MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 23073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012686	GAT	2	6	158347	158352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802569
3502	NC_012686	TTG	2	6	158361	158366	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802569
3503	NC_012686	A	6	6	158390	158395	100 %	0 %	0 %	0 %	237802569
3504	NC_012686	T	6	6	158469	158474	0 %	100 %	0 %	0 %	237802569
3505	NC_012686	ATG	2	6	158519	158524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802569
3506	NC_012686	TG	3	6	158570	158575	0 %	50 %	50 %	0 %	237802569
3507	NC_012686	T	6	6	158589	158594	0 %	100 %	0 %	0 %	237802569
3508	NC_012686	AGA	2	6	158611	158616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802569
3509	NC_012686	AAAG	2	8	158648	158655	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3510	NC_012686	TTTA	2	8	158657	158664	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3511	NC_012686	CTA	2	6	158718	158723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_012686	AAG	2	6	158760	158765	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3513	NC_012686	TAAT	2	8	158774	158781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3514	NC_012686	TCCTTG	2	12	158839	158850	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	237802570
3515	NC_012686	GAA	2	6	158860	158865	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802570
3516	NC_012686	GTT	2	6	158877	158882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802570
3517	NC_012686	AAGTTT	2	12	158924	158935	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	237802570
3518	NC_012686	TTA	2	6	159048	159053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802570
3519	NC_012686	CG	3	6	159080	159085	0 %	0 %	50 %	50 %	237802570
3520	NC_012686	AGA	2	6	159106	159111	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802570
3521	NC_012686	CAT	2	6	159115	159120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802570
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3523	NC_012686	AGA	3	9	159220	159228	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802570
3524	NC_012686	T	6	6	159279	159284	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3525	NC_012686	T	7	7	159403	159409	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3526	NC_012686	ATT	2	6	159522	159527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3527	NC_012686	T	7	7	159552	159558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3528	NC_012686	A	7	7	159586	159592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3529	NC_012686	TAAT	2	8	159610	159617	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3530	NC_012686	ATT	2	6	159677	159682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802571
3531	NC_012686	CAT	2	6	159829	159834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802571
3532	NC_012686	TCAA	2	8	159890	159897	50 %	25 %	0 %	25 %	237802571
3533	NC_012686	TGA	2	6	160087	160092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802571
3534	NC_012686	GAA	2	6	160115	160120	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802571
3535	NC_012686	TC	3	6	160150	160155	0 %	50 %	0 %	50 %	237802571
3536	NC_012686	GT	3	6	160188	160193	0 %	50 %	50 %	0 %	237802571
3537	NC_012686	AAT	2	6	160232	160237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802571
3538	NC_012686	GGA	2	6	160244	160249	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802571
3539	NC_012686	AGGAA	2	10	160273	160282	60 %	0 %	40 %	0 %	237802571
3540	NC_012686	TAG	2	6	160303	160308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802571
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3542	NC_012686	CTG	2	6	160329	160334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802571
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3544	NC_012686	TCT	2	6	160388	160393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802571
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3549	NC_012686	AGG	2	6	160718	160723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802572
3550	NC_012686	AGG	2	6	160733	160738	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802572
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3552	NC_012686	GA	3	6	160841	160846	50 %	0 %	50 %	0 %	237802572
3553	NC_012686	ATT	2	6	160861	160866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802572
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3556	NC_012686	A	8	8	161026	161033	100 %	0 %	0 %	0 %	237802572
3557	NC_012686	ATG	2	6	161107	161112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802572
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3559	NC_012686	TTC	2	6	161336	161341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802572
3560	NC_012686	AGG	2	6	161347	161352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802572
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3562	NC_012686	ATA	3	9	161373	161381	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802573
3563	NC_012686	TTTC	2	8	161391	161398	0 %	75 %	0 %	25 %	237802573
3564	NC_012686	AACAGC	2	12	161476	161487	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	237802573
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3570	NC_012686	A	6	6	161950	161955	100 %	0 %	0 %	0 %	237802573
3571	NC_012686	CTG	2	6	162018	162023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802573
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3581	NC_012686	CAAAA	2	10	162276	162285	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
3582	NC_012686	TGT	2	6	162298	162303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3583	NC_012686	CAA	2	6	162378	162383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3584	NC_012686	GAG	2	6	162397	162402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3591	NC_012686	ATCT	2	8	162859	162866	25 %	50 %	0 %	25 %	237802574
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3608	NC_012686	TC	3	6	163565	163570	0 %	50 %	0 %	50 %	237802574
3609	NC_012686	TGT	2	6	163797	163802	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802574
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3615	NC_012686	AGCAA	2	10	163939	163948	60 %	0 %	20 %	20 %	237802574
3616	NC_012686	TAC	2	6	163965	163970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802574
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3619	NC_012686	GT	3	6	164123	164128	0 %	50 %	50 %	0 %	237802574
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3999	NC_012686	ATT	2	6	181858	181863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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