	2	6	220850	220855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897452
5064	NC_012751	A	6	6	220875	220880	100 %	0 %	0 %	0 %	238897452
5065	NC_012751	TCCA	2	8	220917	220924	25 %	25 %	0 %	50 %	238897452
5066	NC_012751	TAA	2	6	220988	220993	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	238897452
5067	NC_012751	TGA	2	6	221094	221099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897452
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5069	NC_012751	TCTT	2	8	221121	221128	0 %	75 %	0 %	25 %	238897452
5070	NC_012751	A	6	6	221140	221145	100 %	0 %	0 %	0 %	238897452
5071	NC_012751	ACT	2	6	221211	221216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897452
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5076	NC_012751	T	7	7	221479	221485	0 %	100 %	0 %	0 %	238897452
5077	NC_012751	ACTC	2	8	221528	221535	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5078	NC_012751	A	6	6	221541	221546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5079	NC_012751	TGA	2	6	221552	221557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5080	NC_012751	A	7	7	221619	221625	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5081	NC_012751	TGC	2	6	221639	221644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5082	NC_012751	ATC	3	9	221661	221669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5083	NC_012751	CAG	2	6	221693	221698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5084	NC_012751	CG	4	8	221727	221734	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5085	NC_012751	T	7	7	221777	221783	0 %	100 %	0 %	0 %	238897453
5086	NC_012751	G	7	7	221797	221803	0 %	0 %	100 %	0 %	238897453
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5092	NC_012751	TAAA	2	8	222149	222156	75 %	25 %	0 %	0 %	238897453
5093	NC_012751	CAG	2	6	222195	222200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897453
5094	NC_012751	GAG	2	6	222211	222216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	238897453
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5096	NC_012751	GA	4	8	222304	222311	50 %	0 %	50 %	0 %	238897453
5097	NC_012751	TTG	2	6	222374	222379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897453
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5104	NC_012751	T	6	6	222483	222488	0 %	100 %	0 %	0 %	238897453
5105	NC_012751	TGA	2	6	222512	222517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897454
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5107	NC_012751	CGG	2	6	222607	222612	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238897454
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5109	NC_012751	A	6	6	222638	222643	100 %	0 %	0 %	0 %	238897454
5110	NC_012751	TGA	2	6	222661	222666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5111	NC_012751	T	7	7	222667	222673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_012751	AAG	3	9	222786	222794	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5113	NC_012751	ATTT	2	8	222803	222810	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5114	NC_012751	GAT	2	6	222835	222840	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897455
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5117	NC_012751	ATG	2	6	222858	222863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897455
5118	NC_012751	GT	3	6	222866	222871	0 %	50 %	50 %	0 %	238897455
5119	NC_012751	CTGAAT	2	12	223080	223091	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	238897456
5120	NC_012751	TCT	2	6	223139	223144	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	238897456
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5123	NC_012751	TGTT	2	8	223209	223216	0 %	75 %	25 %	0 %	238897456
5124	NC_012751	GTTT	2	8	223247	223254	0 %	75 %	25 %	0 %	238897456
5125	NC_012751	CAT	2	6	223260	223265	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	238897456
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5127	NC_012751	T	6	6	223282	223287	0 %	100 %	0 %	0 %	238897456
5128	NC_012751	T	7	7	223305	223311	0 %	100 %	0 %	0 %	238897456
5129	NC_012751	GTT	2	6	223389	223394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	238897456
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5248	NC_012751	TGGAT	2	10	228829	228838	20 %	40 %	40 %	0 %	238897459
5249	NC_012751	TTTA	2	8	228930	228937	25 %	75 %	0 %	0 %	238897460
5250	NC_012751	TGA	2	6	229039	229044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897460
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5254	NC_012751	GCA	2	6	229196	229201	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	238897460
5255	NC_012751	ATG	2	6	229245	229250	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	238897460
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5257	NC_012751	CA	3	6	229263	229268	50 %	0 %	0 %	50 %	238897460
5258	NC_012751	CA	3	6	229337	229342	50 %	0 %	0 %	50 %	238897460
5259	NC_012751	GGC	2	6	229349	229354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	238897460
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5266	NC_012751	CCA	2	6	229613	229618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	238897460
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5270	NC_012751	TTCA	2	8	229746	229753	25 %	50 %	0 %	25 %	238897460
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5274	NC_012751	TGATT	2	10	229943	229952	20 %	60 %	20 %	0 %	238897460
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5280	NC_012751	CTG	2	6	230198	230203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	238897460
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5366	NC_012751	T	8	8	234180	234187	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5367	NC_012751	ATTT	2	8	234211	234218	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5368	NC_012751	CTA	2	6	234226	234231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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