MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 13553

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012032	TCAT	2	8	244	251	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_012032	GAAG	2	8	440	447	50 %	0 %	50 %	0 %	222523303
3	NC_012032	GCCT	2	8	774	781	0 %	25 %	25 %	50 %	222523303
4	NC_012032	TTCA	2	8	1087	1094	25 %	50 %	0 %	25 %	222523303
5	NC_012032	GAGC	2	8	1469	1476	25 %	0 %	50 %	25 %	222523303
6	NC_012032	TCGC	2	8	1514	1521	0 %	25 %	25 %	50 %	222523303
7	NC_012032	AACG	2	8	1749	1756	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
8	NC_012032	CTGT	2	8	1788	1795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_012032	TGCG	2	8	2282	2289	0 %	25 %	50 %	25 %	222523304
10	NC_012032	GGCC	2	8	2825	2832	0 %	0 %	50 %	50 %	222523304
11	NC_012032	TGGC	2	8	3076	3083	0 %	25 %	50 %	25 %	222523304
12	NC_012032	CCAA	2	8	3137	3144	50 %	0 %	0 %	50 %	222523304
13	NC_012032	GGCA	2	8	3821	3828	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_012032	GCCA	2	8	4194	4201	25 %	0 %	25 %	50 %	222523305
15	NC_012032	AAAG	2	8	4445	4452	75 %	0 %	25 %	0 %	222523305
16	NC_012032	ACCA	2	8	4719	4726	50 %	0 %	0 %	50 %	222523305
17	NC_012032	GTAC	2	8	4909	4916	25 %	25 %	25 %	25 %	222523305
18	NC_012032	TGTT	2	8	6011	6018	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_012032	GGTA	2	8	6172	6179	25 %	25 %	50 %	0 %	222523306
20	NC_012032	CAGG	2	8	6429	6436	25 %	0 %	50 %	25 %	222523306
21	NC_012032	CCCA	2	8	6512	6519	25 %	0 %	0 %	75 %	222523306
22	NC_012032	GTCC	2	8	7465	7472	0 %	25 %	25 %	50 %	222523306
23	NC_012032	GATC	2	8	7474	7481	25 %	25 %	25 %	25 %	222523306
24	NC_012032	CGCC	2	8	7601	7608	0 %	0 %	25 %	75 %	222523306
25	NC_012032	GCGT	2	8	8428	8435	0 %	25 %	50 %	25 %	222523307
26	NC_012032	GCGG	2	8	8560	8567	0 %	0 %	75 %	25 %	222523307
27	NC_012032	GATA	2	8	9296	9303	50 %	25 %	25 %	0 %	222523308
28	NC_012032	CCAG	2	8	9364	9371	25 %	0 %	25 %	50 %	222523308
29	NC_012032	CAAC	2	8	9912	9919	50 %	0 %	0 %	50 %	222523308
30	NC_012032	CAAT	2	8	10187	10194	50 %	25 %	0 %	25 %	222523308
31	NC_012032	CGAA	2	8	10384	10391	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_012032	AGCC	2	8	11158	11165	25 %	0 %	25 %	50 %	222523310
33	NC_012032	ATCA	2	8	11183	11190	50 %	25 %	0 %	25 %	222523310
34	NC_012032	GATC	2	8	11227	11234	25 %	25 %	25 %	25 %	222523310
35	NC_012032	TGCC	2	8	11321	11328	0 %	25 %	25 %	50 %	222523310
36	NC_012032	CATC	2	8	11568	11575	25 %	25 %	0 %	50 %	222523311
37	NC_012032	AACC	2	8	11932	11939	50 %	0 %	0 %	50 %	222523311
38	NC_012032	GATC	2	8	12061	12068	25 %	25 %	25 %	25 %	222523311
39	NC_012032	GGGC	2	8	12544	12551	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_012032	GCGG	2	8	12972	12979	0 %	0 %	75 %	25 %	222523313
41	NC_012032	GGTT	2	8	13134	13141	0 %	50 %	50 %	0 %	222523313
42	NC_012032	AATG	2	8	13864	13871	50 %	25 %	25 %	0 %	222523313
43	NC_012032	TGGT	2	8	14506	14513	0 %	50 %	50 %	0 %	222523314
44	NC_012032	CTGG	2	8	14699	14706	0 %	25 %	50 %	25 %	222523314
45	NC_012032	CGGA	2	8	14803	14810	25 %	0 %	50 %	25 %	222523314
46	NC_012032	TGGC	2	8	14823	14830	0 %	25 %	50 %	25 %	222523314
47	NC_012032	GATC	2	8	15311	15318	25 %	25 %	25 %	25 %	222523315
48	NC_012032	CAGT	2	8	16133	16140	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_012032	CAGA	2	8	16415	16422	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
50	NC_012032	ACTG	2	8	16544	16551	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_012032	TGGC	2	8	17838	17845	0 %	25 %	50 %	25 %	222523318
52	NC_012032	ACCC	2	8	18698	18705	25 %	0 %	0 %	75 %	222523319
53	NC_012032	GACA	2	8	19162	19169	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
54	NC_012032	GAGC	2	8	19894	19901	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
55	NC_012032	CATC	2	8	19940	19947	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
56	NC_012032	CCAC	2	8	20046	20053	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_012032	CTCA	2	8	20067	20074	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_012032	GTTT	2	8	20191	20198	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
59	NC_012032	ATTT	2	8	20349	20356	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_012032	CAAC	2	8	20442	20449	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_012032	CCGA	2	8	21117	21124	25 %	0 %	25 %	50 %	222523321
62	NC_012032	CAGG	2	8	21489	21496	25 %	0 %	50 %	25 %	222523321
63	NC_012032	ACAG	2	8	21810	21817	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_012032	GCGT	2	8	22098	22105	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_012032	GGTG	2	8	22611	22618	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_012032	AGCC	2	8	23167	23174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_012032	CGCT	2	8	23358	23365	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_012032	ACGA	2	8	23765	23772	50 %	0 %	25 %	25 %	222523322
69	NC_012032	CGGT	2	8	24788	24795	0 %	25 %	50 %	25 %	222523323
70	NC_012032	ACAG	2	8	24945	24952	50 %	0 %	25 %	25 %	222523323
71	NC_012032	TCAG	2	8	25097	25104	25 %	25 %	25 %	25 %	222523323
72	NC_012032	TGAG	2	8	25163	25170	25 %	25 %	50 %	0 %	222523323
73	NC_012032	GTGC	2	8	25678	25685	0 %	25 %	50 %	25 %	222523323
74	NC_012032	CATC	2	8	26242	26249	25 %	25 %	0 %	50 %	222523324
75	NC_012032	GAGC	2	8	26320	26327	25 %	0 %	50 %	25 %	222523324
76	NC_012032	CAAC	2	8	26680	26687	50 %	0 %	0 %	50 %	222523325
77	NC_012032	CAGG	2	8	26770	26777	25 %	0 %	50 %	25 %	222523325
78	NC_012032	TGAT	2	8	26978	26985	25 %	50 %	25 %	0 %	222523325
79	NC_012032	ACCG	2	8	27062	27069	25 %	0 %	25 %	50 %	222523325
80	NC_012032	CACG	2	8	27388	27395	25 %	0 %	25 %	50 %	222523325
81	NC_012032	TGCA	2	8	27445	27452	25 %	25 %	25 %	25 %	222523325
82	NC_012032	ATGC	2	8	27726	27733	25 %	25 %	25 %	25 %	222523326
83	NC_012032	GGCC	2	8	28953	28960	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
84	NC_012032	GATC	2	8	29511	29518	25 %	25 %	25 %	25 %	222523327
85	NC_012032	CAAT	2	8	29547	29554	50 %	25 %	0 %	25 %	222523327
86	NC_012032	GAGC	2	8	29694	29701	25 %	0 %	50 %	25 %	222523327
87	NC_012032	ACCA	2	8	29794	29801	50 %	0 %	0 %	50 %	222523327
88	NC_012032	CTGG	2	8	30078	30085	0 %	25 %	50 %	25 %	222523327
89	NC_012032	CAGC	2	8	30368	30375	25 %	0 %	25 %	50 %	222523327
90	NC_012032	CGAC	2	8	30600	30607	25 %	0 %	25 %	50 %	222523327
91	NC_012032	TGGT	2	8	30935	30942	0 %	50 %	50 %	0 %	222523327
92	NC_012032	GAAG	2	8	31254	31261	50 %	0 %	50 %	0 %	222523327
93	NC_012032	GCTC	2	8	32473	32480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_012032	GGCC	2	8	32750	32757	0 %	0 %	50 %	50 %	222523329
95	NC_012032	GGCA	2	8	33326	33333	25 %	0 %	50 %	25 %	222523330
96	NC_012032	ACCG	2	8	34040	34047	25 %	0 %	25 %	50 %	222523331
97	NC_012032	AATC	2	8	34171	34178	50 %	25 %	0 %	25 %	222523331
98	NC_012032	GCCT	2	8	34497	34504	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_012032	AGCC	2	8	35059	35066	25 %	0 %	25 %	50 %	222523332
100	NC_012032	TGCG	2	8	35795	35802	0 %	25 %	50 %	25 %	222523332
101	NC_012032	AGAA	2	8	36046	36053	75 %	0 %	25 %	0 %	222523332
102	NC_012032	CCAT	2	8	36953	36960	25 %	25 %	0 %	50 %	222523334
103	NC_012032	AACG	2	8	37531	37538	50 %	0 %	25 %	25 %	222523334
104	NC_012032	CAAT	2	8	38049	38056	50 %	25 %	0 %	25 %	222523335
105	NC_012032	CCGA	2	8	38281	38288	25 %	0 %	25 %	50 %	222523335
106	NC_012032	AGGC	2	8	38457	38464	25 %	0 %	50 %	25 %	222523335
107	NC_012032	GCAG	2	8	38472	38479	25 %	0 %	50 %	25 %	222523335
108	NC_012032	GGAT	2	8	38635	38642	25 %	25 %	50 %	0 %	222523335
109	NC_012032	GACC	2	8	39575	39582	25 %	0 %	25 %	50 %	222523337
110	NC_012032	CATC	3	12	39790	39801	25 %	25 %	0 %	50 %	222523337
111	NC_012032	CTGG	2	8	40363	40370	0 %	25 %	50 %	25 %	222523337
112	NC_012032	ACCC	2	8	40430	40437	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_012032	TCCA	2	8	40473	40480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_012032	AACC	2	8	40746	40753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_012032	CGGC	2	8	40831	40838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
116	NC_012032	CTTA	2	8	42528	42535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_012032	TCGT	2	8	42784	42791	0 %	50 %	25 %	25 %	222523340
118	NC_012032	GCCA	2	8	43165	43172	25 %	0 %	25 %	50 %	222523340
119	NC_012032	CAGC	2	8	43423	43430	25 %	0 %	25 %	50 %	222523341
120	NC_012032	GCCA	2	8	43464	43471	25 %	0 %	25 %	50 %	222523341
121	NC_012032	CAAG	2	8	43680	43687	50 %	0 %	25 %	25 %	222523341
122	NC_012032	GAAC	2	8	43705	43712	50 %	0 %	25 %	25 %	222523341
123	NC_012032	TCGG	2	8	43909	43916	0 %	25 %	50 %	25 %	222523342
124	NC_012032	GATA	2	8	44039	44046	50 %	25 %	25 %	0 %	222523342
125	NC_012032	GCCG	2	8	44217	44224	0 %	0 %	50 %	50 %	222523342
126	NC_012032	CAAT	2	8	44396	44403	50 %	25 %	0 %	25 %	222523342
127	NC_012032	GCCA	2	8	44559	44566	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
128	NC_012032	CAGC	2	8	44617	44624	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
129	NC_012032	TCGT	2	8	44735	44742	0 %	50 %	25 %	25 %	222523343
130	NC_012032	CGCC	2	8	44781	44788	0 %	0 %	25 %	75 %	222523343
131	NC_012032	AAGC	2	8	44860	44867	50 %	0 %	25 %	25 %	222523343
132	NC_012032	CAGC	2	8	45152	45159	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
133	NC_012032	AAAT	2	8	45307	45314	75 %	25 %	0 %	0 %	222523343
134	NC_012032	CCAT	2	8	45477	45484	25 %	25 %	0 %	50 %	222523344
135	NC_012032	GCCG	2	8	45644	45651	0 %	0 %	50 %	50 %	222523344
136	NC_012032	ACTG	2	8	45911	45918	25 %	25 %	25 %	25 %	222523344
137	NC_012032	ACGA	2	8	46594	46601	50 %	0 %	25 %	25 %	222523344
138	NC_012032	TGCG	2	8	46906	46913	0 %	25 %	50 %	25 %	222523344
139	NC_012032	TTGA	2	8	47409	47416	25 %	50 %	25 %	0 %	222523344
140	NC_012032	GCGA	2	8	48159	48166	25 %	0 %	50 %	25 %	222523344
141	NC_012032	TTTG	2	8	48938	48945	0 %	75 %	25 %	0 %	222523344
142	NC_012032	TGAC	2	8	49090	49097	25 %	25 %	25 %	25 %	222523345
143	NC_012032	GGTG	2	8	49531	49538	0 %	25 %	75 %	0 %	222523346
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