MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Chloroflexus sp. Y-400-fl chromosome

Total Repeats: 104917

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_012032	CGC	2	6	325124	325129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6502	NC_012032	GCC	2	6	325134	325139	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6503	NC_012032	CGC	2	6	325172	325177	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6504	NC_012032	GCC	2	6	325182	325187	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6505	NC_012032	CGC	2	6	325220	325225	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6506	NC_012032	CGC	2	6	325268	325273	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6507	NC_012032	CGC	2	6	325364	325369	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6508	NC_012032	CGC	2	6	325460	325465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6509	NC_012032	GCC	2	6	325470	325475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6510	NC_012032	CGC	2	6	325508	325513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6511	NC_012032	GCC	2	6	325518	325523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6512	NC_012032	GGC	2	6	325553	325558	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6513	NC_012032	TCG	2	6	325569	325574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6514	NC_012032	GCCTCG	2	12	325584	325595	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6515	NC_012032	GCC	2	6	325635	325640	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523563
6516	NC_012032	CTT	2	6	325687	325692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523563
6517	NC_012032	GGC	2	6	325718	325723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6518	NC_012032	TCA	2	6	325734	325739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6519	NC_012032	GC	3	6	325785	325790	0 %	0 %	50 %	50 %	222523563
6520	NC_012032	GGC	2	6	325835	325840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6521	NC_012032	TCG	2	6	325854	325859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6522	NC_012032	GCA	2	6	325860	325865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6523	NC_012032	GCCTCG	2	12	325869	325880	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6524	NC_012032	GC	3	6	325905	325910	0 %	0 %	50 %	50 %	222523563
6525	NC_012032	CTT	2	6	325924	325929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523563
6526	NC_012032	GGC	2	6	325955	325960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6527	NC_012032	TCA	2	6	325971	325976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6528	NC_012032	GCCTCG	2	12	325986	325997	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6529	NC_012032	CTG	2	6	326029	326034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6530	NC_012032	GGC	3	9	326072	326080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6531	NC_012032	TCA	2	6	326091	326096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6532	NC_012032	GCCTCG	2	12	326106	326117	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6533	NC_012032	CTG	2	6	326149	326154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6534	NC_012032	GGC	3	9	326192	326200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6535	NC_012032	TCA	2	6	326211	326216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6536	NC_012032	GCCTCG	2	12	326226	326237	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6537	NC_012032	CTG	2	6	326269	326274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6538	NC_012032	GCA	2	6	326313	326318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6539	NC_012032	TCG	2	6	326328	326333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6540	NC_012032	GCA	2	6	326334	326339	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6541	NC_012032	GCCTCG	2	12	326343	326354	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6542	NC_012032	CTG	2	6	326386	326391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6543	NC_012032	GCA	2	6	326430	326435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6544	NC_012032	TCG	2	6	326445	326450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6545	NC_012032	GCCTCG	2	12	326460	326471	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6546	NC_012032	CTG	2	6	326503	326508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6547	NC_012032	GGCAGC	2	12	326546	326557	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	222523563
6548	NC_012032	TCA	2	6	326565	326570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6549	NC_012032	GCCTCG	2	12	326580	326591	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	222523563
6550	NC_012032	GC	3	6	326616	326621	0 %	0 %	50 %	50 %	222523563
6551	NC_012032	CTT	2	6	326635	326640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	222523563
6552	NC_012032	GGC	2	6	326666	326671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6553	NC_012032	AGC	2	6	326672	326677	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6554	NC_012032	TCA	2	6	326685	326690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6555	NC_012032	CAGA	2	8	326779	326786	50 %	0 %	25 %	25 %	222523563
6556	NC_012032	ACA	2	6	326808	326813	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	222523563
6557	NC_012032	AGA	2	6	326876	326881	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523563
6558	NC_012032	AGC	2	6	326892	326897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6559	NC_012032	TCA	2	6	326943	326948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6560	NC_012032	GAG	2	6	327015	327020	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	222523563
6561	NC_012032	GCA	2	6	327063	327068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6562	NC_012032	ATC	2	6	327083	327088	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6563	NC_012032	CTTC	2	8	327145	327152	0 %	50 %	0 %	50 %	222523563
6564	NC_012032	GTC	2	6	327168	327173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6565	NC_012032	ACTCA	2	10	327218	327227	40 %	20 %	0 %	40 %	222523563
6566	NC_012032	CTG	2	6	327286	327291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
6567	NC_012032	TCGG	2	8	327336	327343	0 %	25 %	50 %	25 %	222523563
6568	NC_012032	TCG	2	6	327370	327375	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523563
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6570	NC_012032	C	6	6	327420	327425	0 %	0 %	0 %	100 %	222523563
6571	NC_012032	CAGC	2	8	327434	327441	25 %	0 %	25 %	50 %	222523563
6572	NC_012032	CGG	2	6	327473	327478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6573	NC_012032	ACC	2	6	327491	327496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523563
6574	NC_012032	GCG	2	6	327507	327512	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6575	NC_012032	GCCA	2	8	327558	327565	25 %	0 %	25 %	50 %	222523563
6576	NC_012032	GGTTCA	2	12	327606	327617	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	222523563
6577	NC_012032	CAGG	2	8	327624	327631	25 %	0 %	50 %	25 %	222523563
6578	NC_012032	TCA	2	6	327702	327707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523563
6579	NC_012032	GCG	2	6	327708	327713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523563
6580	NC_012032	GGT	2	6	327753	327758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523563
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6582	NC_012032	AGC	2	6	327875	327880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523564
6583	NC_012032	CG	3	6	327885	327890	0 %	0 %	50 %	50 %	222523564
6584	NC_012032	ATT	2	6	327938	327943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	222523564
6585	NC_012032	TGG	2	6	327958	327963	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523564
6586	NC_012032	AAT	2	6	327970	327975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	222523564
6587	NC_012032	GC	3	6	328034	328039	0 %	0 %	50 %	50 %	222523564
6588	NC_012032	A	6	6	328057	328062	100 %	0 %	0 %	0 %	222523564
6589	NC_012032	AGC	2	6	328067	328072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523564
6590	NC_012032	GGC	2	6	328084	328089	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523564
6591	NC_012032	AGA	2	6	328182	328187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523564
6592	NC_012032	CAC	2	6	328201	328206	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523564
6593	NC_012032	ACG	2	6	328264	328269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523564
6594	NC_012032	AC	3	6	328284	328289	50 %	0 %	0 %	50 %	222523564
6595	NC_012032	TGC	2	6	328327	328332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523564
6596	NC_012032	TACT	2	8	328359	328366	25 %	50 %	0 %	25 %	222523564
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6598	NC_012032	AGTA	2	8	328574	328581	50 %	25 %	25 %	0 %	222523565
6599	NC_012032	CAG	2	6	328621	328626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523565
6600	NC_012032	GCG	2	6	328654	328659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523565
6601	NC_012032	ATC	2	6	328668	328673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523565
6602	NC_012032	GCC	2	6	328740	328745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523565
6603	NC_012032	CAG	2	6	328819	328824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523565
6604	NC_012032	ACC	2	6	328917	328922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523565
6605	NC_012032	GGC	2	6	328997	329002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523565
6606	NC_012032	GA	3	6	329088	329093	50 %	0 %	50 %	0 %	222523565
6607	NC_012032	GTC	2	6	329101	329106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523565
6608	NC_012032	GC	3	6	329120	329125	0 %	0 %	50 %	50 %	222523565
6609	NC_012032	AGAGC	2	10	329127	329136	40 %	0 %	40 %	20 %	222523565
6610	NC_012032	GCA	2	6	329137	329142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523565
6611	NC_012032	AG	3	6	329183	329188	50 %	0 %	50 %	0 %	222523565
6612	NC_012032	ATG	2	6	329198	329203	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523565
6613	NC_012032	CCAGA	2	10	329207	329216	40 %	0 %	20 %	40 %	222523565
6614	NC_012032	AAG	2	6	329244	329249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523565
6615	NC_012032	TTCC	3	12	329276	329287	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6616	NC_012032	CAA	2	6	329290	329295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6617	NC_012032	ATT	2	6	329360	329365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6618	NC_012032	GCA	2	6	329499	329504	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523566
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6620	NC_012032	GTT	2	6	329616	329621	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523567
6621	NC_012032	GATGA	2	10	329726	329735	40 %	20 %	40 %	0 %	222523567
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6654	NC_012032	GTG	2	6	331858	331863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523570
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6658	NC_012032	CTCGG	2	10	332158	332167	0 %	20 %	40 %	40 %	222523570
6659	NC_012032	GCG	2	6	332176	332181	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	222523570
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6742	NC_012032	CGGT	2	8	335883	335890	0 %	25 %	50 %	25 %	222523572
6743	NC_012032	CGT	2	6	335898	335903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523572
6744	NC_012032	TTG	2	6	335922	335927	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	222523572
6745	NC_012032	CGA	2	6	335955	335960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523572
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6762	NC_012032	GTT	2	6	336885	336890	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6852	NC_012032	GAT	2	6	342036	342041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6862	NC_012032	CCCCCA	2	12	342556	342567	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	222523577
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6986	NC_012032	CGCA	2	8	348781	348788	25 %	0 %	25 %	50 %	222523582
6987	NC_012032	CAC	2	6	348936	348941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	222523582
6988	NC_012032	AGC	2	6	348991	348996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523582
6989	NC_012032	CGA	2	6	349029	349034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	222523582
6990	NC_012032	CAT	2	6	349047	349052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	222523582
6991	NC_012032	GGT	2	6	349096	349101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523582
6992	NC_012032	CTG	2	6	349138	349143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	222523582
6993	NC_012032	GAA	2	6	349165	349170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523582
6994	NC_012032	GAAA	2	8	349198	349205	75 %	0 %	25 %	0 %	222523582
6995	NC_012032	GTG	2	6	349227	349232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	222523582
6996	NC_012032	CTGAA	2	10	349274	349283	40 %	20 %	20 %	20 %	222523582
6997	NC_012032	CCG	2	6	349290	349295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	222523582
6998	NC_012032	AGA	2	6	349296	349301	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	222523582
6999	NC_012032	GAT	2	6	349359	349364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	222523582
7000	NC_012032	TCAC	2	8	349385	349392	25 %	25 %	0 %	50 %	222523582

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