MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 104917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_012032	GCA	2	6	171609	171614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523438
3502	NC_012032	CGTT	2	8	171725	171732	0 %	50 %	25 %	25 %	222523438
3503	NC_012032	GGT	2	6	171746	171751	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523438
3504	NC_012032	GCGT	2	8	171886	171893	0 %	25 %	50 %	25 %	222523438
3505	NC_012032	GCG	2	6	171896	171901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523438
3506	NC_012032	GGA	2	6	171914	171919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523438
3507	NC_012032	GAT	2	6	171920	171925	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523438
3508	NC_012032	CGGCAA	2	12	171953	171964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523438
3509	NC_012032	ACGTG	2	10	172082	172091	20 %	20 %	40 %	20 %	222523438
3510	NC_012032	GGTA	2	8	172120	172127	25 %	25 %	50 %	0 %	222523439
3511	NC_012032	TCA	2	6	172143	172148	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523439
3512	NC_012032	TCG	2	6	172443	172448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523439
3513	NC_012032	TCA	2	6	172455	172460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523439
3514	NC_012032	CAC	2	6	172475	172480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523439
3515	NC_012032	ACA	2	6	172626	172631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523439
3516	NC_012032	TCA	2	6	172741	172746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523439
3517	NC_012032	ATC	2	6	172819	172824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523439
3518	NC_012032	TTG	2	6	172830	172835	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523439
3519	NC_012032	ATT	2	6	172898	172903	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523440
3520	NC_012032	TCGC	2	8	172934	172941	0 %	25 %	25 %	50 %	222523440
3521	NC_012032	CAAC	2	8	172991	172998	50 %	0 %	0 %	50 %	222523440
3522	NC_012032	TGA	2	6	173052	173057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523440
3523	NC_012032	ACA	2	6	173116	173121	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523440
3524	NC_012032	GAT	2	6	173191	173196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523440
3525	NC_012032	A	6	6	173214	173219	100 %	0 %	0 %	0 %	222523440
3526	NC_012032	CAT	2	6	173228	173233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523440
3527	NC_012032	TGG	2	6	173285	173290	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523440
3528	NC_012032	TCT	2	6	173307	173312	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523440
3529	NC_012032	CA	3	6	173378	173383	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3530	NC_012032	AACG	2	8	173437	173444	50 %	0 %	25 %	25 %	222523441
3531	NC_012032	GCG	2	6	173474	173479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523441
3532	NC_012032	CTT	2	6	173521	173526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523441
3533	NC_012032	GCC	2	6	173537	173542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523441
3534	NC_012032	GTT	2	6	173554	173559	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523441
3535	NC_012032	CTG	2	6	173564	173569	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523441
3536	NC_012032	CGTG	2	8	173818	173825	0 %	25 %	50 %	25 %	222523441
3537	NC_012032	CACC	2	8	173855	173862	25 %	0 %	0 %	75 %	222523441
3538	NC_012032	TTG	2	6	173930	173935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523441
3539	NC_012032	GC	3	6	173941	173946	0 %	0 %	50 %	50 %	222523441
3540	NC_012032	TGG	2	6	173980	173985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523441
3541	NC_012032	TGC	2	6	174001	174006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523441
3542	NC_012032	GGC	2	6	174088	174093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523441
3543	NC_012032	TGCCC	2	10	174238	174247	0 %	20 %	20 %	60 %	222523441
3544	NC_012032	GCG	2	6	174249	174254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523441
3545	NC_012032	ATTCTG	2	12	174260	174271	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	222523441
3546	NC_012032	TTG	2	6	174389	174394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523441
3547	NC_012032	AAC	2	6	174541	174546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523442
3548	NC_012032	CGAG	2	8	174653	174660	25 %	0 %	50 %	25 %	222523442
3549	NC_012032	TGG	2	6	174687	174692	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523442
3550	NC_012032	ACT	2	6	174757	174762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523442
3551	NC_012032	ATC	2	6	174816	174821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523442
3552	NC_012032	TTTG	2	8	174908	174915	0 %	75 %	25 %	0 %	222523442
3553	NC_012032	GCC	2	6	174953	174958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523442
3554	NC_012032	AAG	2	6	174969	174974	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523442
3555	NC_012032	GCC	2	6	174989	174994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523442
3556	NC_012032	GGCTA	2	10	175003	175012	20 %	20 %	40 %	20 %	222523442
3557	NC_012032	GTG	2	6	175071	175076	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523442
3558	NC_012032	TGA	2	6	175243	175248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523442
3559	NC_012032	TGG	2	6	175303	175308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523442
3560	NC_012032	AACC	2	8	175342	175349	50 %	0 %	0 %	50 %	222523442
3561	NC_012032	TCG	2	6	175390	175395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523442
3562	NC_012032	ATT	2	6	175407	175412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523442
3563	NC_012032	GGC	2	6	175428	175433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523442
3564	NC_012032	AGG	2	6	175455	175460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3565	NC_012032	GAT	2	6	175464	175469	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523443
3566	NC_012032	AG	3	6	175473	175478	50 %	0 %	50 %	0 %	222523443
3567	NC_012032	CTG	2	6	175603	175608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523443
3568	NC_012032	CCG	2	6	175609	175614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523443
3569	NC_012032	CT	3	6	175768	175773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3570	NC_012032	CAGAG	2	10	175775	175784	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3571	NC_012032	GAG	3	9	175782	175790	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3572	NC_012032	GTA	2	6	175792	175797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523444
3573	NC_012032	ACA	2	6	175809	175814	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523444
3574	NC_012032	TCG	2	6	175852	175857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523444
3575	NC_012032	GTG	2	6	175858	175863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523444
3576	NC_012032	GGATT	2	10	175870	175879	20 %	40 %	40 %	0 %	222523444
3577	NC_012032	TGC	2	6	175906	175911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523444
3578	NC_012032	CGC	2	6	175923	175928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523444
3579	NC_012032	ACG	2	6	175934	175939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523444
3580	NC_012032	GAC	2	6	176013	176018	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523444
3581	NC_012032	GCC	2	6	176025	176030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523444
3582	NC_012032	CGTT	2	8	176082	176089	0 %	50 %	25 %	25 %	222523444
3583	NC_012032	AGA	2	6	176114	176119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523444
3584	NC_012032	GCG	2	6	176178	176183	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523444
3585	NC_012032	TGA	2	6	176189	176194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523444
3586	NC_012032	ACC	2	6	176207	176212	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523444
3587	NC_012032	ACC	2	6	176219	176224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523444
3588	NC_012032	AG	3	6	176369	176374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3589	NC_012032	GTC	2	6	176528	176533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523445
3590	NC_012032	ATC	2	6	176547	176552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523445
3591	NC_012032	GCG	2	6	176689	176694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523445
3592	NC_012032	TGC	2	6	176860	176865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523445
3593	NC_012032	ACA	2	6	176903	176908	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523445
3594	NC_012032	CGG	2	6	176917	176922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523445
3595	NC_012032	GGC	2	6	176956	176961	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523445
3596	NC_012032	GAT	2	6	176969	176974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523445
3597	NC_012032	GCC	2	6	176979	176984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523445
3598	NC_012032	CTG	2	6	177041	177046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523445
3599	NC_012032	GCAA	2	8	177065	177072	50 %	0 %	25 %	25 %	222523445
3600	NC_012032	CGC	2	6	177083	177088	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523445
3601	NC_012032	G	6	6	177198	177203	0 %	0 %	100 %	0 %	222523445
3602	NC_012032	AGGC	2	8	177234	177241	25 %	0 %	50 %	25 %	222523445
3603	NC_012032	ACCG	2	8	177248	177255	25 %	0 %	25 %	50 %	222523445
3604	NC_012032	GCCAC	2	10	177297	177306	20 %	0 %	20 %	60 %	222523445
3605	NC_012032	GCA	2	6	177329	177334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523445
3606	NC_012032	CCA	2	6	177362	177367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523445
3607	NC_012032	GGT	2	6	177472	177477	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523445
3608	NC_012032	ATG	2	6	177492	177497	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523445
3609	NC_012032	GA	3	6	177605	177610	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3610	NC_012032	TGA	2	6	177690	177695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523446
3611	NC_012032	TGA	2	6	177744	177749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523446
3612	NC_012032	AGCA	2	8	177758	177765	50 %	0 %	25 %	25 %	222523446
3613	NC_012032	TGT	2	6	177961	177966	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523446
3614	NC_012032	CGCAG	2	10	178051	178060	20 %	0 %	40 %	40 %	222523446
3615	NC_012032	CTA	2	6	178160	178165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3616	NC_012032	CCG	2	6	178170	178175	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3617	NC_012032	CTC	2	6	178212	178217	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3618	NC_012032	ACCAGC	2	12	178281	178292	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	222523447
3619	NC_012032	TATT	2	8	178321	178328	25 %	75 %	0 %	0 %	222523447
3620	NC_012032	CTG	2	6	178341	178346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523447
3621	NC_012032	TGGT	2	8	178377	178384	0 %	50 %	50 %	0 %	222523447
3622	NC_012032	AGCGCA	2	12	178450	178461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523447
3623	NC_012032	CGC	2	6	178487	178492	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523447
3624	NC_012032	GTT	2	6	178587	178592	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3625	NC_012032	TCG	2	6	178627	178632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523448
3626	NC_012032	CGTT	2	8	178647	178654	0 %	50 %	25 %	25 %	222523448
3627	NC_012032	CGC	2	6	178715	178720	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523448
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3642	NC_012032	CAG	2	6	179770	179775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3644	NC_012032	GTG	2	6	179856	179861	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3645	NC_012032	GTG	2	6	179869	179874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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3652	NC_012032	GCT	2	6	180080	180085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3654	NC_012032	G	6	6	180134	180139	0 %	0 %	100 %	0 %	222523449
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3662	NC_012032	AC	3	6	180706	180711	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3663	NC_012032	CAG	2	6	180892	180897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3665	NC_012032	CGTGA	2	10	180987	180996	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
3666	NC_012032	TGC	2	6	181055	181060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3670	NC_012032	CCGT	2	8	181226	181233	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
3671	NC_012032	AC	3	6	181274	181279	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3672	NC_012032	CAT	2	6	181333	181338	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523450
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3720	NC_012032	ATA	2	6	183800	183805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3721	NC_012032	CTG	2	6	183862	183867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3733	NC_012032	GC	3	6	184235	184240	0 %	0 %	50 %	50 %	222523453
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3738	NC_012032	TG	3	6	184418	184423	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3739	NC_012032	GTG	2	6	184432	184437	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3740	NC_012032	ACCGG	2	10	184501	184510	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
3741	NC_012032	CAG	2	6	184556	184561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3742	NC_012032	CGC	2	6	184614	184619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3744	NC_012032	TGC	2	6	184730	184735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3745	NC_012032	GAC	2	6	184768	184773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3746	NC_012032	CGA	2	6	184796	184801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3748	NC_012032	TCT	2	6	184893	184898	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3749	NC_012032	GCT	2	6	184970	184975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3751	NC_012032	ATC	2	6	185082	185087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523454
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3772	NC_012032	T	6	6	186523	186528	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3773	NC_012032	TG	3	6	186565	186570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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3875	NC_012032	GGT	2	6	191485	191490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523458
3876	NC_012032	CAA	2	6	191551	191556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3877	NC_012032	ATT	2	6	191619	191624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523459
3878	NC_012032	TCG	2	6	191883	191888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523459
3879	NC_012032	CAG	2	6	191955	191960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523459
3880	NC_012032	CCA	2	6	192044	192049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523459
3881	NC_012032	GAT	2	6	192075	192080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523459
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3884	NC_012032	GCCGCA	3	18	192362	192379	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	222523459
3885	NC_012032	CGC	2	6	192404	192409	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523459
3886	NC_012032	TGAACA	2	12	192715	192726	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3887	NC_012032	ACGC	2	8	192865	192872	25 %	0 %	25 %	50 %	222523460
3888	NC_012032	AGC	2	6	192905	192910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523460
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3892	NC_012032	GCAG	2	8	193104	193111	25 %	0 %	50 %	25 %	222523460
3893	NC_012032	GCG	2	6	193254	193259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523460
3894	NC_012032	TC	3	6	193289	193294	0 %	50 %	0 %	50 %	222523460
3895	NC_012032	ATCA	3	12	193342	193353	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3896	NC_012032	TGG	2	6	193582	193587	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523461
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3902	NC_012032	T	7	7	193888	193894	0 %	100 %	0 %	0 %	222523461
3903	NC_012032	TGA	2	6	193900	193905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523461
3904	NC_012032	TAC	2	6	193922	193927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523461
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3906	NC_012032	GCG	2	6	194016	194021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523462
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3908	NC_012032	GAA	2	6	194055	194060	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523462
3909	NC_012032	GCTG	2	8	194135	194142	0 %	25 %	50 %	25 %	222523462
3910	NC_012032	GTG	2	6	194146	194151	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523462
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3914	NC_012032	CTG	2	6	194370	194375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523462
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3923	NC_012032	GAT	2	6	194944	194949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523463
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3961	NC_012032	TGGTG	2	10	196935	196944	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
3962	NC_012032	CGAA	2	8	196961	196968	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3963	NC_012032	AGA	2	6	197016	197021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3964	NC_012032	GTAT	2	8	197074	197081	25 %	50 %	25 %	0 %	222523466
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3976	NC_012032	CG	3	6	197783	197788	0 %	0 %	50 %	50 %	222523467
3977	NC_012032	CTA	2	6	197809	197814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523467
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3980	NC_012032	CTG	2	6	197920	197925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523467
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3982	NC_012032	CTG	2	6	198401	198406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523467
3983	NC_012032	TC	3	6	198544	198549	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3984	NC_012032	A	7	7	198626	198632	100 %	0 %	0 %	0 %	222523468
3985	NC_012032	CT	4	8	198639	198646	0 %	50 %	0 %	50 %	222523468
3986	NC_012032	CAC	2	6	198650	198655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523468
3987	NC_012032	CAG	2	6	198698	198703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523468
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3989	NC_012032	GCCC	2	8	198732	198739	0 %	0 %	25 %	75 %	222523468
3990	NC_012032	CCG	2	6	198757	198762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523468
3991	NC_012032	ACT	2	6	198780	198785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523468
3992	NC_012032	ACC	2	6	198804	198809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523468
3993	NC_012032	TAC	2	6	198812	198817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523468
3994	NC_012032	CTGAC	2	10	198850	198859	20 %	20 %	20 %	40 %	222523468
3995	NC_012032	GGAA	2	8	198893	198900	50 %	0 %	50 %	0 %	222523468
3996	NC_012032	AGG	2	6	198919	198924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523468
3997	NC_012032	GCA	2	6	198947	198952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523468
3998	NC_012032	ATC	2	6	198954	198959	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523468
3999	NC_012032	AGA	2	6	199064	199069	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523468
4000	NC_012032	GAA	2	6	199350	199355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523468

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