MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Cyanothece sp. PCC 7425 plasmid pP742502

Total Repeats: 3053

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_011885	TGG	2	6	176104	176109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910775
3002	NC_011885	ATCG	2	8	176194	176201	25 %	25 %	25 %	25 %	220910775
3003	NC_011885	TACT	2	8	176322	176329	25 %	50 %	0 %	25 %	220910775
3004	NC_011885	CAC	2	6	176351	176356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910775
3005	NC_011885	CGC	2	6	176372	176377	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	220910775
3006	NC_011885	TGAA	2	8	176530	176537	50 %	25 %	25 %	0 %	220910775
3007	NC_011885	GT	3	6	176568	176573	0 %	50 %	50 %	0 %	220910775
3008	NC_011885	GCCG	2	8	176584	176591	0 %	0 %	50 %	50 %	220910775
3009	NC_011885	CAT	2	6	176692	176697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_011885	ATTG	2	8	176775	176782	25 %	50 %	25 %	0 %	220910776
3011	NC_011885	CTG	2	6	176798	176803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910776
3012	NC_011885	ACTG	2	8	176832	176839	25 %	25 %	25 %	25 %	220910776
3013	NC_011885	AGCAG	2	10	176897	176906	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3014	NC_011885	ATT	2	6	176993	176998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	220910777
3015	NC_011885	T	7	7	177156	177162	0 %	100 %	0 %	0 %	220910777
3016	NC_011885	CCCT	2	8	177325	177332	0 %	25 %	0 %	75 %	220910777
3017	NC_011885	TGG	2	6	177340	177345	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	220910777
3018	NC_011885	ACT	2	6	177395	177400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910778
3019	NC_011885	TGAT	2	8	177424	177431	25 %	50 %	25 %	0 %	220910778
3020	NC_011885	GAAT	2	8	177611	177618	50 %	25 %	25 %	0 %	220910778
3021	NC_011885	TTCA	2	8	177708	177715	25 %	50 %	0 %	25 %	220910778
3022	NC_011885	TTTG	2	8	177898	177905	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_011885	CAT	2	6	177948	177953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_011885	TGC	2	6	177974	177979	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_011885	GAG	2	6	177981	177986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_011885	TGC	2	6	178006	178011	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3027	NC_011885	ACC	2	6	178200	178205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910779
3028	NC_011885	CCCGG	2	10	178206	178215	0 %	0 %	40 %	60 %	220910779
3029	NC_011885	ACT	2	6	178217	178222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910779
3030	NC_011885	GCTCAA	2	12	178241	178252	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	220910779
3031	NC_011885	CGG	2	6	178703	178708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	220910780
3032	NC_011885	GGTC	2	8	178724	178731	0 %	25 %	50 %	25 %	220910780
3033	NC_011885	AAT	2	6	178772	178777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	220910780
3034	NC_011885	CCCCT	2	10	178813	178822	0 %	20 %	0 %	80 %	220910780
3035	NC_011885	GCT	3	9	178853	178861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910780
3036	NC_011885	CTG	2	6	178883	178888	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	220910780
3037	NC_011885	TCA	2	6	178929	178934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3038	NC_011885	TTA	2	6	178986	178991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_011885	TGTAAC	2	12	179149	179160	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	220910781
3040	NC_011885	TGCACC	2	12	179163	179174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	220910781
3041	NC_011885	CT	3	6	179186	179191	0 %	50 %	0 %	50 %	220910781
3042	NC_011885	AGAA	2	8	179200	179207	75 %	0 %	25 %	0 %	220910781
3043	NC_011885	CAC	2	6	179272	179277	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910781
3044	NC_011885	TGA	2	6	179288	179293	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	220910781
3045	NC_011885	ACCA	2	8	179312	179319	50 %	0 %	0 %	50 %	220910781
3046	NC_011885	A	7	7	179329	179335	100 %	0 %	0 %	0 %	220910781
3047	NC_011885	ATAA	2	8	179350	179357	75 %	25 %	0 %	0 %	220910781
3048	NC_011885	GAG	2	6	179643	179648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	220910782
3049	NC_011885	CTT	2	6	179691	179696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	220910782
3050	NC_011885	T	7	7	179770	179776	0 %	100 %	0 %	0 %	220910782
3051	NC_011885	GCAAAA	2	12	179847	179858	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	220910782
3052	NC_011885	CCA	2	6	179873	179878	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	220910782
3053	NC_011885	ATC	2	6	179963	179968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	220910782

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.