MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 8415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3002	NC_012654	ATT	2	6	99407	99412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587371
3003	NC_012654	A	6	6	99446	99451	100 %	0 %	0 %	0 %	229587371
3004	NC_012654	TCC	2	6	99452	99457	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587371
3005	NC_012654	ATT	2	6	99461	99466	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587371
3006	NC_012654	TTC	2	6	99485	99490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587371
3007	NC_012654	ATA	2	6	99511	99516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587371
3008	NC_012654	CATT	2	8	99519	99526	25 %	50 %	0 %	25 %	229587371
3009	NC_012654	TTTAAA	2	12	99587	99598	50 %	50 %	0 %	0 %	229587371
3010	NC_012654	TAAT	2	8	99616	99623	50 %	50 %	0 %	0 %	229587371
3011	NC_012654	ATT	2	6	99657	99662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587371
3012	NC_012654	TAA	2	6	99668	99673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587371
3013	NC_012654	T	7	7	99686	99692	0 %	100 %	0 %	0 %	229587371
3014	NC_012654	TA	4	8	99703	99710	50 %	50 %	0 %	0 %	229587371
3015	NC_012654	TA	4	8	99721	99728	50 %	50 %	0 %	0 %	229587371
3016	NC_012654	AT	3	6	99747	99752	50 %	50 %	0 %	0 %	229587371
3017	NC_012654	TAG	2	6	99755	99760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587371
3018	NC_012654	T	6	6	99809	99814	0 %	100 %	0 %	0 %	229587371
3019	NC_012654	TAAT	2	8	99826	99833	50 %	50 %	0 %	0 %	229587371
3020	NC_012654	ATA	2	6	99943	99948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587371
3021	NC_012654	T	6	6	99954	99959	0 %	100 %	0 %	0 %	229587371
3022	NC_012654	TTCCA	2	10	99980	99989	20 %	40 %	0 %	40 %	229587371
3023	NC_012654	TCC	2	6	100022	100027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3024	NC_012654	TAA	2	6	100062	100067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3025	NC_012654	ATT	3	9	100068	100076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_012654	T	7	7	100085	100091	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_012654	TA	3	6	100100	100105	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3028	NC_012654	A	6	6	100122	100127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3029	NC_012654	ATC	2	6	100175	100180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_012654	TA	4	8	100310	100317	50 %	50 %	0 %	0 %	229587372
3031	NC_012654	AT	3	6	100345	100350	50 %	50 %	0 %	0 %	229587372
3032	NC_012654	TTATA	2	10	100373	100382	40 %	60 %	0 %	0 %	229587372
3033	NC_012654	TATC	2	8	100411	100418	25 %	50 %	0 %	25 %	229587372
3034	NC_012654	TTC	2	6	100460	100465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587372
3035	NC_012654	TCTA	2	8	100476	100483	25 %	50 %	0 %	25 %	229587372
3036	NC_012654	GGTT	2	8	100501	100508	0 %	50 %	50 %	0 %	229587372
3037	NC_012654	TAT	2	6	100524	100529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587372
3038	NC_012654	TA	3	6	100536	100541	50 %	50 %	0 %	0 %	229587372
3039	NC_012654	CTA	2	6	100565	100570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587372
3040	NC_012654	A	6	6	100572	100577	100 %	0 %	0 %	0 %	229587372
3041	NC_012654	TCC	2	6	100590	100595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587372
3042	NC_012654	TAA	2	6	100610	100615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587372
3043	NC_012654	CTATA	2	10	100622	100631	40 %	40 %	0 %	20 %	229587372
3044	NC_012654	ATA	2	6	100645	100650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587372
3045	NC_012654	TAA	2	6	100674	100679	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587372
3046	NC_012654	CTT	2	6	100686	100691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587372
3047	NC_012654	ATA	2	6	100712	100717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587372
3048	NC_012654	CTTT	2	8	100767	100774	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3049	NC_012654	A	6	6	100779	100784	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_012654	TTAA	2	8	100792	100799	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_012654	TCC	2	6	100842	100847	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3052	NC_012654	TTAT	2	8	100853	100860	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3053	NC_012654	A	6	6	100869	100874	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3054	NC_012654	ATTT	2	8	100878	100885	25 %	75 %	0 %	0 %	229587373
3055	NC_012654	T	8	8	100888	100895	0 %	100 %	0 %	0 %	229587373
3056	NC_012654	CTT	2	6	100896	100901	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587373
3057	NC_012654	GTCA	2	8	100916	100923	25 %	25 %	25 %	25 %	229587373
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3059	NC_012654	AAAT	2	8	101014	101021	75 %	25 %	0 %	0 %	229587373
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3061	NC_012654	CTT	2	6	101076	101081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3062	NC_012654	TTC	2	6	101112	101117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3063	NC_012654	ACT	2	6	101126	101131	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3064	NC_012654	ATT	2	6	101146	101151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3065	NC_012654	TTAA	2	8	101179	101186	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3066	NC_012654	ATT	2	6	101266	101271	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587374
3067	NC_012654	TGT	3	9	101272	101280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587374
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3070	NC_012654	TCT	2	6	101411	101416	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587374
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3072	NC_012654	TAA	2	6	101461	101466	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3073	NC_012654	GCT	2	6	101484	101489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3074	NC_012654	T	7	7	101518	101524	0 %	100 %	0 %	0 %	229587375
3075	NC_012654	TAA	2	6	101552	101557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587375
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3079	NC_012654	TTTAC	2	10	101673	101682	20 %	60 %	0 %	20 %	229587375
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3081	NC_012654	TTTC	2	8	101838	101845	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3082	NC_012654	ATTA	2	8	101887	101894	50 %	50 %	0 %	0 %	229587376
3083	NC_012654	ATC	3	9	101904	101912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587376
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3091	NC_012654	ATTT	2	8	102150	102157	25 %	75 %	0 %	0 %	229587376
3092	NC_012654	T	6	6	102155	102160	0 %	100 %	0 %	0 %	229587376
3093	NC_012654	AAT	2	6	102196	102201	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587376
3094	NC_012654	TCC	2	6	102208	102213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3095	NC_012654	TAA	2	6	102241	102246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_012654	ATAA	2	8	102259	102266	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_012654	TAT	2	6	102267	102272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587377
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3099	NC_012654	TAA	2	6	102401	102406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587377
3100	NC_012654	AAT	2	6	102446	102451	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_012654	TA	4	8	102454	102461	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_012654	CTC	2	6	102531	102536	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587378
3103	NC_012654	T	7	7	102563	102569	0 %	100 %	0 %	0 %	229587378
3104	NC_012654	AT	3	6	102578	102583	50 %	50 %	0 %	0 %	229587378
3105	NC_012654	T	6	6	102619	102624	0 %	100 %	0 %	0 %	229587378
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3107	NC_012654	TAT	2	6	102647	102652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587378
3108	NC_012654	TTC	2	6	102657	102662	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587378
3109	NC_012654	CTC	2	6	102689	102694	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587378
3110	NC_012654	AT	3	6	102739	102744	50 %	50 %	0 %	0 %	229587378
3111	NC_012654	T	6	6	102780	102785	0 %	100 %	0 %	0 %	229587378
3112	NC_012654	ACT	2	6	102787	102792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587378
3113	NC_012654	TTC	2	6	102801	102806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587378
3114	NC_012654	TA	3	6	102821	102826	50 %	50 %	0 %	0 %	229587378
3115	NC_012654	TTC	2	6	102863	102868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_012654	TATT	2	8	102875	102882	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_012654	TAAT	2	8	102913	102920	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3118	NC_012654	TAT	2	6	102921	102926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3119	NC_012654	A	8	8	102935	102942	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3120	NC_012654	TA	3	6	103013	103018	50 %	50 %	0 %	0 %	229587379
3121	NC_012654	TTC	2	6	103029	103034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587379
3122	NC_012654	ATC	2	6	103059	103064	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587379
3123	NC_012654	CCA	2	6	103084	103089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	229587379
3124	NC_012654	CTG	2	6	103152	103157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587379
3125	NC_012654	TAA	2	6	103161	103166	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587379
3126	NC_012654	TCC	2	6	103254	103259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3127	NC_012654	TTA	2	6	103286	103291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_012654	TAAT	2	8	103294	103301	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_012654	TAT	2	6	103302	103307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_012654	A	6	6	103315	103320	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_012654	TAT	2	6	103323	103328	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_012654	TA	3	6	103354	103359	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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