MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Clostridium cellulolyticum H10 chromosome

Total Repeats: 87190

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_011898	CATAA	2	10	21022	21031	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
502	NC_011898	A	6	6	21030	21035	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_011898	TA	3	6	21036	21041	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
504	NC_011898	GTT	2	6	21056	21061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_011898	TGA	2	6	21073	21078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_011898	TTA	2	6	21162	21167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927480
507	NC_011898	CTT	2	6	21243	21248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220927480
508	NC_011898	CTGC	2	8	21311	21318	0 %	25 %	25 %	50 %	220927480
509	NC_011898	TA	3	6	21331	21336	50 %	50 %	0 %	0 %	220927480
510	NC_011898	AGA	2	6	21341	21346	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927480
511	NC_011898	AAG	2	6	21416	21421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927480
512	NC_011898	CCT	2	6	21470	21475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220927480
513	NC_011898	GAAA	2	8	21480	21487	75 %	0 %	25 %	0 %	220927480
514	NC_011898	TAT	2	6	21503	21508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927480
515	NC_011898	TGA	2	6	21530	21535	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927480
516	NC_011898	GAT	2	6	21573	21578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927480
517	NC_011898	GAT	2	6	21594	21599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927480
518	NC_011898	CTA	2	6	21670	21675	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927480
519	NC_011898	GTA	2	6	21753	21758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927480
520	NC_011898	GAT	2	6	21795	21800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927480
521	NC_011898	GGA	2	6	21860	21865	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927480
522	NC_011898	AGG	2	6	21871	21876	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927480
523	NC_011898	TTTGA	2	10	21897	21906	20 %	60 %	20 %	0 %	220927480
524	NC_011898	AAT	2	6	22040	22045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927480
525	NC_011898	AATC	2	8	22049	22056	50 %	25 %	0 %	25 %	220927480
526	NC_011898	TGA	2	6	22079	22084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927480
527	NC_011898	TAA	2	6	22244	22249	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927480
528	NC_011898	TA	3	6	22253	22258	50 %	50 %	0 %	0 %	220927480
529	NC_011898	ACG	2	6	22267	22272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927480
530	NC_011898	GTT	2	6	22320	22325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927480
531	NC_011898	CAT	2	6	22472	22477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927480
532	NC_011898	GAA	2	6	22508	22513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927480
533	NC_011898	ACT	2	6	22514	22519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927480
534	NC_011898	TAA	2	6	22534	22539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927480
535	NC_011898	TA	3	6	22540	22545	50 %	50 %	0 %	0 %	220927480
536	NC_011898	A	7	7	22580	22586	100 %	0 %	0 %	0 %	220927480
537	NC_011898	TCT	2	6	22607	22612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220927480
538	NC_011898	AAT	2	6	22620	22625	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927480
539	NC_011898	GCA	2	6	22655	22660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927480
540	NC_011898	GCT	2	6	22661	22666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927480
541	NC_011898	AT	3	6	22689	22694	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_011898	TATT	2	8	22763	22770	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
543	NC_011898	T	6	6	22769	22774	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_011898	TAATT	2	10	22776	22785	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_011898	TA	3	6	22845	22850	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_011898	TAAA	2	8	22858	22865	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
547	NC_011898	AAGAC	2	10	22940	22949	60 %	0 %	20 %	20 %	220927481
548	NC_011898	AGC	2	6	23045	23050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927481
549	NC_011898	ATA	2	6	23062	23067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927481
550	NC_011898	GTT	2	6	23103	23108	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927481
551	NC_011898	A	7	7	23148	23154	100 %	0 %	0 %	0 %	220927481
552	NC_011898	GCC	2	6	23163	23168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220927481
553	NC_011898	GGA	2	6	23178	23183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927481
554	NC_011898	GCA	2	6	23193	23198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927481
555	NC_011898	GGA	2	6	23304	23309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927481
556	NC_011898	AATT	2	8	23335	23342	50 %	50 %	0 %	0 %	220927481
557	NC_011898	CTC	2	6	23344	23349	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	220927481
558	NC_011898	GTA	2	6	23605	23610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927481
559	NC_011898	TGA	2	6	23648	23653	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927481
560	NC_011898	A	8	8	23687	23694	100 %	0 %	0 %	0 %	220927481
561	NC_011898	AT	3	6	23717	23722	50 %	50 %	0 %	0 %	220927481
562	NC_011898	ATAA	2	8	23745	23752	75 %	25 %	0 %	0 %	220927482
563	NC_011898	AATT	2	8	23772	23779	50 %	50 %	0 %	0 %	220927482
564	NC_011898	AG	3	6	23824	23829	50 %	0 %	50 %	0 %	220927482
565	NC_011898	TAT	2	6	23832	23837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927482
566	NC_011898	GA	4	8	23858	23865	50 %	0 %	50 %	0 %	220927482
567	NC_011898	A	6	6	23888	23893	100 %	0 %	0 %	0 %	220927482
568	NC_011898	CAG	2	6	23901	23906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927482
569	NC_011898	TTG	2	6	23951	23956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927482
570	NC_011898	AAGG	2	8	23967	23974	50 %	0 %	50 %	0 %	220927482
571	NC_011898	CGT	2	6	24032	24037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927482
572	NC_011898	TGA	3	9	24078	24086	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927482
573	NC_011898	AAG	2	6	24160	24165	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927482
574	NC_011898	ATT	2	6	24184	24189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927482
575	NC_011898	TAA	2	6	24224	24229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927482
576	NC_011898	TA	3	6	24264	24269	50 %	50 %	0 %	0 %	220927482
577	NC_011898	TAA	2	6	24282	24287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927482
578	NC_011898	TTCT	2	8	24401	24408	0 %	75 %	0 %	25 %	220927482
579	NC_011898	T	6	6	24461	24466	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_011898	TA	3	6	24468	24473	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_011898	TA	3	6	24493	24498	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
582	NC_011898	ATA	2	6	24601	24606	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
583	NC_011898	T	6	6	24614	24619	0 %	100 %	0 %	0 %	220927483
584	NC_011898	AT	3	6	24623	24628	50 %	50 %	0 %	0 %	220927483
585	NC_011898	TAG	2	6	24664	24669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927483
586	NC_011898	T	7	7	24762	24768	0 %	100 %	0 %	0 %	220927483
587	NC_011898	A	6	6	24847	24852	100 %	0 %	0 %	0 %	220927483
588	NC_011898	AG	3	6	24890	24895	50 %	0 %	50 %	0 %	220927483
589	NC_011898	GAAA	2	8	25059	25066	75 %	0 %	25 %	0 %	220927483
590	NC_011898	A	6	6	25064	25069	100 %	0 %	0 %	0 %	220927483
591	NC_011898	TCA	2	6	25140	25145	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927483
592	NC_011898	AGGCAG	2	12	25183	25194	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	220927483
593	NC_011898	A	8	8	25228	25235	100 %	0 %	0 %	0 %	220927483
594	NC_011898	TA	3	6	25277	25282	50 %	50 %	0 %	0 %	220927483
595	NC_011898	AGG	2	6	25307	25312	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927483
596	NC_011898	GCT	2	6	25320	25325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927483
597	NC_011898	CTAA	2	8	25335	25342	50 %	25 %	0 %	25 %	220927483
598	NC_011898	ATA	2	6	25347	25352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
599	NC_011898	AGA	2	6	25362	25367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927483
600	NC_011898	AAG	2	6	25376	25381	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927483
601	NC_011898	AGAT	2	8	25477	25484	50 %	25 %	25 %	0 %	220927483
602	NC_011898	GTGAAA	2	12	25513	25524	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	220927483
603	NC_011898	A	6	6	25533	25538	100 %	0 %	0 %	0 %	220927483
604	NC_011898	TGA	2	6	25583	25588	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927483
605	NC_011898	AGA	2	6	25605	25610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927483
606	NC_011898	ATA	2	6	25681	25686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
607	NC_011898	AAT	2	6	25694	25699	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
608	NC_011898	TGC	2	6	25706	25711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927483
609	NC_011898	AACA	2	8	25712	25719	75 %	0 %	0 %	25 %	220927483
610	NC_011898	TGC	2	6	25736	25741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220927483
611	NC_011898	AAT	2	6	25820	25825	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220927483
612	NC_011898	CGGAG	2	10	25898	25907	20 %	0 %	60 %	20 %	220927483
613	NC_011898	ATC	2	6	25960	25965	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220927483
614	NC_011898	TTA	2	6	25969	25974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927483
615	NC_011898	GAT	2	6	26064	26069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220927483
616	NC_011898	ATA	2	6	26122	26127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
617	NC_011898	TAAA	2	8	26140	26147	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
618	NC_011898	TAT	2	6	26168	26173	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_011898	ATTTT	2	10	26205	26214	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
620	NC_011898	TAG	2	6	26219	26224	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
621	NC_011898	TA	3	6	26238	26243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
622	NC_011898	AGG	2	6	26250	26255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_011898	TTTA	2	8	26270	26277	25 %	75 %	0 %	0 %	220927484
624	NC_011898	TTG	2	6	26317	26322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	220927484
625	NC_011898	GAA	2	6	26331	26336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927484
626	NC_011898	AGC	2	6	26401	26406	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	220927484
627	NC_011898	ATT	2	6	26409	26414	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220927484
628	NC_011898	GGA	2	6	26937	26942	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220927484
629	NC_011898	A	6	6	26968	26973	100 %	0 %	0 %	0 %	220927484
630	NC_011898	AGA	3	9	27047	27055	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	220927485
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632	NC_011898	TA	4	8	27190	27197	50 %	50 %	0 %	0 %	220927485
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