MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 104917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_012032	GATC	2	8	74670	74677	25 %	25 %	25 %	25 %	222523366
1502	NC_012032	CAA	2	6	74690	74695	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523366
1503	NC_012032	TTG	2	6	74699	74704	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523366
1504	NC_012032	ACCG	2	8	74719	74726	25 %	0 %	25 %	50 %	222523366
1505	NC_012032	GTG	2	6	74756	74761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523366
1506	NC_012032	CTA	2	6	74901	74906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523366
1507	NC_012032	GAC	2	6	74968	74973	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523366
1508	NC_012032	CTC	2	6	74982	74987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523366
1509	NC_012032	CCA	2	6	75161	75166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523366
1510	NC_012032	ACGC	2	8	75216	75223	25 %	0 %	25 %	50 %	222523366
1511	NC_012032	GT	3	6	75233	75238	0 %	50 %	50 %	0 %	222523366
1512	NC_012032	GC	3	6	75240	75245	0 %	0 %	50 %	50 %	222523366
1513	NC_012032	AGT	2	6	75276	75281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523366
1514	NC_012032	CTG	2	6	75319	75324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523366
1515	NC_012032	ACTGGC	2	12	75339	75350	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222523366
1516	NC_012032	GTG	2	6	75352	75357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523366
1517	NC_012032	CAA	2	6	75372	75377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523366
1518	NC_012032	CTG	2	6	75460	75465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523366
1519	NC_012032	CGG	2	6	75506	75511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523366
1520	NC_012032	GTATG	2	10	75565	75574	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_012032	CA	3	6	75591	75596	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1522	NC_012032	GAG	2	6	75599	75604	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1523	NC_012032	AGC	2	6	75627	75632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523367
1524	NC_012032	GC	3	6	75639	75644	0 %	0 %	50 %	50 %	222523367
1525	NC_012032	CCG	2	6	75669	75674	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523367
1526	NC_012032	GCC	2	6	75746	75751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523367
1527	NC_012032	CGTG	2	8	75885	75892	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1528	NC_012032	CAGTGG	2	12	75984	75995	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
1529	NC_012032	GCCC	2	8	76014	76021	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1530	NC_012032	CCG	2	6	76022	76027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_012032	CAACTA	2	12	76062	76073	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1532	NC_012032	AGC	2	6	76140	76145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1533	NC_012032	TAA	2	6	76221	76226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_012032	TCA	2	6	76239	76244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_012032	ATTG	2	8	76349	76356	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_012032	GCG	2	6	76394	76399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523368
1537	NC_012032	CCA	2	6	76407	76412	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523368
1538	NC_012032	ACC	2	6	76463	76468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523368
1539	NC_012032	CAG	2	6	76498	76503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523368
1540	NC_012032	CGA	2	6	76651	76656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523368
1541	NC_012032	AC	3	6	76676	76681	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1542	NC_012032	AC	3	6	76701	76706	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1543	NC_012032	TAC	2	6	76746	76751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1544	NC_012032	CCTGAG	2	12	76834	76845	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1545	NC_012032	GCA	2	6	76866	76871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1546	NC_012032	ACG	2	6	76873	76878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_012032	TTGA	2	8	76879	76886	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_012032	AC	3	6	76900	76905	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1549	NC_012032	CAACG	2	10	77016	77025	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1550	NC_012032	TAC	2	6	77089	77094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1551	NC_012032	GGC	2	6	77162	77167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523369
1552	NC_012032	GCC	2	6	77262	77267	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523369
1553	NC_012032	GC	3	6	77306	77311	0 %	0 %	50 %	50 %	222523369
1554	NC_012032	CTT	2	6	77361	77366	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523369
1555	NC_012032	GC	3	6	77378	77383	0 %	0 %	50 %	50 %	222523369
1556	NC_012032	CTG	2	6	77440	77445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523369
1557	NC_012032	CAG	2	6	77451	77456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523369
1558	NC_012032	TGCG	2	8	77495	77502	0 %	25 %	50 %	25 %	222523369
1559	NC_012032	CAT	2	6	77610	77615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523369
1560	NC_012032	GTT	2	6	77644	77649	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523369
1561	NC_012032	CCA	2	6	77656	77661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523369
1562	NC_012032	GGC	2	6	77676	77681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523369
1563	NC_012032	AGA	2	6	77800	77805	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523370
1564	NC_012032	ACG	2	6	77828	77833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523370
1565	NC_012032	TCT	2	6	77889	77894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523370
1566	NC_012032	CT	3	6	78039	78044	0 %	50 %	0 %	50 %	222523370
1567	NC_012032	AGGT	2	8	78050	78057	25 %	25 %	50 %	0 %	222523370
1568	NC_012032	AGC	2	6	78065	78070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523370
1569	NC_012032	CCCAG	2	10	78105	78114	20 %	0 %	20 %	60 %	222523370
1570	NC_012032	GAC	2	6	78250	78255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523370
1571	NC_012032	GCG	2	6	78263	78268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523370
1572	NC_012032	CCG	2	6	78401	78406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523370
1573	NC_012032	CCG	2	6	78491	78496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523371
1574	NC_012032	CCT	2	6	78515	78520	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523371
1575	NC_012032	GAGT	2	8	78555	78562	25 %	25 %	50 %	0 %	222523371
1576	NC_012032	CGAA	2	8	78563	78570	50 %	0 %	25 %	25 %	222523371
1577	NC_012032	TCA	2	6	78692	78697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523371
1578	NC_012032	CGC	2	6	78858	78863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523371
1579	NC_012032	CAA	2	6	78875	78880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523371
1580	NC_012032	CGA	2	6	78894	78899	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523371
1581	NC_012032	C	6	6	78963	78968	0 %	0 %	0 %	100 %	222523371
1582	NC_012032	CGCT	2	8	78973	78980	0 %	25 %	25 %	50 %	222523371
1583	NC_012032	ACC	2	6	79033	79038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523371
1584	NC_012032	CGG	2	6	79082	79087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523371
1585	NC_012032	GC	3	6	79094	79099	0 %	0 %	50 %	50 %	222523371
1586	NC_012032	GA	3	6	79246	79251	50 %	0 %	50 %	0 %	222523371
1587	NC_012032	CTGC	2	8	79259	79266	0 %	25 %	25 %	50 %	222523371
1588	NC_012032	CAC	2	6	79391	79396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523371
1589	NC_012032	GTT	2	6	79401	79406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523371
1590	NC_012032	AGC	2	6	79434	79439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523371
1591	NC_012032	ACT	2	6	79496	79501	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523372
1592	NC_012032	ATC	3	9	79518	79526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523372
1593	NC_012032	ACT	2	6	79533	79538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523372
1594	NC_012032	TCA	2	6	79585	79590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523372
1595	NC_012032	CCA	2	6	79619	79624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523372
1596	NC_012032	ATC	2	6	79636	79641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523372
1597	NC_012032	CATC	2	8	79658	79665	25 %	25 %	0 %	50 %	222523372
1598	NC_012032	CG	3	6	79715	79720	0 %	0 %	50 %	50 %	222523372
1599	NC_012032	TAA	2	6	79805	79810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523372
1600	NC_012032	GCA	2	6	79835	79840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523372
1601	NC_012032	ATA	2	6	80008	80013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523372
1602	NC_012032	GAT	2	6	80021	80026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523372
1603	NC_012032	CAG	2	6	80094	80099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523372
1604	NC_012032	GAAA	2	8	80119	80126	75 %	0 %	25 %	0 %	222523372
1605	NC_012032	ACGA	2	8	80181	80188	50 %	0 %	25 %	25 %	222523372
1606	NC_012032	GCC	2	6	80290	80295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523372
1607	NC_012032	TGA	2	6	80356	80361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523372
1608	NC_012032	AGG	2	6	80380	80385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523372
1609	NC_012032	CGCAG	2	10	80434	80443	20 %	0 %	40 %	40 %	222523372
1610	NC_012032	GAT	2	6	80513	80518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523372
1611	NC_012032	CCAGT	2	10	80523	80532	20 %	20 %	20 %	40 %	222523372
1612	NC_012032	CAACC	2	10	80604	80613	40 %	0 %	0 %	60 %	222523372
1613	NC_012032	GCT	2	6	80729	80734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523372
1614	NC_012032	TGC	2	6	80752	80757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523372
1615	NC_012032	GCA	2	6	80878	80883	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523372
1616	NC_012032	CGG	2	6	80952	80957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523372
1617	NC_012032	GCT	2	6	80969	80974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523372
1618	NC_012032	ACC	2	6	80976	80981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523372
1619	NC_012032	CACC	2	8	81047	81054	25 %	0 %	0 %	75 %	222523372
1620	NC_012032	GGCAAG	2	12	81069	81080	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	222523372
1621	NC_012032	TGT	2	6	81103	81108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523372
1622	NC_012032	AAAAG	2	10	81130	81139	80 %	0 %	20 %	0 %	222523372
1623	NC_012032	A	6	6	81147	81152	100 %	0 %	0 %	0 %	222523372
1624	NC_012032	T	6	6	81160	81165	0 %	100 %	0 %	0 %	222523372
1625	NC_012032	GGGT	2	8	81183	81190	0 %	25 %	75 %	0 %	222523372
1626	NC_012032	TACT	2	8	81328	81335	25 %	50 %	0 %	25 %	222523372
1627	NC_012032	CGT	2	6	81420	81425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523373
1628	NC_012032	TGA	3	9	81504	81512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523373
1629	NC_012032	GA	3	6	81539	81544	50 %	0 %	50 %	0 %	222523373
1630	NC_012032	TGCC	2	8	81592	81599	0 %	25 %	25 %	50 %	222523373
1631	NC_012032	ATG	2	6	81644	81649	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523373
1632	NC_012032	CAGT	2	8	81661	81668	25 %	25 %	25 %	25 %	222523373
1633	NC_012032	CTCG	2	8	81784	81791	0 %	25 %	25 %	50 %	222523373
1634	NC_012032	TGGG	2	8	81801	81808	0 %	25 %	75 %	0 %	222523373
1635	NC_012032	CTG	2	6	81893	81898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523373
1636	NC_012032	GCCA	2	8	81939	81946	25 %	0 %	25 %	50 %	222523373
1637	NC_012032	GC	3	6	81951	81956	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
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1639	NC_012032	GCA	2	6	81981	81986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523373
1640	NC_012032	CTGG	2	8	82116	82123	0 %	25 %	50 %	25 %	222523373
1641	NC_012032	AAC	2	6	82205	82210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523373
1642	NC_012032	AAT	2	6	82211	82216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523373
1643	NC_012032	CT	3	6	82278	82283	0 %	50 %	0 %	50 %	222523373
1644	NC_012032	GATCGG	2	12	82429	82440	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222523373
1645	NC_012032	GGC	2	6	82456	82461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523373
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1648	NC_012032	AAT	2	6	82565	82570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523373
1649	NC_012032	AGC	2	6	82583	82588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523373
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1651	NC_012032	GC	3	6	82766	82771	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
1652	NC_012032	GCA	2	6	82822	82827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523373
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1658	NC_012032	CTG	2	6	83003	83008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523373
1659	NC_012032	TTCAG	2	10	83010	83019	20 %	40 %	20 %	20 %	222523373
1660	NC_012032	CG	3	6	83029	83034	0 %	0 %	50 %	50 %	222523373
1661	NC_012032	CCG	2	6	83036	83041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523373
1662	NC_012032	TGA	2	6	83073	83078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523373
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1664	NC_012032	ACC	2	6	83147	83152	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523373
1665	NC_012032	GCC	2	6	83178	83183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523373
1666	NC_012032	ACC	2	6	83193	83198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523373
1667	NC_012032	CAA	2	6	83210	83215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523373
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1673	NC_012032	TCA	2	6	83346	83351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523373
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1682	NC_012032	GCC	2	6	83676	83681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523373
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1684	NC_012032	GCT	2	6	83752	83757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523373
1685	NC_012032	CGT	2	6	83804	83809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523374
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1687	NC_012032	GCCA	2	8	83842	83849	25 %	0 %	25 %	50 %	222523374
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1714	NC_012032	TCG	2	6	84936	84941	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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1716	NC_012032	TGAG	2	8	84996	85003	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1717	NC_012032	CA	3	6	85061	85066	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1718	NC_012032	TGCA	2	8	85165	85172	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1719	NC_012032	TGA	2	6	85179	85184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1746	NC_012032	AC	3	6	86619	86624	50 %	0 %	0 %	50 %	222523375
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1749	NC_012032	AC	3	6	86736	86741	50 %	0 %	0 %	50 %	222523376
1750	NC_012032	GCA	2	6	86838	86843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523376
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1752	NC_012032	TAC	2	6	87035	87040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523376
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1754	NC_012032	GCA	2	6	87105	87110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1755	NC_012032	TCT	2	6	87152	87157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523376
1756	NC_012032	GAT	2	6	87206	87211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523376
1757	NC_012032	TCAA	2	8	87262	87269	50 %	25 %	0 %	25 %	222523376
1758	NC_012032	GAC	2	6	87292	87297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1759	NC_012032	CTG	2	6	87315	87320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1760	NC_012032	ATT	2	6	87400	87405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523376
1761	NC_012032	GC	3	6	87552	87557	0 %	0 %	50 %	50 %	222523376
1762	NC_012032	GCG	2	6	87644	87649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523376
1763	NC_012032	CTG	2	6	87747	87752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523376
1764	NC_012032	CAGGC	2	10	87756	87765	20 %	0 %	40 %	40 %	222523376
1765	NC_012032	GGA	2	6	87824	87829	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523376
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1771	NC_012032	CGG	2	6	88119	88124	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523376
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1798	NC_012032	CCGC	2	8	89549	89556	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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1874	NC_012032	CCA	2	6	93263	93268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1876	NC_012032	CTG	2	6	93357	93362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1877	NC_012032	CAC	2	6	93448	93453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523380
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1997	NC_012032	GGT	2	6	100055	100060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523384
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1999	NC_012032	CAG	2	6	100124	100129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523384
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