MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 2386

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012687	GA	3	6	206	211	50 %	0 %	50 %	0 %	237804349
2	NC_012687	TC	3	6	813	818	0 %	50 %	0 %	50 %	237804349
3	NC_012687	AG	3	6	835	840	50 %	0 %	50 %	0 %	237804349
4	NC_012687	TC	3	6	2258	2263	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_012687	AG	3	6	2741	2746	50 %	0 %	50 %	0 %	237804352
6	NC_012687	GA	3	6	3409	3414	50 %	0 %	50 %	0 %	237804352
7	NC_012687	AT	3	6	5102	5107	50 %	50 %	0 %	0 %	237804353
8	NC_012687	TC	3	6	5852	5857	0 %	50 %	0 %	50 %	237804354
9	NC_012687	GA	3	6	5863	5868	50 %	0 %	50 %	0 %	237804354
10	NC_012687	AT	3	6	5967	5972	50 %	50 %	0 %	0 %	237804354
11	NC_012687	TG	3	6	6120	6125	0 %	50 %	50 %	0 %	237804354
12	NC_012687	AG	3	6	6528	6533	50 %	0 %	50 %	0 %	237804354
13	NC_012687	GA	3	6	7586	7591	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_012687	AC	3	6	8237	8242	50 %	0 %	0 %	50 %	237804356
15	NC_012687	AG	3	6	8980	8985	50 %	0 %	50 %	0 %	237804357
16	NC_012687	CT	4	8	9099	9106	0 %	50 %	0 %	50 %	237804357
17	NC_012687	GT	3	6	9181	9186	0 %	50 %	50 %	0 %	237804357
18	NC_012687	GT	3	6	9608	9613	0 %	50 %	50 %	0 %	237804357
19	NC_012687	GA	3	6	10455	10460	50 %	0 %	50 %	0 %	237804359
20	NC_012687	AG	3	6	10672	10677	50 %	0 %	50 %	0 %	237804359
21	NC_012687	TA	3	6	11837	11842	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_012687	AG	3	6	11897	11902	50 %	0 %	50 %	0 %	237804360
23	NC_012687	TA	3	6	12457	12462	50 %	50 %	0 %	0 %	237804360
24	NC_012687	TG	3	6	13360	13365	0 %	50 %	50 %	0 %	237804361
25	NC_012687	AG	3	6	13509	13514	50 %	0 %	50 %	0 %	237804361
26	NC_012687	TC	3	6	13643	13648	0 %	50 %	0 %	50 %	237804361
27	NC_012687	AG	4	8	13665	13672	50 %	0 %	50 %	0 %	237804361
28	NC_012687	TA	3	6	13927	13932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012687	TA	4	8	14151	14158	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012687	AC	3	6	14994	14999	50 %	0 %	0 %	50 %	237804362
31	NC_012687	AG	3	6	16333	16338	50 %	0 %	50 %	0 %	237804363
32	NC_012687	TC	3	6	16373	16378	0 %	50 %	0 %	50 %	237804363
33	NC_012687	GA	3	6	16902	16907	50 %	0 %	50 %	0 %	237804364
34	NC_012687	AG	3	6	16973	16978	50 %	0 %	50 %	0 %	237804364
35	NC_012687	GA	3	6	17757	17762	50 %	0 %	50 %	0 %	237804364
36	NC_012687	AG	3	6	18103	18108	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012687	GA	3	6	18116	18121	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012687	GA	3	6	18360	18365	50 %	0 %	50 %	0 %	237804365
39	NC_012687	TC	3	6	18810	18815	0 %	50 %	0 %	50 %	237804365
40	NC_012687	CT	3	6	19038	19043	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_012687	TC	3	6	19238	19243	0 %	50 %	0 %	50 %	237804366
42	NC_012687	GA	3	6	19253	19258	50 %	0 %	50 %	0 %	237804366
43	NC_012687	GA	3	6	19352	19357	50 %	0 %	50 %	0 %	237804366
44	NC_012687	AG	3	6	19818	19823	50 %	0 %	50 %	0 %	237804366
45	NC_012687	AG	4	8	20104	20111	50 %	0 %	50 %	0 %	237804366
46	NC_012687	GT	3	6	20367	20372	0 %	50 %	50 %	0 %	237804366
47	NC_012687	AG	3	6	20595	20600	50 %	0 %	50 %	0 %	237804367
48	NC_012687	TG	3	6	20708	20713	0 %	50 %	50 %	0 %	237804367
49	NC_012687	AG	3	6	21104	21109	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_012687	GA	3	6	21262	21267	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012687	AG	3	6	21779	21784	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_012687	CT	3	6	21848	21853	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_012687	CT	4	8	22505	22512	0 %	50 %	0 %	50 %	237804368
54	NC_012687	AT	3	6	22775	22780	50 %	50 %	0 %	0 %	237804368
55	NC_012687	AT	3	6	23099	23104	50 %	50 %	0 %	0 %	237804368
56	NC_012687	GA	3	6	24418	24423	50 %	0 %	50 %	0 %	237804368
57	NC_012687	GA	3	6	24510	24515	50 %	0 %	50 %	0 %	237804368
58	NC_012687	AG	3	6	24891	24896	50 %	0 %	50 %	0 %	237804368
59	NC_012687	GA	3	6	26309	26314	50 %	0 %	50 %	0 %	237804369
60	NC_012687	GT	3	6	26329	26334	0 %	50 %	50 %	0 %	237804369
61	NC_012687	TA	3	6	26531	26536	50 %	50 %	0 %	0 %	237804369
62	NC_012687	GA	3	6	26977	26982	50 %	0 %	50 %	0 %	237804369
63	NC_012687	GA	3	6	27101	27106	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012687	CT	3	6	27108	27113	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_012687	AT	3	6	27394	27399	50 %	50 %	0 %	0 %	237804370
66	NC_012687	GA	3	6	27608	27613	50 %	0 %	50 %	0 %	237804370
67	NC_012687	TC	3	6	28476	28481	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012687	AG	3	6	28559	28564	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012687	TG	3	6	28982	28987	0 %	50 %	50 %	0 %	237804372
70	NC_012687	TC	3	6	29035	29040	0 %	50 %	0 %	50 %	237804372
71	NC_012687	GC	4	8	29449	29456	0 %	0 %	50 %	50 %	237804372
72	NC_012687	TA	3	6	29571	29576	50 %	50 %	0 %	0 %	237804372
73	NC_012687	GA	3	6	30522	30527	50 %	0 %	50 %	0 %	237804373
74	NC_012687	AG	3	6	30620	30625	50 %	0 %	50 %	0 %	237804374
75	NC_012687	TC	3	6	30729	30734	0 %	50 %	0 %	50 %	237804374
76	NC_012687	GA	3	6	31350	31355	50 %	0 %	50 %	0 %	237804374
77	NC_012687	GA	3	6	31818	31823	50 %	0 %	50 %	0 %	237804374
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85	NC_012687	AG	3	6	34503	34508	50 %	0 %	50 %	0 %	237804379
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87	NC_012687	GA	4	8	35219	35226	50 %	0 %	50 %	0 %	237804380
88	NC_012687	GA	3	6	36972	36977	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012687	AT	3	6	37074	37079	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012687	GA	3	6	37122	37127	50 %	0 %	50 %	0 %	237804382
91	NC_012687	CT	3	6	37606	37611	0 %	50 %	0 %	50 %	237804382
92	NC_012687	AG	3	6	38117	38122	50 %	0 %	50 %	0 %	237804382
93	NC_012687	AG	3	6	38663	38668	50 %	0 %	50 %	0 %	237804382
94	NC_012687	AG	3	6	39190	39195	50 %	0 %	50 %	0 %	237804382
95	NC_012687	CT	3	6	39341	39346	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_012687	GA	3	6	39974	39979	50 %	0 %	50 %	0 %	237804383
97	NC_012687	AG	3	6	40111	40116	50 %	0 %	50 %	0 %	237804383
98	NC_012687	AG	3	6	40211	40216	50 %	0 %	50 %	0 %	237804383
99	NC_012687	CT	3	6	40712	40717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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102	NC_012687	GA	3	6	41402	41407	50 %	0 %	50 %	0 %	237804384
103	NC_012687	TC	3	6	41411	41416	0 %	50 %	0 %	50 %	237804384
104	NC_012687	GC	3	6	41476	41481	0 %	0 %	50 %	50 %	237804384
105	NC_012687	GA	3	6	41616	41621	50 %	0 %	50 %	0 %	237804384
106	NC_012687	GT	3	6	42054	42059	0 %	50 %	50 %	0 %	237804385
107	NC_012687	GA	3	6	42592	42597	50 %	0 %	50 %	0 %	237804385
108	NC_012687	GA	4	8	42602	42609	50 %	0 %	50 %	0 %	237804385
109	NC_012687	AG	3	6	42838	42843	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012687	CT	3	6	42904	42909	0 %	50 %	0 %	50 %	237804386
111	NC_012687	GA	5	10	43180	43189	50 %	0 %	50 %	0 %	237804386
112	NC_012687	AC	3	6	44062	44067	50 %	0 %	0 %	50 %	237804388
113	NC_012687	TC	3	6	44231	44236	0 %	50 %	0 %	50 %	237804388
114	NC_012687	TC	3	6	44396	44401	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012687	TA	3	6	44549	44554	50 %	50 %	0 %	0 %	237804389
116	NC_012687	TC	3	6	45461	45466	0 %	50 %	0 %	50 %	237804390
117	NC_012687	GA	3	6	45944	45949	50 %	0 %	50 %	0 %	237804391
118	NC_012687	TG	3	6	46162	46167	0 %	50 %	50 %	0 %	237804391
119	NC_012687	AG	3	6	46173	46178	50 %	0 %	50 %	0 %	237804391
120	NC_012687	AG	4	8	46614	46621	50 %	0 %	50 %	0 %	237804392
121	NC_012687	CT	3	6	46805	46810	0 %	50 %	0 %	50 %	237804392
122	NC_012687	TG	3	6	47006	47011	0 %	50 %	50 %	0 %	237804392
123	NC_012687	AG	3	6	47059	47064	50 %	0 %	50 %	0 %	237804392
124	NC_012687	AG	3	6	48631	48636	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_012687	AG	3	6	49983	49988	50 %	0 %	50 %	0 %	237804394
126	NC_012687	CA	3	6	50649	50654	50 %	0 %	0 %	50 %	237804395
127	NC_012687	TG	4	8	51978	51985	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_012687	TC	3	6	53382	53387	0 %	50 %	0 %	50 %	237804397
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130	NC_012687	GA	3	6	53854	53859	50 %	0 %	50 %	0 %	237804398
131	NC_012687	CT	3	6	54171	54176	0 %	50 %	0 %	50 %	237804398
132	NC_012687	CT	3	6	54834	54839	0 %	50 %	0 %	50 %	237804399
133	NC_012687	AT	3	6	56042	56047	50 %	50 %	0 %	0 %	237804399
134	NC_012687	GA	3	6	56079	56084	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_012687	AG	3	6	56503	56508	50 %	0 %	50 %	0 %	237804400
136	NC_012687	CT	3	6	56965	56970	0 %	50 %	0 %	50 %	237804400
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138	NC_012687	TG	3	6	57734	57739	0 %	50 %	50 %	0 %	237804400
139	NC_012687	CT	3	6	58621	58626	0 %	50 %	0 %	50 %	237804401
140	NC_012687	GA	3	6	60181	60186	50 %	0 %	50 %	0 %	237804402
141	NC_012687	GT	3	6	60319	60324	0 %	50 %	50 %	0 %	237804402
142	NC_012687	TC	3	6	61067	61072	0 %	50 %	0 %	50 %	237804403
143	NC_012687	GA	3	6	61295	61300	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_012687	CA	3	6	61693	61698	50 %	0 %	0 %	50 %	237804404
145	NC_012687	AT	3	6	61943	61948	50 %	50 %	0 %	0 %	237804404
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