MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 8415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012654	TA	3	6	50730	50735	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1502	NC_012654	GCT	2	6	50769	50774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587312
1503	NC_012654	ATCTA	2	10	50778	50787	40 %	40 %	0 %	20 %	229587312
1504	NC_012654	TTG	2	6	50789	50794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587312
1505	NC_012654	TA	3	6	50810	50815	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1506	NC_012654	ATT	2	6	50835	50840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1507	NC_012654	TAT	2	6	50841	50846	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1508	NC_012654	AAT	2	6	50852	50857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587312
1509	NC_012654	CTTG	2	8	50890	50897	0 %	50 %	25 %	25 %	229587312
1510	NC_012654	AATC	2	8	50906	50913	50 %	25 %	0 %	25 %	229587312
1511	NC_012654	TTA	2	6	50923	50928	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1512	NC_012654	GCT	2	6	50989	50994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	229587312
1513	NC_012654	CTT	2	6	50999	51004	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1514	NC_012654	TTG	2	6	51023	51028	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587312
1515	NC_012654	TTA	2	6	51041	51046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1516	NC_012654	TTATT	2	10	51062	51071	20 %	80 %	0 %	0 %	229587312
1517	NC_012654	TTC	2	6	51075	51080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1518	NC_012654	TA	3	6	51108	51113	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1519	NC_012654	TA	4	8	51161	51168	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1520	NC_012654	T	7	7	51192	51198	0 %	100 %	0 %	0 %	229587312
1521	NC_012654	TCT	2	6	51211	51216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1522	NC_012654	T	6	6	51237	51242	0 %	100 %	0 %	0 %	229587312
1523	NC_012654	ATC	2	6	51300	51305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1524	NC_012654	ATC	2	6	51321	51326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1525	NC_012654	CTAT	2	8	51370	51377	25 %	50 %	0 %	25 %	229587312
1526	NC_012654	ATC	2	6	51378	51383	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1527	NC_012654	TAG	2	6	51392	51397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587312
1528	NC_012654	TCT	2	6	51427	51432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1529	NC_012654	T	6	6	51438	51443	0 %	100 %	0 %	0 %	229587312
1530	NC_012654	TCT	2	6	51451	51456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1531	NC_012654	AGA	2	6	51474	51479	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587312
1532	NC_012654	TCAT	2	8	51493	51500	25 %	50 %	0 %	25 %	229587312
1533	NC_012654	AGC	2	6	51636	51641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587312
1534	NC_012654	ATC	2	6	51654	51659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1535	NC_012654	CTT	2	6	51713	51718	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1536	NC_012654	TAG	2	6	51719	51724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587312
1537	NC_012654	TCT	2	6	51742	51747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1538	NC_012654	ATT	2	6	51768	51773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1539	NC_012654	T	6	6	51772	51777	0 %	100 %	0 %	0 %	229587312
1540	NC_012654	GTT	2	6	51787	51792	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587312
1541	NC_012654	TAC	2	6	51804	51809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1542	NC_012654	T	6	6	51840	51845	0 %	100 %	0 %	0 %	229587312
1543	NC_012654	TAATA	2	10	51867	51876	60 %	40 %	0 %	0 %	229587312
1544	NC_012654	TTA	2	6	51880	51885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1545	NC_012654	CTT	2	6	51926	51931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1546	NC_012654	TATCTT	2	12	51932	51943	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	229587312
1547	NC_012654	CTT	2	6	51956	51961	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1548	NC_012654	AT	5	10	51964	51973	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1549	NC_012654	ATT	2	6	51975	51980	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1550	NC_012654	CAT	2	6	52049	52054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1551	NC_012654	CAT	2	6	52070	52075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1552	NC_012654	CTT	2	6	52091	52096	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1553	NC_012654	TTA	2	6	52135	52140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1554	NC_012654	ATTTAT	2	12	52149	52160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1555	NC_012654	TATTT	2	10	52179	52188	20 %	80 %	0 %	0 %	229587312
1556	NC_012654	ACT	3	9	52189	52197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1557	NC_012654	TTAG	2	8	52213	52220	25 %	50 %	25 %	0 %	229587312
1558	NC_012654	TCT	2	6	52225	52230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1559	NC_012654	AAAT	2	8	52232	52239	75 %	25 %	0 %	0 %	229587312
1560	NC_012654	TAC	2	6	52287	52292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1561	NC_012654	AAT	2	6	52308	52313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587312
1562	NC_012654	TAA	2	6	52417	52422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587312
1563	NC_012654	ATT	2	6	52431	52436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1564	NC_012654	T	6	6	52504	52509	0 %	100 %	0 %	0 %	229587312
1565	NC_012654	CAT	2	6	52550	52555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1566	NC_012654	TTA	2	6	52615	52620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1567	NC_012654	TATC	2	8	52655	52662	25 %	50 %	0 %	25 %	229587312
1568	NC_012654	CTA	2	6	52667	52672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1569	NC_012654	TAG	2	6	52682	52687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587312
1570	NC_012654	TTA	2	6	52690	52695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1571	NC_012654	TCT	2	6	52705	52710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1572	NC_012654	TATT	2	8	52763	52770	25 %	75 %	0 %	0 %	229587312
1573	NC_012654	TTA	2	6	52930	52935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1574	NC_012654	TAG	2	6	52973	52978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587312
1575	NC_012654	TATT	2	8	52987	52994	25 %	75 %	0 %	0 %	229587312
1576	NC_012654	TAT	2	6	52998	53003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
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1582	NC_012654	TTA	2	6	53164	53169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
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1584	NC_012654	TTAC	2	8	53209	53216	25 %	50 %	0 %	25 %	229587312
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1587	NC_012654	TAACA	2	10	53304	53313	60 %	20 %	0 %	20 %	229587312
1588	NC_012654	TTG	2	6	53330	53335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587312
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1592	NC_012654	TA	4	8	53400	53407	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
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1594	NC_012654	AGT	2	6	53556	53561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587312
1595	NC_012654	ACT	2	6	53646	53651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1596	NC_012654	AATA	2	8	53703	53710	75 %	25 %	0 %	0 %	229587312
1597	NC_012654	ATC	2	6	53715	53720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
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1599	NC_012654	TATT	2	8	53753	53760	25 %	75 %	0 %	0 %	229587312
1600	NC_012654	AT	3	6	53774	53779	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1601	NC_012654	ACTTA	2	10	53796	53805	40 %	40 %	0 %	20 %	229587312
1602	NC_012654	ATG	2	6	53837	53842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587312
1603	NC_012654	CTA	2	6	53857	53862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
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1605	NC_012654	AT	3	6	53897	53902	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1606	NC_012654	TTACAG	2	12	53912	53923	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	229587312
1607	NC_012654	CTA	3	9	53954	53962	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587312
1608	NC_012654	CAAT	2	8	53965	53972	50 %	25 %	0 %	25 %	229587312
1609	NC_012654	AT	3	6	53978	53983	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1610	NC_012654	AT	3	6	53987	53992	50 %	50 %	0 %	0 %	229587312
1611	NC_012654	TTA	2	6	54058	54063	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1612	NC_012654	TAT	2	6	54083	54088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587312
1613	NC_012654	TCT	2	6	54161	54166	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587312
1614	NC_012654	T	6	6	54177	54182	0 %	100 %	0 %	0 %	229587312
1615	NC_012654	TAAT	2	8	54222	54229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1616	NC_012654	T	6	6	54229	54234	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_012654	ATT	2	6	54235	54240	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1618	NC_012654	AATT	2	8	54243	54250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1619	NC_012654	ATT	3	9	54248	54256	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1620	NC_012654	A	6	6	54265	54270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1621	NC_012654	CTT	2	6	54276	54281	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_012654	TAAT	2	8	54284	54291	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_012654	A	7	7	54296	54302	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1624	NC_012654	TA	3	6	54318	54323	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1625	NC_012654	AT	3	6	54356	54361	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_012654	TA	4	8	54363	54370	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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