MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 104917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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104002	NC_012032	ATC	2	6	5220872	5220877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527422
104003	NC_012032	AGGT	2	8	5220939	5220946	25 %	25 %	50 %	0 %	222527422
104004	NC_012032	TTG	2	6	5220951	5220956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527422
104005	NC_012032	CGA	2	6	5220961	5220966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527422
104006	NC_012032	TGC	2	6	5221012	5221017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527422
104007	NC_012032	GCA	2	6	5221044	5221049	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527422
104008	NC_012032	TTG	2	6	5221155	5221160	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527422
104009	NC_012032	GGT	2	6	5221188	5221193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527422
104010	NC_012032	CTGC	2	8	5221320	5221327	0 %	25 %	25 %	50 %	222527422
104011	NC_012032	CGG	2	6	5221429	5221434	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527422
104012	NC_012032	CGA	2	6	5221468	5221473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527422
104013	NC_012032	AC	3	6	5221492	5221497	50 %	0 %	0 %	50 %	222527422
104014	NC_012032	CAGC	2	8	5221708	5221715	25 %	0 %	25 %	50 %	222527422
104015	NC_012032	CTT	2	6	5221780	5221785	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222527422
104016	NC_012032	GGC	2	6	5221787	5221792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527422
104017	NC_012032	TCG	2	6	5221890	5221895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527422
104018	NC_012032	CTT	2	6	5221928	5221933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104019	NC_012032	TTG	2	6	5221989	5221994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104020	NC_012032	GCC	2	6	5222242	5222247	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527423
104021	NC_012032	CGTG	2	8	5222346	5222353	0 %	25 %	50 %	25 %	222527423
104022	NC_012032	GTG	2	6	5222360	5222365	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527423
104023	NC_012032	CTG	2	6	5222392	5222397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527423
104024	NC_012032	ACG	2	6	5222584	5222589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527423
104025	NC_012032	TGAA	2	8	5222600	5222607	50 %	25 %	25 %	0 %	222527423
104026	NC_012032	GCA	2	6	5222673	5222678	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527423
104027	NC_012032	CGT	3	9	5222706	5222714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527423
104028	NC_012032	CGC	2	6	5222719	5222724	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527423
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104030	NC_012032	CG	3	6	5222807	5222812	0 %	0 %	50 %	50 %	222527423
104031	NC_012032	CAT	2	6	5222856	5222861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527423
104032	NC_012032	TGA	2	6	5222900	5222905	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527423
104033	NC_012032	AAG	2	6	5222954	5222959	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222527423
104034	NC_012032	CATCC	2	10	5222971	5222980	20 %	20 %	0 %	60 %	222527423
104035	NC_012032	GGCC	2	8	5222989	5222996	0 %	0 %	50 %	50 %	222527423
104036	NC_012032	CGC	2	6	5223001	5223006	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527423
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104039	NC_012032	GGT	2	6	5223150	5223155	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527424
104040	NC_012032	ACG	2	6	5223208	5223213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527424
104041	NC_012032	ACG	2	6	5223239	5223244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527424
104042	NC_012032	AGA	2	6	5223306	5223311	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222527424
104043	NC_012032	ATG	2	6	5223332	5223337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527424
104044	NC_012032	GCT	2	6	5223356	5223361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527425
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104047	NC_012032	GCT	2	6	5223633	5223638	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527425
104048	NC_012032	GTCAAG	2	12	5223654	5223665	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222527425
104049	NC_012032	GCA	3	9	5223683	5223691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527425
104050	NC_012032	CTGC	2	8	5223736	5223743	0 %	25 %	25 %	50 %	222527425
104051	NC_012032	TGA	2	6	5223776	5223781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527425
104052	NC_012032	GTC	2	6	5223784	5223789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527425
104053	NC_012032	CGC	2	6	5223898	5223903	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527425
104054	NC_012032	CAG	2	6	5223912	5223917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527425
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104057	NC_012032	CT	3	6	5224021	5224026	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104058	NC_012032	CGC	3	9	5224298	5224306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527426
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104081	NC_012032	TCA	2	6	5225669	5225674	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527427
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104101	NC_012032	AT	3	6	5227079	5227084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104102	NC_012032	GAA	2	6	5227093	5227098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104103	NC_012032	AT	3	6	5227099	5227104	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104104	NC_012032	GGCACA	2	12	5227195	5227206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104105	NC_012032	A	6	6	5227268	5227273	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
104106	NC_012032	GTGC	2	8	5227349	5227356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104107	NC_012032	TGC	2	6	5227401	5227406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527429
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104113	NC_012032	CAG	2	6	5227578	5227583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527429
104114	NC_012032	TGCG	2	8	5227589	5227596	0 %	25 %	50 %	25 %	222527429
104115	NC_012032	CGG	2	6	5227658	5227663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527429
104116	NC_012032	TCA	2	6	5227677	5227682	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527429
104117	NC_012032	TGG	2	6	5227696	5227701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527429
104118	NC_012032	CGC	2	6	5227770	5227775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527429
104119	NC_012032	ATG	2	6	5227949	5227954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527430
104120	NC_012032	CGT	2	6	5227964	5227969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527430
104121	NC_012032	CGC	2	6	5228035	5228040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527430
104122	NC_012032	TCT	2	6	5228061	5228066	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222527430
104123	NC_012032	GGT	3	9	5228125	5228133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527430
104124	NC_012032	CAG	2	6	5228140	5228145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527430
104125	NC_012032	TCG	2	6	5228188	5228193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527430
104126	NC_012032	GAT	2	6	5228264	5228269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527430
104127	NC_012032	CGA	2	6	5228304	5228309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527430
104128	NC_012032	ATT	2	6	5228327	5228332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222527430
104129	NC_012032	CTT	2	6	5228461	5228466	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222527430
104130	NC_012032	ATT	2	6	5228495	5228500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222527430
104131	NC_012032	GAC	2	6	5228551	5228556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104132	NC_012032	GCA	2	6	5228601	5228606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104133	NC_012032	GGA	2	6	5228610	5228615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104134	NC_012032	AC	4	8	5228632	5228639	50 %	0 %	0 %	50 %	222527431
104135	NC_012032	TGA	2	6	5228690	5228695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527431
104136	NC_012032	TCG	2	6	5228696	5228701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527431
104137	NC_012032	GAG	2	6	5228752	5228757	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222527431
104138	NC_012032	GCT	2	6	5228782	5228787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527431
104139	NC_012032	CCGG	2	8	5228821	5228828	0 %	0 %	50 %	50 %	222527431
104140	NC_012032	CGCTC	2	10	5228867	5228876	0 %	20 %	20 %	60 %	222527431
104141	NC_012032	GATC	2	8	5228883	5228890	25 %	25 %	25 %	25 %	222527431
104142	NC_012032	CAA	2	6	5228895	5228900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222527431
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104144	NC_012032	GTG	2	6	5228957	5228962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527431
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104146	NC_012032	TCAA	2	8	5229059	5229066	50 %	25 %	0 %	25 %	222527431
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104148	NC_012032	AAC	2	6	5229280	5229285	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222527431
104149	NC_012032	TGG	2	6	5229291	5229296	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527431
104150	NC_012032	GGCT	2	8	5229301	5229308	0 %	25 %	50 %	25 %	222527431
104151	NC_012032	GAG	2	6	5229326	5229331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222527431
104152	NC_012032	GTG	2	6	5229335	5229340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527431
104153	NC_012032	GGAGCT	2	12	5229360	5229371	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	222527431
104154	NC_012032	GGCC	2	8	5229425	5229432	0 %	0 %	50 %	50 %	222527431
104155	NC_012032	CGG	2	6	5229532	5229537	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527431
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104159	NC_012032	GCCC	2	8	5229938	5229945	0 %	0 %	25 %	75 %	222527431
104160	NC_012032	CG	3	6	5230004	5230009	0 %	0 %	50 %	50 %	222527431
104161	NC_012032	CAAA	2	8	5230056	5230063	75 %	0 %	0 %	25 %	222527431
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104165	NC_012032	TGG	2	6	5230416	5230421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527431
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104169	NC_012032	GAT	2	6	5230728	5230733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527431
104170	NC_012032	TGG	2	6	5230830	5230835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527431
104171	NC_012032	GAG	2	6	5230945	5230950	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222527431
104172	NC_012032	TACC	2	8	5230962	5230969	25 %	25 %	0 %	50 %	222527431
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104174	NC_012032	CTGCGC	2	12	5231134	5231145	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222527431
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104176	NC_012032	TAGG	3	12	5231173	5231184	25 %	25 %	50 %	0 %	222527431
104177	NC_012032	GAG	2	6	5231281	5231286	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104178	NC_012032	TGA	2	6	5231292	5231297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527432
104179	NC_012032	GCT	2	6	5231329	5231334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104180	NC_012032	TTC	2	6	5231339	5231344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222527432
104181	NC_012032	TGC	2	6	5231353	5231358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104182	NC_012032	TGC	2	6	5231370	5231375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104183	NC_012032	ACC	2	6	5231377	5231382	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527432
104184	NC_012032	ATC	2	6	5231426	5231431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527432
104185	NC_012032	GTC	2	6	5231477	5231482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104186	NC_012032	CAA	2	6	5231502	5231507	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222527432
104187	NC_012032	CAA	2	6	5231560	5231565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222527432
104188	NC_012032	TACTGC	2	12	5231572	5231583	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	222527432
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104190	NC_012032	TTG	2	6	5231709	5231714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527432
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104196	NC_012032	AGCG	2	8	5231964	5231971	25 %	0 %	50 %	25 %	222527432
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104199	NC_012032	GATT	2	8	5232130	5232137	25 %	50 %	25 %	0 %	222527432
104200	NC_012032	GGC	2	6	5232152	5232157	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527432
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104202	NC_012032	TCCA	2	8	5232243	5232250	25 %	25 %	0 %	50 %	222527432
104203	NC_012032	CTG	2	6	5232255	5232260	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104204	NC_012032	CGC	2	6	5232325	5232330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527432
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104206	NC_012032	GGT	2	6	5232350	5232355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527432
104207	NC_012032	CAA	2	6	5232453	5232458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222527432
104208	NC_012032	GCG	2	6	5232501	5232506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527432
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104213	NC_012032	GCC	2	6	5232781	5232786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527432
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104215	NC_012032	GCA	2	6	5232812	5232817	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104216	NC_012032	ATGT	2	8	5232821	5232828	25 %	50 %	25 %	0 %	222527432
104217	NC_012032	AATC	2	8	5232842	5232849	50 %	25 %	0 %	25 %	222527432
104218	NC_012032	CCAA	2	8	5232857	5232864	50 %	0 %	0 %	50 %	222527432
104219	NC_012032	TTG	2	6	5232873	5232878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527432
104220	NC_012032	GTGG	2	8	5232884	5232891	0 %	25 %	75 %	0 %	222527432
104221	NC_012032	ACC	2	6	5232902	5232907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527432
104222	NC_012032	C	7	7	5233016	5233022	0 %	0 %	0 %	100 %	222527432
104223	NC_012032	GTG	2	6	5233064	5233069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527432
104224	NC_012032	CCA	2	6	5233113	5233118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527432
104225	NC_012032	ACC	2	6	5233154	5233159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527432
104226	NC_012032	TGT	2	6	5233192	5233197	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527432
104227	NC_012032	TTCA	2	8	5233262	5233269	25 %	50 %	0 %	25 %	222527432
104228	NC_012032	CTG	2	6	5233301	5233306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104229	NC_012032	GCT	2	6	5233457	5233462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104230	NC_012032	CGG	2	6	5233465	5233470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527432
104231	NC_012032	TGG	2	6	5233471	5233476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527432
104232	NC_012032	AAG	2	6	5233611	5233616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222527432
104233	NC_012032	CCGTT	2	10	5233641	5233650	0 %	40 %	20 %	40 %	222527432
104234	NC_012032	ACG	2	6	5233722	5233727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527432
104235	NC_012032	TTG	3	9	5233734	5233742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527432
104236	NC_012032	AAC	2	6	5233784	5233789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222527432
104237	NC_012032	CCG	2	6	5233808	5233813	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527432
104238	NC_012032	TAT	2	6	5233819	5233824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222527432
104239	NC_012032	CAC	2	6	5233845	5233850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527432
104240	NC_012032	GAT	2	6	5233957	5233962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104241	NC_012032	GAA	2	6	5234004	5234009	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104242	NC_012032	CACT	2	8	5234150	5234157	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104243	NC_012032	ATA	2	6	5234179	5234184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104244	NC_012032	ATC	2	6	5234209	5234214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527433
104245	NC_012032	CT	3	6	5234246	5234251	0 %	50 %	0 %	50 %	222527433
104246	NC_012032	GCT	2	6	5234283	5234288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527433
104247	NC_012032	GGGT	2	8	5234357	5234364	0 %	25 %	75 %	0 %	222527433
104248	NC_012032	ATG	2	6	5234377	5234382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527433
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104250	NC_012032	CA	3	6	5234482	5234487	50 %	0 %	0 %	50 %	222527433
104251	NC_012032	TC	3	6	5234553	5234558	0 %	50 %	0 %	50 %	222527433
104252	NC_012032	TGA	2	6	5234595	5234600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222527433
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104256	NC_012032	ACC	2	6	5234686	5234691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527433
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104259	NC_012032	ATC	3	9	5234780	5234788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104260	NC_012032	TAT	2	6	5234800	5234805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222527434
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104291	NC_012032	ATAA	2	8	5236717	5236724	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
104292	NC_012032	CCT	2	6	5236740	5236745	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222527436
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104316	NC_012032	GTAC	2	8	5238173	5238180	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
104317	NC_012032	ATC	2	6	5238325	5238330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104318	NC_012032	CAA	2	6	5238356	5238361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104319	NC_012032	GGC	2	6	5238525	5238530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527437
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104331	NC_012032	TGC	2	6	5238935	5238940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527437
104332	NC_012032	AACC	2	8	5238944	5238951	50 %	0 %	0 %	50 %	222527437
104333	NC_012032	ATC	2	6	5238952	5238957	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527437
104334	NC_012032	GCTC	2	8	5238971	5238978	0 %	25 %	25 %	50 %	222527437
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104336	NC_012032	TTG	2	6	5239139	5239144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222527437
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104338	NC_012032	CTTG	2	8	5239206	5239213	0 %	50 %	25 %	25 %	222527437
104339	NC_012032	CGC	2	6	5239272	5239277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527437
104340	NC_012032	GCG	2	6	5239279	5239284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527437
104341	NC_012032	GCTG	2	8	5239316	5239323	0 %	25 %	50 %	25 %	222527437
104342	NC_012032	ACC	2	6	5239324	5239329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222527437
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104344	NC_012032	TCG	2	6	5239496	5239501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527437
104345	NC_012032	GC	3	6	5239512	5239517	0 %	0 %	50 %	50 %	222527437
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104461	NC_012032	AGCC	2	8	5245303	5245310	25 %	0 %	25 %	50 %	222527440
104462	NC_012032	C	6	6	5245400	5245405	0 %	0 %	0 %	100 %	222527440
104463	NC_012032	GGTACC	2	12	5245495	5245506	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222527440
104464	NC_012032	CGACC	2	10	5245580	5245589	20 %	0 %	20 %	60 %	222527440
104465	NC_012032	CGC	2	6	5245614	5245619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527440
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104468	NC_012032	CGC	2	6	5245782	5245787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222527440
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104488	NC_012032	GTG	2	6	5246665	5246670	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222527440
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104490	NC_012032	CGG	2	6	5246792	5246797	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222527440
104491	NC_012032	CAG	2	6	5246858	5246863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527440
104492	NC_012032	CTC	2	6	5246877	5246882	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222527440
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104494	NC_012032	GCT	2	6	5247013	5247018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222527440
104495	NC_012032	GC	3	6	5247152	5247157	0 %	0 %	50 %	50 %	222527440
104496	NC_012032	ATC	2	6	5247201	5247206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222527440
104497	NC_012032	GCA	2	6	5247209	5247214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222527440
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