MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 23090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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23002	NC_012687	CAAA	2	8	1040530	1040537	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
23003	NC_012687	T	8	8	1040547	1040554	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23004	NC_012687	A	6	6	1040558	1040563	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23005	NC_012687	AAG	2	6	1040642	1040647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23006	NC_012687	ATTTTT	2	12	1040684	1040695	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23007	NC_012687	AAT	2	6	1040696	1040701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23008	NC_012687	A	6	6	1040702	1040707	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23009	NC_012687	TTA	2	6	1040740	1040745	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23010	NC_012687	T	6	6	1040757	1040762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23011	NC_012687	TAC	2	6	1040808	1040813	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237805227
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23013	NC_012687	AGA	2	6	1040944	1040949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237805227
23014	NC_012687	TCA	2	6	1040952	1040957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237805227
23015	NC_012687	CAA	2	6	1040971	1040976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237805227
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23017	NC_012687	TGT	2	6	1040998	1041003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237805227
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23019	NC_012687	TA	3	6	1041101	1041106	50 %	50 %	0 %	0 %	237805227
23020	NC_012687	GA	3	6	1041140	1041145	50 %	0 %	50 %	0 %	237805227
23021	NC_012687	AG	3	6	1041186	1041191	50 %	0 %	50 %	0 %	237805227
23022	NC_012687	GTTAG	2	10	1041199	1041208	20 %	40 %	40 %	0 %	237805227
23023	NC_012687	A	8	8	1041296	1041303	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23024	NC_012687	AG	4	8	1041315	1041322	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
23025	NC_012687	TAG	2	6	1041616	1041621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237805228
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23027	NC_012687	T	8	8	1041639	1041646	0 %	100 %	0 %	0 %	237805228
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23032	NC_012687	TA	3	6	1041978	1041983	50 %	50 %	0 %	0 %	237805228
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23035	NC_012687	ATG	2	6	1042110	1042115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237805228
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23043	NC_012687	AG	4	8	1042443	1042450	50 %	0 %	50 %	0 %	237805228
23044	NC_012687	AG	3	6	1042524	1042529	50 %	0 %	50 %	0 %	237805228
23045	NC_012687	T	6	6	1042574	1042579	0 %	100 %	0 %	0 %	237805228
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23049	NC_012687	GCT	2	6	1042754	1042759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237805228
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23057	NC_012687	AG	3	6	1043097	1043102	50 %	0 %	50 %	0 %	237805228
23058	NC_012687	CTCC	2	8	1043104	1043111	0 %	25 %	0 %	75 %	237805228
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23062	NC_012687	AG	6	12	1043263	1043274	50 %	0 %	50 %	0 %	237805228
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23082	NC_012687	A	8	8	1044047	1044054	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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23085	NC_012687	AAT	2	6	1044185	1044190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23086	NC_012687	TATT	2	8	1044207	1044214	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
23087	NC_012687	T	7	7	1044220	1044226	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23088	NC_012687	TAAAAT	2	12	1044239	1044250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23089	NC_012687	TTTTA	2	10	1044255	1044264	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23090	NC_012687	GGTT	2	8	1044271	1044278	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.