MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Campylobacter lari RM2100 megaplasmid pCL2100

Total Repeats: 39

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012040	AAGCAA	2	12	614	625	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	222778488
2	NC_012040	TTTCTT	2	12	3412	3423	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222778489
3	NC_012040	ATTTTT	2	12	8768	8779	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	222778492
4	NC_012040	CAATAA	2	12	9121	9132	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_012040	TAAAAA	2	12	9404	9415	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	222778493
6	NC_012040	TCTTCA	2	12	9753	9764	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	222778493
7	NC_012040	TTTAAT	2	12	11250	11261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012040	CAAAAG	2	12	12361	12372	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	222778496
9	NC_012040	AGATAA	2	12	13403	13414	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222778496
10	NC_012040	AAATAC	2	12	14392	14403	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222778497
11	NC_012040	TATTCT	2	12	14605	14616	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222778497
12	NC_012040	AACAAA	2	12	15862	15873	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	222778498
13	NC_012040	AACAAA	2	12	17202	17213	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	222778500
14	NC_012040	AAAAAG	2	12	18826	18837	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222778502
15	NC_012040	ATCCAA	2	12	20301	20312	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	222778504
16	NC_012040	CTAGTG	2	12	21461	21472	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222778505
17	NC_012040	CAATTA	2	12	22375	22386	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	222778506
18	NC_012040	AGTGAT	2	12	24224	24235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222778508
19	NC_012040	ATTTAA	2	12	24360	24371	50 %	50 %	0 %	0 %	222778508
20	NC_012040	TGATTT	2	12	24673	24684	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222778508
21	NC_012040	TATGTT	2	12	25997	26008	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222778510
22	NC_012040	TAGAAA	2	12	26990	27001	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222778511
23	NC_012040	AGAAAA	2	12	27195	27206	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	222778511
24	NC_012040	GGAATT	2	12	27975	27986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222778512
25	NC_012040	CAAAAA	2	12	28668	28679	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	222778513
26	NC_012040	AAACAC	2	12	31002	31013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222778515
27	NC_012040	AGCAAA	2	12	31726	31737	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	222778515
28	NC_012040	GAAAAT	2	12	33304	33315	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	222778515
29	NC_012040	AAGTTA	2	12	33899	33910	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	222778515
30	NC_012040	TGTATT	2	12	35263	35274	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	222778516
31	NC_012040	ATAATT	2	12	36316	36327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_012040	TTGCTT	2	12	37308	37319	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	222778518
33	NC_012040	TTGTTT	2	12	40093	40104	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	222778521
34	NC_012040	TTTCAA	2	12	40690	40701	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	222778522
35	NC_012040	TTTTCT	2	12	41074	41085	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	222778523
36	NC_012040	TTTATC	2	12	41235	41246	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222778523
37	NC_012040	TCAAAA	2	12	41808	41819	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	222778524
38	NC_012040	ACTTTT	2	12	45054	45065	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	222778527
39	NC_012040	ATGGAA	2	12	45916	45927	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.