MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 23073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_012686	TGG	2	6	91354	91359	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237802509
2003	NC_012686	AAT	2	6	91448	91453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802509
2004	NC_012686	CGC	2	6	91463	91468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	237802509
2005	NC_012686	CTT	2	6	91478	91483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802509
2006	NC_012686	TTTTC	2	10	91557	91566	0 %	80 %	0 %	20 %	237802509
2007	NC_012686	GAA	2	6	91606	91611	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802509
2008	NC_012686	AT	3	6	91693	91698	50 %	50 %	0 %	0 %	237802509
2009	NC_012686	CTT	2	6	91733	91738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802510
2010	NC_012686	GTC	2	6	91753	91758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802510
2011	NC_012686	GGATG	2	10	91817	91826	20 %	20 %	60 %	0 %	237802510
2012	NC_012686	GCT	2	6	91827	91832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802510
2013	NC_012686	TCT	2	6	91834	91839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802510
2014	NC_012686	TGT	2	6	91883	91888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802510
2015	NC_012686	TCG	2	6	91919	91924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802510
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2019	NC_012686	GTA	2	6	92037	92042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802510
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2061	NC_012686	GA	3	6	94041	94046	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2062	NC_012686	GAA	2	6	94052	94057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_012686	TGA	2	6	94063	94068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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2251	NC_012686	TTCCC	2	10	101059	101068	0 %	40 %	0 %	60 %	237802519
2252	NC_012686	TCT	2	6	101155	101160	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802519
2253	NC_012686	CGA	2	6	101294	101299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802519
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2255	NC_012686	TTG	2	6	101373	101378	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802519
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2370	NC_012686	T	6	6	107209	107214	0 %	100 %	0 %	0 %	237802523
2371	NC_012686	TA	3	6	107270	107275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2372	NC_012686	AAGA	2	8	107288	107295	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2373	NC_012686	T	8	8	107358	107365	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2374	NC_012686	TAA	3	9	107423	107431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2375	NC_012686	CTT	2	6	107467	107472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2379	NC_012686	TCAG	2	8	107656	107663	25 %	25 %	25 %	25 %	237802524
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