MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Caulobacter crescentus NA1000 chromosome

Total Repeats: 103591

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_011916	CGA	2	6	193964	193969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233119
5003	NC_011916	CGA	2	6	193976	193981	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233119
5004	NC_011916	GAG	2	6	194013	194018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221233119
5005	NC_011916	GC	3	6	194025	194030	0 %	0 %	50 %	50 %	221233119
5006	NC_011916	TGGA	2	8	194031	194038	25 %	25 %	50 %	0 %	221233119
5007	NC_011916	GCC	2	6	194055	194060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233119
5008	NC_011916	CGG	2	6	194071	194076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233119
5009	NC_011916	GGA	2	6	194114	194119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	221233119
5010	NC_011916	CGC	2	6	194147	194152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233119
5011	NC_011916	TGG	2	6	194164	194169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221233119
5012	NC_011916	CTGG	2	8	194198	194205	0 %	25 %	50 %	25 %	221233119
5013	NC_011916	GAC	2	6	194296	194301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233119
5014	NC_011916	GC	3	6	194305	194310	0 %	0 %	50 %	50 %	221233119
5015	NC_011916	GCGGAT	2	12	194346	194357	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	221233119
5016	NC_011916	GC	4	8	194436	194443	0 %	0 %	50 %	50 %	221233119
5017	NC_011916	CTG	2	6	194457	194462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233119
5018	NC_011916	CGGG	2	8	194488	194495	0 %	0 %	75 %	25 %	221233119
5019	NC_011916	CGG	2	6	194508	194513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233119
5020	NC_011916	CGG	4	12	194527	194538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233119
5021	NC_011916	TGC	2	6	194551	194556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233119
5022	NC_011916	TGA	2	6	194557	194562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221233119
5023	NC_011916	GC	4	8	194592	194599	0 %	0 %	50 %	50 %	221233119
5024	NC_011916	GGC	2	6	194690	194695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233119
5025	NC_011916	GTCGA	2	10	194748	194757	20 %	20 %	40 %	20 %	221233119
5026	NC_011916	ACA	2	6	194824	194829	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	221233119
5027	NC_011916	GGGC	2	8	194909	194916	0 %	0 %	75 %	25 %	221233119
5028	NC_011916	CAG	2	6	194921	194926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233119
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5032	NC_011916	TGG	2	6	194981	194986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221233120
5033	NC_011916	TGC	2	6	195012	195017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233120
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5035	NC_011916	GTG	2	6	195044	195049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221233120
5036	NC_011916	CGC	2	6	195072	195077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233120
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5040	NC_011916	CGGC	2	8	195174	195181	0 %	0 %	50 %	50 %	221233120
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5043	NC_011916	GC	3	6	195239	195244	0 %	0 %	50 %	50 %	221233120
5044	NC_011916	CGC	2	6	195283	195288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233120
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5055	NC_011916	CTGG	2	8	195708	195715	0 %	25 %	50 %	25 %	221233121
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5060	NC_011916	GGGC	2	8	195848	195855	0 %	0 %	75 %	25 %	221233121
5061	NC_011916	GGTC	2	8	195987	195994	0 %	25 %	50 %	25 %	221233121
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5070	NC_011916	CAG	2	6	196256	196261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233122
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5111	NC_011916	AGCTG	2	10	198373	198382	20 %	20 %	40 %	20 %	221233124
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5122	NC_011916	GCG	2	6	199037	199042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233124
5123	NC_011916	GGC	2	6	199097	199102	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233124
5124	NC_011916	GCC	2	6	199131	199136	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233124
5125	NC_011916	TCGAAG	2	12	199185	199196	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	221233124
5126	NC_011916	GTG	2	6	199209	199214	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221233124
5127	NC_011916	GCCG	2	8	199226	199233	0 %	0 %	50 %	50 %	221233124
5128	NC_011916	CGT	2	6	199336	199341	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233124
5129	NC_011916	CCG	2	6	199417	199422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233124
5130	NC_011916	GCT	2	6	199465	199470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233124
5131	NC_011916	TCCCG	2	10	199493	199502	0 %	20 %	20 %	60 %	221233124
5132	NC_011916	ACC	2	6	199521	199526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221233124
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5136	NC_011916	CGT	2	6	199744	199749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233124
5137	NC_011916	AAT	2	6	199824	199829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5138	NC_011916	TGG	2	6	199879	199884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5139	NC_011916	GCG	2	6	199922	199927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5140	NC_011916	GGC	2	6	199930	199935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5141	NC_011916	GCG	2	6	200045	200050	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5142	NC_011916	TTG	2	6	200111	200116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5143	NC_011916	AGG	2	6	200223	200228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5144	NC_011916	GGCC	2	8	200324	200331	0 %	0 %	50 %	50 %	221233125
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5147	NC_011916	CAT	2	6	200517	200522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	221233125
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5149	NC_011916	CAG	2	6	200598	200603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233125
5150	NC_011916	CAG	2	6	200607	200612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233125
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5154	NC_011916	GCC	2	6	200709	200714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233125
5155	NC_011916	TGG	2	6	200717	200722	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	221233125
5156	NC_011916	CGG	2	6	200732	200737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233125
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5163	NC_011916	CGA	2	6	201002	201007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233125
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5182	NC_011916	GC	3	6	201757	201762	0 %	0 %	50 %	50 %	221233126
5183	NC_011916	GCG	2	6	201766	201771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233126
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5186	NC_011916	GC	4	8	202036	202043	0 %	0 %	50 %	50 %	221233126
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5200	NC_011916	GCCGG	2	10	202520	202529	0 %	0 %	60 %	40 %	221233126
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5205	NC_011916	GC	4	8	202701	202708	0 %	0 %	50 %	50 %	221233126
5206	NC_011916	GC	3	6	202724	202729	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5207	NC_011916	TCG	2	6	202731	202736	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5228	NC_011916	CG	3	6	203413	203418	0 %	0 %	50 %	50 %	221233127
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5232	NC_011916	CGCGG	2	10	203465	203474	0 %	0 %	60 %	40 %	221233127
5233	NC_011916	CG	3	6	203479	203484	0 %	0 %	50 %	50 %	221233127
5234	NC_011916	TGA	2	6	203557	203562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221233127
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5237	NC_011916	CGC	3	9	203823	203831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5238	NC_011916	CGCC	2	8	203879	203886	0 %	0 %	25 %	75 %	221233128
5239	NC_011916	GCC	3	9	203884	203892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233128
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5242	NC_011916	TCG	2	6	204032	204037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233128
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5244	NC_011916	TCG	2	6	204062	204067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233128
5245	NC_011916	GACG	2	8	204072	204079	25 %	0 %	50 %	25 %	221233128
5246	NC_011916	CGC	2	6	204120	204125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233128
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5248	NC_011916	AGG	2	6	204213	204218	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5249	NC_011916	TGC	2	6	204225	204230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	367465531
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5251	NC_011916	CGG	2	6	204277	204282	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	367465531
5252	NC_011916	GCC	3	9	204308	204316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	367465531
5253	NC_011916	CG	3	6	204332	204337	0 %	0 %	50 %	50 %	367465531
5254	NC_011916	GCCG	2	8	204338	204345	0 %	0 %	50 %	50 %	367465531
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5331	NC_011916	CCG	3	9	206931	206939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5332	NC_011916	CACCC	2	10	206943	206952	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
5333	NC_011916	AGGGG	2	10	206969	206978	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
5334	NC_011916	GCC	2	6	206996	207001	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233132
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5366	NC_011916	CG	3	6	208115	208120	0 %	0 %	50 %	50 %	221233133
5367	NC_011916	CGC	2	6	208124	208129	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233133
5368	NC_011916	CGC	3	9	208160	208168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233133
5369	NC_011916	CGC	2	6	208249	208254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233133
5370	NC_011916	CG	3	6	208384	208389	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5371	NC_011916	CGCTG	2	10	208448	208457	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
5372	NC_011916	GCC	2	6	208481	208486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5373	NC_011916	CCAG	2	8	208495	208502	25 %	0 %	25 %	50 %	221233134
5374	NC_011916	GGCT	2	8	208503	208510	0 %	25 %	50 %	25 %	221233134
5375	NC_011916	GC	3	6	208515	208520	0 %	0 %	50 %	50 %	221233134
5376	NC_011916	CGC	2	6	208543	208548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233134
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5380	NC_011916	ACC	3	9	208734	208742	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	221233134
5381	NC_011916	GCA	2	6	208744	208749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233134
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5383	NC_011916	GTT	3	9	208766	208774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	221233134
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5399	NC_011916	GGCC	2	8	209529	209536	0 %	0 %	50 %	50 %	221233135
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5424	NC_011916	GC	3	6	210660	210665	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5425	NC_011916	AGAA	2	8	210726	210733	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5426	NC_011916	TG	3	6	210808	210813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5427	NC_011916	CGT	2	6	210882	210887	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5428	NC_011916	GACC	2	8	210979	210986	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5429	NC_011916	TCCA	2	8	211023	211030	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5430	NC_011916	CAGC	2	8	211043	211050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
5431	NC_011916	CGAAGC	2	12	211133	211144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233136
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5434	NC_011916	GTA	2	6	211202	211207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221233136
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5441	NC_011916	CG	3	6	211451	211456	0 %	0 %	50 %	50 %	221233136
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5486	NC_011916	TTCGA	2	10	213461	213470	20 %	40 %	20 %	20 %	221233138
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5488	NC_011916	AG	3	6	213526	213531	50 %	0 %	50 %	0 %	221233138
5489	NC_011916	CGC	2	6	213643	213648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233138
5490	NC_011916	CAG	2	6	213694	213699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233138
5491	NC_011916	CGA	2	6	213720	213725	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	221233138
5492	NC_011916	CGC	2	6	213729	213734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233138
5493	NC_011916	CGAC	2	8	213738	213745	25 %	0 %	25 %	50 %	221233138
5494	NC_011916	CGG	2	6	213795	213800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233138
5495	NC_011916	TTGGC	2	10	213807	213816	0 %	40 %	40 %	20 %	221233138
5496	NC_011916	CGC	2	6	213880	213885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	221233138
5497	NC_011916	TGA	2	6	213903	213908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221233138
5498	NC_011916	GTC	2	6	213911	213916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	221233138
5499	NC_011916	TGA	2	6	213921	213926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	221233138
5500	NC_011916	CGG	2	6	213931	213936	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	221233138

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