MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 161

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011885	TA	3	6	5	10	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011885	CT	3	6	204	209	0 %	50 %	0 %	50 %	220910611
3	NC_011885	GC	3	6	240	245	0 %	0 %	50 %	50 %	220910611
4	NC_011885	TC	3	6	2562	2567	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_011885	GA	3	6	3578	3583	50 %	0 %	50 %	0 %	220910613
6	NC_011885	TC	3	6	6120	6125	0 %	50 %	0 %	50 %	220910615
7	NC_011885	GA	3	6	7681	7686	50 %	0 %	50 %	0 %	220910617
8	NC_011885	TC	3	6	7689	7694	0 %	50 %	0 %	50 %	220910617
9	NC_011885	CG	3	6	8452	8457	0 %	0 %	50 %	50 %	220910618
10	NC_011885	AC	5	10	10125	10134	50 %	0 %	0 %	50 %	220910619
11	NC_011885	AG	3	6	12891	12896	50 %	0 %	50 %	0 %	220910621
12	NC_011885	AG	3	6	13970	13975	50 %	0 %	50 %	0 %	220910623
13	NC_011885	GA	3	6	14097	14102	50 %	0 %	50 %	0 %	220910623
14	NC_011885	GT	3	6	14614	14619	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_011885	AG	3	6	15291	15296	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011885	AG	3	6	16020	16025	50 %	0 %	50 %	0 %	220910625
17	NC_011885	CT	3	6	17106	17111	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_011885	AT	3	6	17257	17262	50 %	50 %	0 %	0 %	220910627
19	NC_011885	GA	3	6	17395	17400	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011885	AG	4	8	17562	17569	50 %	0 %	50 %	0 %	220910628
21	NC_011885	AG	3	6	20170	20175	50 %	0 %	50 %	0 %	220910631
22	NC_011885	CT	3	6	20243	20248	0 %	50 %	0 %	50 %	220910631
23	NC_011885	GC	3	6	22407	22412	0 %	0 %	50 %	50 %	220910632
24	NC_011885	GA	3	6	25267	25272	50 %	0 %	50 %	0 %	220910634
25	NC_011885	TC	4	8	27036	27043	0 %	50 %	0 %	50 %	220910634
26	NC_011885	AG	3	6	27786	27791	50 %	0 %	50 %	0 %	220910634
27	NC_011885	AT	3	6	28761	28766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011885	CT	3	6	30327	30332	0 %	50 %	0 %	50 %	220910636
29	NC_011885	TC	3	6	31243	31248	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_011885	AG	3	6	32345	32350	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011885	GC	3	6	32929	32934	0 %	0 %	50 %	50 %	220910640
32	NC_011885	CG	3	6	34441	34446	0 %	0 %	50 %	50 %	220910641
33	NC_011885	AC	3	6	36395	36400	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_011885	CA	3	6	38768	38773	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
35	NC_011885	TG	3	6	39781	39786	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011885	TC	3	6	40061	40066	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_011885	TC	3	6	40357	40362	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011885	TC	3	6	40492	40497	0 %	50 %	0 %	50 %	220910644
39	NC_011885	TA	3	6	41693	41698	50 %	50 %	0 %	0 %	220910645
40	NC_011885	AG	3	6	42212	42217	50 %	0 %	50 %	0 %	220910646
41	NC_011885	CT	3	6	43287	43292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_011885	TC	3	6	43355	43360	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_011885	AT	4	8	43843	43850	50 %	50 %	0 %	0 %	220910647
44	NC_011885	GA	3	6	45257	45262	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
45	NC_011885	AG	3	6	45978	45983	50 %	0 %	50 %	0 %	220910647
46	NC_011885	TA	3	6	46281	46286	50 %	50 %	0 %	0 %	220910647
47	NC_011885	AT	3	6	50368	50373	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011885	TG	3	6	50597	50602	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011885	AT	3	6	51095	51100	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_011885	CT	3	6	51760	51765	0 %	50 %	0 %	50 %	220910656
51	NC_011885	AT	3	6	51996	52001	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011885	AC	3	6	53437	53442	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_011885	CA	3	6	54260	54265	50 %	0 %	0 %	50 %	220910659
54	NC_011885	TC	3	6	56244	56249	0 %	50 %	0 %	50 %	220910661
55	NC_011885	CG	3	6	57769	57774	0 %	0 %	50 %	50 %	220910663
56	NC_011885	CT	3	6	59034	59039	0 %	50 %	0 %	50 %	220910664
57	NC_011885	TC	3	6	60402	60407	0 %	50 %	0 %	50 %	220910666
58	NC_011885	CT	3	6	60985	60990	0 %	50 %	0 %	50 %	220910667
59	NC_011885	CT	3	6	63117	63122	0 %	50 %	0 %	50 %	220910668
60	NC_011885	CA	3	6	66525	66530	50 %	0 %	0 %	50 %	220910672
61	NC_011885	CT	3	6	67402	67407	0 %	50 %	0 %	50 %	220910672
62	NC_011885	CG	3	6	67864	67869	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_011885	CT	3	6	68703	68708	0 %	50 %	0 %	50 %	220910673
64	NC_011885	AG	3	6	68741	68746	50 %	0 %	50 %	0 %	220910673
65	NC_011885	AG	3	6	69521	69526	50 %	0 %	50 %	0 %	220910674
66	NC_011885	GT	3	6	71502	71507	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011885	CT	3	6	73179	73184	0 %	50 %	0 %	50 %	220910676
68	NC_011885	TG	3	6	73362	73367	0 %	50 %	50 %	0 %	220910676
69	NC_011885	GC	3	6	76646	76651	0 %	0 %	50 %	50 %	220910677
70	NC_011885	AC	3	6	78553	78558	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_011885	GT	3	6	79826	79831	0 %	50 %	50 %	0 %	220910678
72	NC_011885	TG	3	6	80957	80962	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011885	TA	3	6	82093	82098	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011885	AC	3	6	83108	83113	50 %	0 %	0 %	50 %	220910679
75	NC_011885	GA	3	6	84549	84554	50 %	0 %	50 %	0 %	220910680
76	NC_011885	GA	3	6	84684	84689	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011885	GA	3	6	84980	84985	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011885	CA	3	6	85260	85265	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_011885	GT	3	6	86272	86277	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011885	GA	4	8	86799	86806	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011885	CG	3	6	87847	87852	0 %	0 %	50 %	50 %	220910682
82	NC_011885	CA	3	6	94838	94843	50 %	0 %	0 %	50 %	220910689
83	NC_011885	GA	3	6	95809	95814	50 %	0 %	50 %	0 %	220910690
84	NC_011885	CA	3	6	95983	95988	50 %	0 %	0 %	50 %	220910690
85	NC_011885	CG	3	6	96380	96385	0 %	0 %	50 %	50 %	220910691
86	NC_011885	TC	3	6	96663	96668	0 %	50 %	0 %	50 %	220910691
87	NC_011885	GT	3	6	101446	101451	0 %	50 %	50 %	0 %	220910695
88	NC_011885	CT	3	6	101744	101749	0 %	50 %	0 %	50 %	220910695
89	NC_011885	TC	3	6	104249	104254	0 %	50 %	0 %	50 %	220910698
90	NC_011885	AT	3	6	104768	104773	50 %	50 %	0 %	0 %	220910698
91	NC_011885	TC	3	6	105208	105213	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_011885	GA	3	6	107110	107115	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011885	AC	3	6	107915	107920	50 %	0 %	0 %	50 %	220910703
94	NC_011885	AC	3	6	108185	108190	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
95	NC_011885	GA	3	6	109029	109034	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011885	AT	3	6	109458	109463	50 %	50 %	0 %	0 %	220910704
97	NC_011885	AT	3	6	110119	110124	50 %	50 %	0 %	0 %	220910704
98	NC_011885	AG	3	6	110145	110150	50 %	0 %	50 %	0 %	220910704
99	NC_011885	GT	3	6	113253	113258	0 %	50 %	50 %	0 %	220910705
100	NC_011885	AG	3	6	114199	114204	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011885	GA	3	6	115502	115507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011885	CA	3	6	121542	121547	50 %	0 %	0 %	50 %	220910717
103	NC_011885	AT	3	6	122308	122313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011885	CT	3	6	123231	123236	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
105	NC_011885	AC	3	6	124284	124289	50 %	0 %	0 %	50 %	220910719
106	NC_011885	CA	3	6	126053	126058	50 %	0 %	0 %	50 %	220910721
107	NC_011885	AG	3	6	126789	126794	50 %	0 %	50 %	0 %	220910721
108	NC_011885	AT	3	6	127085	127090	50 %	50 %	0 %	0 %	220910721
109	NC_011885	GT	3	6	127711	127716	0 %	50 %	50 %	0 %	220910721
110	NC_011885	GA	3	6	128277	128282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011885	GA	3	6	128987	128992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011885	TA	3	6	132161	132166	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011885	AT	4	8	132225	132232	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011885	TA	3	6	132245	132250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011885	GA	3	6	133505	133510	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011885	GA	3	6	134159	134164	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011885	TC	3	6	135259	135264	0 %	50 %	0 %	50 %	220910730
118	NC_011885	AT	3	6	136112	136117	50 %	50 %	0 %	0 %	220910730
119	NC_011885	TA	3	6	136544	136549	50 %	50 %	0 %	0 %	220910730
120	NC_011885	AT	3	6	137137	137142	50 %	50 %	0 %	0 %	220910730
121	NC_011885	TA	3	6	138768	138773	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_011885	GA	3	6	139252	139257	50 %	0 %	50 %	0 %	220910732
123	NC_011885	CT	3	6	139349	139354	0 %	50 %	0 %	50 %	220910732
124	NC_011885	GC	3	6	139659	139664	0 %	0 %	50 %	50 %	220910732
125	NC_011885	GC	3	6	140001	140006	0 %	0 %	50 %	50 %	220910732
126	NC_011885	GA	3	6	142127	142132	50 %	0 %	50 %	0 %	220910734
127	NC_011885	AC	3	6	142548	142553	50 %	0 %	0 %	50 %	220910734
128	NC_011885	AC	3	6	142665	142670	50 %	0 %	0 %	50 %	220910734
129	NC_011885	TC	3	6	143777	143782	0 %	50 %	0 %	50 %	220910735
130	NC_011885	TG	3	6	143813	143818	0 %	50 %	50 %	0 %	220910735
131	NC_011885	AT	3	6	144116	144121	50 %	50 %	0 %	0 %	220910735
132	NC_011885	GC	3	6	145828	145833	0 %	0 %	50 %	50 %	220910735
133	NC_011885	TC	3	6	146765	146770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_011885	GA	3	6	147558	147563	50 %	0 %	50 %	0 %	220910738
135	NC_011885	AG	3	6	148827	148832	50 %	0 %	50 %	0 %	220910740
136	NC_011885	AT	3	6	150157	150162	50 %	50 %	0 %	0 %	220910741
137	NC_011885	GA	3	6	151964	151969	50 %	0 %	50 %	0 %	220910745
138	NC_011885	AG	3	6	151983	151988	50 %	0 %	50 %	0 %	220910745
139	NC_011885	CT	3	6	152233	152238	0 %	50 %	0 %	50 %	220910745
140	NC_011885	GA	3	6	153177	153182	50 %	0 %	50 %	0 %	220910746
141	NC_011885	AC	3	6	153882	153887	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_011885	AC	3	6	153923	153928	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_011885	GA	3	6	154915	154920	50 %	0 %	50 %	0 %	220910747
144	NC_011885	CT	3	6	155618	155623	0 %	50 %	0 %	50 %	220910748
145	NC_011885	CT	3	6	156251	156256	0 %	50 %	0 %	50 %	220910748
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.