MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 chromosome

Total Repeats: 4578

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012658	TAAAT	2	10	3767	3776	60 %	40 %	0 %	0 %	237793324
2	NC_012658	AAGAT	2	10	6479	6488	60 %	20 %	20 %	0 %	237793326
3	NC_012658	TAAAA	2	10	7132	7141	80 %	20 %	0 %	0 %	237793327
4	NC_012658	ATACC	2	10	7286	7295	40 %	20 %	0 %	40 %	237793327
5	NC_012658	GGTAA	2	10	9645	9654	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
6	NC_012658	TCGTG	2	10	10436	10445	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_012658	TAAGT	2	10	12174	12183	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012658	AAGCT	2	10	12664	12673	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_012658	AAATT	2	10	14757	14766	60 %	40 %	0 %	0 %	237793328
10	NC_012658	AATAA	2	10	15495	15504	80 %	20 %	0 %	0 %	237793329
11	NC_012658	TTTTA	2	10	16435	16444	20 %	80 %	0 %	0 %	237793330
12	NC_012658	AATAA	2	10	16784	16793	80 %	20 %	0 %	0 %	237793331
13	NC_012658	TTATT	2	10	17227	17236	20 %	80 %	0 %	0 %	237793331
14	NC_012658	TATAA	2	10	17873	17882	60 %	40 %	0 %	0 %	237793331
15	NC_012658	CAAAG	2	10	18662	18671	60 %	0 %	20 %	20 %	237793331
16	NC_012658	TAATG	2	10	18847	18856	40 %	40 %	20 %	0 %	237793331
17	NC_012658	TAAAA	2	10	19395	19404	80 %	20 %	0 %	0 %	237793331
18	NC_012658	GAAAT	2	10	19684	19693	60 %	20 %	20 %	0 %	237793332
19	NC_012658	ATATT	2	10	20123	20132	40 %	60 %	0 %	0 %	237793332
20	NC_012658	TAATA	2	10	20183	20192	60 %	40 %	0 %	0 %	237793332
21	NC_012658	ATAGT	2	10	21241	21250	40 %	40 %	20 %	0 %	237793333
22	NC_012658	AATTT	2	10	21731	21740	40 %	60 %	0 %	0 %	237793333
23	NC_012658	ATTAT	2	10	22408	22417	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_012658	CTAAA	2	10	22661	22670	60 %	20 %	0 %	20 %	237793335
25	NC_012658	TTTAA	2	10	23792	23801	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_012658	ATTAA	2	10	23812	23821	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_012658	TATTT	2	10	23884	23893	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012658	AAATG	2	10	24392	24401	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012658	ATAAG	2	10	25851	25860	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_012658	TAATT	2	10	26810	26819	40 %	60 %	0 %	0 %	237793337
31	NC_012658	ATTTT	2	10	27639	27648	20 %	80 %	0 %	0 %	237793338
32	NC_012658	TAAAT	2	10	27977	27986	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012658	TATTT	2	10	28215	28224	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012658	TATAA	2	10	28297	28306	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012658	GAAAA	2	10	29478	29487	80 %	0 %	20 %	0 %	237793340
36	NC_012658	AAAAT	2	10	31091	31100	80 %	20 %	0 %	0 %	237793341
37	NC_012658	AATAC	2	10	31183	31192	60 %	20 %	0 %	20 %	237793341
38	NC_012658	ATATT	2	10	31522	31531	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012658	AATAA	2	10	31580	31589	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_012658	GATTT	2	10	32599	32608	20 %	60 %	20 %	0 %	237793342
41	NC_012658	ATAAA	2	10	35037	35046	80 %	20 %	0 %	0 %	237793345
42	NC_012658	TAATA	2	10	35132	35141	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012658	GAATA	2	10	35219	35228	60 %	20 %	20 %	0 %	237793346
44	NC_012658	TTATT	2	10	35235	35244	20 %	80 %	0 %	0 %	237793346
45	NC_012658	ATAAA	2	10	35614	35623	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012658	GATTT	2	10	35969	35978	20 %	60 %	20 %	0 %	237793347
47	NC_012658	AAAAG	2	10	36228	36237	80 %	0 %	20 %	0 %	237793347
48	NC_012658	TTGTA	2	10	36493	36502	20 %	60 %	20 %	0 %	237793348
49	NC_012658	TATTT	2	10	37849	37858	20 %	80 %	0 %	0 %	237793350
50	NC_012658	ATAGA	2	10	37891	37900	60 %	20 %	20 %	0 %	237793350
51	NC_012658	AAAGA	2	10	38565	38574	80 %	0 %	20 %	0 %	237793350
52	NC_012658	AGTAT	2	10	39574	39583	40 %	40 %	20 %	0 %	237793352
53	NC_012658	TTAAT	2	10	40611	40620	40 %	60 %	0 %	0 %	237793353
54	NC_012658	ATTGT	2	10	41794	41803	20 %	60 %	20 %	0 %	237793354
55	NC_012658	ATAGA	2	10	41899	41908	60 %	20 %	20 %	0 %	237793354
56	NC_012658	GGTAA	2	10	42686	42695	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012658	TCGTG	2	10	43477	43486	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
58	NC_012658	TAAGT	2	10	45215	45224	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012658	AAGCT	2	10	45705	45714	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
60	NC_012658	AATAA	2	10	47704	47713	80 %	20 %	0 %	0 %	237793355
61	NC_012658	GAATA	2	10	48055	48064	60 %	20 %	20 %	0 %	237793355
62	NC_012658	TAATT	2	10	48354	48363	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012658	GGTAA	2	10	49278	49287	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
64	NC_012658	TCGTG	2	10	50069	50078	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
65	NC_012658	TAAGT	2	10	51807	51816	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012658	AAGCT	2	10	52297	52306	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_012658	AAAAT	2	10	53658	53667	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_012658	TTATA	2	10	54284	54293	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012658	AAAGG	2	10	56152	56161	60 %	0 %	40 %	0 %	237793358
70	NC_012658	GGTAA	2	10	57270	57279	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012658	TCGTG	2	10	58061	58070	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
72	NC_012658	TAAGT	2	10	59799	59808	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_012658	AAGCT	2	10	60289	60298	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
74	NC_012658	TGATT	2	10	62039	62048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012658	GTATA	2	10	63361	63370	40 %	40 %	20 %	0 %	237793359
76	NC_012658	TTATA	2	10	63433	63442	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_012658	GGTAA	2	10	64328	64337	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
78	NC_012658	TCGTG	2	10	65119	65128	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_012658	TAAGT	2	10	66859	66868	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012658	AAGCT	2	10	67349	67358	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
81	NC_012658	GAAGA	2	10	69271	69280	60 %	0 %	40 %	0 %	237793360
82	NC_012658	AAATA	2	10	69889	69898	80 %	20 %	0 %	0 %	237793360
83	NC_012658	ATTAT	2	10	70012	70021	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012658	GGTAA	2	10	70664	70673	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
85	NC_012658	TCGTG	2	10	71455	71464	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_012658	TAAGT	2	10	73193	73202	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012658	AAGCT	2	10	73683	73692	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
88	NC_012658	AAAAT	2	10	75044	75053	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_012658	TTGAA	2	10	76451	76460	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_012658	CAATC	2	10	76602	76611	40 %	20 %	0 %	40 %	237793362
91	NC_012658	TTATT	2	10	78878	78887	20 %	80 %	0 %	0 %	237793364
92	NC_012658	ATTTT	2	10	78895	78904	20 %	80 %	0 %	0 %	237793364
93	NC_012658	ATTTT	2	10	79248	79257	20 %	80 %	0 %	0 %	237793364
94	NC_012658	AAAAT	2	10	79282	79291	80 %	20 %	0 %	0 %	237793364
95	NC_012658	TTTCC	2	10	79963	79972	0 %	60 %	0 %	40 %	237793365
96	NC_012658	ATTTT	2	10	79978	79987	20 %	80 %	0 %	0 %	237793365
97	NC_012658	TAAAT	2	10	83971	83980	60 %	40 %	0 %	0 %	237793370
98	NC_012658	TAAAT	2	10	84764	84773	60 %	40 %	0 %	0 %	237793371
99	NC_012658	TAGAA	2	10	84893	84902	60 %	20 %	20 %	0 %	237793371
100	NC_012658	AGGTT	2	10	86268	86277	20 %	40 %	40 %	0 %	237793374
101	NC_012658	ATGGA	2	10	86706	86715	40 %	20 %	40 %	0 %	237793374
102	NC_012658	AGGAT	2	10	87202	87211	40 %	20 %	40 %	0 %	237793375
103	NC_012658	AATGG	2	10	87449	87458	40 %	20 %	40 %	0 %	237793375
104	NC_012658	AAATT	2	10	87634	87643	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_012658	AAAGA	2	10	88190	88199	80 %	0 %	20 %	0 %	237793376
106	NC_012658	ATTTA	2	10	89285	89294	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012658	TACAA	2	10	89543	89552	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
108	NC_012658	TTTAA	2	10	89950	89959	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_012658	TAAAT	2	10	92305	92314	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_012658	TATAA	2	10	93400	93409	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012658	ATTTT	2	10	94469	94478	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_012658	ATTTA	2	10	94674	94683	40 %	60 %	0 %	0 %	237793383
113	NC_012658	TAATA	2	10	94944	94953	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_012658	AATAC	2	10	96460	96469	60 %	20 %	0 %	20 %	237793386
115	NC_012658	TAAAT	2	10	96709	96718	60 %	40 %	0 %	0 %	237793386
116	NC_012658	ATTCT	2	10	97959	97968	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
117	NC_012658	ATTAT	2	10	98537	98546	40 %	60 %	0 %	0 %	237793388
118	NC_012658	TAAAT	2	10	99084	99093	60 %	40 %	0 %	0 %	237793388
119	NC_012658	TACTT	2	10	99266	99275	20 %	60 %	0 %	20 %	237793389
120	NC_012658	AAATA	2	10	99374	99383	80 %	20 %	0 %	0 %	237793389
121	NC_012658	ATATT	2	10	101823	101832	40 %	60 %	0 %	0 %	237793391
122	NC_012658	AGAAA	2	10	104323	104332	80 %	0 %	20 %	0 %	237793393
123	NC_012658	AAAAC	2	10	104368	104377	80 %	0 %	0 %	20 %	237793393
124	NC_012658	AAATT	2	10	105338	105347	60 %	40 %	0 %	0 %	237793394
125	NC_012658	AAATG	2	10	105606	105615	60 %	20 %	20 %	0 %	237793394
126	NC_012658	GAAAA	2	10	108184	108193	80 %	0 %	20 %	0 %	237793396
127	NC_012658	ACATT	2	10	111249	111258	40 %	40 %	0 %	20 %	237793399
128	NC_012658	AAAAT	2	10	113738	113747	80 %	20 %	0 %	0 %	237793402
129	NC_012658	ATAAA	2	10	113828	113837	80 %	20 %	0 %	0 %	237793402
130	NC_012658	ATTTA	2	10	114715	114724	40 %	60 %	0 %	0 %	237793403
131	NC_012658	GTTAT	2	10	117332	117341	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012658	ATTTT	2	10	119073	119082	20 %	80 %	0 %	0 %	237793409
133	NC_012658	ATACA	2	10	119590	119599	60 %	20 %	0 %	20 %	237793410
134	NC_012658	AATAT	2	10	119894	119903	60 %	40 %	0 %	0 %	237793410
135	NC_012658	TAAAA	2	10	120186	120195	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012658	AAGAA	2	10	121159	121168	80 %	0 %	20 %	0 %	237793411
137	NC_012658	TAATA	2	10	121447	121456	60 %	40 %	0 %	0 %	237793411
138	NC_012658	AGAGA	2	10	121481	121490	60 %	0 %	40 %	0 %	237793411
139	NC_012658	TAAAT	2	10	122071	122080	60 %	40 %	0 %	0 %	237793411
140	NC_012658	AATTC	2	10	124412	124421	40 %	40 %	0 %	20 %	237793415
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142	NC_012658	AAAAG	2	10	127298	127307	80 %	0 %	20 %	0 %	237793417
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