MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 23073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_012686	TGT	2	6	181900	181905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_012686	T	6	6	182004	182009	0 %	100 %	0 %	0 %	237802584
4003	NC_012686	TTGAA	2	10	182030	182039	40 %	40 %	20 %	0 %	237802584
4004	NC_012686	TTTG	2	8	182044	182051	0 %	75 %	25 %	0 %	237802584
4005	NC_012686	ATC	2	6	182141	182146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802584
4006	NC_012686	TGCA	2	8	182162	182169	25 %	25 %	25 %	25 %	237802584
4007	NC_012686	TGT	2	6	182180	182185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802584
4008	NC_012686	AGT	2	6	182199	182204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802584
4009	NC_012686	CT	3	6	182244	182249	0 %	50 %	0 %	50 %	237802584
4010	NC_012686	T	6	6	182249	182254	0 %	100 %	0 %	0 %	237802584
4011	NC_012686	CTC	2	6	182278	182283	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802584
4012	NC_012686	GA	3	6	182323	182328	50 %	0 %	50 %	0 %	237802584
4013	NC_012686	GAT	2	6	182378	182383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802584
4014	NC_012686	AAAG	2	8	182531	182538	75 %	0 %	25 %	0 %	237802584
4015	NC_012686	CA	3	6	182636	182641	50 %	0 %	0 %	50 %	237802584
4016	NC_012686	ACA	2	6	182694	182699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802584
4017	NC_012686	CGA	2	6	182712	182717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802584
4018	NC_012686	AAT	2	6	182738	182743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802584
4019	NC_012686	ATT	2	6	182778	182783	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802584
4020	NC_012686	GTTT	2	8	182834	182841	0 %	75 %	25 %	0 %	237802584
4021	NC_012686	TTTGC	2	10	182906	182915	0 %	60 %	20 %	20 %	237802584
4022	NC_012686	CTT	2	6	182922	182927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802584
4023	NC_012686	AGA	2	6	183002	183007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802584
4024	NC_012686	TG	3	6	183019	183024	0 %	50 %	50 %	0 %	237802584
4025	NC_012686	G	8	8	183026	183033	0 %	0 %	100 %	0 %	237802584
4026	NC_012686	GA	3	6	183064	183069	50 %	0 %	50 %	0 %	237802584
4027	NC_012686	AGG	2	6	183092	183097	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802584
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4029	NC_012686	GAA	2	6	183117	183122	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802584
4030	NC_012686	AGA	3	9	183161	183169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802584
4031	NC_012686	AGAAA	2	10	183203	183212	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_012686	AAGA	2	8	183224	183231	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4033	NC_012686	T	8	8	183248	183255	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_012686	AGAAAA	2	12	183266	183277	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4035	NC_012686	A	7	7	183274	183280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4036	NC_012686	TCG	2	6	183315	183320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_012686	TGT	2	6	183327	183332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4038	NC_012686	T	6	6	183345	183350	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_012686	T	7	7	183352	183358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4040	NC_012686	AAG	2	6	183405	183410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4041	NC_012686	TCT	2	6	183453	183458	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_012686	AGG	2	6	183507	183512	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_012686	GGA	2	6	183541	183546	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4044	NC_012686	TTGAG	2	10	183586	183595	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
4045	NC_012686	GAATG	2	10	183611	183620	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
4046	NC_012686	CT	3	6	183661	183666	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4047	NC_012686	TGA	2	6	183675	183680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4048	NC_012686	GA	4	8	183703	183710	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4049	NC_012686	AAC	2	6	183758	183763	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_012686	TGA	2	6	183777	183782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4051	NC_012686	TGC	2	6	183813	183818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_012686	CCAG	2	8	183833	183840	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
4053	NC_012686	TTG	2	6	183842	183847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4054	NC_012686	GAT	2	6	183881	183886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4055	NC_012686	GA	3	6	183907	183912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_012686	GCG	2	6	183915	183920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4057	NC_012686	ACT	2	6	183963	183968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_012686	TAG	2	6	183997	184002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4059	NC_012686	GCA	2	6	184052	184057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_012686	TCGC	2	8	184095	184102	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4061	NC_012686	AGA	2	6	184106	184111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_012686	GCA	2	6	184115	184120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_012686	TA	3	6	184150	184155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4064	NC_012686	GAA	2	6	184185	184190	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_012686	AGA	2	6	184224	184229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_012686	GA	3	6	184263	184268	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_012686	GTT	2	6	184280	184285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4068	NC_012686	GTT	2	6	184315	184320	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_012686	CTT	2	6	184323	184328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4070	NC_012686	GA	3	6	184366	184371	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4074	NC_012686	TTG	2	6	184429	184434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4078	NC_012686	CAG	3	9	184659	184667	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4079	NC_012686	TAA	2	6	184703	184708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4080	NC_012686	GTTG	2	8	184742	184749	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4084	NC_012686	A	7	7	184822	184828	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_012686	T	8	8	184834	184841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4086	NC_012686	ATA	2	6	184884	184889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4087	NC_012686	A	6	6	184889	184894	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4088	NC_012686	TAT	2	6	184965	184970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4089	NC_012686	GA	3	6	185004	185009	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4094	NC_012686	CTG	2	6	185295	185300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4096	NC_012686	TAG	2	6	185345	185350	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4097	NC_012686	AGT	2	6	185475	185480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_012686	ATCG	2	8	185502	185509	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4099	NC_012686	TCA	2	6	185587	185592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4100	NC_012686	GGA	2	6	185602	185607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_012686	AG	3	6	185700	185705	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_012686	GCA	2	6	185791	185796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_012686	TTA	2	6	186087	186092	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_012686	GAA	2	6	186156	186161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4105	NC_012686	ATA	2	6	186216	186221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4106	NC_012686	TCTA	2	8	186257	186264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4107	NC_012686	GTT	2	6	186325	186330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4109	NC_012686	CA	3	6	186479	186484	50 %	0 %	0 %	50 %	237802585
4110	NC_012686	AGA	2	6	186594	186599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802585
4111	NC_012686	GTT	3	9	186723	186731	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_012686	T	6	6	186737	186742	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_012686	T	7	7	186745	186751	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_012686	T	6	6	186757	186762	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_012686	T	7	7	186807	186813	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_012686	A	7	7	186829	186835	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4117	NC_012686	T	6	6	186852	186857	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4118	NC_012686	T	7	7	186947	186953	0 %	100 %	0 %	0 %	237802586
4119	NC_012686	TCT	2	6	186971	186976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802586
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4126	NC_012686	GAA	2	6	187245	187250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802586
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4129	NC_012686	TCT	2	6	187419	187424	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802586
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4132	NC_012686	T	6	6	187477	187482	0 %	100 %	0 %	0 %	237802586
4133	NC_012686	GCTT	2	8	187496	187503	0 %	50 %	25 %	25 %	237802586
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4250	NC_012686	CCTT	2	8	192424	192431	0 %	50 %	0 %	50 %	237802590
4251	NC_012686	ATT	2	6	192453	192458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802590
4252	NC_012686	TAC	2	6	192518	192523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802590
4253	NC_012686	GAATGC	2	12	192527	192538	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	237802590
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4255	NC_012686	TGC	2	6	192628	192633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802591
4256	NC_012686	ATG	2	6	192649	192654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802591
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