MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 chromosome

Total Repeats: 62952

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012658	TAG	2	6	2	7	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_012658	CAA	2	6	61	66	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012658	GTT	2	6	98	103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_012658	GGA	2	6	151	156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012658	AAT	2	6	278	283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
6	NC_012658	ACT	2	6	407	412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793321
7	NC_012658	GAA	2	6	413	418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
8	NC_012658	ATA	2	6	444	449	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
9	NC_012658	ATG	2	6	474	479	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
10	NC_012658	CTA	2	6	486	491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793321
11	NC_012658	GCA	2	6	554	559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237793321
12	NC_012658	TGG	2	6	613	618	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237793321
13	NC_012658	AGT	2	6	691	696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
14	NC_012658	TCT	2	6	704	709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237793321
15	NC_012658	GAT	2	6	746	751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
16	NC_012658	TGA	2	6	802	807	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
17	NC_012658	AAT	2	6	889	894	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
18	NC_012658	AGA	2	6	934	939	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
19	NC_012658	GAA	2	6	1018	1023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
20	NC_012658	TAA	2	6	1119	1124	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
21	NC_012658	TAG	2	6	1128	1133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793321
22	NC_012658	TAA	2	6	1150	1155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
23	NC_012658	ATT	2	6	1235	1240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793321
24	NC_012658	AAG	2	6	1242	1247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
25	NC_012658	TAT	2	6	1259	1264	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793321
26	NC_012658	AGA	2	6	1276	1281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
27	NC_012658	AGA	2	6	1295	1300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
28	NC_012658	GAA	2	6	1382	1387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793321
29	NC_012658	TAC	2	6	1405	1410	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793321
30	NC_012658	TAA	2	6	1438	1443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793321
31	NC_012658	TAA	2	6	1531	1536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012658	TTG	2	6	1549	1554	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012658	ATT	2	6	1627	1632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_012658	CAA	2	6	1684	1689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_012658	CTA	6	18	1693	1710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012658	TAT	2	6	1714	1719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_012658	TAA	2	6	1753	1758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012658	AGG	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012658	TAT	2	6	1858	1863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
40	NC_012658	TTA	2	6	1873	1878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
41	NC_012658	TAA	2	6	1883	1888	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
42	NC_012658	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
43	NC_012658	AGA	2	6	2045	2050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
44	NC_012658	ATA	2	6	2064	2069	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
45	NC_012658	TAT	2	6	2129	2134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
46	NC_012658	TAG	2	6	2275	2280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
47	NC_012658	AAG	2	6	2306	2311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
48	NC_012658	GTT	2	6	2316	2321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237793322
49	NC_012658	AGA	3	9	2387	2395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
50	NC_012658	AAT	2	6	2459	2464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
51	NC_012658	ATT	2	6	2471	2476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
52	NC_012658	TTA	2	6	2488	2493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
53	NC_012658	GAA	2	6	2514	2519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
54	NC_012658	ATA	2	6	2532	2537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
55	NC_012658	AAG	2	6	2590	2595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
56	NC_012658	TAA	2	6	2641	2646	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
57	NC_012658	AGA	2	6	2675	2680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793322
58	NC_012658	GTA	2	6	2688	2693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
59	NC_012658	GAT	2	6	2763	2768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
60	NC_012658	AGT	2	6	2790	2795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793322
61	NC_012658	TAT	2	6	2807	2812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793322
62	NC_012658	AAT	2	6	2829	2834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
63	NC_012658	AAT	2	6	2868	2873	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793322
64	NC_012658	GAT	2	6	2895	2900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793323
65	NC_012658	ATA	2	6	2923	2928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793323
66	NC_012658	CAA	2	6	2960	2965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237793323
67	NC_012658	TAA	2	6	3075	3080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793323
68	NC_012658	ATT	2	6	3094	3099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793323
69	NC_012658	AAT	2	6	3121	3126	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012658	TAT	2	6	3140	3145	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_012658	TAA	2	6	3193	3198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
72	NC_012658	ATG	2	6	3211	3216	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
73	NC_012658	TAA	2	6	3260	3265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
74	NC_012658	ATA	2	6	3367	3372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
75	NC_012658	TGT	2	6	3509	3514	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237793324
76	NC_012658	AGA	2	6	3527	3532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793324
77	NC_012658	AAT	2	6	3539	3544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
78	NC_012658	TAT	2	6	3609	3614	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793324
79	NC_012658	ATA	2	6	3631	3636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
80	NC_012658	AAT	2	6	3675	3680	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
81	NC_012658	ATG	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
82	NC_012658	ATT	2	6	3777	3782	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793324
83	NC_012658	AAG	2	6	3798	3803	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793324
84	NC_012658	AGA	2	6	3818	3823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793324
85	NC_012658	ATT	2	6	3878	3883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793324
86	NC_012658	GAT	2	6	3951	3956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
87	NC_012658	ACA	2	6	4007	4012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237793324
88	NC_012658	CAT	2	6	4042	4047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793324
89	NC_012658	ATA	2	6	4053	4058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
90	NC_012658	GAT	2	6	4095	4100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793324
91	NC_012658	TAA	2	6	4168	4173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
92	NC_012658	AGA	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793324
93	NC_012658	TAA	2	6	4238	4243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793324
94	NC_012658	TTC	2	6	4290	4295	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237793325
95	NC_012658	GTA	3	9	4310	4318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793325
96	NC_012658	TTG	2	6	4413	4418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237793325
97	NC_012658	AGG	2	6	4555	4560	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012658	ATG	2	6	4592	4597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
99	NC_012658	TCA	2	6	4683	4688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793326
100	NC_012658	ATA	2	6	4709	4714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
101	NC_012658	GAT	2	6	4792	4797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
102	NC_012658	CTG	2	6	4841	4846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	237793326
103	NC_012658	TAA	2	6	4853	4858	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
104	NC_012658	GGT	2	6	4888	4893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237793326
105	NC_012658	GGA	2	6	4894	4899	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237793326
106	NC_012658	TGG	2	6	4911	4916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	237793326
107	NC_012658	TGT	2	6	4938	4943	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	237793326
108	NC_012658	AAG	2	6	4977	4982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793326
109	NC_012658	TAG	2	6	5042	5047	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
110	NC_012658	TGA	2	6	5103	5108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
111	NC_012658	CAA	2	6	5284	5289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237793326
112	NC_012658	TAA	2	6	5382	5387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
113	NC_012658	CAG	2	6	5531	5536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237793326
114	NC_012658	TAG	2	6	5627	5632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
115	NC_012658	ATA	2	6	5680	5685	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
116	NC_012658	AGA	2	6	5749	5754	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793326
117	NC_012658	TTC	2	6	5802	5807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	237793326
118	NC_012658	CAT	2	6	5816	5821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793326
119	NC_012658	AGG	2	6	5856	5861	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	237793326
120	NC_012658	GAA	2	6	5876	5881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793326
121	NC_012658	ATA	2	6	6038	6043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
122	NC_012658	AAT	2	6	6045	6050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
123	NC_012658	TAG	2	6	6131	6136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
124	NC_012658	ACC	2	6	6162	6167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	237793326
125	NC_012658	AAC	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	237793326
126	NC_012658	ACT	2	6	6322	6327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	237793326
127	NC_012658	TTA	2	6	6349	6354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	237793326
128	NC_012658	GCA	2	6	6379	6384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	237793326
129	NC_012658	AAG	2	6	6426	6431	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793326
130	NC_012658	AAT	2	6	6445	6450	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793326
131	NC_012658	AGT	2	6	6459	6464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	237793326
132	NC_012658	AGA	2	6	6638	6643	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	237793327
133	NC_012658	ATA	2	6	6644	6649	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	237793327
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