MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chlamydia trachomatis B/Jali20/OT chromosome

Total Repeats: 23073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012686	CTG	2	6	23116	23121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802453
502	NC_012686	TCG	2	6	23135	23140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802453
503	NC_012686	GAA	2	6	23144	23149	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
504	NC_012686	TTG	2	6	23198	23203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802453
505	NC_012686	CATT	2	8	23297	23304	25 %	50 %	0 %	25 %	237802453
506	NC_012686	AGA	2	6	23476	23481	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
507	NC_012686	TGA	2	6	23507	23512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802453
508	NC_012686	GAA	2	6	23545	23550	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
509	NC_012686	TTG	2	6	23567	23572	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802453
510	NC_012686	AGA	2	6	23627	23632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
511	NC_012686	GCTT	2	8	23640	23647	0 %	50 %	25 %	25 %	237802453
512	NC_012686	GGTT	2	8	23688	23695	0 %	50 %	50 %	0 %	237802453
513	NC_012686	TGC	2	6	23714	23719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802453
514	NC_012686	ATT	2	6	23766	23771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802453
515	NC_012686	AAT	2	6	23808	23813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802453
516	NC_012686	TTG	2	6	23871	23876	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802453
517	NC_012686	TTCT	2	8	24058	24065	0 %	75 %	0 %	25 %	237802453
518	NC_012686	TGC	2	6	24122	24127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802453
519	NC_012686	TAAC	2	8	24160	24167	50 %	25 %	0 %	25 %	237802453
520	NC_012686	GCA	2	6	24228	24233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802453
521	NC_012686	CATT	2	8	24283	24290	25 %	50 %	0 %	25 %	237802453
522	NC_012686	AGA	2	6	24302	24307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
523	NC_012686	GAG	2	6	24325	24330	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802453
524	NC_012686	TTC	2	6	24388	24393	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802453
525	NC_012686	GGAAA	2	10	24401	24410	60 %	0 %	40 %	0 %	237802453
526	NC_012686	GA	3	6	24424	24429	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
527	NC_012686	GA	3	6	24516	24521	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
528	NC_012686	GAA	2	6	24647	24652	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
529	NC_012686	GGTA	2	8	24653	24660	25 %	25 %	50 %	0 %	237802453
530	NC_012686	GTT	2	6	24741	24746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802453
531	NC_012686	CTT	2	6	24835	24840	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802453
532	NC_012686	AG	3	6	24897	24902	50 %	0 %	50 %	0 %	237802453
533	NC_012686	TAA	2	6	24908	24913	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802453
534	NC_012686	GAA	2	6	24928	24933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
535	NC_012686	AAG	2	6	25069	25074	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802453
536	NC_012686	A	7	7	25154	25160	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
537	NC_012686	TTA	2	6	25167	25172	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
538	NC_012686	T	9	9	25182	25190	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012686	T	6	6	25214	25219	0 %	100 %	0 %	0 %	237802454
540	NC_012686	AGA	2	6	25341	25346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802454
541	NC_012686	TAA	2	6	25473	25478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237802454
542	NC_012686	GGA	3	9	25505	25513	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802454
543	NC_012686	GAT	2	6	25550	25555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802454
544	NC_012686	TTGA	2	8	25648	25655	25 %	50 %	25 %	0 %	237802454
545	NC_012686	TTCG	2	8	25793	25800	0 %	50 %	25 %	25 %	237802454
546	NC_012686	TAGG	2	8	25872	25879	25 %	25 %	50 %	0 %	237802454
547	NC_012686	TGT	2	6	25963	25968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802454
548	NC_012686	TTA	2	6	25973	25978	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237802454
549	NC_012686	TTCC	2	8	25996	26003	0 %	50 %	0 %	50 %	237802454
550	NC_012686	TAG	2	6	26034	26039	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802454
551	NC_012686	GTGAGG	2	12	26068	26079	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	237802454
552	NC_012686	TAGG	2	8	26110	26117	25 %	25 %	50 %	0 %	237802454
553	NC_012686	AGAGG	2	10	26126	26135	40 %	0 %	60 %	0 %	237802454
554	NC_012686	AGC	2	6	26152	26157	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802454
555	NC_012686	T	6	6	26161	26166	0 %	100 %	0 %	0 %	237802454
556	NC_012686	T	6	6	26192	26197	0 %	100 %	0 %	0 %	237802454
557	NC_012686	AAG	2	6	26298	26303	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802454
558	NC_012686	GA	3	6	26314	26319	50 %	0 %	50 %	0 %	237802454
559	NC_012686	GT	3	6	26334	26339	0 %	50 %	50 %	0 %	237802454
560	NC_012686	TA	3	6	26536	26541	50 %	50 %	0 %	0 %	237802454
561	NC_012686	T	6	6	26545	26550	0 %	100 %	0 %	0 %	237802454
562	NC_012686	GAT	2	6	26557	26562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802454
563	NC_012686	TGT	2	6	26692	26697	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237802454
564	NC_012686	TAG	2	6	26730	26735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802454
565	NC_012686	A	6	6	26789	26794	100 %	0 %	0 %	0 %	237802454
566	NC_012686	GCA	2	6	26804	26809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802454
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569	NC_012686	CTT	2	6	26952	26957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802454
570	NC_012686	GA	3	6	26982	26987	50 %	0 %	50 %	0 %	237802454
571	NC_012686	GAA	2	6	27017	27022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802454
572	NC_012686	GAA	2	6	27024	27029	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802454
573	NC_012686	CGA	2	6	27032	27037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802454
574	NC_012686	GA	3	6	27106	27111	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
575	NC_012686	CT	3	6	27113	27118	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
576	NC_012686	ACT	2	6	27121	27126	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_012686	A	6	6	27137	27142	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012686	T	7	7	27149	27155	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_012686	AGG	3	9	27290	27298	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802455
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582	NC_012686	T	7	7	27412	27418	0 %	100 %	0 %	0 %	237802455
583	NC_012686	GAA	2	6	27430	27435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802455
584	NC_012686	GGAA	2	8	27465	27472	50 %	0 %	50 %	0 %	237802455
585	NC_012686	TTAA	2	8	27538	27545	50 %	50 %	0 %	0 %	237802455
586	NC_012686	AAAG	2	8	27588	27595	75 %	0 %	25 %	0 %	237802455
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588	NC_012686	T	7	7	27687	27693	0 %	100 %	0 %	0 %	237802455
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597	NC_012686	GGATA	2	10	27931	27940	40 %	20 %	40 %	0 %	237802455
598	NC_012686	A	7	7	27955	27961	100 %	0 %	0 %	0 %	237802455
599	NC_012686	AAG	2	6	27972	27977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802455
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601	NC_012686	A	8	8	28089	28096	100 %	0 %	0 %	0 %	237802456
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609	NC_012686	T	7	7	28463	28469	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
610	NC_012686	TAA	2	6	28474	28479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
611	NC_012686	TC	3	6	28481	28486	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_012686	ATTG	2	8	28532	28539	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012686	AG	3	6	28564	28569	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012686	AGA	2	6	28586	28591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012686	GAA	2	6	28636	28641	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
616	NC_012686	ATCCG	2	10	28656	28665	20 %	20 %	20 %	40 %	237802457
617	NC_012686	TTC	2	6	28769	28774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802457
618	NC_012686	TAG	2	6	28817	28822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802457
619	NC_012686	AGA	2	6	28830	28835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
620	NC_012686	GAT	3	9	28912	28920	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802457
621	NC_012686	GAG	2	6	28955	28960	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237802457
622	NC_012686	TG	3	6	28987	28992	0 %	50 %	50 %	0 %	237802457
623	NC_012686	GCA	2	6	29011	29016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802457
624	NC_012686	TC	3	6	29040	29045	0 %	50 %	0 %	50 %	237802457
625	NC_012686	AGGGT	2	10	29174	29183	20 %	20 %	60 %	0 %	237802457
626	NC_012686	TTC	2	6	29210	29215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802457
627	NC_012686	CAG	2	6	29222	29227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237802457
628	NC_012686	GAA	2	6	29236	29241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
629	NC_012686	TGA	2	6	29250	29255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237802457
630	NC_012686	TTC	2	6	29283	29288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237802457
631	NC_012686	CTG	2	6	29324	29329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237802457
632	NC_012686	GC	4	8	29454	29461	0 %	0 %	50 %	50 %	237802457
633	NC_012686	AAG	2	6	29462	29467	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237802457
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641	NC_012686	TTTG	2	8	30160	30167	0 %	75 %	25 %	0 %	237802458
642	NC_012686	TTGT	2	8	30195	30202	0 %	75 %	25 %	0 %	237802458
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