MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 23073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012686	CAAGC	2	10	69330	69339	40 %	0 %	20 %	40 %	237802493
1502	NC_012686	TCT	2	6	69507	69512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802493
1503	NC_012686	ATG	2	6	69546	69551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802493
1504	NC_012686	AAAAG	2	10	69578	69587	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1505	NC_012686	A	6	6	69679	69684	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1506	NC_012686	TA	3	6	69714	69719	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1507	NC_012686	TTC	2	6	69754	69759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802494
1508	NC_012686	CTT	3	9	69763	69771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802494
1509	NC_012686	AT	3	6	69776	69781	50 %	50 %	0 %	0 %	237802494
1510	NC_012686	TTCG	2	8	69796	69803	0 %	50 %	25 %	25 %	237802494
1511	NC_012686	TGT	2	6	69821	69826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802494
1512	NC_012686	TGAT	2	8	69913	69920	25 %	50 %	25 %	0 %	237802494
1513	NC_012686	T	6	6	69961	69966	0 %	100 %	0 %	0 %	237802494
1514	NC_012686	TC	3	6	70011	70016	0 %	50 %	0 %	50 %	237802494
1515	NC_012686	TCT	2	6	70077	70082	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802494
1516	NC_012686	GGAGC	2	10	70200	70209	20 %	0 %	60 %	20 %	237802494
1517	NC_012686	TGC	2	6	70283	70288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802494
1518	NC_012686	A	7	7	70320	70326	100 %	0 %	0 %	0 %	237802494
1519	NC_012686	CT	3	6	70328	70333	0 %	50 %	0 %	50 %	237802494
1520	NC_012686	AGA	2	6	70337	70342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802494
1521	NC_012686	GCGAT	2	10	70390	70399	20 %	20 %	40 %	20 %	237802494
1522	NC_012686	GTT	2	6	70412	70417	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802494
1523	NC_012686	GCT	2	6	70434	70439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802494
1524	NC_012686	GCA	3	9	70536	70544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802494
1525	NC_012686	AAAG	2	8	70569	70576	75 %	0 %	25 %	0 %	237802494
1526	NC_012686	GCA	2	6	70583	70588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802494
1527	NC_012686	ATT	2	6	70597	70602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802494
1528	NC_012686	TAT	2	6	70705	70710	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802494
1529	NC_012686	CTT	2	6	70729	70734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802494
1530	NC_012686	GA	3	6	70738	70743	50 %	0 %	50 %	0 %	237802494
1531	NC_012686	CTCTT	2	10	70744	70753	0 %	60 %	0 %	40 %	237802494
1532	NC_012686	AGAA	2	8	70756	70763	75 %	0 %	25 %	0 %	237802494
1533	NC_012686	TGA	2	6	70784	70789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802494
1534	NC_012686	TTG	2	6	70873	70878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802494
1535	NC_012686	TCT	2	6	70896	70901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802494
1536	NC_012686	GA	3	6	70937	70942	50 %	0 %	50 %	0 %	237802494
1537	NC_012686	AGCT	2	8	70978	70985	25 %	25 %	25 %	25 %	237802494
1538	NC_012686	TGA	2	6	71024	71029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802494
1539	NC_012686	GCAT	2	8	71039	71046	25 %	25 %	25 %	25 %	237802494
1540	NC_012686	AGA	2	6	71057	71062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802494
1541	NC_012686	TCAA	2	8	71183	71190	50 %	25 %	0 %	25 %	237802494
1542	NC_012686	GT	3	6	71213	71218	0 %	50 %	50 %	0 %	237802494
1543	NC_012686	CT	3	6	71294	71299	0 %	50 %	0 %	50 %	237802494
1544	NC_012686	GA	3	6	71315	71320	50 %	0 %	50 %	0 %	237802494
1545	NC_012686	AGT	2	6	71357	71362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802494
1546	NC_012686	AGGGG	2	10	71390	71399	20 %	0 %	80 %	0 %	237802494
1547	NC_012686	AAGAA	2	10	71432	71441	80 %	0 %	20 %	0 %	237802494
1548	NC_012686	AGA	2	6	71504	71509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802494
1549	NC_012686	TGA	2	6	71540	71545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802494
1550	NC_012686	TAT	2	6	71551	71556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802494
1551	NC_012686	T	6	6	71640	71645	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_012686	T	8	8	71661	71668	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_012686	CAT	2	6	71726	71731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802495
1554	NC_012686	CCTT	2	8	71755	71762	0 %	50 %	0 %	50 %	237802495
1555	NC_012686	GCTT	2	8	71785	71792	0 %	50 %	25 %	25 %	237802495
1556	NC_012686	A	6	6	71880	71885	100 %	0 %	0 %	0 %	237802495
1557	NC_012686	ATT	2	6	71930	71935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802495
1558	NC_012686	CAA	2	6	72077	72082	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237802495
1559	NC_012686	TCC	2	6	72101	72106	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	237802495
1560	NC_012686	TTCT	2	8	72123	72130	0 %	75 %	0 %	25 %	237802495
1561	NC_012686	ATG	2	6	72135	72140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802495
1562	NC_012686	GCTT	2	8	72169	72176	0 %	50 %	25 %	25 %	237802495
1563	NC_012686	AGA	2	6	72178	72183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802495
1564	NC_012686	GAGC	2	8	72197	72204	25 %	0 %	50 %	25 %	237802495
1565	NC_012686	TCA	2	6	72222	72227	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802495
1566	NC_012686	A	7	7	72229	72235	100 %	0 %	0 %	0 %	237802495
1567	NC_012686	CTATTT	2	12	72240	72251	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	237802495
1568	NC_012686	TGA	2	6	72274	72279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802495
1569	NC_012686	ATG	2	6	72312	72317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802495
1570	NC_012686	AGA	2	6	72442	72447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_012686	CT	3	6	72450	72455	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1572	NC_012686	CGT	2	6	72490	72495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_012686	T	7	7	72495	72501	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1574	NC_012686	CTTGC	2	10	72521	72530	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1575	NC_012686	GATA	2	8	72545	72552	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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1578	NC_012686	ATTGG	2	10	72722	72731	20 %	40 %	40 %	0 %	237802496
1579	NC_012686	T	6	6	72738	72743	0 %	100 %	0 %	0 %	237802496
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1582	NC_012686	ATA	2	6	72866	72871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802496
1583	NC_012686	GCT	2	6	72886	72891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802496
1584	NC_012686	GCTA	2	8	72895	72902	25 %	25 %	25 %	25 %	237802496
1585	NC_012686	AAT	2	6	72925	72930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802496
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1593	NC_012686	GATT	2	8	73173	73180	25 %	50 %	25 %	0 %	237802496
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1599	NC_012686	TGA	2	6	73407	73412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802496
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1601	NC_012686	T	6	6	73522	73527	0 %	100 %	0 %	0 %	237802496
1602	NC_012686	TAG	2	6	73562	73567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802496
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1607	NC_012686	GAAAA	2	10	73794	73803	80 %	0 %	20 %	0 %	237802496
1608	NC_012686	A	7	7	73800	73806	100 %	0 %	0 %	0 %	237802496
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1611	NC_012686	TTTCTG	2	12	73919	73930	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	237802497
1612	NC_012686	AGA	2	6	73956	73961	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802497
1613	NC_012686	GA	3	6	73979	73984	50 %	0 %	50 %	0 %	237802497
1614	NC_012686	TAC	2	6	74004	74009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237802497
1615	NC_012686	GATCAT	2	12	74049	74060	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	237802497
1616	NC_012686	TGA	2	6	74082	74087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802497
1617	NC_012686	G	6	6	74140	74145	0 %	0 %	100 %	0 %	237802497
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1619	NC_012686	A	7	7	74187	74193	100 %	0 %	0 %	0 %	237802497
1620	NC_012686	TGGGA	2	10	74211	74220	20 %	20 %	60 %	0 %	237802497
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1623	NC_012686	AGG	2	6	74364	74369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802497
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1625	NC_012686	T	6	6	74494	74499	0 %	100 %	0 %	0 %	237802497
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