MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Caldicellulosiruptor bescii DSM 6725 chromosome

Total Repeats: 2645

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012034	GGAAA	2	10	714	723	60 %	0 %	40 %	0 %	222528058
2	NC_012034	AGGCG	2	10	1274	1283	20 %	0 %	60 %	20 %	222528058
3	NC_012034	CTTCT	2	10	2870	2879	0 %	60 %	0 %	40 %	222528061
4	NC_012034	TTTAG	2	10	3376	3385	20 %	60 %	20 %	0 %	222528061
5	NC_012034	CTTCT	2	10	3620	3629	0 %	60 %	0 %	40 %	222528061
6	NC_012034	GACAG	2	10	4669	4678	40 %	0 %	40 %	20 %	222528063
7	NC_012034	TGCAG	2	10	4953	4962	20 %	20 %	40 %	20 %	222528063
8	NC_012034	AAGGC	2	10	7273	7282	40 %	0 %	40 %	20 %	222528065
9	NC_012034	AAAAG	2	10	7890	7899	80 %	0 %	20 %	0 %	222528065
10	NC_012034	TGTGT	2	10	8470	8479	0 %	60 %	40 %	0 %	222528065
11	NC_012034	AATTG	2	10	9113	9122	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
12	NC_012034	TGTCA	2	10	9255	9264	20 %	40 %	20 %	20 %	222528066
13	NC_012034	AAATT	2	10	9602	9611	60 %	40 %	0 %	0 %	222528066
14	NC_012034	AAAAG	2	10	9675	9684	80 %	0 %	20 %	0 %	222528066
15	NC_012034	GTATT	2	10	9783	9792	20 %	60 %	20 %	0 %	222528066
16	NC_012034	CAAAT	2	10	9810	9819	60 %	20 %	0 %	20 %	222528066
17	NC_012034	GTTTT	2	10	10931	10940	0 %	80 %	20 %	0 %	222528066
18	NC_012034	ATTCA	2	10	11562	11571	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
19	NC_012034	TGGTT	2	10	13027	13036	0 %	60 %	40 %	0 %	222528069
20	NC_012034	AGACA	2	10	13048	13057	60 %	0 %	20 %	20 %	222528069
21	NC_012034	ATTAC	2	10	16167	16176	40 %	40 %	0 %	20 %	222528069
22	NC_012034	AGATT	2	10	18411	18420	40 %	40 %	20 %	0 %	222528069
23	NC_012034	TAATT	2	10	18691	18700	40 %	60 %	0 %	0 %	222528069
24	NC_012034	GTAAT	2	10	19062	19071	40 %	40 %	20 %	0 %	222528069
25	NC_012034	TAAAT	2	10	19642	19651	60 %	40 %	0 %	0 %	222528069
26	NC_012034	GTAAT	2	10	20382	20391	40 %	40 %	20 %	0 %	222528069
27	NC_012034	GATAT	2	10	21014	21023	40 %	40 %	20 %	0 %	222528069
28	NC_012034	AGTTT	2	10	21799	21808	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
29	NC_012034	GGAGC	2	10	22309	22318	20 %	0 %	60 %	20 %	222528070
30	NC_012034	ATTGG	2	10	23247	23256	20 %	40 %	40 %	0 %	222528071
31	NC_012034	AAGAG	2	10	23745	23754	60 %	0 %	40 %	0 %	222528071
32	NC_012034	ATAGA	2	10	23925	23934	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
33	NC_012034	ATCTT	2	10	24133	24142	20 %	60 %	0 %	20 %	222528072
34	NC_012034	ATATT	2	10	24256	24265	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_012034	AGTTT	2	10	24279	24288	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
36	NC_012034	CATTT	2	10	26134	26143	20 %	60 %	0 %	20 %	222528074
37	NC_012034	GTTAT	2	10	26611	26620	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
38	NC_012034	AAGAA	2	10	29042	29051	80 %	0 %	20 %	0 %	222528075
39	NC_012034	AGAAA	2	10	29135	29144	80 %	0 %	20 %	0 %	222528075
40	NC_012034	AAATT	2	10	29514	29523	60 %	40 %	0 %	0 %	222528075
41	NC_012034	ATAAA	2	10	29815	29824	80 %	20 %	0 %	0 %	222528075
42	NC_012034	TTAAA	2	10	30449	30458	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_012034	TGTCA	2	10	33074	33083	20 %	40 %	20 %	20 %	222528077
44	NC_012034	CCTAT	2	10	33450	33459	20 %	40 %	0 %	40 %	222528077
45	NC_012034	GATTA	2	10	34992	35001	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_012034	TGATT	2	10	35466	35475	20 %	60 %	20 %	0 %	222528079
47	NC_012034	ATTTA	2	10	35523	35532	40 %	60 %	0 %	0 %	222528079
48	NC_012034	AAAAT	2	10	35576	35585	80 %	20 %	0 %	0 %	222528079
49	NC_012034	ATATT	2	10	37870	37879	40 %	60 %	0 %	0 %	222528083
50	NC_012034	TAAAA	2	10	39118	39127	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012034	CTTTC	2	10	39990	39999	0 %	60 %	0 %	40 %	222528084
52	NC_012034	TGTTT	2	10	41252	41261	0 %	80 %	20 %	0 %	222528085
53	NC_012034	ACATT	2	10	41938	41947	40 %	40 %	0 %	20 %	222528085
54	NC_012034	AAATC	2	10	42139	42148	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_012034	ACAAT	2	10	42757	42766	60 %	20 %	0 %	20 %	222528086
56	NC_012034	CAAGC	2	10	42843	42852	40 %	0 %	20 %	40 %	222528086
57	NC_012034	AGATA	2	10	44121	44130	60 %	20 %	20 %	0 %	222528088
58	NC_012034	AAAAT	2	10	47694	47703	80 %	20 %	0 %	0 %	222528089
59	NC_012034	AAGGT	2	10	49017	49026	40 %	20 %	40 %	0 %	222528091
60	NC_012034	ATTAC	2	10	50889	50898	40 %	40 %	0 %	20 %	222528091
61	NC_012034	CTTTG	2	10	51512	51521	0 %	60 %	20 %	20 %	222528092
62	NC_012034	GCAAA	2	10	53765	53774	60 %	0 %	20 %	20 %	222528094
63	NC_012034	CAAAA	2	10	57338	57347	80 %	0 %	0 %	20 %	222528097
64	NC_012034	TTTTA	2	10	58255	58264	20 %	80 %	0 %	0 %	222528098
65	NC_012034	GAAAA	2	10	60306	60315	80 %	0 %	20 %	0 %	222528098
66	NC_012034	AAAGA	2	10	60392	60401	80 %	0 %	20 %	0 %	222528098
67	NC_012034	TGTAT	2	10	60695	60704	20 %	60 %	20 %	0 %	222528098
68	NC_012034	CATTA	2	10	62913	62922	40 %	40 %	0 %	20 %	222528100
69	NC_012034	GAAAA	2	10	63139	63148	80 %	0 %	20 %	0 %	222528100
70	NC_012034	AACAG	2	10	64567	64576	60 %	0 %	20 %	20 %	222528101
71	NC_012034	TAAAA	2	10	67476	67485	80 %	20 %	0 %	0 %	222528103
72	NC_012034	AAAAT	2	10	68980	68989	80 %	20 %	0 %	0 %	222528104
73	NC_012034	TTAAA	2	10	71856	71865	60 %	40 %	0 %	0 %	222528107
74	NC_012034	CTGAA	2	10	72174	72183	40 %	20 %	20 %	20 %	222528107
75	NC_012034	GATAC	2	10	74573	74582	40 %	20 %	20 %	20 %	222528110
76	NC_012034	AAATT	2	10	74728	74737	60 %	40 %	0 %	0 %	222528110
77	NC_012034	AGATA	2	10	75009	75018	60 %	20 %	20 %	0 %	222528110
78	NC_012034	AAGAG	2	10	75034	75043	60 %	0 %	40 %	0 %	222528110
79	NC_012034	TTTAT	2	10	75055	75064	20 %	80 %	0 %	0 %	222528110
80	NC_012034	GAAAA	2	10	76252	76261	80 %	0 %	20 %	0 %	222528111
81	NC_012034	TTTAT	2	10	78134	78143	20 %	80 %	0 %	0 %	222528112
82	NC_012034	ACAGT	2	10	78494	78503	40 %	20 %	20 %	20 %	222528113
83	NC_012034	AATAA	2	10	82027	82036	80 %	20 %	0 %	0 %	222528116
84	NC_012034	AAACA	2	10	82234	82243	80 %	0 %	0 %	20 %	222528117
85	NC_012034	AATGC	2	10	82357	82366	40 %	20 %	20 %	20 %	222528117
86	NC_012034	ATTTA	2	10	83187	83196	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012034	GGAAG	2	10	83321	83330	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_012034	TTTTC	2	10	83585	83594	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
89	NC_012034	TTGTT	2	10	84830	84839	0 %	80 %	20 %	0 %	222528120
90	NC_012034	TTCAA	2	10	85951	85960	40 %	40 %	0 %	20 %	222528121
91	NC_012034	ACAAA	2	10	86120	86129	80 %	0 %	0 %	20 %	222528121
92	NC_012034	GAAGA	2	10	87256	87265	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012034	TTGTT	2	10	87438	87447	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012034	AGTAG	2	10	87821	87830	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012034	TAGAA	2	10	88310	88319	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
96	NC_012034	GAAGG	2	10	91924	91933	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012034	ACAGG	2	10	93235	93244	40 %	0 %	40 %	20 %	222528127
98	NC_012034	ATTAC	2	10	94532	94541	40 %	40 %	0 %	20 %	222528128
99	NC_012034	AGTAG	2	10	95299	95308	40 %	20 %	40 %	0 %	222528128
100	NC_012034	GAATG	2	10	96936	96945	40 %	20 %	40 %	0 %	222528128
101	NC_012034	TATGG	2	10	97297	97306	20 %	40 %	40 %	0 %	222528128
102	NC_012034	GAAAA	2	10	99778	99787	80 %	0 %	20 %	0 %	222528129
103	NC_012034	AAAAC	2	10	99843	99852	80 %	0 %	0 %	20 %	222528129
104	NC_012034	CAGAA	2	10	99914	99923	60 %	0 %	20 %	20 %	222528129
105	NC_012034	TTTTG	2	10	100919	100928	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
106	NC_012034	AATTA	2	10	101556	101565	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012034	AAGAG	2	10	102144	102153	60 %	0 %	40 %	0 %	222528131
108	NC_012034	TATTT	2	10	102830	102839	20 %	80 %	0 %	0 %	222528132
109	NC_012034	TAGCA	2	10	103274	103283	40 %	20 %	20 %	20 %	222528132
110	NC_012034	GGTAT	2	10	103311	103320	20 %	40 %	40 %	0 %	222528132
111	NC_012034	CAAGG	2	10	103886	103895	40 %	0 %	40 %	20 %	222528132
112	NC_012034	TTAAC	2	10	104183	104192	40 %	40 %	0 %	20 %	222528133
113	NC_012034	TGAAA	2	10	107920	107929	60 %	20 %	20 %	0 %	222528137
114	NC_012034	ATTAC	2	10	109102	109111	40 %	40 %	0 %	20 %	222528138
115	NC_012034	TAAAA	2	10	109587	109596	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_012034	GAAGG	2	10	109963	109972	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012034	TATTG	2	10	110196	110205	20 %	60 %	20 %	0 %	222528139
118	NC_012034	ATTCA	2	10	112272	112281	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
119	NC_012034	CCTTC	2	10	113786	113795	0 %	40 %	0 %	60 %	222528143
120	NC_012034	TCTTT	2	10	113839	113848	0 %	80 %	0 %	20 %	222528143
121	NC_012034	ATCCT	2	10	114375	114384	20 %	40 %	0 %	40 %	222528143
122	NC_012034	AGAGG	2	10	116788	116797	40 %	0 %	60 %	0 %	222528146
123	NC_012034	GATAT	2	10	117464	117473	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_012034	ATTTT	2	10	118045	118054	20 %	80 %	0 %	0 %	222528147
125	NC_012034	ATTAG	2	10	118878	118887	40 %	40 %	20 %	0 %	222528147
126	NC_012034	ATAAA	2	10	119147	119156	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_012034	TAGCT	2	10	120718	120727	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_012034	GGATT	2	10	121451	121460	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
129	NC_012034	TGCAT	2	10	122512	122521	20 %	40 %	20 %	20 %	222528149
130	NC_012034	ACTGC	2	10	123365	123374	20 %	20 %	20 %	40 %	222528150
131	NC_012034	GTATA	2	10	126496	126505	40 %	40 %	20 %	0 %	222528152
132	NC_012034	TCTTT	2	10	126953	126962	0 %	80 %	0 %	20 %	222528153
133	NC_012034	TTATA	2	10	127703	127712	40 %	60 %	0 %	0 %	222528153
134	NC_012034	CAATG	2	10	127722	127731	40 %	20 %	20 %	20 %	222528153
135	NC_012034	AATTT	2	10	129136	129145	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_012034	CAGAA	2	10	130071	130080	60 %	0 %	20 %	20 %	222528155
137	NC_012034	TGGTA	2	10	130848	130857	20 %	40 %	40 %	0 %	222528156
138	NC_012034	GCATT	2	10	131177	131186	20 %	40 %	20 %	20 %	222528156
139	NC_012034	ATTTA	2	10	131910	131919	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_012034	TTTGC	2	10	132017	132026	0 %	60 %	20 %	20 %	222528157
141	NC_012034	TTTTA	2	10	132617	132626	20 %	80 %	0 %	0 %	222528158
142	NC_012034	TAAAA	2	10	133574	133583	80 %	20 %	0 %	0 %	222528158
143	NC_012034	AAGTT	2	10	134187	134196	40 %	40 %	20 %	0 %	222528159
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152	NC_012034	ATTTT	2	10	142882	142891	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_012034	TGAGA	2	10	142979	142988	40 %	20 %	40 %	0 %	222528170
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157	NC_012034	TGAAG	2	10	146807	146816	40 %	20 %	40 %	0 %	222528173
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160	NC_012034	AAGAA	2	10	151385	151394	80 %	0 %	20 %	0 %	222528177
161	NC_012034	TGTTC	2	10	152814	152823	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
162	NC_012034	ATGGT	2	10	159286	159295	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
163	NC_012034	TTGTT	2	10	159347	159356	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
164	NC_012034	ATGTT	2	10	159950	159959	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_012034	AGGTT	2	10	161964	161973	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
167	NC_012034	ATAAA	2	10	162116	162125	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_012034	TGATA	2	10	162169	162178	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
169	NC_012034	TTTCA	2	10	163660	163669	20 %	60 %	0 %	20 %	222528179
170	NC_012034	TTTCA	2	10	164279	164288	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
171	NC_012034	TTTCA	2	10	164346	164355	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
172	NC_012034	AAAGG	2	10	165714	165723	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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174	NC_012034	ATTTT	2	10	167167	167176	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_012034	ATTTT	2	10	168129	168138	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
176	NC_012034	AGAAT	2	10	168706	168715	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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183	NC_012034	ATAAA	2	10	173376	173385	80 %	20 %	0 %	0 %	222528183
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195	NC_012034	TTTTG	2	10	189129	189138	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
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211	NC_012034	TACAA	2	10	209745	209754	60 %	20 %	0 %	20 %	222528213
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245	NC_012034	GAAGG	2	10	256794	256803	40 %	0 %	60 %	0 %	222528250
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249	NC_012034	CAGGG	2	10	263395	263404	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
250	NC_012034	AAAAG	2	10	264431	264440	80 %	0 %	20 %	0 %	222528259
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252	NC_012034	GATGA	2	10	266221	266230	40 %	20 %	40 %	0 %	222528260
253	NC_012034	TTTTA	2	10	266461	266470	20 %	80 %	0 %	0 %	222528260
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256	NC_012034	ATTTT	2	10	268960	268969	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_012034	TTATA	2	10	269920	269929	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
258	NC_012034	TTTGG	2	10	270176	270185	0 %	60 %	40 %	0 %	222528265
259	NC_012034	GCAAA	2	10	271539	271548	60 %	0 %	20 %	20 %	222528265
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262	NC_012034	AAGAA	2	10	273773	273782	80 %	0 %	20 %	0 %	222528268
263	NC_012034	TGTGG	2	10	274178	274187	0 %	40 %	60 %	0 %	222528268
264	NC_012034	TAGAG	2	10	275127	275136	40 %	20 %	40 %	0 %	222528268
265	NC_012034	TGTTT	2	10	275749	275758	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
266	NC_012034	CTAAT	2	10	276153	276162	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
267	NC_012034	AGACA	2	10	276860	276869	60 %	0 %	20 %	20 %	222528269
268	NC_012034	TCAAA	2	10	281621	281630	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_012034	GGGAT	2	10	281964	281973	20 %	20 %	60 %	0 %	222528274
270	NC_012034	ATATT	2	10	283545	283554	40 %	60 %	0 %	0 %	222528274
271	NC_012034	TAAAA	2	10	284948	284957	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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