MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/TZ1A828/OT chromosome

Total Repeats: 23090

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_012687	ATT	2	6	226332	226337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804544
5002	NC_012687	ATG	2	6	226363	226368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804544
5003	NC_012687	TATCT	2	10	226449	226458	20 %	60 %	0 %	20 %	237804544
5004	NC_012687	TAT	2	6	226526	226531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804544
5005	NC_012687	TGC	2	6	226532	226537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804544
5006	NC_012687	A	7	7	226629	226635	100 %	0 %	0 %	0 %	237804544
5007	NC_012687	TTTTC	2	10	226651	226660	0 %	80 %	0 %	20 %	237804544
5008	NC_012687	TC	3	6	226765	226770	0 %	50 %	0 %	50 %	237804544
5009	NC_012687	CATT	2	8	226813	226820	25 %	50 %	0 %	25 %	237804544
5010	NC_012687	A	7	7	226856	226862	100 %	0 %	0 %	0 %	237804544
5011	NC_012687	TTA	2	6	226872	226877	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804544
5012	NC_012687	TAA	2	6	226912	226917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804544
5013	NC_012687	AAC	2	6	226973	226978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804544
5014	NC_012687	TTG	2	6	227126	227131	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804544
5015	NC_012687	ATA	2	6	227195	227200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804544
5016	NC_012687	TAA	2	6	227204	227209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5017	NC_012687	AAAC	2	8	227220	227227	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5018	NC_012687	ACAA	2	8	227272	227279	75 %	0 %	0 %	25 %	237804545
5019	NC_012687	TTC	2	6	227333	227338	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804545
5020	NC_012687	CT	3	6	227467	227472	0 %	50 %	0 %	50 %	237804545
5021	NC_012687	ATT	2	6	227497	227502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804545
5022	NC_012687	ACT	2	6	227517	227522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804545
5023	NC_012687	A	7	7	227550	227556	100 %	0 %	0 %	0 %	237804545
5024	NC_012687	ATT	2	6	227617	227622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804545
5025	NC_012687	TTA	2	6	227626	227631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804545
5026	NC_012687	CTGG	2	8	227681	227688	0 %	25 %	50 %	25 %	237804545
5027	NC_012687	TAT	2	6	227703	227708	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804545
5028	NC_012687	TGT	2	6	227747	227752	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804545
5029	NC_012687	ATT	2	6	227824	227829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804545
5030	NC_012687	TCA	2	6	227876	227881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804545
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5032	NC_012687	CATT	2	8	227943	227950	25 %	50 %	0 %	25 %	237804545
5033	NC_012687	CTT	2	6	227973	227978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804545
5034	NC_012687	T	6	6	227989	227994	0 %	100 %	0 %	0 %	237804545
5035	NC_012687	TTA	2	6	228080	228085	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804546
5036	NC_012687	GTC	2	6	228101	228106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804546
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5038	NC_012687	GAA	2	6	228264	228269	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804546
5039	NC_012687	GAA	2	6	228331	228336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804546
5040	NC_012687	AGA	2	6	228439	228444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804546
5041	NC_012687	ATTGCT	2	12	228557	228568	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	237804546
5042	NC_012687	ATT	2	6	228590	228595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804546
5043	NC_012687	CTA	2	6	228686	228691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804546
5044	NC_012687	TCA	2	6	228693	228698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804546
5045	NC_012687	TG	3	6	228726	228731	0 %	50 %	50 %	0 %	237804546
5046	NC_012687	TCCTAG	2	12	228847	228858	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	237804546
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5049	NC_012687	GAG	2	6	229001	229006	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804547
5050	NC_012687	CT	3	6	229047	229052	0 %	50 %	0 %	50 %	237804547
5051	NC_012687	TCGA	2	8	229096	229103	25 %	25 %	25 %	25 %	237804547
5052	NC_012687	TCC	2	6	229113	229118	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237804547
5053	NC_012687	GAT	2	6	229146	229151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804547
5054	NC_012687	ATG	2	6	229183	229188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804547
5055	NC_012687	CAT	2	6	229221	229226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804547
5056	NC_012687	G	6	6	229227	229232	0 %	0 %	100 %	0 %	237804547
5057	NC_012687	AAG	2	6	229253	229258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804547
5058	NC_012687	TAA	2	6	229317	229322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237804547
5059	NC_012687	GCAACG	2	12	229335	229346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804547
5060	NC_012687	GT	3	6	229369	229374	0 %	50 %	50 %	0 %	237804547
5061	NC_012687	AATT	2	8	229382	229389	50 %	50 %	0 %	0 %	237804547
5062	NC_012687	ATTT	2	8	229445	229452	25 %	75 %	0 %	0 %	237804547
5063	NC_012687	T	6	6	229482	229487	0 %	100 %	0 %	0 %	237804547
5064	NC_012687	TCA	2	6	229490	229495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804547
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5068	NC_012687	T	8	8	229695	229702	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5069	NC_012687	TCCT	2	8	229845	229852	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5070	NC_012687	AGA	2	6	229897	229902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5071	NC_012687	ATT	2	6	229934	229939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_012687	TTC	2	6	230018	230023	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804548
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5078	NC_012687	TGA	2	6	230298	230303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237804548
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5081	NC_012687	CCTT	2	8	230467	230474	0 %	50 %	0 %	50 %	237804548
5082	NC_012687	TTG	2	6	230489	230494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237804548
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5088	NC_012687	AGA	2	6	230676	230681	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804548
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5090	NC_012687	TAC	2	6	230870	230875	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804549
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5093	NC_012687	TTTC	2	8	231015	231022	0 %	75 %	0 %	25 %	237804549
5094	NC_012687	CTT	2	6	231077	231082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804549
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5098	NC_012687	TAT	2	6	231344	231349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804549
5099	NC_012687	ATT	2	6	231423	231428	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804549
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5102	NC_012687	ATT	2	6	231555	231560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804549
5103	NC_012687	CAA	2	6	231622	231627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237804549
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5105	NC_012687	ACT	2	6	231702	231707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804549
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5107	NC_012687	CTTC	2	8	231751	231758	0 %	50 %	0 %	50 %	237804549
5108	NC_012687	TTAT	2	8	231853	231860	25 %	75 %	0 %	0 %	237804549
5109	NC_012687	CTAT	2	8	231872	231879	25 %	50 %	0 %	25 %	237804549
5110	NC_012687	TCTT	2	8	231919	231926	0 %	75 %	0 %	25 %	237804549
5111	NC_012687	TGC	2	6	231962	231967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804549
5112	NC_012687	CTTAGC	2	12	231968	231979	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	237804549
5113	NC_012687	GGA	2	6	231999	232004	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237804549
5114	NC_012687	CA	3	6	232007	232012	50 %	0 %	0 %	50 %	237804549
5115	NC_012687	TGG	2	6	232071	232076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804549
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5117	NC_012687	TGG	3	9	232134	232142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804549
5118	NC_012687	GTC	2	6	232188	232193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237804550
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5121	NC_012687	CTT	2	6	232294	232299	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804550
5122	NC_012687	CTA	2	6	232353	232358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804550
5123	NC_012687	ATTT	2	8	232362	232369	25 %	75 %	0 %	0 %	237804550
5124	NC_012687	TGG	2	6	232440	232445	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237804550
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5132	NC_012687	TTA	2	6	232925	232930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804550
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5168	NC_012687	CTT	3	9	234885	234893	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804552
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5230	NC_012687	A	7	7	237814	237820	100 %	0 %	0 %	0 %	237804553
5231	NC_012687	CAT	2	6	237837	237842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237804553
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5233	NC_012687	TTCAC	2	10	237916	237925	20 %	40 %	0 %	40 %	237804554
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5240	NC_012687	AT	5	10	238605	238614	50 %	50 %	0 %	0 %	237804554
5241	NC_012687	TTGA	2	8	238656	238663	25 %	50 %	25 %	0 %	237804554
5242	NC_012687	CTT	2	6	238668	238673	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804554
5243	NC_012687	AAGT	2	8	238737	238744	50 %	25 %	25 %	0 %	237804554
5244	NC_012687	TTCCTT	2	12	238800	238811	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237804554
5245	NC_012687	GAC	2	6	239039	239044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804554
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5497	NC_012687	TC	3	6	250494	250499	0 %	50 %	0 %	50 %	237804564
5498	NC_012687	TTA	2	6	250517	250522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237804564
5499	NC_012687	GCA	2	6	250547	250552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237804564
5500	NC_012687	AAG	2	6	250596	250601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237804564

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