MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium botulinum Ba4 str. 657 plasmid pCLJ

Total Repeats: 8415

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012654	AGA	2	6	15901	15906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587280
502	NC_012654	GGA	2	6	15915	15920	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587280
503	NC_012654	TTA	2	6	15947	15952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587280
504	NC_012654	AGA	2	6	16058	16063	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587280
505	NC_012654	AAG	2	6	16099	16104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587280
506	NC_012654	AGA	2	6	16123	16128	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587280
507	NC_012654	AGC	2	6	16162	16167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587280
508	NC_012654	ACT	2	6	16199	16204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587280
509	NC_012654	TAG	2	6	16266	16271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587280
510	NC_012654	TAT	2	6	16294	16299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587280
511	NC_012654	AT	3	6	16348	16353	50 %	50 %	0 %	0 %	229587280
512	NC_012654	ACA	2	6	16363	16368	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587280
513	NC_012654	TAA	2	6	16396	16401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587280
514	NC_012654	GCA	2	6	16408	16413	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587280
515	NC_012654	ATTT	2	8	16484	16491	25 %	75 %	0 %	0 %	229587280
516	NC_012654	A	7	7	16509	16515	100 %	0 %	0 %	0 %	229587280
517	NC_012654	AGG	2	6	16559	16564	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
518	NC_012654	ACA	2	6	16582	16587	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587281
519	NC_012654	ATTAAA	2	12	16642	16653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587281
520	NC_012654	GAA	2	6	16717	16722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587281
521	NC_012654	CGG	2	6	16737	16742	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	229587281
522	NC_012654	AGG	2	6	16821	16826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587281
523	NC_012654	TAAAAA	2	12	16890	16901	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	229587281
524	NC_012654	AGA	2	6	16947	16952	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	229587281
525	NC_012654	TAT	2	6	16959	16964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
526	NC_012654	ATT	2	6	16966	16971	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
527	NC_012654	CAA	2	6	16973	16978	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587281
528	NC_012654	ATTTT	2	10	16995	17004	20 %	80 %	0 %	0 %	229587281
529	NC_012654	TTA	2	6	17023	17028	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
530	NC_012654	GAT	2	6	17038	17043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587281
531	NC_012654	TAT	2	6	17049	17054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
532	NC_012654	ATT	2	6	17057	17062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
533	NC_012654	ATTA	2	8	17070	17077	50 %	50 %	0 %	0 %	229587281
534	NC_012654	AGAA	2	8	17088	17095	75 %	0 %	25 %	0 %	229587281
535	NC_012654	AATTTA	2	12	17131	17142	50 %	50 %	0 %	0 %	229587281
536	NC_012654	TA	4	8	17141	17148	50 %	50 %	0 %	0 %	229587281
537	NC_012654	TAA	2	6	17151	17156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587281
538	NC_012654	AAATGG	2	12	17161	17172	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	229587281
539	NC_012654	TAT	2	6	17243	17248	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
540	NC_012654	A	6	6	17274	17279	100 %	0 %	0 %	0 %	229587281
541	NC_012654	ATT	2	6	17352	17357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
542	NC_012654	A	6	6	17358	17363	100 %	0 %	0 %	0 %	229587281
543	NC_012654	A	7	7	17385	17391	100 %	0 %	0 %	0 %	229587281
544	NC_012654	AGT	2	6	17421	17426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587281
545	NC_012654	AGG	2	6	17442	17447	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587281
546	NC_012654	TA	3	6	17458	17463	50 %	50 %	0 %	0 %	229587281
547	NC_012654	TTAAAA	2	12	17464	17475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587281
548	NC_012654	AATT	2	8	17487	17494	50 %	50 %	0 %	0 %	229587281
549	NC_012654	TTA	2	6	17557	17562	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587281
550	NC_012654	CTA	2	6	17585	17590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587281
551	NC_012654	TTC	2	6	17616	17621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587281
552	NC_012654	TAA	2	6	17715	17720	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587281
553	NC_012654	A	6	6	17732	17737	100 %	0 %	0 %	0 %	229587281
554	NC_012654	TAG	2	6	17855	17860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587281
555	NC_012654	AGG	2	6	18018	18023	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	229587281
556	NC_012654	ATTAT	2	10	18048	18057	40 %	60 %	0 %	0 %	229587281
557	NC_012654	AT	3	6	18089	18094	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
558	NC_012654	T	6	6	18191	18196	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
559	NC_012654	TCT	3	9	18198	18206	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012654	ATTA	2	8	18221	18228	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012654	AATT	2	8	18261	18268	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
562	NC_012654	T	6	6	18274	18279	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012654	ATA	2	6	18330	18335	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012654	ATT	2	6	18350	18355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_012654	ATA	2	6	18358	18363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
566	NC_012654	TAT	2	6	18431	18436	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012654	AT	3	6	18435	18440	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_012654	T	6	6	18452	18457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
569	NC_012654	T	6	6	18472	18477	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
570	NC_012654	CTT	2	6	18489	18494	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012654	T	7	7	18506	18512	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012654	ATTT	2	8	18513	18520	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_012654	TCTT	2	8	18523	18530	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
574	NC_012654	T	6	6	18529	18534	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
575	NC_012654	CCCAC	2	10	18551	18560	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
576	NC_012654	TAACT	2	10	18612	18621	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
577	NC_012654	TTA	2	6	18630	18635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012654	CTTTT	2	10	18810	18819	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
579	NC_012654	TCT	2	6	18820	18825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_012654	T	6	6	18903	18908	0 %	100 %	0 %	0 %	229587282
581	NC_012654	TCC	2	6	18939	18944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587282
582	NC_012654	TTC	2	6	18962	18967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587282
583	NC_012654	TCA	2	6	18970	18975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587282
584	NC_012654	ATA	2	6	19090	19095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
585	NC_012654	CTTT	2	8	19168	19175	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
586	NC_012654	ATA	2	6	19197	19202	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_012654	CTT	2	6	19253	19258	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012654	AAT	2	6	19283	19288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587283
589	NC_012654	CTA	2	6	19323	19328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587283
590	NC_012654	TGT	2	6	19433	19438	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587283
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592	NC_012654	TTA	2	6	19569	19574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587283
593	NC_012654	CTC	2	6	19584	19589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587283
594	NC_012654	TTA	2	6	19598	19603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587283
595	NC_012654	AGT	2	6	19644	19649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587283
596	NC_012654	TAT	3	9	19731	19739	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587283
597	NC_012654	TAA	2	6	19768	19773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587283
598	NC_012654	ATTT	2	8	19785	19792	25 %	75 %	0 %	0 %	229587283
599	NC_012654	A	6	6	19796	19801	100 %	0 %	0 %	0 %	229587283
600	NC_012654	AAT	2	6	19812	19817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587283
601	NC_012654	TTTC	2	8	19835	19842	0 %	75 %	0 %	25 %	229587283
602	NC_012654	CTT	2	6	19845	19850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587283
603	NC_012654	TAG	2	6	19872	19877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587283
604	NC_012654	TTA	2	6	19907	19912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587283
605	NC_012654	TTG	2	6	19971	19976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587283
606	NC_012654	CTT	2	6	19998	20003	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	229587283
607	NC_012654	ATT	2	6	20083	20088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587283
608	NC_012654	TAT	2	6	20106	20111	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587283
609	NC_012654	T	6	6	20156	20161	0 %	100 %	0 %	0 %	229587283
610	NC_012654	TCC	2	6	20224	20229	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_012654	T	6	6	20246	20251	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_012654	TA	3	6	20255	20260	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012654	ATA	2	6	20267	20272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_012654	TAT	2	6	20330	20335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012654	T	6	6	20348	20353	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_012654	T	7	7	20444	20450	0 %	100 %	0 %	0 %	229587284
617	NC_012654	TCA	2	6	20490	20495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587284
618	NC_012654	TG	3	6	20586	20591	0 %	50 %	50 %	0 %	229587284
619	NC_012654	TTCATA	2	12	20645	20656	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	229587284
620	NC_012654	GTA	2	6	20682	20687	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587284
621	NC_012654	GCA	2	6	20688	20693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	229587284
622	NC_012654	ATA	3	9	20696	20704	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	229587284
623	NC_012654	TCA	2	6	20709	20714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	229587284
624	NC_012654	T	8	8	20744	20751	0 %	100 %	0 %	0 %	229587284
625	NC_012654	GTG	2	6	20752	20757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	229587284
626	NC_012654	TAT	2	6	20758	20763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	229587284
627	NC_012654	ATG	2	6	20815	20820	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	229587284
628	NC_012654	CAA	2	6	20872	20877	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	229587284
629	NC_012654	T	8	8	20891	20898	0 %	100 %	0 %	0 %	229587284
630	NC_012654	TA	3	6	20905	20910	50 %	50 %	0 %	0 %	229587284
631	NC_012654	CCT	2	6	20922	20927	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	229587285
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633	NC_012654	TGT	2	6	21037	21042	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	229587285
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