MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 plasmid pATHE01

Total Repeats: 89

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012036	TTC	2	6	323	328	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530713
2	NC_012036	CCT	2	6	379	384	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_012036	TCT	2	6	398	403	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012036	TTA	2	6	411	416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_012036	GGT	2	6	451	456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530714
6	NC_012036	TTG	2	6	539	544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530714
7	NC_012036	AGC	2	6	551	556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530714
8	NC_012036	CTT	2	6	626	631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
9	NC_012036	CAA	2	6	656	661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530715
10	NC_012036	TCT	2	6	730	735	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530715
11	NC_012036	CAC	2	6	817	822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
12	NC_012036	TGC	2	6	993	998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_012036	CTG	2	6	1059	1064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012036	GTT	2	6	1065	1070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012036	TGA	2	6	1121	1126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_012036	TAC	2	6	1139	1144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_012036	ACG	2	6	1169	1174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012036	TAT	2	6	1193	1198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012036	TTC	2	6	1288	1293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
20	NC_012036	TGC	2	6	1412	1417	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
21	NC_012036	CTT	2	6	1485	1490	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530716
22	NC_012036	TCG	2	6	1508	1513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530716
23	NC_012036	TGT	2	6	1579	1584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530716
24	NC_012036	TCT	2	6	2118	2123	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_012036	TCG	2	6	2165	2170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_012036	CTT	2	6	2329	2334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_012036	GTT	2	6	2375	2380	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_012036	ATT	2	6	2758	2763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012036	CCG	2	6	2865	2870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_012036	TGC	2	6	3164	3169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
31	NC_012036	CAA	2	6	3293	3298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
32	NC_012036	TTG	2	6	3324	3329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222530717
33	NC_012036	TCT	2	6	3394	3399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
34	NC_012036	TAC	2	6	3440	3445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
35	NC_012036	GTC	2	6	3489	3494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
36	NC_012036	TAT	2	6	3531	3536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530717
37	NC_012036	TCT	2	6	3540	3545	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
38	NC_012036	TCT	2	6	3733	3738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
39	NC_012036	CTT	2	6	3802	3807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530717
40	NC_012036	TGC	2	6	3876	3881	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
41	NC_012036	AAC	2	6	3882	3887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530717
42	NC_012036	TCA	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530717
43	NC_012036	CTG	2	6	4041	4046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530717
44	NC_012036	TCA	2	6	4171	4176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
45	NC_012036	ACC	2	6	4216	4221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530718
46	NC_012036	TCA	2	6	4282	4287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530718
47	NC_012036	AAG	2	6	4311	4316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
48	NC_012036	AGA	2	6	4629	4634	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222530718
49	NC_012036	CCT	2	6	4838	4843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012036	CAG	2	6	4970	4975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_012036	CTT	2	6	5063	5068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012036	ACC	2	6	5159	5164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_012036	GTC	2	6	5277	5282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012036	GCT	2	6	5378	5383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530719
55	NC_012036	TTA	2	6	5544	5549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_012036	TAC	2	6	5580	5585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_012036	CTG	2	6	5622	5627	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_012036	GCA	2	6	5917	5922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012036	GAC	2	6	5970	5975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012036	TGC	2	6	6036	6041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_012036	TTG	2	6	6042	6047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_012036	TAC	2	6	6166	6171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
63	NC_012036	CTT	2	6	6198	6203	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
64	NC_012036	CTG	2	6	6300	6305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
65	NC_012036	CTT	2	6	6650	6655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
66	NC_012036	TTC	2	6	6814	6819	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
67	NC_012036	TTC	2	6	6861	6866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
68	NC_012036	CTT	2	6	6946	6951	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
69	NC_012036	CTA	2	6	7095	7100	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
70	NC_012036	ACT	2	6	7103	7108	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
71	NC_012036	TGC	2	6	7214	7219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
72	NC_012036	TCT	2	6	7222	7227	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
73	NC_012036	CTG	2	6	7299	7304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
74	NC_012036	AGC	2	6	7451	7456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
75	NC_012036	CAA	2	6	7500	7505	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222530720
76	NC_012036	TCA	2	6	7613	7618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222530720
77	NC_012036	CTT	2	6	7659	7664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
78	NC_012036	ACC	2	6	7668	7673	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
79	NC_012036	ACC	2	6	7687	7692	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
80	NC_012036	TTA	2	6	7766	7771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222530720
81	NC_012036	TTC	2	6	7837	7842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222530720
82	NC_012036	CTG	2	6	7879	7884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
83	NC_012036	CAG	2	6	7978	7983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
84	NC_012036	TGC	2	6	8056	8061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
85	NC_012036	GGT	2	6	8064	8069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222530720
86	NC_012036	CCA	2	6	8082	8087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222530720
87	NC_012036	CAG	2	6	8090	8095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222530720
88	NC_012036	TCG	2	6	8156	8161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222530720
89	NC_012036	CCT	2	6	8282	8287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.