MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 104917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012032	GAA	2	6	26830	26835	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523325
502	NC_012032	GCC	2	6	26842	26847	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523325
503	NC_012032	ATC	2	6	26903	26908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523325
504	NC_012032	CTG	2	6	26929	26934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523325
505	NC_012032	TGAT	2	8	26978	26985	25 %	50 %	25 %	0 %	222523325
506	NC_012032	ACCG	2	8	27062	27069	25 %	0 %	25 %	50 %	222523325
507	NC_012032	CGA	2	6	27075	27080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523325
508	NC_012032	CGC	2	6	27109	27114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523325
509	NC_012032	CGT	2	6	27201	27206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523325
510	NC_012032	GC	3	6	27268	27273	0 %	0 %	50 %	50 %	222523325
511	NC_012032	TACACC	2	12	27289	27300	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	222523325
512	NC_012032	ACC	2	6	27307	27312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523325
513	NC_012032	CAC	2	6	27363	27368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523325
514	NC_012032	CACG	2	8	27388	27395	25 %	0 %	25 %	50 %	222523325
515	NC_012032	TGCA	2	8	27445	27452	25 %	25 %	25 %	25 %	222523325
516	NC_012032	GC	3	6	27501	27506	0 %	0 %	50 %	50 %	222523325
517	NC_012032	CTT	2	6	27510	27515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523325
518	NC_012032	AGA	2	6	27585	27590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523325
519	NC_012032	CTA	2	6	27612	27617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523325
520	NC_012032	GAG	2	6	27626	27631	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523325
521	NC_012032	CTC	2	6	27651	27656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523326
522	NC_012032	TCG	2	6	27682	27687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523326
523	NC_012032	ATGC	2	8	27726	27733	25 %	25 %	25 %	25 %	222523326
524	NC_012032	TTC	2	6	27783	27788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523326
525	NC_012032	TGG	2	6	27889	27894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523326
526	NC_012032	TCGGT	2	10	27976	27985	0 %	40 %	40 %	20 %	222523326
527	NC_012032	GTG	2	6	28123	28128	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523326
528	NC_012032	ACCTC	2	10	28210	28219	20 %	20 %	0 %	60 %	222523326
529	NC_012032	CGC	2	6	28275	28280	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523326
530	NC_012032	CTA	2	6	28337	28342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523326
531	NC_012032	GCA	2	6	28392	28397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523326
532	NC_012032	ACTCGG	2	12	28451	28462	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	222523326
533	NC_012032	TGC	2	6	28514	28519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523326
534	NC_012032	TG	3	6	28536	28541	0 %	50 %	50 %	0 %	222523326
535	NC_012032	CAT	2	6	28571	28576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523326
536	NC_012032	CGG	2	6	28681	28686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523326
537	NC_012032	TCG	2	6	28690	28695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523326
538	NC_012032	TGC	2	6	28697	28702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523326
539	NC_012032	GGC	2	6	28921	28926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
540	NC_012032	CTC	2	6	28933	28938	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523327
541	NC_012032	GGCC	2	8	28953	28960	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
542	NC_012032	TCG	2	6	28997	29002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523327
543	NC_012032	TGCAA	2	10	29033	29042	40 %	20 %	20 %	20 %	222523327
544	NC_012032	GC	3	6	29177	29182	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
545	NC_012032	CG	3	6	29267	29272	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
546	NC_012032	GGC	2	6	29275	29280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
547	NC_012032	GC	4	8	29367	29374	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
548	NC_012032	GCC	2	6	29437	29442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
549	NC_012032	TCG	2	6	29465	29470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523327
550	NC_012032	GATC	2	8	29511	29518	25 %	25 %	25 %	25 %	222523327
551	NC_012032	CAAT	2	8	29547	29554	50 %	25 %	0 %	25 %	222523327
552	NC_012032	GAA	2	6	29577	29582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523327
553	NC_012032	TTCGG	2	10	29623	29632	0 %	40 %	40 %	20 %	222523327
554	NC_012032	CAC	2	6	29649	29654	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523327
555	NC_012032	GAGC	2	8	29694	29701	25 %	0 %	50 %	25 %	222523327
556	NC_012032	GGC	2	6	29731	29736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
557	NC_012032	ACCA	2	8	29794	29801	50 %	0 %	0 %	50 %	222523327
558	NC_012032	CAC	2	6	29834	29839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523327
559	NC_012032	CGC	2	6	29952	29957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
560	NC_012032	GCAATG	2	12	29962	29973	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222523327
561	NC_012032	ATC	2	6	29983	29988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523327
562	NC_012032	CAG	2	6	29992	29997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523327
563	NC_012032	ACA	2	6	30002	30007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523327
564	NC_012032	CGC	2	6	30018	30023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
565	NC_012032	CAA	2	6	30027	30032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523327
566	NC_012032	GCC	2	6	30034	30039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
567	NC_012032	GCC	2	6	30043	30048	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
568	NC_012032	CTGG	2	8	30078	30085	0 %	25 %	50 %	25 %	222523327
569	NC_012032	TCC	2	6	30116	30121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523327
570	NC_012032	GATTG	2	10	30132	30141	20 %	40 %	40 %	0 %	222523327
571	NC_012032	GAA	2	6	30174	30179	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523327
572	NC_012032	GCC	2	6	30283	30288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
573	NC_012032	ACTGA	2	10	30316	30325	40 %	20 %	20 %	20 %	222523327
574	NC_012032	CAGC	2	8	30368	30375	25 %	0 %	25 %	50 %	222523327
575	NC_012032	GCG	2	6	30397	30402	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
576	NC_012032	CAT	2	6	30426	30431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523327
577	NC_012032	CG	3	6	30464	30469	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
578	NC_012032	AC	3	6	30501	30506	50 %	0 %	0 %	50 %	222523327
579	NC_012032	ACC	2	6	30566	30571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523327
580	NC_012032	GCG	2	6	30572	30577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
581	NC_012032	CGAC	2	8	30600	30607	25 %	0 %	25 %	50 %	222523327
582	NC_012032	CTG	2	6	30682	30687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523327
583	NC_012032	GC	3	6	30736	30741	0 %	0 %	50 %	50 %	222523327
584	NC_012032	CGG	2	6	30863	30868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
585	NC_012032	GAC	2	6	30873	30878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523327
586	NC_012032	GAA	2	6	30900	30905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523327
587	NC_012032	ATC	2	6	30916	30921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523327
588	NC_012032	TGGT	2	8	30935	30942	0 %	50 %	50 %	0 %	222523327
589	NC_012032	GGC	2	6	31230	31235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
590	NC_012032	GAAG	2	8	31254	31261	50 %	0 %	50 %	0 %	222523327
591	NC_012032	CCG	2	6	31311	31316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
592	NC_012032	CGC	2	6	31321	31326	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
593	NC_012032	GCC	2	6	31332	31337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
594	NC_012032	TGA	2	6	31347	31352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523327
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596	NC_012032	GTG	2	6	31421	31426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523327
597	NC_012032	AGA	2	6	31508	31513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523327
598	NC_012032	ACC	2	6	31519	31524	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523327
599	NC_012032	ATC	2	6	31544	31549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523327
600	NC_012032	TGA	2	6	31608	31613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523327
601	NC_012032	ATG	2	6	31651	31656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523327
602	NC_012032	ACT	2	6	31679	31684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523327
603	NC_012032	CTC	2	6	31687	31692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	222523327
604	NC_012032	GAT	2	6	31833	31838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523327
605	NC_012032	GCG	2	6	31913	31918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
606	NC_012032	CCG	2	6	31952	31957	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523327
607	NC_012032	TGC	2	6	31989	31994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523327
608	NC_012032	CGG	2	6	32043	32048	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523327
609	NC_012032	TCT	2	6	32057	32062	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523327
610	NC_012032	AC	3	6	32097	32102	50 %	0 %	0 %	50 %	222523327
611	NC_012032	AC	3	6	32160	32165	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
612	NC_012032	GT	3	6	32173	32178	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
613	NC_012032	CTA	2	6	32219	32224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012032	CAC	2	6	32232	32237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
615	NC_012032	GCT	2	6	32317	32322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523328
616	NC_012032	GTT	2	6	32329	32334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523328
617	NC_012032	CAA	2	6	32450	32455	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012032	GCTC	2	8	32473	32480	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
619	NC_012032	ACA	2	6	32487	32492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
620	NC_012032	CGTAC	2	10	32677	32686	20 %	20 %	20 %	40 %	222523329
621	NC_012032	AAC	2	6	32725	32730	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523329
622	NC_012032	GCA	3	9	32736	32744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523329
623	NC_012032	GGCC	2	8	32750	32757	0 %	0 %	50 %	50 %	222523329
624	NC_012032	GCA	2	6	32853	32858	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523329
625	NC_012032	AC	3	6	32882	32887	50 %	0 %	0 %	50 %	222523329
626	NC_012032	CAA	2	6	32920	32925	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523329
627	NC_012032	TGA	2	6	32926	32931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523329
628	NC_012032	CAC	2	6	32974	32979	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523329
629	NC_012032	AGG	2	6	32988	32993	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
630	NC_012032	TGA	2	6	33009	33014	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523330
631	NC_012032	TGCCCC	2	12	33048	33059	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	222523330
632	NC_012032	CTG	2	6	33154	33159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523330
633	NC_012032	GCGTAA	2	12	33230	33241	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	222523330
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641	NC_012032	TGC	2	6	33733	33738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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643	NC_012032	CAC	2	6	33809	33814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
644	NC_012032	AAC	2	6	33844	33849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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646	NC_012032	GGC	2	6	33889	33894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
647	NC_012032	CCT	2	6	33953	33958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
648	NC_012032	CAT	2	6	33959	33964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
649	NC_012032	AGA	2	6	33967	33972	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
650	NC_012032	GAG	2	6	33974	33979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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752	NC_012032	A	7	7	38822	38828	100 %	0 %	0 %	0 %	222523335
753	NC_012032	TAT	2	6	38875	38880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
754	NC_012032	TGC	2	6	38887	38892	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
755	NC_012032	GAG	2	6	38919	38924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
756	NC_012032	TCA	2	6	38965	38970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
757	NC_012032	CAA	2	6	39005	39010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
758	NC_012032	GAC	2	6	39076	39081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523336
759	NC_012032	CA	3	6	39127	39132	50 %	0 %	0 %	50 %	222523336
760	NC_012032	GCA	2	6	39199	39204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523336
761	NC_012032	ACG	2	6	39222	39227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523336
762	NC_012032	GGCAA	2	10	39248	39257	40 %	0 %	40 %	20 %	222523336
763	NC_012032	GAC	2	6	39312	39317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
764	NC_012032	AAG	2	6	39334	39339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
765	NC_012032	GAA	2	6	39349	39354	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
766	NC_012032	CAT	2	6	39416	39421	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
767	NC_012032	TGT	2	6	39425	39430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
768	NC_012032	TATTT	2	10	39481	39490	20 %	80 %	0 %	0 %	222523337
769	NC_012032	CAT	2	6	39501	39506	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523337
770	NC_012032	GCC	2	6	39536	39541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523337
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772	NC_012032	CCG	2	6	39595	39600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523337
773	NC_012032	ACC	3	9	39607	39615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523337
774	NC_012032	GCA	2	6	39626	39631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523337
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777	NC_012032	GCT	2	6	39802	39807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523337
778	NC_012032	GA	3	6	39855	39860	50 %	0 %	50 %	0 %	222523337
779	NC_012032	CCA	2	6	39941	39946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523337
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781	NC_012032	TAT	2	6	40204	40209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523337
782	NC_012032	GCG	2	6	40214	40219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523337
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785	NC_012032	ACA	2	6	40386	40391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523337
786	NC_012032	ACCC	2	8	40430	40437	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
787	NC_012032	TCCA	2	8	40473	40480	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
788	NC_012032	CAT	2	6	40647	40652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
789	NC_012032	TGGCCG	2	12	40672	40683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
790	NC_012032	CAA	2	6	40709	40714	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
791	NC_012032	AACC	2	8	40746	40753	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
792	NC_012032	GAT	2	6	40755	40760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
793	NC_012032	CGGC	2	8	40831	40838	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
794	NC_012032	GCA	2	6	40842	40847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
795	NC_012032	ATG	2	6	40881	40886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
796	NC_012032	CCG	2	6	41033	41038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
797	NC_012032	CTG	2	6	41171	41176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
798	NC_012032	TACAG	2	10	41209	41218	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
799	NC_012032	TTC	2	6	41260	41265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523338
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804	NC_012032	GA	4	8	41649	41656	50 %	0 %	50 %	0 %	222523338
805	NC_012032	GTA	2	6	41685	41690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523338
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816	NC_012032	CTG	2	6	42367	42372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
817	NC_012032	TGC	2	6	42390	42395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
818	NC_012032	CT	3	6	42414	42419	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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822	NC_012032	CTTA	2	8	42528	42535	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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871	NC_012032	GCCA	2	8	44559	44566	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
872	NC_012032	CAGC	2	8	44617	44624	25 %	0 %	25 %	50 %	222523343
873	NC_012032	CCA	2	6	44645	44650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523343
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878	NC_012032	TCGT	2	8	44735	44742	0 %	50 %	25 %	25 %	222523343
879	NC_012032	GCA	2	6	44763	44768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523343
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881	NC_012032	CGG	2	6	44804	44809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523343
882	NC_012032	ATC	2	6	44838	44843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523343
883	NC_012032	AAGC	2	8	44860	44867	50 %	0 %	25 %	25 %	222523343
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998	NC_012032	ATC	2	6	50911	50916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523347
999	NC_012032	GC	4	8	51052	51059	0 %	0 %	50 %	50 %	222523348
1000	NC_012032	GCC	2	6	51067	51072	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523348

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