MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 23073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_012686	CTGA	2	8	113538	113545	25 %	25 %	25 %	25 %	237802529
2502	NC_012686	AAT	2	6	113604	113609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802529
2503	NC_012686	GTC	2	6	113622	113627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802529
2504	NC_012686	AAT	2	6	113699	113704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802529
2505	NC_012686	CT	3	6	113841	113846	0 %	50 %	0 %	50 %	237802529
2506	NC_012686	CTT	2	6	113873	113878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802529
2507	NC_012686	CTG	2	6	113932	113937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802529
2508	NC_012686	CCA	2	6	113953	113958	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802529
2509	NC_012686	AAG	2	6	113982	113987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802529
2510	NC_012686	AGT	2	6	114046	114051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802529
2511	NC_012686	CAA	2	6	114071	114076	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802529
2512	NC_012686	T	6	6	114127	114132	0 %	100 %	0 %	0 %	237802529
2513	NC_012686	TTC	2	6	114144	114149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802529
2514	NC_012686	TC	4	8	114160	114167	0 %	50 %	0 %	50 %	237802529
2515	NC_012686	GCA	2	6	114202	114207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802529
2516	NC_012686	GCA	2	6	114211	114216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802529
2517	NC_012686	CGA	2	6	114335	114340	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802529
2518	NC_012686	A	6	6	114353	114358	100 %	0 %	0 %	0 %	237802529
2519	NC_012686	GCA	2	6	114427	114432	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802529
2520	NC_012686	CTA	2	6	114458	114463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802529
2521	NC_012686	TC	3	6	114485	114490	0 %	50 %	0 %	50 %	237802529
2522	NC_012686	CTC	2	6	114536	114541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2523	NC_012686	A	7	7	114555	114561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2524	NC_012686	A	8	8	114564	114571	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2525	NC_012686	GCTCT	2	10	114598	114607	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2526	NC_012686	ATT	2	6	114632	114637	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2527	NC_012686	AGA	2	6	114660	114665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802530
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2529	NC_012686	AG	3	6	114786	114791	50 %	0 %	50 %	0 %	237802530
2530	NC_012686	TAC	2	6	114900	114905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802530
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2532	NC_012686	CTTT	2	8	114997	115004	0 %	75 %	0 %	25 %	237802530
2533	NC_012686	ACAG	2	8	115009	115016	50 %	0 %	25 %	25 %	237802530
2534	NC_012686	T	6	6	115041	115046	0 %	100 %	0 %	0 %	237802530
2535	NC_012686	T	6	6	115071	115076	0 %	100 %	0 %	0 %	237802530
2536	NC_012686	AACG	2	8	115131	115138	50 %	0 %	25 %	25 %	237802530
2537	NC_012686	CTG	2	6	115166	115171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802530
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2539	NC_012686	TGTTT	2	10	115222	115231	0 %	80 %	20 %	0 %	237802530
2540	NC_012686	GA	4	8	115242	115249	50 %	0 %	50 %	0 %	237802530
2541	NC_012686	AGAA	2	8	115272	115279	75 %	0 %	25 %	0 %	237802530
2542	NC_012686	ACT	2	6	115282	115287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802530
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2547	NC_012686	GGA	2	6	115447	115452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802530
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2551	NC_012686	CATGT	2	10	115600	115609	20 %	40 %	20 %	20 %	237802530
2552	NC_012686	TCT	2	6	115761	115766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802530
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2557	NC_012686	GGAA	2	8	115879	115886	50 %	0 %	50 %	0 %	237802530
2558	NC_012686	ACC	2	6	115914	115919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237802530
2559	NC_012686	TTG	2	6	116000	116005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802530
2560	NC_012686	AAC	2	6	116022	116027	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802530
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2564	NC_012686	TTC	3	9	116226	116234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802530
2565	NC_012686	TCT	2	6	116287	116292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802530
2566	NC_012686	AAGC	2	8	116296	116303	50 %	0 %	25 %	25 %	237802530
2567	NC_012686	TATCG	2	10	116304	116313	20 %	40 %	20 %	20 %	237802530
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2570	NC_012686	AGT	2	6	116395	116400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2572	NC_012686	TAA	2	6	116447	116452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2573	NC_012686	A	7	7	116469	116475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2574	NC_012686	TTTTAG	2	12	116497	116508	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2575	NC_012686	TG	3	6	116513	116518	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2576	NC_012686	GGTT	2	8	116628	116635	0 %	50 %	50 %	0 %	237802531
2577	NC_012686	T	7	7	116644	116650	0 %	100 %	0 %	0 %	237802531
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2583	NC_012686	TTTG	2	8	117174	117181	0 %	75 %	25 %	0 %	237802531
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2616	NC_012686	TAA	2	6	118551	118556	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2617	NC_012686	AT	3	6	118638	118643	50 %	50 %	0 %	0 %	237802534
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2619	NC_012686	AGA	3	9	118654	118662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802534
2620	NC_012686	CTTT	2	8	118691	118698	0 %	75 %	0 %	25 %	237802534
2621	NC_012686	GTAG	2	8	118736	118743	25 %	25 %	50 %	0 %	237802534
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2623	NC_012686	T	6	6	118807	118812	0 %	100 %	0 %	0 %	237802534
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2625	NC_012686	GA	3	6	118934	118939	50 %	0 %	50 %	0 %	237802534
2626	NC_012686	TTA	2	6	118955	118960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802534
2627	NC_012686	TCC	2	6	118969	118974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802534
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2629	NC_012686	CTC	2	6	119025	119030	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802534
2630	NC_012686	AAAGA	2	10	119066	119075	80 %	0 %	20 %	0 %	237802534
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2633	NC_012686	CTT	2	6	119108	119113	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2634	NC_012686	TTA	2	6	119130	119135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802535
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2646	NC_012686	GTT	2	6	119784	119789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802535
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2659	NC_012686	GCTA	2	8	120214	120221	25 %	25 %	25 %	25 %	237802536
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2662	NC_012686	TGC	2	6	120313	120318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802536
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2672	NC_012686	GA	3	6	120922	120927	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2673	NC_012686	TAT	2	6	120946	120951	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2674	NC_012686	ATA	2	6	120967	120972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2723	NC_012686	AGCT	2	8	123403	123410	25 %	25 %	25 %	25 %	237802537
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2735	NC_012686	T	6	6	124190	124195	0 %	100 %	0 %	0 %	237802538
2736	NC_012686	GA	3	6	124268	124273	50 %	0 %	50 %	0 %	237802538
2737	NC_012686	GGGTTT	2	12	124291	124302	0 %	50 %	50 %	0 %	237802538
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2740	NC_012686	T	6	6	124349	124354	0 %	100 %	0 %	0 %	237802538
2741	NC_012686	TGGA	2	8	124359	124366	25 %	25 %	50 %	0 %	237802538
2742	NC_012686	GCAA	2	8	124394	124401	50 %	0 %	25 %	25 %	237802538
2743	NC_012686	TTA	2	6	124439	124444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802538
2744	NC_012686	TTA	2	6	124480	124485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802538
2745	NC_012686	GGA	2	6	124497	124502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802538
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2747	NC_012686	TTGCAT	2	12	124573	124584	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	237802538
2748	NC_012686	A	7	7	124591	124597	100 %	0 %	0 %	0 %	237802538
2749	NC_012686	CTG	2	6	124600	124605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802538
2750	NC_012686	TGA	2	6	124627	124632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802538
2751	NC_012686	ATT	2	6	124637	124642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802538
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